Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g112050.3.1
CDS Infomation	DUF630 family protein, putative (DUF630 and DUF632) (AHRD V3.3 *** AT1G21740.1)
Sequence	ATGGGGTGCGCAACCTCTAAGCATGATGACTTGCCGGCGGTCGCTCTATGCCGTGAACGT TGTGCCTTTTTAGACCAAGCTATTCACCACCGTTACGCTTTTGCGGAAGCCCATCTAGCT TATCTTCACTCATTGAAATCCGTCGGCGCTTCTCTTCACCGGTTTTTCCAAAATGATCTC GATCTTTCCACTTCATCATCGGGTAGTCCTCTTTCCCCGATTCTCCCTCATCCCAAAGAT GAAACTTCCTCTGCCCTTCCTCATCCAGTTAAAAAAATTCACCATTCTCACTCTAGTTCC GGTTCACACCTTCACTTCCACTCGGAATCCGACGAAGATGATGATTCCGGTTCCGACTCT TTGCATCACCATACGGAAACCCCTACTCATGGTCAGTTCACTTATGGTGATCATCAAAAC CTAGGGTTCGGAGCACCACCATATCAAGTTGGTGGCGTCGGTGGGTTCGGACCACCATAT CAAGTCGCCGGGGCCGGTGGATTCGGACCACCATATCAAGTCGCTGGGACCGGTGGATTC GGGCAACCATATCAAGTCGGTGGTGGGTTCGGAGCACCATATCAAGTTGGTGGTGGTGGT GGGTTCGGGGCACCCTATCAAGTTGGTGGTGGTGGGTTAGGCGCACCATATCAAGATGGT GGTGGTGGTAGTGGAGGGTTTATGCATATGAATTACATGAGGAAACAAACGACGCCCTCG GTGACCTATCATCAACGACCCATAAGTCCGGAGACTGTTCGTATGGGTGAAGCGTCTTCT TCCTATTATCCTTATCCTTATCCCAATAGTAGTAACCCTAATTCTTACAACTATCCGAAT TATCCCAATTACGCTGGTGAGTTTTTTTCCTCGTCCATTCAAAGGCCGTATGGTGATTCA TCTCCACCGGCGCCATCTGGAGCTGGGCCTTCGTCAGCGCCTTCTACTTCAAAACCGCCT CCTCCGCCACCCTCTCCACCGAGGAGCTCACCTTGGGATTTTCTGAACCCTTTTGAGACT TTTGAGAGTAATAATTACCCTACACCATATACGCCAAGCCGAGACTCGAGAGAGGTTAGG GAAGAAGAAGGTATCCCTGATTTGGAAGACGAGGATTTTGAGCACGAGGTTGTTAAGGAA GTTCATGGACATCAGAAGTTTGTCGAAGGCGAAAGTGAAGTTCACGGAGGGAACCATTCA AAGGCAGTGGCAGAGGAGGAGAGAGAGAAGCAAAGTGATTCGGAGTCGCTATACCATGGG AGGCCAAGTGCGTCAATGGAAAATGAGCAGGTGGAGTTTGAGGTACACGTTGTGGATAAG AAAGTGGTAGATGAGGAAGGGAAGTCAGGGCATGGGGGAAATGTTGCTGGGTTCAAAGCT CGTGCATTCAAGGACGACTCTGATGTTGTGAAAGAGATTCAGGTTCAGTTTGAGCAAGCT TCTGAATCTGGAAATGAGCTTGCTAAGATGCTGGAGGTTGGAAAGCTTCCCCACAATCGT AAGAACGCCACATATCAAGTGTCTTCCAAGATGTTGCATGCAATTTCACCTTCATTGTCC GTAGTGTCGTCACAACCTTCTACGTCAAACAATGCTGCAATTCAGATTAATGATCCTGCT GCTTTAGATGTGGAAGGAGATGTAAGTTCAAGGTACAAGAACCTTTCTTCAACGTTAAAC AAGCTGTACCTCTGGGAGAAGAAACTGTATCAGGAGGTTAAGTCTGAGGAGAAGATAAGG GTGCTTCATGAAAGGAAATCTGAAAAGCTGAAGAGGCTAGATCAAAAGGGTGCTGAGGCT CACAAGGTTGACATGACAAGACAATTGGTTAGAAGTCTCTCCACAAAAATTAGAATTGCG ATTCAGGTTGTCGATAAGATTTCTGAGAAGATAAACAAGATGAGGGATGAAGAGTTATGG CCGCAACTGAATGTACTTATTCAGGGGTTAAGTAAAATGTGGAAAGGCATGCTTGAGTGT CATCGTAACCAATGCCAGGCTATTGGAGAAGCCAAAAGATTAGATGCCATTGCATCTCAC AAACACTTGAGTGATGCTCATCTTGAAGCCACTCTGCAGCTTGAACATGAGCTTTTGAAC TGGACTTTGAGATTCTCTTGCTGGGTGAATGCACAGAAGGGCTATGTGAGAGCACTAAAC ACTTGGCTCATGAAATGTCTTCTGTATGTGCCCGAGGAAACAGCCGATGGAAGAGTTCCC TTTTCTCCAGGCAGAATTGGTGCTCCCCCAATTTTTGTCATCTGTAATCAGTGGTCACAA ACCATTGAAGGAGTTTCTGAGAAAGAGGTTATTGACTGTATGCGAGATTTTGCATCAAAT GTCCTTCAACTCTGGGAGCGAGATAAGCATGAAATGCGGCAAAGGATGATGGTGCACAAG GATATGGAGAGAAAAGTGAAGAACCTTGAGAGGGAGGATCAGAAGATACAAAAGGGGATT CATGCACTGGACAAAAGAATAGTACTCATTTCTGGGGATGAAACTGGTCTCTCATTAAAT AGGCATGTCGTTTACCAGAGTGACACAAGCAAAAATAGTAGCCTTCAGGTCGGTCTGAGA CATATTTTTGAGGCCATGGAAAGGTTTACTGCCAAATCCTTGAAGGTGTATGAGGAACTT CTACAACGCATTGAAGAGGATGATCTGGCTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g112050.3.1
PEP Infomation	DUF630 family protein, putative (DUF630 and DUF632) (AHRD V3.3 *** AT1G21740.1)
Sequence	MGCATSKHDDLPAVALCRERCAFLDQAIHHRYAFAEAHLAYLHSLKSVGASLHRFFQNDL DLSTSSSGSPLSPILPHPKDETSSALPHPVKKIHHSHSSSGSHLHFHSESDEDDDSGSDS LHHHTETPTHGQFTYGDHQNLGFGAPPYQVGGVGGFGPPYQVAGAGGFGPPYQVAGTGGF GQPYQVGGGFGAPYQVGGGGGFGAPYQVGGGGLGAPYQDGGGGSGGFMHMNYMRKQTTPS VTYHQRPISPETVRMGEASSSYYPYPYPNSSNPNSYNYPNYPNYAGEFFSSSIQRPYGDS SPPAPSGAGPSSAPSTSKPPPPPPSPPRSSPWDFLNPFETFESNNYPTPYTPSRDSREVR EEEGIPDLEDEDFEHEVVKEVHGHQKFVEGESEVHGGNHSKAVAEEEREKQSDSESLYHG RPSASMENEQVEFEVHVVDKKVVDEEGKSGHGGNVAGFKARAFKDDSDVVKEIQVQFEQA SESGNELAKMLEVGKLPHNRKNATYQVSSKMLHAISPSLSVVSSQPSTSNNAAIQINDPA ALDVEGDVSSRYKNLSSTLNKLYLWEKKLYQEVKSEEKIRVLHERKSEKLKRLDQKGAEA HKVDMTRQLVRSLSTKIRIAIQVVDKISEKINKMRDEELWPQLNVLIQGLSKMWKGMLEC HRNQCQAIGEAKRLDAIASHKHLSDAHLEATLQLEHELLNWTLRFSCWVNAQKGYVRALN TWLMKCLLYVPEETADGRVPFSPGRIGAPPIFVICNQWSQTIEGVSEKEVIDCMRDFASN VLQLWERDKHEMRQRMMVHKDMERKVKNLEREDQKIQKGIHALDKRIVLISGDETGLSLN RHVVYQSDTSKNSSLQVGLRHIFEAMERFTAKSLKVYEELLQRIEEDDLA*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g112050.3.1
Transcript Infomation	DUF630 family protein, putative (DUF630 and DUF632) (AHRD V3.3 *** AT1G21740.1)
Sequence	ACGGCTTATTCATTCATATCAAATGAGTATCAATATATGCTGGAAACGGAAGAGAGATAC ACCAAAAACATCTTTTCTTTTTTTTCCCTTTTGAAAATATATTCATTCATTGAATTATAA AACTTTAGTACTCAGATTATCACTATTTATTTTCGTCCAGAATCATATTATAGTAATTTT TCATGTGTTTATTAACATACATATTTAATTTATGCGAATATCCATTGAAATTAATTGGCC GATTAGTCTCAATTACAACTCTTAATTATAGAAATGGCTATTCGATACGGTATTTTGCTT GCAATTTTAACTCTTTTAATCATCATTTGTTATAAGTTAAATGCCCCTAATGCAACAATT TTCAAAAAAAAGTGAAGAAGAACATAAGTAACCTATTAAAGTCATGATAAATGTGTGAAT ATGTCAATGCATATAGAGTTTAGGAAAATGGTAAAACTTACCCTTTAAATTAATGAAAAG GTCATAGTTAATCTTTTGTTAATAGTTGGATTAGATCTACAACTTTCATCTCACTAGTTA ATCTTATTATACATAATATAATAATAGTTGGCTAAGGATAATAGTTTTACAACGAGAGAC GAGAGTCAAATTTATGTGCAATTAGTACTACTATGAAATTTGTTGTGGACTAAATTGTGT TATACTATCAATAGGAGTGTCAAATGGACTAAGCAAAGAAGATAGAATCAATAAATAAAC GAGTCATTACTTCAATTGAAATAAATTAAACTGAATTGAATAAACAAATCCGCTTAATTT TTGTTCATATAATTTTTTGTGCATAAATAGCATATCAAACAAATAAAACAATCCCCTCTA TAAATATCCTTTTCAACTGGTGCCTTGCTGCTTCTTTTTTCAACCTATCGTCCTTTTCTT AATAACTATTCCTCTTTTTTTTCTTCTTAGTGCTAAAAAGATGAAAATTTCATTATCCGC CCAGATTTCATTAATAGTGATAAGTTCGATTTTGAAAAATTAAAGATTTTGTAAGATATG TAAATGCCCAATACAATTTCGATCGATGAGGTTTTCAATTAGCAAATATATTAACACAAC TTTTATATGAACTGAAGTGAATAAATTGAGTTAACAAGTAATAACTTACCCAAAACTTTC TTTTTTTAAAATATATAACAATGGTAGAGTTTTGAGAGGTGGGGCATGAAGAGTGAAAAT AGGGTCAAATAATTTGCATAAAATGGCAAAAAGAAAAATGGTATAACAGTGATTGTGGAG ATTTTTTTTTTTTGAATGATTCAATGAGTGATAAGTCCTGAAATAAAGAAACTTTATAGC ATTTCACTGTCACATTTAATCCAATCATTACTACTACCTCATTCATGCATATTCAATTTT AATAAAGACTTGCAGATTTCCCCAAGTTTTTCATTTGGTCCTCAAACGTCCAGTTTTGGT ATAAAACTTTGTTGCCCATGAAAATACTATTTTTTCAATGTTTGAATTGATTAATTAGTG GAAAATGTTTTATGCTTGTAGATCGATAATAGTCGATCATTGGCTCTTGCAAATTAAACT AGAATATATACACCAATCCCTCTTTGTCATTTTCATGCCCAAATAAAGATACCTAACTTT TTTTTTAAAGTAAGGGCATTTAAAAAATTATATGACATTTTAATGGTAAAAAGGCATCTA ATATTTAGTTTTCTATTTTAAGGTTATCTTATTGATGAAGGTTTAAAAGTATGACTCTAT TGGACCTAGGATATACGGAATTAGATTGACTTGGACTTATCTTTGTGTTTGGTAAGTAAC AAGAATGTTACCTATAATTTAAAAACTTTATTTGCTTTTATTTTTTCTAAAGACGTTTCC AAATGCATTTTACCACATGGTAGAGTTTTGACCAAACTAGGAGACTAGTCCAATTTGAAT GCAACAACCTTCCATTTCCACATATACACGCTTACACTTTTTCCTTTTTATTTATTACTA ATGTTCACCAAAATAATAAATTTATTGCTGTTCACCAAGTTATTTTTTTGTTGTTAATGA GCTAGTAGGTTAGGTTAACCATTGAAATTGCATGTTAAATGCCATTTTTAATCAGCAAAA AGTAAAGAGTAGCAATAATAATGGTATTCGTCGGAGCAGCCATTTTTCTCTTTATATAAA CGGACGAATTCTCTGCTGGCAAAGATTCCCTCTAGGATGCTTCTTTCTCTTTACCCTTCA TTCATCCATCCATCCCTCTCTCACTATGACTTCTTTTCCCTTTTTACTTAATTACTAATT CCCCAATTTTAAATTATGGGGTGCGCAACCTCTAAGCATGATGACTTGCCGGCGGTCGCT CTATGCCGTGAACGTTGTGCCTTTTTAGACCAAGCTATTCACCACCGTTACGCTTTTGCG GAAGCCCATCTAGCTTATCTTCACTCATTGAAATCCGTCGGCGCTTCTCTTCACCGGTTT TTCCAAAATGATCTCGATCTTTCCACTTCATCATCGGGTAGTCCTCTTTCCCCGATTCTC CCTCATCCCAAAGATGAAACTTCCTCTGCCCTTCCTCATCCAGTTAAAAAAATTCACCAT TCTCACTCTAGTTCCGGTTCACACCTTCACTTCCACTCGGAATCCGACGAAGATGATGAT TCCGGTTCCGACTCTTTGCATCACCATACGGAAACCCCTACTCATGGTCAGTTCACTTAT GGTGATCATCAAAACCTAGGGTTCGGAGCACCACCATATCAAGTTGGTGGCGTCGGTGGG TTCGGACCACCATATCAAGTCGCCGGGGCCGGTGGATTCGGACCACCATATCAAGTCGCT GGGACCGGTGGATTCGGGCAACCATATCAAGTCGGTGGTGGGTTCGGAGCACCATATCAA GTTGGTGGTGGTGGTGGGTTCGGGGCACCCTATCAAGTTGGTGGTGGTGGGTTAGGCGCA CCATATCAAGATGGTGGTGGTGGTAGTGGAGGGTTTATGCATATGAATTACATGAGGAAA CAAACGACGCCCTCGGTGACCTATCATCAACGACCCATAAGTCCGGAGACTGTTCGTATG GGTGAAGCGTCTTCTTCCTATTATCCTTATCCTTATCCCAATAGTAGTAACCCTAATTCT TACAACTATCCGAATTATCCCAATTACGCTGGTGAGTTTTTTTCCTCGTCCATTCAAAGG CCGTATGGTGATTCATCTCCACCGGCGCCATCTGGAGCTGGGCCTTCGTCAGCGCCTTCT ACTTCAAAACCGCCTCCTCCGCCACCCTCTCCACCGAGGAGCTCACCTTGGGATTTTCTG AACCCTTTTGAGACTTTTGAGAGTAATAATTACCCTACACCATATACGCCAAGCCGAGAC TCGAGAGAGGTTAGGGAAGAAGAAGGTATCCCTGATTTGGAAGACGAGGATTTTGAGCAC GAGGTTGTTAAGGAAGTTCATGGACATCAGAAGTTTGTCGAAGGCGAAAGTGAAGTTCAC GGAGGGAACCATTCAAAGGCAGTGGCAGAGGAGGAGAGAGAGAAGCAAAGTGATTCGGAG TCGCTATACCATGGGAGGCCAAGTGCGTCAATGGAAAATGAGCAGGTGGAGTTTGAGGTA CACGTTGTGGATAAGAAAGTGGTAGATGAGGAAGGGAAGTCAGGGCATGGGGGAAATGTT GCTGGGTTCAAAGCTCGTGCATTCAAGGACGACTCTGATGTTGTGAAAGAGATTCAGGTT CAGTTTGAGCAAGCTTCTGAATCTGGAAATGAGCTTGCTAAGATGCTGGAGGTTGGAAAG CTTCCCCACAATCGTAAGAACGCCACATATCAAGTGTCTTCCAAGATGTTGCATGCAATT TCACCTTCATTGTCCGTAGTGTCGTCACAACCTTCTACGTCAAACAATGCTGCAATTCAG ATTAATGATCCTGCTGCTTTAGATGTGGAAGGAGATGTAAGTTCAAGGTACAAGAACCTT TCTTCAACGTTAAACAAGCTGTACCTCTGGGAGAAGAAACTGTATCAGGAGGTTAAGTCT GAGGAGAAGATAAGGGTGCTTCATGAAAGGAAATCTGAAAAGCTGAAGAGGCTAGATCAA AAGGGTGCTGAGGCTCACAAGGTTGACATGACAAGACAATTGGTTAGAAGTCTCTCCACA AAAATTAGAATTGCGATTCAGGTTGTCGATAAGATTTCTGAGAAGATAAACAAGATGAGG GATGAAGAGTTATGGCCGCAACTGAATGTACTTATTCAGGGGTTAAGTAAAATGTGGAAA GGCATGCTTGAGTGTCATCGTAACCAATGCCAGGCTATTGGAGAAGCCAAAAGATTAGAT GCCATTGCATCTCACAAACACTTGAGTGATGCTCATCTTGAAGCCACTCTGCAGCTTGAA CATGAGCTTTTGAACTGGACTTTGAGATTCTCTTGCTGGGTGAATGCACAGAAGGGCTAT GTGAGAGCACTAAACACTTGGCTCATGAAATGTCTTCTGTATGTGCCCGAGGAAACAGCC GATGGAAGAGTTCCCTTTTCTCCAGGCAGAATTGGTGCTCCCCCAATTTTTGTCATCTGT AATCAGTGGTCACAAACCATTGAAGGAGTTTCTGAGAAAGAGGTTATTGACTGTATGCGA GATTTTGCATCAAATGTCCTTCAACTCTGGGAGCGAGATAAGCATGAAATGCGGCAAAGG ATGATGGTGCACAAGGATATGGAGAGAAAAGTGAAGAACCTTGAGAGGGAGGATCAGAAG ATACAAAAGGGGATTCATGCACTGGACAAAAGAATAGTACTCATTTCTGGGGATGAAACT GGTCTCTCATTAAATAGGCATGTCGTTTACCAGAGTGACACAAGCAAAAATAGTAGCCTT CAGGTCGGTCTGAGACATATTTTTGAGGCCATGGAAAGGTTTACTGCCAAATCCTTGAAG GTGTATGAGGAACTTCTACAACGCATTGAAGAGGATGATCTGGCTTAAAGAGCATGAGAA ATTGGTATAGCCGCTACCTTGAGAAGGTTATGTCTTCCAGACAGAGGACAATGTGAAATG GAGCAACGAAAACCTTGTTGTCTTTCTCTGCTCTTGCTGTAGCATCATCACAGCTGATCA GTTTCAGTTCGGTAAGCGGGGTCATGGAAGAGGTAATTCCTGATGATGTGCCTTTTGTGG TTGTTGCAATGGCATCTTTTTGCCAATGTCAGAACAGATATTCTTGAATCTCCTGTGTTA GAAGTCTCCCCGGATGTTGAATATTGCAGTAATTGATGCATCAGCAAGTATCCTGTTTTT CAGTGGTAAGGATCCATGCCAGACTGGCTGTGAACCTGAAACAAGATGATTAAATACCCT AGGATGGCCATCAATCCTCAAGTCACTAATGTGCTTACAAAAGGGGACCTGAGCTAGTGG AGATGTATAAATTCTAAAATGCTATGACTACTCTGGGGCTAAATGCAAGTATATTTATGG TTGGGGACATTATATGACATGCTATGACTACCTTGATGATTGTTAGAGATATATGTGCTA CGGCAGGCCATGTTCATGTATAGATTGGCTGCACTCTTGTGATAATTGCAAATAAGCGAA GTAGGGGTGGTATCTCTAAACTGTAAGCAGCAGGGGCCATCTAAGGAAAAAAAAGCATGA AGAATGGCTTATTATAGTTGGGCGTTTTTCAGTTGGATTGATGAGAAGAAGCTGTTTGGT AACACAAGTCATTGAGACTGCTGGTTGTCTGGCACCAGACCTGCCTGAGAACAGAGAGAT AATACTTGTAACTTGTAAGTAAGTTGTATTCAGATTGTTCTTTAAATTCTGATAATAATC TGTGTCTTA