Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc02g005280.1.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat superfamily protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A061E854_THECC)
Sequence	ATGGCAGGTTTGAATGAAGAGTTGAAGTCGTTGTTTTTGTTGAAAGGATGGAAGTTGTAC CATCTGAAACAGATGAACTGTGTCTTGTTCACTTGTGGCCTCTCACATCACACTTTTTTT TTCAGCAAACTACTCCGCCTTTGCTTACTTCTTCCTTCATTCCCATCTTCTTATGCTTCT TCTCTCTTCAATCACATCACAAGACCCGCTATACATACATGGAACATCATGTTCAAAGGA TTTTCTAATAATACTTCACACCCTCAAAACTCCTCCATTAGTTTATACATTCAAATGCGC CAACATGGGGTTTTTCCTAATAAACATACTTTTCCATTGCTTCTTAGAGCCAAGAATGAA AACCCACATCTCATTTTCCCACAAATTTTAAAGTTCGGATACATTTCTGACCAATTTGTG CAGAATTCTTTGGTTTCTTGTTTTGCCAGCAGTGGGTATGTCGACCTTGCACGCCAAGTG TTTGATGATATTACGCATAAGGACGTGCTTTCTTATACTGCTTTGATTGATGGGTATGCC CGGAATGCTCTGCCAGTTAGAGCTTTGAAACTTTTCCTGGAGATGAGACAAGCACAAGTT AAGGTGGATGAAGTGGCTGTTGTAGCAGCTCTTTCTCCTGCTGGAACGTTAAGATGTGTT TGGTTTGGCAAGTGTCTTCATGCTTTCTATATCGAGCCAGGGAGGGTTTCTAGGGATGTT TACATTGGTAGTGCTCTTGTTGATATGTATTCTAAATGTGGATTTTGGGATGATGCCATG AAAGTTTTTGAAGACATGCCTTACAAGAATCTTATTTCTTGGACTGCTATGATTGCTGGC TCTCTACACTGCAATAGATGTAGGGAAGCACTCTCTGTTTTCGAAGAGATGCTGTCCAGA AAGGTTGTGCCCAATCAAGTAACATTGACAAGCGTCCTCAGTGCATCTACTAAGCTTGGG GCATTGGAGCAGGGCAGATGGATTGCTAATTATATAAAAGCTCACAACGTAAAATTTAAT ACAGCACTTGCCACTGCTTTGATAGATATGTATGCAAAGTGTGGGTGCATTGAAGAGGCA CTGTTGGTTTTCGACAATCTTCCAAATAAAGATGTTTATCTATGGACTGCTATGATACAT GGCCTGGCAACACATGGTGATGCTGCAAAGTCCATGACCTTCTTCTTAGAAATGTTGAGA CATGGTATAAGGCCCAATGAAGTAACCTTCATTGGTATTCTCAGTGCGTGTTCTCATGGA GGACTTGTGGATGAAGGACGCCAGTTGTTCTCATTAATGGACCAAGTTTACGGTTTAAAA CCTAATTTAGATCATTATGGCTGTATGGTCGATCTGCTGGGTCGGGCAGGATATCTGGAA GAAGCTTGTAAATTGATTCAAGACATGCCAATGAAACCTACTCCTAGCATATGGGGTGCT CTCTTTGGTTCTTGCATGATTCACAAGGCGTATGAATTAGGTGAATGGATAGGAAGATAT CTAATCGATATACAGCCTTATCACAGTGGCAGATATACACTCTTGGCGAATTTGTATTCT ACTTGTAAAAATTGGGAAGGGGTAGCTCATGTTAGGAAAATGATGAAAGAGATGGGTGTG GAAAAGACTCGAGGGTGTAGTTGGATCGAATTGAACGGGGAAGTGCATGAGTTTATTGCC TTTGATGGTTCACATGCTAAGTCTGAACATATTTACACCATTTTAGATAACCTAGTCAGT CATCTACAACACATTACCATTTCTCCGTGTGCTGATTCATTACTTCTTGAGAGTAATGGA ACAATGCAACATTGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc02g005280.1.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat superfamily protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A061E854_THECC)
Sequence	MAGLNEELKSLFLLKGWKLYHLKQMNCVLFTCGLSHHTFFFSKLLRLCLLLPSFPSSYAS SLFNHITRPAIHTWNIMFKGFSNNTSHPQNSSISLYIQMRQHGVFPNKHTFPLLLRAKNE NPHLIFPQILKFGYISDQFVQNSLVSCFASSGYVDLARQVFDDITHKDVLSYTALIDGYA RNALPVRALKLFLEMRQAQVKVDEVAVVAALSPAGTLRCVWFGKCLHAFYIEPGRVSRDV YIGSALVDMYSKCGFWDDAMKVFEDMPYKNLISWTAMIAGSLHCNRCREALSVFEEMLSR KVVPNQVTLTSVLSASTKLGALEQGRWIANYIKAHNVKFNTALATALIDMYAKCGCIEEA LLVFDNLPNKDVYLWTAMIHGLATHGDAAKSMTFFLEMLRHGIRPNEVTFIGILSACSHG GLVDEGRQLFSLMDQVYGLKPNLDHYGCMVDLLGRAGYLEEACKLIQDMPMKPTPSIWGA LFGSCMIHKAYELGEWIGRYLIDIQPYHSGRYTLLANLYSTCKNWEGVAHVRKMMKEMGV EKTRGCSWIELNGEVHEFIAFDGSHAKSEHIYTILDNLVSHLQHITISPCADSLLLESNG TMQHC*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc02g005280.1.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat superfamily protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A061E854_THECC)
Sequence	ATGGCAGGTTTGAATGAAGAGTTGAAGTCGTTGTTTTTGTTGAAAGGATGGAAGTTGTAC CATCTGAAACAGATGAACTGTGTCTTGTTCACTTGTGGCCTCTCACATCACACTTTTTTT TTCAGCAAACTACTCCGCCTTTGCTTACTTCTTCCTTCATTCCCATCTTCTTATGCTTCT TCTCTCTTCAATCACATCACAAGACCCGCTATACATACATGGAACATCATGTTCAAAGGA TTTTCTAATAATACTTCACACCCTCAAAACTCCTCCATTAGTTTATACATTCAAATGCGC CAACATGGGGTTTTTCCTAATAAACATACTTTTCCATTGCTTCTTAGAGCCAAGAATGAA AACCCACATCTCATTTTCCCACAAATTTTAAAGTTCGGATACATTTCTGACCAATTTGTG CAGAATTCTTTGGTTTCTTGTTTTGCCAGCAGTGGGTATGTCGACCTTGCACGCCAAGTG TTTGATGATATTACGCATAAGGACGTGCTTTCTTATACTGCTTTGATTGATGGGTATGCC CGGAATGCTCTGCCAGTTAGAGCTTTGAAACTTTTCCTGGAGATGAGACAAGCACAAGTT AAGGTGGATGAAGTGGCTGTTGTAGCAGCTCTTTCTCCTGCTGGAACGTTAAGATGTGTT TGGTTTGGCAAGTGTCTTCATGCTTTCTATATCGAGCCAGGGAGGGTTTCTAGGGATGTT TACATTGGTAGTGCTCTTGTTGATATGTATTCTAAATGTGGATTTTGGGATGATGCCATG AAAGTTTTTGAAGACATGCCTTACAAGAATCTTATTTCTTGGACTGCTATGATTGCTGGC TCTCTACACTGCAATAGATGTAGGGAAGCACTCTCTGTTTTCGAAGAGATGCTGTCCAGA AAGGTTGTGCCCAATCAAGTAACATTGACAAGCGTCCTCAGTGCATCTACTAAGCTTGGG GCATTGGAGCAGGGCAGATGGATTGCTAATTATATAAAAGCTCACAACGTAAAATTTAAT ACAGCACTTGCCACTGCTTTGATAGATATGTATGCAAAGTGTGGGTGCATTGAAGAGGCA CTGTTGGTTTTCGACAATCTTCCAAATAAAGATGTTTATCTATGGACTGCTATGATACAT GGCCTGGCAACACATGGTGATGCTGCAAAGTCCATGACCTTCTTCTTAGAAATGTTGAGA CATGGTATAAGGCCCAATGAAGTAACCTTCATTGGTATTCTCAGTGCGTGTTCTCATGGA GGACTTGTGGATGAAGGACGCCAGTTGTTCTCATTAATGGACCAAGTTTACGGTTTAAAA CCTAATTTAGATCATTATGGCTGTATGGTCGATCTGCTGGGTCGGGCAGGATATCTGGAA GAAGCTTGTAAATTGATTCAAGACATGCCAATGAAACCTACTCCTAGCATATGGGGTGCT CTCTTTGGTTCTTGCATGATTCACAAGGCGTATGAATTAGGTGAATGGATAGGAAGATAT CTAATCGATATACAGCCTTATCACAGTGGCAGATATACACTCTTGGCGAATTTGTATTCT ACTTGTAAAAATTGGGAAGGGGTAGCTCATGTTAGGAAAATGATGAAAGAGATGGGTGTG GAAAAGACTCGAGGGTGTAGTTGGATCGAATTGAACGGGGAAGTGCATGAGTTTATTGCC TTTGATGGTTCACATGCTAAGTCTGAACATATTTACACCATTTTAGATAACCTAGTCAGT CATCTACAACACATTACCATTTCTCCGTGTGCTGATTCATTACTTCTTGAGAGTAATGGA ACAATGCAACATTGTTGA