Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g112090.3.1
CDS Infomation	Protein DETOXIFICATION (AHRD V3.3 *** K4B470_SOLLC)
Sequence	ATGGCAGCTGCACAATTGACCAGTAAGGCGTTATATAATGGGTTTACTGAATTGGAAGTG AAAGAGGAGATTTCCAAATGCTGCTCGTTAAGATTCTCACATCGCCATTTTAGTTCCTTT TCAAGAATCAGTCAGAATAGCTTGAAAAATGTTTATGGTAGCAACAGTTGTTCTTTATCA ATTGGAAAAAGCAAAAGATTTTCATATGCACCTGTTCTTTTCCCAAGGAAGCAGAAATAT TTAAGGTTCCGCAATAAGTTCAGTTCAGAGAGTGGTGCGGAAACTTCTGATTTGCAATAT ACCACTGCTGTAAAGGGAATGGATGATCTCTCAAGCTCAAGGGGAGAAGTAGATGAGTTG AATGAGACTGTTCCCATTATAACAAATGTCGAAAGTGAATCAATAGAAGAGGCTCCGACA AGTTCATCTCAATCTGAGGATGTCAGGCGTGAGCTTGTGATGCTGTCTTTGCCAGCAATT GCTGGACAGGCCATTGACCCTTTGGCACAGTTAATGGAGACTGCTTATATTGGGCGCCTG GGTTCTGTGGAATTAGCTTCAGCTGGTGTCTCAATATCAATTTTTAACATAATATCAAAG CTTTTTAATATTCCTCTACTTAGTGTTGCTACATCTTTTGTCGCTGAAGACATCGCCAAG AATGCAACCAAAGTTAACATGTCAGAGGGGGCAAAAGGCACTGATGGTAGATTTCCCACT GGGGTAGCAGAAAGGCATCAGTTTTCTTCTGTGTCTACCGCATTATTTTTAGCTGTTGGC ATCGGCATAATTGAAGCTTTGGCTTTGGCGTTGGGATCTGAACTACTTCTTGGTTTAATG GGCATATCATCTACTTCACCTATGAGAGTTCCAACAAAACAATTTCTTGCTGTGCGTGCT CTTGGTGCTCCTGCATTTGTAGTTTCTTTGGCCCTTCAAGGCATATTCCGTGGATTTAAG GATACAAAGACTCCAGTCTTCTGTTTAGGCATTGGGAACTTTGCAGCTATATTTTTGTTT CCCTTACTTATGTACTATTTCGGCTTGGGTGTGTCCGGAGCTGCCATATCCACTGTCATT TCACAATACCTAGTGGCCTTCTCTATGATGTGGTATTTAAATCAGAGAGTAATGATATTA CCTCCACGATTTGAAGAGCTGCAATTTGGTGGCTATTTAAAATCTGGTGGATTTCTCATT GGAAGAACTCTTTCTGTCCTTTTCACAATGACACTTGCTACATCAATGGCTGCCCGTCAA GGTGCTGTAGCAATGGCGGGTCACCAAATATGCTTACAAGTTTGGCTAGCTGTCTCCCTC CTCACAGATGCACTGGCTGCATCTGCACAGGCGTTGATTGCTAGTTATTTATCAAAAGGA GATTACGTGGTGGCAACTGAAATTACACACTATGTTCTAAAGATAGGGCTAGTTGCAGGT GTCTTTTTAGCGGCTGCATTAGGTGTTTCTTTTGGCTCTTTATCTACTTTATTTACCAAG GACACAGAGGTGCTAGCTGTGGTTAGTACAGGTTTATTGTTTGTCAGTGCCAGTCAACCA ATAAATGCTCTTGCGTTTATCTTTGATGGCCTCCATTATGGTGTTTCAGACTTCGCTTAT GCAGCTCACTCCATGATGTTGGTGGGGGCAATATCATCTGGATTTCTGCTTTGTGCTCCT AGACTTCTTGGTCTTCCTGGTGTTTGGTTGGGATTGACCCTTTTCATGGGCTTACGCATG ATGGCTGGGTTTATCAGGTTATTGTCAAAGAGAAGTCCTTGGTGGTTTCTGCATTGTGAT GCAAATGAAGCTAAGGTTATTAGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g112090.3.1
PEP Infomation	Protein DETOXIFICATION (AHRD V3.3 *** K4B470_SOLLC)
Sequence	MAAAQLTSKALYNGFTELEVKEEISKCCSLRFSHRHFSSFSRISQNSLKNVYGSNSCSLS IGKSKRFSYAPVLFPRKQKYLRFRNKFSSESGAETSDLQYTTAVKGMDDLSSSRGEVDEL NETVPIITNVESESIEEAPTSSSQSEDVRRELVMLSLPAIAGQAIDPLAQLMETAYIGRL GSVELASAGVSISIFNIISKLFNIPLLSVATSFVAEDIAKNATKVNMSEGAKGTDGRFPT GVAERHQFSSVSTALFLAVGIGIIEALALALGSELLLGLMGISSTSPMRVPTKQFLAVRA LGAPAFVVSLALQGIFRGFKDTKTPVFCLGIGNFAAIFLFPLLMYYFGLGVSGAAISTVI SQYLVAFSMMWYLNQRVMILPPRFEELQFGGYLKSGGFLIGRTLSVLFTMTLATSMAARQ GAVAMAGHQICLQVWLAVSLLTDALAASAQALIASYLSKGDYVVATEITHYVLKIGLVAG VFLAAALGVSFGSLSTLFTKDTEVLAVVSTGLLFVSASQPINALAFIFDGLHYGVSDFAY AAHSMMLVGAISSGFLLCAPRLLGLPGVWLGLTLFMGLRMMAGFIRLLSKRSPWWFLHCD ANEAKVIS*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g112090.3.1
Transcript Infomation	Protein DETOXIFICATION (AHRD V3.3 *** K4B470_SOLLC)
Sequence	TTTAAAAGGCAAAATGAGGAATTTTATCGACTCTGCTTCTTCCTTAGTATAATTCTGGTT AGCCCCTTCCCTTCTGTACCGGCGGCAGGCTCTTCACTAGGTTCTTCTACTTAGATTATG AAGTGAGGCACACCAGCTTATAAAAATGGCAGCTGCACAATTGACCAGTAAGGCGTTATA TAATGGGTTTACTGAATTGGAAGTGAAAGAGGAGATTTCCAAATGCTGCTCGTTAAGATT CTCACATCGCCATTTTAGTTCCTTTTCAAGAATCAGTCAGAATAGCTTGAAAAATGTTTA TGGTAGCAACAGTTGTTCTTTATCAATTGGAAAAAGCAAAAGATTTTCATATGCACCTGT TCTTTTCCCAAGGAAGCAGAAATATTTAAGGTTCCGCAATAAGTTCAGTTCAGAGAGTGG TGCGGAAACTTCTGATTTGCAATATACCACTGCTGTAAAGGGAATGGATGATCTCTCAAG CTCAAGGGGAGAAGTAGATGAGTTGAATGAGACTGTTCCCATTATAACAAATGTCGAAAG TGAATCAATAGAAGAGGCTCCGACAAGTTCATCTCAATCTGAGGATGTCAGGCGTGAGCT TGTGATGCTGTCTTTGCCAGCAATTGCTGGACAGGCCATTGACCCTTTGGCACAGTTAAT GGAGACTGCTTATATTGGGCGCCTGGGTTCTGTGGAATTAGCTTCAGCTGGTGTCTCAAT ATCAATTTTTAACATAATATCAAAGCTTTTTAATATTCCTCTACTTAGTGTTGCTACATC TTTTGTCGCTGAAGACATCGCCAAGAATGCAACCAAAGTTAACATGTCAGAGGGGGCAAA AGGCACTGATGGTAGATTTCCCACTGGGGTAGCAGAAAGGCATCAGTTTTCTTCTGTGTC TACCGCATTATTTTTAGCTGTTGGCATCGGCATAATTGAAGCTTTGGCTTTGGCGTTGGG ATCTGAACTACTTCTTGGTTTAATGGGCATATCATCTACTTCACCTATGAGAGTTCCAAC AAAACAATTTCTTGCTGTGCGTGCTCTTGGTGCTCCTGCATTTGTAGTTTCTTTGGCCCT TCAAGGCATATTCCGTGGATTTAAGGATACAAAGACTCCAGTCTTCTGTTTAGGCATTGG GAACTTTGCAGCTATATTTTTGTTTCCCTTACTTATGTACTATTTCGGCTTGGGTGTGTC CGGAGCTGCCATATCCACTGTCATTTCACAATACCTAGTGGCCTTCTCTATGATGTGGTA TTTAAATCAGAGAGTAATGATATTACCTCCACGATTTGAAGAGCTGCAATTTGGTGGCTA TTTAAAATCTGGTGGATTTCTCATTGGAAGAACTCTTTCTGTCCTTTTCACAATGACACT TGCTACATCAATGGCTGCCCGTCAAGGTGCTGTAGCAATGGCGGGTCACCAAATATGCTT ACAAGTTTGGCTAGCTGTCTCCCTCCTCACAGATGCACTGGCTGCATCTGCACAGGCGTT GATTGCTAGTTATTTATCAAAAGGAGATTACGTGGTGGCAACTGAAATTACACACTATGT TCTAAAGATAGGGCTAGTTGCAGGTGTCTTTTTAGCGGCTGCATTAGGTGTTTCTTTTGG CTCTTTATCTACTTTATTTACCAAGGACACAGAGGTGCTAGCTGTGGTTAGTACAGGTTT ATTGTTTGTCAGTGCCAGTCAACCAATAAATGCTCTTGCGTTTATCTTTGATGGCCTCCA TTATGGTGTTTCAGACTTCGCTTATGCAGCTCACTCCATGATGTTGGTGGGGGCAATATC ATCTGGATTTCTGCTTTGTGCTCCTAGACTTCTTGGTCTTCCTGGTGTTTGGTTGGGATT GACCCTTTTCATGGGCTTACGCATGATGGCTGGGTTTATCAGGTTATTGTCAAAGAGAAG TCCTTGGTGGTTTCTGCATTGTGATGCAAATGAAGCTAAGGTTATTAGTTGAGTGGATTA GATTTCAGACCATGACACCTCCTATCATATTCATGATTATAACTTAGCTTTCTTGGATGT TGTCTTTTTCTCTGAAAATAGGATTACCGAGTCTCTATTCTCCATGGGTGCTTGCTTTCT TAATATTTGTTTTTCCTTTACACTACCCCCCACTTTAAGTTATTTTCTGGGTGGTGGTGG ATGTTCGAAGATTCATCACGACTGCAATAATGCCTTGCGGCTTGGTCTGTCCTATGTACA TAAGTTGAAACATGTGTATATACATTACTTATCGGCATAACTTCCTTATTTATTATGTAA TTTTTTTGCTTTTAGAGGAAAGTGTTCGAATTCAGCTTTGCTAGAGCGAAAGAAGGTTAA TTAGCATCCCTTGAATTTGTTGAGGTCAATCAATCCCTAATGTTCTTGCAAACTAGCTGT TGAATTTGGATGTGTTCAATGAGTTTTGTAGTGTTTGGTTCTCTGTGTTAAAGCCTACCT GTTGATTTCTGCGAGAACAACACTGTTGTATTGTCATTCTACCTTAAGTGTTGCACGGAC ACAGCATGAATGAATGTGAAGCTGTCTTTGGTGGGTGGAATTTATTTGCAATGAAGAGAG AAGAAAAGAAATGAGAAATCACACTTGTAAAACAAGGACGAGGAAGAAGTAAAAACAAAA GAGAAAGCCCGTGAAAGGGGAAGTTGGATGATGATCTTATATTGGGCCTGTGTAATCCAT TGGTCCGTATGGTTCAAACCACTCAGCCCAAAGACCCTTTTTCCTCTTAGGATTCCAGCC CATGTCCTTGCAGAGTTGGTCGTTGTGCCAAATATGCAAAGCACCGATGCATGATCTCCT GTAGTACTTCTTTGAGTATCTCTTCTTGTATTTATCCCATTCAGCTATGTCTTTCTCCAT CATCTTTACACTAGGCAGCTTGAATTTTCCATCAAGAAGCTCTGCCAGCCATCGGCACCT TATTTCTGAGGTGTATAGATTTGCTATGCTTTCTGAGAATCCAATTATTGCCAGTTGTGG AATTTGGGGATGAATGCATTCCCTGATAATAATAATCCATTATTATTCATATATACAAAA AAGTGTTGTTTTTATGTATATTATTACTTACCTATAGAGGGGAACTGCAGCAGAATCATC TGAGCCTGCTATGAGTTGCTGATATTTTGGTGATTCAAAAATGTGTTTGAGCTTATCAAT TCCCCTGAAGCCTGTGGCGAGTATGACTAAGTCAGATTTAATGGGTTCAGCCTGACCCTC TAGCACAATGCCTTGTTTGGTAAATCCAAAACTCTTGGCTTTCTTTAGTTTGAGACGTCC TTCCTCAACTCTGTCGTAGAAGCCCTGAGGCACTGTAGAAATTAAGCAGGCACTCAATTC GTTTAAGAAACTATGATCTGGCACCATCCCGTGCTTTGAAAGCCTGAGCTTGTGTTTTAT ATAGCTTTCCACAAACTTTGAGAAGCCCCACCTCTGTAAAATGTGTAGCAATGAGATACT ATAAAAGAGTACATTAGACTAAGATTAATAATAAATTACCAGAGGCGAGAGAATTGTAGC AATGAGATATAAAAGAAGGCCTTCACCAGGTTTATGCACTGTAAGTTCTGAGAATCTATT CAAATAGAGTTTTGCCATTGGGAATCCCCAAGGGAAATAATCAGGAACGTTCCAATGTGG TGTCCTGACTACTACGGTGCACGGACGTTCAACCCCTGCAGAATTGATTTTTTATCAAGA GAAGAAAACAAAAGGTGAAGAATTGAATTTTGTTGATACCATTTACTGTGGAGGACTCCA TGGCAATGTCCAGTCCTGATTTTTGGAATCCAACGACCGCTACATGTTTTCCTTTGACAA ATTCGGTTGCAGTTGTGGAGTCCATCTTTGAATAATCCATTGAATGGATTACTTTCCCTT CAAAAGCTTCAGGACCTTTGTTTTCAGGGAATTCAGGAATGTTTGGAACTTGACTGAACC TTCCCACACAAACTACTACATAATCGACTTGGTATACCTAAAAAAAGACTTCCATTTTAT TTTTATCTTAGATCTTATTTAATAAAATCCAACCTATAATATTAAATAGAATTCCAAATA TACTTATCATTCTTGACAAATCAAAATATATTTGGTAATTCTATGAGAATTTGATGCTTC AGTTAGGGCGAAATTTTTTATCCAAATCTCAATGAATTGAATAGATATTTATGATAAAGC ATAACTATTTGAGGGTTACCTTTGTGGATAGGGTTTGAGTTTGTTGTACAGTGACGTTCC ATTTGCCTTTAGACATCCATTCTCTATCATCTTCATCTTCATAGCTAAGGCTCAATACTT TGTTATTGAACTGAATGTGTCTCACCAAATCAAAGTGACGTGCATAGGATTTAATGTACT CCAACACGGTGTGTTGATCGGGGAACACTTGGGTTACGGAATCTGGCCATGGAAAATCAG AGAATTGGTAAAGGGGTTTTGGTGTCTGCAGTTTAGTGCTCTCAATCGTCTTGCTCCAAA CACCTCCGATGCTACTTTCTGACTCGAACACAATTGGATCAAATCCTTTAGAAATTGCAT ATTTACAGGCCAAGAGACCGCTAATTCCACCTCCAATTATTGCAATCCTTCTCCCATCAC AATTTGCCATTCTCTCTTACTTGCCGATTGATGGTTCAGTTTTAGGAACACTATTTATAA CAACACTTATCATTAATCTTATATTTATTTTTAACAAAACTCTTATAAAAAAATATAAAT ATATAAGGAAAGGTTTTCTTTTTCTTCTAACAATGAAGGAGACTCCAAAAACTATTGCGC GATATACACAAAACTTAATACTCTTTTTTTTA