Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc01g108840.3.1

CDS Infomation

Receptor protein kinase, putative (AHRD V3.3 *** B9T5F6_RICCO)

Sequence

ATGAAGTTGAAGAAACCCCATCTGGGTTTTGTGTGTTTCTTGATATTATTGTCGTTTGTC
GTCTCTGTATACTCTCAGGGCAGTGCAGCAACGGATGCTGCAGTGATGCAAGAGTTGAAG
AAGGGAATCAGCCCACCGAGTTCACTAAAATGGGACGATCCAAACCCCTGTAAATGGGGT
AAAGTTCAGTGTACTAAAGATGGTCGTGTAACTAGGATTCAAGTAGGGAATCAAGGGCTA
AAAGGTTCTCTACCACCGAGCATGAATAACTTGACGGAATTGCAGGTGTTTGAAGTTCAA
AATAATGCACTTACTGGGCCGATTCCGAGTTTTGCTGGGATGAATTCGTTGCAGACCATT
CTTCTTGACAACAATGGGTTCACTTCAATTCCTGTCGACTTTTTTGAGGGTATGACTAAT
TTACAAACTGTTAACTTGGATACCAATTCCTTTTCGCCATGGTCTGTACCAGAGAGTTTG
AAAGATGCTACTTCTCTTCAAAGTTTCTCTGCTAACTCTGCTAATATTACTGGTAAAGTC
CCTGATTTCTTTGGTGGAGATACCTTTGTTAGTTTAACAGATTTGCATATGGCCTTTAAT
AATTTTGAGGGTCCCCTGCCCTCGAATTTTTCGGGTTCTTCTATCCAAACGTTGTGGTTA
AATGGTATCCATGGTAAGTTGAATGGTTCAATAGATGTGGTACAGAACATGACCGCATTA
ACCCAACTCTGGTTTTCAGGCAATCAGTTTACAGGCCCTTTGCCTGATTTTTCGGGCTTG
ACTCAGTTGAGAGAGTGCAATTTGAGAGACAATAGCTTCACTGGTCCAGTGCCAGACTCA
TTGGTTAATCTTCCTTCATTAAAGATGGTTAATTTGACAAACAACTTTTTTCAAGGGCCT
ACGCCAAAATTTCCATCTTCAGTGCTAGTGGATATGTTGGATAATACCAATAGTTTTTGT
TTGTCACAGCCGGGTCCTTGTAACTCACAAGTTAATGCGCTGTTGGCTGTGGCTAAGGAT
GTGGGGTATCCCACGGGGTTTGCGGAGAATTGGAAGGGGAATGATCCTTGTTCGTCTTGG
ATGGGCATAACTTGTGATGGTGGGAATATTACAGTGCTGAATTTTCAGAAAATGGGACTT
ACAGGGACAATCTCTCCCAACTACTCGTCCATTACGTCGTTACAAAAGTTGATCCTAGCA
AATAATTTTCTTACTGGAACTATTCCGAATGAGCTCGTTTCGCTGCCAAACCTAAAGGAA
TTTGATATTTCTAACAATCTAATTTATGGGAAAATCCCACCATTTAAGAGCAATGTATTG
GTTAAATATGATGGCAATGTCAATATTGGGAAAGATAATCCACCTCCTTTTGCACCTTCC
GGGAGCACTCCTAGTTCACCCGATGGAGGTGGACAAACTCATGGGAATGGTAATAAAAAA
TCTTCAACTGGAGTTGTTGTGGGCTCAGTGATAGGTGGTGTTTGTGGTGCCGTTGCGATT
GCTGGATTATTTGTGTTTTGTCTTTACAGGACTAAGCGTATGCGGTCCGGTAGAGTTCAG
AGTCCACACACAGTTGTTATTCATCCTCATCATTCAGGATCTGACCAAGATGCTGTTAAG
ATCACAGTTGCTGGTTCAAGTGTCAATGGAGGGACAACTGAAACGCACAGTTGTGGAAGC
AGTGCACCTGGGGACTTGCACATTGTTGAGGCTGGTAACATGGTGATTTCCATCCAAGTT
TTGAGGAATGTCACGAACAACTTCAGCGAGGAGAATATATTGGGGAGAGGTGGATTTGGA
ACTGTTTACAAGGGGGAGTTGCATGATGGAACTAAAATTGCTGTTAAGAGAATGGAATCT
GGTGTTATGAGCGAGAAGGGGTTGGATGAGTTCACGTCTGAGATTGCGGTGCTTACTAAG
GTCCGCCACAGGCATTTGGTGGCACTGCTAGGATATTGCTTGGATGGAAATGAGAGGTTA
CTTGTATATGAATATATGCCACAAGGGACAGTCAGCAGGTATCTTTTCAACTGGAAGGAA
GAAGGGATAAAGCCCCTCGAATGGACAAGGAGGCTAATCATTGCACTTGATGTTGCAAGG
GGTGTTGAATATCTTCATGGTTTAGCTCAACAGAGCTTCATTCATAGAGATCTGAAGCCA
TCTAACATTCTTTTGGGAGATGATATGAGGGCTAAAGTTGCAGATTTTGGACTTGTTCGC
CTTGCTCCTGAGGGAAAAACTTCATTGGTTACTAGGTTGGCTGGAACTTTTGGCTATCTT
GCACCAGAGTATGCAGTTACGGGCCGAGTAACCACAAAGATTGATGTGTTTAGCTTTGGT
GTAATCTTGATGGAGCTAATTACTGGAAGAAGAGCTCTGGATGAATCTCAGCCCGAGGAG
AGCATGCATCTGGTCCCATGGTTCCGCAGAATGCATATAAATAAGGAGACATTCCGTAAG
GCCATTGACCACACAATCGATCTTGATGAAGATACTCTGGCCAGTGTCAGCAAAGTTGCT
GAGTTGGCTGGTCACTGCTGTGCTAGGGAACCCCATCAGAGACCAGACATGGGTCATGCT
GTCAACGTGCTTTCCTCCCTGGCTGAGCTCTGGAAGCCAGCAGAAGTGGACGAGGATGAA
ATATATGGTATCGATTATGACATGACGCTACCTCAAGCAGTTAAGAAGTGGCAGGCTCTC
GAGGGAATGAGTGGCATTGACGGCTCTTCTTCATATATTGGAAGCAGTGAAAATACACAA
ACAAGTATACCCACTCGGCCATCTGGATTCGCCGATTCATTTACGTCAGTGGATGGACGA
TAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc01g108840.3.1

PEP Infomation

Receptor protein kinase, putative (AHRD V3.3 *** B9T5F6_RICCO)

Sequence

MKLKKPHLGFVCFLILLSFVVSVYSQGSAATDAAVMQELKKGISPPSSLKWDDPNPCKWG
KVQCTKDGRVTRIQVGNQGLKGSLPPSMNNLTELQVFEVQNNALTGPIPSFAGMNSLQTI
LLDNNGFTSIPVDFFEGMTNLQTVNLDTNSFSPWSVPESLKDATSLQSFSANSANITGKV
PDFFGGDTFVSLTDLHMAFNNFEGPLPSNFSGSSIQTLWLNGIHGKLNGSIDVVQNMTAL
TQLWFSGNQFTGPLPDFSGLTQLRECNLRDNSFTGPVPDSLVNLPSLKMVNLTNNFFQGP
TPKFPSSVLVDMLDNTNSFCLSQPGPCNSQVNALLAVAKDVGYPTGFAENWKGNDPCSSW
MGITCDGGNITVLNFQKMGLTGTISPNYSSITSLQKLILANNFLTGTIPNELVSLPNLKE
FDISNNLIYGKIPPFKSNVLVKYDGNVNIGKDNPPPFAPSGSTPSSPDGGGQTHGNGNKK
SSTGVVVGSVIGGVCGAVAIAGLFVFCLYRTKRMRSGRVQSPHTVVIHPHHSGSDQDAVK
ITVAGSSVNGGTTETHSCGSSAPGDLHIVEAGNMVISIQVLRNVTNNFSEENILGRGGFG
TVYKGELHDGTKIAVKRMESGVMSEKGLDEFTSEIAVLTKVRHRHLVALLGYCLDGNERL
LVYEYMPQGTVSRYLFNWKEEGIKPLEWTRRLIIALDVARGVEYLHGLAQQSFIHRDLKP
SNILLGDDMRAKVADFGLVRLAPEGKTSLVTRLAGTFGYLAPEYAVTGRVTTKIDVFSFG
VILMELITGRRALDESQPEESMHLVPWFRRMHINKETFRKAIDHTIDLDEDTLASVSKVA
ELAGHCCAREPHQRPDMGHAVNVLSSLAELWKPAEVDEDEIYGIDYDMTLPQAVKKWQAL
EGMSGIDGSSSYIGSSENTQTSIPTRPSGFADSFTSVDGR*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc01g108840.3.1

Transcript Infomation

Receptor protein kinase, putative (AHRD V3.3 *** B9T5F6_RICCO)

Sequence

TCACTTGACTTTTTTATCCACTCTATAAAGAAAGCAAACAAAAATTCCAAATTCCCAACT
TTTTTCCTCCCCTTTCTTCCCACAGTCTCCGCCGTTCAATCTGCACAACTTTTTCATTGT
CACACTCTGCGATTCTTCTTTATACCCAACTGGAAGAAAACCCTAACACACTTCTCTTTA
AGGAAAAAAAGTTAAAAGTTTTCGAGTCATTCTGTAGAATTTTCTTGAACAAAATGAAGT
TGAAGAAACCCCATCTGGGTTTTGTGTGTTTCTTGATATTATTGTCGTTTGTCGTCTCTG
TATACTCTCAGGGCAGTGCAGCAACGGATGCTGCAGTGATGCAAGAGTTGAAGAAGGGAA
TCAGCCCACCGAGTTCACTAAAATGGGACGATCCAAACCCCTGTAAATGGGGTAAAGTTC
AGTGTACTAAAGATGGTCGTGTAACTAGGATTCAAGTAGGGAATCAAGGGCTAAAAGGTT
CTCTACCACCGAGCATGAATAACTTGACGGAATTGCAGGTGTTTGAAGTTCAAAATAATG
CACTTACTGGGCCGATTCCGAGTTTTGCTGGGATGAATTCGTTGCAGACCATTCTTCTTG
ACAACAATGGGTTCACTTCAATTCCTGTCGACTTTTTTGAGGGTATGACTAATTTACAAA
CTGTTAACTTGGATACCAATTCCTTTTCGCCATGGTCTGTACCAGAGAGTTTGAAAGATG
CTACTTCTCTTCAAAGTTTCTCTGCTAACTCTGCTAATATTACTGGTAAAGTCCCTGATT
TCTTTGGTGGAGATACCTTTGTTAGTTTAACAGATTTGCATATGGCCTTTAATAATTTTG
AGGGTCCCCTGCCCTCGAATTTTTCGGGTTCTTCTATCCAAACGTTGTGGTTAAATGGTA
TCCATGGTAAGTTGAATGGTTCAATAGATGTGGTACAGAACATGACCGCATTAACCCAAC
TCTGGTTTTCAGGCAATCAGTTTACAGGCCCTTTGCCTGATTTTTCGGGCTTGACTCAGT
TGAGAGAGTGCAATTTGAGAGACAATAGCTTCACTGGTCCAGTGCCAGACTCATTGGTTA
ATCTTCCTTCATTAAAGATGGTTAATTTGACAAACAACTTTTTTCAAGGGCCTACGCCAA
AATTTCCATCTTCAGTGCTAGTGGATATGTTGGATAATACCAATAGTTTTTGTTTGTCAC
AGCCGGGTCCTTGTAACTCACAAGTTAATGCGCTGTTGGCTGTGGCTAAGGATGTGGGGT
ATCCCACGGGGTTTGCGGAGAATTGGAAGGGGAATGATCCTTGTTCGTCTTGGATGGGCA
TAACTTGTGATGGTGGGAATATTACAGTGCTGAATTTTCAGAAAATGGGACTTACAGGGA
CAATCTCTCCCAACTACTCGTCCATTACGTCGTTACAAAAGTTGATCCTAGCAAATAATT
TTCTTACTGGAACTATTCCGAATGAGCTCGTTTCGCTGCCAAACCTAAAGGAATTTGATA
TTTCTAACAATCTAATTTATGGGAAAATCCCACCATTTAAGAGCAATGTATTGGTTAAAT
ATGATGGCAATGTCAATATTGGGAAAGATAATCCACCTCCTTTTGCACCTTCCGGGAGCA
CTCCTAGTTCACCCGATGGAGGTGGACAAACTCATGGGAATGGTAATAAAAAATCTTCAA
CTGGAGTTGTTGTGGGCTCAGTGATAGGTGGTGTTTGTGGTGCCGTTGCGATTGCTGGAT
TATTTGTGTTTTGTCTTTACAGGACTAAGCGTATGCGGTCCGGTAGAGTTCAGAGTCCAC
ACACAGTTGTTATTCATCCTCATCATTCAGGATCTGACCAAGATGCTGTTAAGATCACAG
TTGCTGGTTCAAGTGTCAATGGAGGGACAACTGAAACGCACAGTTGTGGAAGCAGTGCAC
CTGGGGACTTGCACATTGTTGAGGCTGGTAACATGGTGATTTCCATCCAAGTTTTGAGGA
ATGTCACGAACAACTTCAGCGAGGAGAATATATTGGGGAGAGGTGGATTTGGAACTGTTT
ACAAGGGGGAGTTGCATGATGGAACTAAAATTGCTGTTAAGAGAATGGAATCTGGTGTTA
TGAGCGAGAAGGGGTTGGATGAGTTCACGTCTGAGATTGCGGTGCTTACTAAGGTCCGCC
ACAGGCATTTGGTGGCACTGCTAGGATATTGCTTGGATGGAAATGAGAGGTTACTTGTAT
ATGAATATATGCCACAAGGGACAGTCAGCAGGTATCTTTTCAACTGGAAGGAAGAAGGGA
TAAAGCCCCTCGAATGGACAAGGAGGCTAATCATTGCACTTGATGTTGCAAGGGGTGTTG
AATATCTTCATGGTTTAGCTCAACAGAGCTTCATTCATAGAGATCTGAAGCCATCTAACA
TTCTTTTGGGAGATGATATGAGGGCTAAAGTTGCAGATTTTGGACTTGTTCGCCTTGCTC
CTGAGGGAAAAACTTCATTGGTTACTAGGTTGGCTGGAACTTTTGGCTATCTTGCACCAG
AGTATGCAGTTACGGGCCGAGTAACCACAAAGATTGATGTGTTTAGCTTTGGTGTAATCT
TGATGGAGCTAATTACTGGAAGAAGAGCTCTGGATGAATCTCAGCCCGAGGAGAGCATGC
ATCTGGTCCCATGGTTCCGCAGAATGCATATAAATAAGGAGACATTCCGTAAGGCCATTG
ACCACACAATCGATCTTGATGAAGATACTCTGGCCAGTGTCAGCAAAGTTGCTGAGTTGG
CTGGTCACTGCTGTGCTAGGGAACCCCATCAGAGACCAGACATGGGTCATGCTGTCAACG
TGCTTTCCTCCCTGGCTGAGCTCTGGAAGCCAGCAGAAGTGGACGAGGATGAAATATATG
GTATCGATTATGACATGACGCTACCTCAAGCAGTTAAGAAGTGGCAGGCTCTCGAGGGAA
TGAGTGGCATTGACGGCTCTTCTTCATATATTGGAAGCAGTGAAAATACACAAACAAGTA
TACCCACTCGGCCATCTGGATTCGCCGATTCATTTACGTCAGTGGATGGACGATAA