Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g111220.3.1
CDS Infomation	Amidase family protein (AHRD V3.3 *** B9H162_POPTR)
Sequence	ATGAACGTTTCCGCATTACTTACTCTTACGGCTATCTCACTTTTTGGGTGGTCGTATATT GATACTTGCCATGCATTCTCGATCAAAGAAGCTAGCATTAGTGATCTTCAGCTTGCTTTT ATCCAAAACCAGCTTACATCGAGACAGCTCGTGGAGTTCTACCTAGGAGAAATTTCACGG CTAAATTCCGTTCTCAAAAGTGTCATTGAGCTAAATCCCGATGCACTCCTGGAAGCTGAC AGGGCTGACAGAGAGAGGAACGATGCAAAGGAGTCAGCAAGCTCTTTGTCAATGTTGCAT GGTGTTCCAATCCTTCTTAAAGATAACATTGCAACAAAAGATAAGCTTAACACTACAGCT GGATCATTTTCATTACTGGGATCAGTGGTGCCCCGTGACGCAGATGTAGTGAAAAAACTG AGAAGAGCAGGTGTGATTGTACTAGGGAAAGCTAGCCTCAGCGAATGGGCTCACACTCGG GCGCTAAAGGCGCCCAATGGCTGGAGTCCTAGAGGTGGACAGGGAAGGAATCCTTATGTT CTCTCCGCAGACCCTTGTGGCTCGAGTAGTGGATCTGCAATATCAGTGGCAGCAAACATG GTATCTGTGTCATTAGGTACAGAGACCCGTGGTTCCATCTTATGCCCGGCCAGCTCAAAT GCAGTTGTAGGCATCAAACCAACCGTTGGACTCACTAGCCGAGCAGGGGTGATCCCAGTT ACACCTAGACAAGACACTGTTGGACCAATTGGCAGAACAGTAACAGATGCTGTTCATGTT CTTGATGCCATTGTAGGCTTTGACCACAATGACGCAGCTGCAACTGCTGCAGCAGCTAAA TTCATTCCTCATGGTGGTTATACTCGATTTCTGAAAGTAGATGGCCTTAATGGCAAGCGC ATTGGAATAGTGAGAGACCCCTTCTTCAATTTCACTAATAATCCTGCCCTCGCTCAAGCT TTTGAGAAACATCTCCAAACACTCAGGCTACAAGGTGCAGTCTTGGTAGACAATGTGAAG ATAGCCAACCTTGAGACAATTTTAGACTTCAATCTGAGTGGTGAAGCATCAGCAGTATTG GCTGAATTCAAGATAGCCTTAAATGTTTATCTAAAAGAGCTAATCGATTCCCCTGTTCGA TCCTTATCAGATATAATAATCTTCAATCGAAAAAATCCCCAACTGGAGATGCTAAAGGAA TTTGGTCAAGATATATTTTTGGCAGCTGAATCTACAAATGGAATTGGAGAAACAGAAATA AAAGCTTTGAGGAATTTATCAAGATTAACAAGAAGTGGATTTGTAAAGTTGATGAATAAG TATGAGTTGGATGCATTGGTGACTGCTGGCTCTAGTGTTGCTGCAGTTCTTTCAATAGGT GGATTTCCAGCAATTAGTGTGCCAGCTGCTTATGACAAAAGGGTGCCTATTGGCATTTGT TTTAGTGGGTTGAAAGGTTCAGAGCCTAAGTTAATTGAAATCGCCTATGGCTTTGAACAA GCAACTCTAATTAGAAAGCCTCCTACATTTTTGCCCTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g111220.3.1
PEP Infomation	Amidase family protein (AHRD V3.3 *** B9H162_POPTR)
Sequence	MNVSALLTLTAISLFGWSYIDTCHAFSIKEASISDLQLAFIQNQLTSRQLVEFYLGEISR LNSVLKSVIELNPDALLEADRADRERNDAKESASSLSMLHGVPILLKDNIATKDKLNTTA GSFSLLGSVVPRDADVVKKLRRAGVIVLGKASLSEWAHTRALKAPNGWSPRGGQGRNPYV LSADPCGSSSGSAISVAANMVSVSLGTETRGSILCPASSNAVVGIKPTVGLTSRAGVIPV TPRQDTVGPIGRTVTDAVHVLDAIVGFDHNDAAATAAAAKFIPHGGYTRFLKVDGLNGKR IGIVRDPFFNFTNNPALAQAFEKHLQTLRLQGAVLVDNVKIANLETILDFNLSGEASAVL AEFKIALNVYLKELIDSPVRSLSDIIIFNRKNPQLEMLKEFGQDIFLAAESTNGIGETEI KALRNLSRLTRSGFVKLMNKYELDALVTAGSSVAAVLSIGGFPAISVPAAYDKRVPIGIC FSGLKGSEPKLIEIAYGFEQATLIRKPPTFLP*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g111220.3.1
Transcript Infomation	Amidase family protein (AHRD V3.3 *** B9H162_POPTR)
Sequence	ATGAACGTTTCCGCATTACTTACTCTTACGGCTATCTCACTTTTTGGGTGGTCGTATATT GATACTTGCCATGCATTCTCGATCAAAGAAGCTAGCATTAGTGATCTTCAGCTTGCTTTT ATCCAAAACCAGCTTACATCGAGACAGCTCGTGGAGTTCTACCTAGGAGAAATTTCACGG CTAAATTCCGTTCTCAAAAGTGTCATTGAGCTAAATCCCGATGCACTCCTGGAAGCTGAC AGGGCTGACAGAGAGAGGAACGATGCAAAGGAGTCAGCAAGCTCTTTGTCAATGTTGCAT GGTGTTCCAATCCTTCTTAAAGATAACATTGCAACAAAAGATAAGCTTAACACTACAGCT GGATCATTTTCATTACTGGGATCAGTGGTGCCCCGTGACGCAGATGTAGTGAAAAAACTG AGAAGAGCAGGTGTGATTGTACTAGGGAAAGCTAGCCTCAGCGAATGGGCTCACACTCGG GCGCTAAAGGCGCCCAATGGCTGGAGTCCTAGAGGTGGACAGGGAAGGAATCCTTATGTT CTCTCCGCAGACCCTTGTGGCTCGAGTAGTGGATCTGCAATATCAGTGGCAGCAAACATG GTATCTGTGTCATTAGGTACAGAGACCCGTGGTTCCATCTTATGCCCGGCCAGCTCAAAT GCAGTTGTAGGCATCAAACCAACCGTTGGACTCACTAGCCGAGCAGGGGTGATCCCAGTT ACACCTAGACAAGACACTGTTGGACCAATTGGCAGAACAGTAACAGATGCTGTTCATGTT CTTGATGCCATTGTAGGCTTTGACCACAATGACGCAGCTGCAACTGCTGCAGCAGCTAAA TTCATTCCTCATGGTGGTTATACTCGATTTCTGAAAGTAGATGGCCTTAATGGCAAGCGC ATTGGAATAGTGAGAGACCCCTTCTTCAATTTCACTAATAATCCTGCCCTCGCTCAAGCT TTTGAGAAACATCTCCAAACACTCAGGCTACAAGGTGCAGTCTTGGTAGACAATGTGAAG ATAGCCAACCTTGAGACAATTTTAGACTTCAATCTGAGTGGTGAAGCATCAGCAGTATTG GCTGAATTCAAGATAGCCTTAAATGTTTATCTAAAAGAGCTAATCGATTCCCCTGTTCGA TCCTTATCAGATATAATAATCTTCAATCGAAAAAATCCCCAACTGGAGATGCTAAAGGAA TTTGGTCAAGATATATTTTTGGCAGCTGAATCTACAAATGGAATTGGAGAAACAGAAATA AAAGCTTTGAGGAATTTATCAAGATTAACAAGAAGTGGATTTGTAAAGTTGATGAATAAG TATGAGTTGGATGCATTGGTGACTGCTGGCTCTAGTGTTGCTGCAGTTCTTTCAATAGGT GGATTTCCAGCAATTAGTGTGCCAGCTGCTTATGACAAAAGGGTGCCTATTGGCATTTGT TTTAGTGGGTTGAAAGGTTCAGAGCCTAAGTTAATTGAAATCGCCTATGGCTTTGAACAA GCAACTCTAATTAGAAAGCCTCCTACATTTTTGCCCTAAAAATGTACTATTATTAAAAAA ATGTGTGTTACATTTGTTTTGTTGTGTGTACTTCTTATTTGAAATTTACCGATCCATGTA ACTCAATCTTAAGAGCAAAAAGAAAATCGAATTTGAATAATTGATGTTCGACAAAATCAA AAAGATATTTAATTTCTTTTCTAGATTTGCCCTTAAACATATTCATAATTCGATAAATAT AGTAGTACTTAATAATAAACATGTCAATCTAAAAAGAAAAAAAAAAGATCATAATTGAAG AGTATTTTTTGCCATCACCTTTAATGACGGTTGATTTTGGATGCTTTA