Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc01g111370.3.1

CDS Infomation

Choline transporter-related family protein (AHRD V3.3 *** B9HR78_POPTR)

Sequence

ATGGAAACCAGTGAAGACCCAAACAAGCTTTCTTCTACTCTTGCTGACCCAACCACACAA
CCCCTTCTCTCCAAACCTTACCCTGTTGATGATTCAATAACACCCCATCAATACCCTGGA
CAATCTTCTTTAGACCCAGATGATCAAACTCAGTTCCTTCAGATCTCTTACAATTTTGGA
ACTCGACCCTTTAAGGACCTTCCTTTTCTTATCCTTTTTGTTCTTCTTGTTCTTTGCACT
TTTGGTTTTGGTATCTTTGCTTCTGTTCATAGAAATCCTCATCACTCTCAAATTTCATCT
TTTACCTACAATATCACCTCATCTTCTTGTAGTATTGGGAGTTCTACCTCTGAGAGCTCT
AGTGACTTCTTTTCACTTTACTCATCTGATTCTAGTTTCTTGAAGAGTTTGATATGGACC
CTTGTGGTTACTTTAATTCTAAGCATACCCTTTATGCTTTTTGTGCTTTTCTTGCTCAAG
CGCTATACAAAGCAGATAGTTTATGCTTCACTTCCCTTTTTTGTAATTGTCCCTGTTTTT
CTTGACATCTACTGGTTTGTTGCTTGTACTGTGAGCTCCAAATGTAGTGAGGATTTCCCT
TTGGCTTATAGAATTTTGGTACTGTTTTTCGTGTTGTTGTTAATTGGGCTACTTGTTTGG
ATTTTCGTAGCAAATTGGCACAGGATCGAGTTGACTATTAAGATTATTGGGGTTGCTTCT
TCTGCCCTTTCAAGTAATTTGGGGTTGTTTGGAGTGCTTCCATCATTGACTTTGGGGCTG
TTAGCTTATTATGCACCCATTGTTGTTTTCTTGGTGTTTGCTAGGCTTAATGGACAAGTA
GTACCCAAGGAAAAACATGGGGAGTATTATTGTGTATGGAAACAGGATAGCTGGGTTCCT
GCTTATTACACATTTGCAATTCTAACCATGCTTTGGTCAGCCACATCAATGATTGAGGCA
CATGTTTATGTCATAAGTGGAACAATTGCACAATGGTACTTCTCCAAGGATGAATCAGGT
CCCAAAAGGTCTATGAGAAGTGCTTTGAGAAATGCATTTGGTCCATCCTCAGGCACAGTA
TGTTTCTCTGGGTTACTGATTGCTGTGGTTCGTGTTGTTCGTTCCATAGTTGATAATGCA
AATCAAGAAGATTCTGGAATTGTGAACCTTATTCTGCGATTTTGTGCCAATACCTTGCTG
TCAGCGGTTGAGTTTGTGAATAAATTCACCATAAACTTTGCTGCTATAACTGGTGAAGCA
TACTGCACTTCTGCTAAGATGACATATGAACTTCTAAAGCGCAATCTTCTCTCTCCAGTG
TTTGTGGAGACCGTCTCCACTCGTTTACTGGCTGGAATAATCTTTGTTCTCTCAACAATA
TATGCAATATTGGTTTTTGTTGTGGTAAGAGCTGCTAGTAATCTTGATGTCGAATCATAC
CTTATTGCTGTTCTGGCATGGCTGCTACTGATGGTGATTCTTGGTTTCTTCGTCTTTGTT
TTGGATAACGTTATAGACACAGTATATGTTTGTTATGCGATTGATAGAGACAGAGGAGAG
GTATGTAAACAGGAGGTTCATGATGTTTATGTGCACCTTCCTATCAGTAGGAGTCATAGT
TCTGCCTCTTATGGTGCCAGAAGTCCCCTGCTTGTATAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc01g111370.3.1

PEP Infomation

Choline transporter-related family protein (AHRD V3.3 *** B9HR78_POPTR)

Sequence

METSEDPNKLSSTLADPTTQPLLSKPYPVDDSITPHQYPGQSSLDPDDQTQFLQISYNFG
TRPFKDLPFLILFVLLVLCTFGFGIFASVHRNPHHSQISSFTYNITSSSCSIGSSTSESS
SDFFSLYSSDSSFLKSLIWTLVVTLILSIPFMLFVLFLLKRYTKQIVYASLPFFVIVPVF
LDIYWFVACTVSSKCSEDFPLAYRILVLFFVLLLIGLLVWIFVANWHRIELTIKIIGVAS
SALSSNLGLFGVLPSLTLGLLAYYAPIVVFLVFARLNGQVVPKEKHGEYYCVWKQDSWVP
AYYTFAILTMLWSATSMIEAHVYVISGTIAQWYFSKDESGPKRSMRSALRNAFGPSSGTV
CFSGLLIAVVRVVRSIVDNANQEDSGIVNLILRFCANTLLSAVEFVNKFTINFAAITGEA
YCTSAKMTYELLKRNLLSPVFVETVSTRLLAGIIFVLSTIYAILVFVVVRAASNLDVESY
LIAVLAWLLLMVILGFFVFVLDNVIDTVYVCYAIDRDRGEVCKQEVHDVYVHLPISRSHS
SASYGARSPLLV*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc01g111370.3.1

Transcript Infomation

Choline transporter-related family protein (AHRD V3.3 *** B9HR78_POPTR)

Sequence

TCCCATTCTCTTCTTTCTTCTTCTCAATCTAACTTCCGCTAACCCCAAGAAAGATTCTTG
ATTTTTCCGCCATGGAAACCAGTGAAGACCCAAACAAGCTTTCTTCTACTCTTGCTGACC
CAACCACACAACCCCTTCTCTCCAAACCTTACCCTGTTGATGATTCAATAACACCCCATC
AATACCCTGGACAATCTTCTTTAGACCCAGATGATCAAACTCAGTTCCTTCAGATCTCTT
ACAATTTTGGAACTCGACCCTTTAAGGACCTTCCTTTTCTTATCCTTTTTGTTCTTCTTG
TTCTTTGCACTTTTGGTTTTGGTATCTTTGCTTCTGTTCATAGAAATCCTCATCACTCTC
AAATTTCATCTTTTACCTACAATATCACCTCATCTTCTTGTAGTATTGGGAGTTCTACCT
CTGAGAGCTCTAGTGACTTCTTTTCACTTTACTCATCTGATTCTAGTTTCTTGAAGAGTT
TGATATGGACCCTTGTGGTTACTTTAATTCTAAGCATACCCTTTATGCTTTTTGTGCTTT
TCTTGCTCAAGCGCTATACAAAGCAGATAGTTTATGCTTCACTTCCCTTTTTTGTAATTG
TCCCTGTTTTTCTTGACATCTACTGGTTTGTTGCTTGTACTGTGAGCTCCAAATGTAGTG
AGGATTTCCCTTTGGCTTATAGAATTTTGGTACTGTTTTTCGTGTTGTTGTTAATTGGGC
TACTTGTTTGGATTTTCGTAGCAAATTGGCACAGGATCGAGTTGACTATTAAGATTATTG
GGGTTGCTTCTTCTGCCCTTTCAAGTAATTTGGGGTTGTTTGGAGTGCTTCCATCATTGA
CTTTGGGGCTGTTAGCTTATTATGCACCCATTGTTGTTTTCTTGGTGTTTGCTAGGCTTA
ATGGACAAGTAGTACCCAAGGAAAAACATGGGGAGTATTATTGTGTATGGAAACAGGATA
GCTGGGTTCCTGCTTATTACACATTTGCAATTCTAACCATGCTTTGGTCAGCCACATCAA
TGATTGAGGCACATGTTTATGTCATAAGTGGAACAATTGCACAATGGTACTTCTCCAAGG
ATGAATCAGGTCCCAAAAGGTCTATGAGAAGTGCTTTGAGAAATGCATTTGGTCCATCCT
CAGGCACAGTATGTTTCTCTGGGTTACTGATTGCTGTGGTTCGTGTTGTTCGTTCCATAG
TTGATAATGCAAATCAAGAAGATTCTGGAATTGTGAACCTTATTCTGCGATTTTGTGCCA
ATACCTTGCTGTCAGCGGTTGAGTTTGTGAATAAATTCACCATAAACTTTGCTGCTATAA
CTGGTGAAGCATACTGCACTTCTGCTAAGATGACATATGAACTTCTAAAGCGCAATCTTC
TCTCTCCAGTGTTTGTGGAGACCGTCTCCACTCGTTTACTGGCTGGAATAATCTTTGTTC
TCTCAACAATATATGCAATATTGGTTTTTGTTGTGGTAAGAGCTGCTAGTAATCTTGATG
TCGAATCATACCTTATTGCTGTTCTGGCATGGCTGCTACTGATGGTGATTCTTGGTTTCT
TCGTCTTTGTTTTGGATAACGTTATAGACACAGTATATGTTTGTTATGCGATTGATAGAG
ACAGAGGAGAGGTATGTAAACAGGAGGTTCATGATGTTTATGTGCACCTTCCTATCAGTA
GGAGTCATAGTTCTGCCTCTTATGGTGCCAGAAGTCCCCTGCTTGTATAAGGACTTCAAT
GTGTTGTAGTCTGTCTGTAATTCTTTTTCTCCTTTTTGGTTTCGGTTTCCCTTTGTAATT
GCCGGATTGTCCTGTTAGGCAGGTTGTGCAGCGAGGTAAATTTATTCTGTATAACAGTGT
TTTTCCAATAAAAATGAAAATATCTGCTGACTGTGCGATGATCTCTATAGTTAGGGAATA
AGTAGTCTTGAGAGTTGACATTACTGAATCAGTTATATCTGTTTAGTTTTTTTTACCAAA
AGAACTTCCTATGGTTTCTATTCTTATTCTTCGATTTTTATTATCTGTTGTTTTTAAACC
TTTGCTTAGGTTGTTTTATCAAGTATTTGTTGTTGCTACTGTTCTATTTCC