Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g109270.3.1
CDS Infomation	electron transporter, putative (Protein of unknown function, DUF547) (AHRD V3.3 *** AT5G66600.9)
Sequence	ATGCAGTTTACTTCATTCATGAAGACAATGGAGGAAGAAAAGATTAGTGAATTCTGCAAA TATTCACACCATCTTGATTTGGATACTGGGATAGAGAAGAACTATGTTGAGCTGAAGAAG AGACAATTACACGGCGGCAGACACCATGATTCTTCTAAAGAAGAGGTTGATCATGCTCAT GAGGATCTGGTTAAAGAAATTGCTCTTCTGGAGCTGAATATTATGTGTTTGGAGAAGTAT CTTCTTTCAATGTATCGGAGAACATTTGCCAAGCGATTAGAACCACTGTCCATGAAGGAT GATAGAACAAAAGCTAAGAAGTTTGCAGAAGTGAAGGAGAAAAATGACAAGTTGAAGGAA AATCCTGTTTTGGCAACTTTGAGTAATGCAATCAAAGAATGTGATGATGACAAACAAAGA TTAGTTGACTCAACCATTTTGAGATGTCACTCTTCCCTATCACATGCTGCTTGTTCCTTC AGAGCTTCACCTTCAGTTGCAGTTCTTGCTGATGCTGTAGACTCATACCATTCTATGCCT TTATCAATGCTGGAGCATGCTCAGCCATCAACTTCAAACAGGAGTCTCATGGAGCATCAG GTTACTAGTTGTTCTAATAATCTTCATCATGACTCGCCAAGCCGGTTGTCTGAGGAAATG ATCAAGTGTATTTCAGCCATATATTGTCAGCTTGCTGATCCACCTTTATTCCATCGCGAT TTAAGTTTATCTCCCATCTCAGTTTCATCATCCACACTTGAATCTTTTCCTCAAGCTCAG AGTGATATGAAGGGACGTCAATGCATAGAAAATTCACCTTCCAATTTGTTGAGCAATCCT TTCCACTTTGAAGATTCAAAGGGATTTAGTGGATTCATTGTTAGAATGGTTGAAGTGCAA CGGTTATGTCGAGATAGTCAGAGCTTAGATGGTGTTGAACAAATGCTGAAACGATTTCGG TACCTAGTCTCAAAATTGGAAGAAGTTGCCCCTGAAGAAATGAGACATGAAGAGAAACTA GCCTTTTGGATTAATGTCCACAATGCATTAGTAATGCATGCATTTTTGGTTCATGGGATT CCAAGAAGTAATCTCAAGAGAGCATCTTTACTTCTTAAGTCAGCTTACAATATTGGAGGG AATACAGTAAGTGTGGACATGATCCAGAATTCTATACTACAATGCCAGTTGCCTCGTCCC GGTCAGTGGCTTCAGTCATTGTTCTTTACGAAACAAAGATTTAAGGGTGGCGATGCAAGA AGAGGATATGCAATGGAGCATCCAGATCCTCGCCTACGCTTTGCTCTTTGCTCAGGAAAT CATTCTGATCCTGTGCTTCGTTTGTACACATCGAAGAGAGTATTCGAAGAACTAGAAGTG GCTAAAGATGATTACATTCAGGCAAACATAAGGGTACACAAAGAACAAAAACTAGTCCTT CCAAAGAATGTGGAATCTTATGTTAAAGAAGTGAATGTGAGTCCATCTGGTTTGTTCGAA ACTATAGAGCTGGCATTACCTTGTTATTTGAGGAAGAAATTTCAGCAGCCCGAGCAACGA AAGTTGTGGAAGAAAATTGATTGGATTCCTCACAACTTCAGTTTCAGATACCTTGTTTCA AGTGAATTGGTTGAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g109270.3.1
PEP Infomation	electron transporter, putative (Protein of unknown function, DUF547) (AHRD V3.3 *** AT5G66600.9)
Sequence	MQFTSFMKTMEEEKISEFCKYSHHLDLDTGIEKNYVELKKRQLHGGRHHDSSKEEVDHAH EDLVKEIALLELNIMCLEKYLLSMYRRTFAKRLEPLSMKDDRTKAKKFAEVKEKNDKLKE NPVLATLSNAIKECDDDKQRLVDSTILRCHSSLSHAACSFRASPSVAVLADAVDSYHSMP LSMLEHAQPSTSNRSLMEHQVTSCSNNLHHDSPSRLSEEMIKCISAIYCQLADPPLFHRD LSLSPISVSSSTLESFPQAQSDMKGRQCIENSPSNLLSNPFHFEDSKGFSGFIVRMVEVQ RLCRDSQSLDGVEQMLKRFRYLVSKLEEVAPEEMRHEEKLAFWINVHNALVMHAFLVHGI PRSNLKRASLLLKSAYNIGGNTVSVDMIQNSILQCQLPRPGQWLQSLFFTKQRFKGGDAR RGYAMEHPDPRLRFALCSGNHSDPVLRLYTSKRVFEELEVAKDDYIQANIRVHKEQKLVL PKNVESYVKEVNVSPSGLFETIELALPCYLRKKFQQPEQRKLWKKIDWIPHNFSFRYLVS SELVE*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g109270.3.1
Transcript Infomation	electron transporter, putative (Protein of unknown function, DUF547) (AHRD V3.3 *** AT5G66600.9)
Sequence	TGGATTTTATAAGGTGAGGCAATGAGTCACAAACTCACACGTGAGTGTTGGTCATCGATG TGTGCACCAAGAAAGTATTCACCCTTTAAAACAAAAGGATGCATGTTTGTCTTTTCTCTT TCAAAATATTTGTTCATCACCACTTTACAACTTTTAGAAAGAATGTCGTCTTTTCTTCTT TCAATTCACTGTTAAGTAATCATCAGAAATGCACATCCTCCCATGCATCTTACTAGATGT GACATACAATACAAAACATTCTATTACGATACACATTATTTGATTTGATTGATCTAAGTT TATATTATTTTACATTAGTAAAGAAAGAAGTATTTCTTTAGTTATCAAAAGTTTTCTCAT TTTTAAGATTAAGAGATTCATGATTTATGATAAAACTAAATCATAACGAATTATATTCAT ATCGTCACAATTTTTTTTACTATTACATAATATAATTACAACTTAAATTGTTTACAAATC AGAAAATTACTTACTAGACTAGTCATTTCAATTTGTCACATTCTTTTTGCAATTGCTTTG ACCTTCACCTTTCAGCCCTTTTTAGGTGATCTCTTGTTAGTGCATCTCCTTGAAGGATAA AGCCCACCAACTTACTTTTTTTTTTACTATATCCATTCCCTTTCCCCCACAACTACGTAC GTACTGATAAGATTTGTTCTCCCCCGTGATTGGATTTGGGTGATATATATGATCTGGTGT TATAATTAAATGAGGTATTGTGACGACCATGATAGAGGGGCAAGTCAGAAAAGGATTGAC AAATTTCTAATTTAAGAAGACCTGAAGCATATTGGATTAAAGCAGACAACATGTGTGATG AACTTGGATGGTGAGACATTACTTGGCTAATTAGTTTAACGAAATTACATATCGAATTCT AGTTAGCACATTAGCATTGTATATTTATATCATGATTAGTAACTATTGTATTGTTTTTTT GGGAACATGGTCATGTGTAAGCTAGGATGGGAGGACCCTTCAATTTATAAAATCAGTACT TCTTTGCTGTACATACATTAAATACGTTATACAATTTCGTTTTGTCATTTGGTAATGATT GGGTAAATGCATTAAAGGAAAAACTTTGGTACTTTTTTAGCATGGTGTATATTCCAAAGT CTAAAATGTGACTTTGTTGAAATAAAAAAGGTAACCAGCTAATTTACTTCTTTTAATGCA ACAAAAGGCTCCCGGTCCCTTCTCATATAAAGGTAGTATTGCTTTCTAAGTGACTAGTCA AAGCCTCACCAACAAAGAATAATATAGCATCCAAACTTCATCTAATAAAAAAATCTATGT ATTCTATTTGAACATCTCTATTTAACTTTTTTTTATACGTCTATTTATTTTGAAACAATT TCAGATATGCAAAAGCCTAGTGTTGTCTGCACTTCAGCTATATCTACATGAACATTAGGC GAAAATGACTCAAATTTGAGTGATAAAATATGAAATTTCACATATTCGTGTGAAGTTCAA ATCTTGCACCAGTCACCACGTTTTTTAAATTATTTCAAAGTGCAAATTTTTAGGCACTTG AATGATGATCCAAATACAAGATGATTAAACCAAAAGTAAAAGATAGTAAAAGGCTTAAAA TAAGCCACACGTTAAAGAAGTGAATGAATGCATGCGCTCATAATTCATAAATATAAGACC ATACTTTGGAGTGAAAAATATGAAATGCTAATAATAATCAGAGTGAACCACTTGATTGAG TATTATTTTAGGAAACTTGTGGTGAGTAGTCTCAATAGTTAAAGCATATTTAATGTTTCT TGGAATTTGTCATAACCTGTTTTTCTTTGCTTCTGTTTGGGTAGATGTACATAGCTGCAA TTAATGCTCTGTTTCAGAAAATTTTATTTTTAAATTTGTGGGGTATGATTTCTATTATAT AATAATAATAATAATATATTCTACTTATACACTTCATTGTTTGTCATTTGTGACACTGCT ATACATACTACTTGTCATGTTAAAATTTGGAGCAAAATAAAGTAAGTAAAGCCAATTAGC AGTTATAAATGACTGAACTTTCACATTGACATGCAGTTTACTTCATTCATGAAGACAATG GAGGAAGAAAAGATTAGTGAATTCTGCAAATATTCACACCATCTTGATTTGGATACTGGG ATAGAGAAGAACTATGTTGAGCTGAAGAAGAGACAATTACACGGCGGCAGACACCATGAT TCTTCTAAAGAAGAGGTTGATCATGCTCATGAGGATCTGGTTAAAGAAATTGCTCTTCTG GAGCTGAATATTATGTGTTTGGAGAAGTATCTTCTTTCAATGTATCGGAGAACATTTGCC AAGCGATTAGAACCACTGTCCATGAAGGATGATAGAACAAAAGCTAAGAAGTTTGCAGAA GTGAAGGAGAAAAATGACAAGTTGAAGGAAAATCCTGTTTTGGCAACTTTGAGTAATGCA ATCAAAGAATGTGATGATGACAAACAAAGATTAGTTGACTCAACCATTTTGAGATGTCAC TCTTCCCTATCACATGCTGCTTGTTCCTTCAGAGCTTCACCTTCAGTTGCAGTTCTTGCT GATGCTGTAGACTCATACCATTCTATGCCTTTATCAATGCTGGAGCATGCTCAGCCATCA ACTTCAAACAGGAGTCTCATGGAGCATCAGGTTACTAGTTGTTCTAATAATCTTCATCAT GACTCGCCAAGCCGGTTGTCTGAGGAAATGATCAAGTGTATTTCAGCCATATATTGTCAG CTTGCTGATCCACCTTTATTCCATCGCGATTTAAGTTTATCTCCCATCTCAGTTTCATCA TCCACACTTGAATCTTTTCCTCAAGCTCAGAGTGATATGAAGGGACGTCAATGCATAGAA AATTCACCTTCCAATTTGTTGAGCAATCCTTTCCACTTTGAAGATTCAAAGGGATTTAGT GGATTCATTGTTAGAATGGTTGAAGTGCAACGGTTATGTCGAGATAGTCAGAGCTTAGAT GGTGTTGAACAAATGCTGAAACGATTTCGGTACCTAGTCTCAAAATTGGAAGAAGTTGCC CCTGAAGAAATGAGACATGAAGAGAAACTAGCCTTTTGGATTAATGTCCACAATGCATTA GTAATGCATGCATTTTTGGTTCATGGGATTCCAAGAAGTAATCTCAAGAGAGCATCTTTA CTTCTTAAGTCAGCTTACAATATTGGAGGGAATACAGTAAGTGTGGACATGATCCAGAAT TCTATACTACAATGCCAGTTGCCTCGTCCCGGTCAGTGGCTTCAGTCATTGTTCTTTACG AAACAAAGATTTAAGGGTGGCGATGCAAGAAGAGGATATGCAATGGAGCATCCAGATCCT CGCCTACGCTTTGCTCTTTGCTCAGGAAATCATTCTGATCCTGTGCTTCGTTTGTACACA TCGAAGAGAGTATTCGAAGAACTAGAAGTGGCTAAAGATGATTACATTCAGGCAAACATA AGGGTACACAAAGAACAAAAACTAGTCCTTCCAAAGAATGTGGAATCTTATGTTAAAGAA GTGAATGTGAGTCCATCTGGTTTGTTCGAAACTATAGAGCTGGCATTACCTTGTTATTTG AGGAAGAAATTTCAGCAGCCCGAGCAACGAAAGTTGTGGAAGAAAATTGATTGGATTCCT CACAACTTCAGTTTCAGATACCTTGTTTCAAGTGAATTGGTTGAGTGATCAAACTCAAGA GTTTTGAATGTCAGATGAATCACAATCAAAGGGGCTATTCAGATTGAGAAGTGTGAAATA TTTGAACTTGTTGTTTAACAGAAGTGCTATAGTTGTGATTCAACTGTCATTCCTAATGAC TAATGAGTCTCCCCTCATTTTCATAAGTGAGTTTGTAATAATTTGGATGGTCCAAAACCT CATTTATTCTCTTGTTTTTCTATTTTTCCTTCTTGTTGAGAGTTTTTCATTGGTTATTGT AGCTCTAAGCAGAAGAATTGTATGCAAAAGCCTAAAGGCAGTTGGGAACTATAAAATAAA GGAGTGAATAGGTTAAATTTAATTATTGAGTTTTATATTTAAATTATTAGGTGTTTTTAT TATCTTTTAACTATTATTTCTTTTATATTTAAATTATTTGGTGTTTGTATTATCTTTTAA CTATAATCCTTTCAGATTTAAGAAGTCTCAGTTAAATGTGAAAAAATATGAAGGATAACT TGCCGAGAGGTGAGTGAAGACAATTAAATCTGATCAGAGACTCCTTTCATATATTGGTTG AAATATATTAAAGACTATTTAACCAGATACGTGGCAAATGCAGAAAGAACTATAGTCAAT TATTGAACCAGTCAATAGTTAGTCGAACCAAGGACTTGTTAGACCAATTGAGATCAGC