Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc01g108010.3.1

CDS Infomation

Endonuclease or glycosyl hydrolase (AHRD V3.3 *** A0A061E1S3_THECC)

Sequence

ATGGAACTTCCTCCTACTTCATCTTTTGGTTTGTCATCAGAGTCCGTGGAACAAAGTGGG
AAGCTGATGGCAAACACAAATGCGAAAGCACTAGCAACTTTTTCCCTGCAAAGCCCAAAT
TCTTCACAGGGACCAGTGGCAATTCTTTGGGACATTGAGAACTGTCCTGTTCCAAGTGAT
GTACGGCCTGAGGATGTGGCTGGCAACATCAGAATGACTCTGCGGGTCCATCCTGTGATC
AAAGGAGCAGTTACACTGTTTTCTGCCTATGGAGATTTTAATTCTTTCCCGAGACGATTA
AGAGAGGGATGCCAGAGAACTGGTGTTAAACTTGTAGATGTCCCCAATGGCAGAAAGGAT
GCAGCTGACAAGGCCATCTTGGTTGACATGTTTCTTTTTGCTCTTGACAATCCTCCACCC
TCGTCCATTATGCTAATATCAGGAGATGTTGATTTTGCTCCTGCACTTCACATTCTTGGT
CAACGTGGATACACTGTAATCCTTGTCATTCCTTCAGGGGTTGGAGTTTCGTCTGCTCTA
TGTAATGCAGGGAGGTTTGTATGGGACTGGCCAAGTGTCGTTCGAGGCGAAGGTTTTGTG
CCTCCTGCAAAGGCCTTAATGCCTTGTCGTGGTGGCGTGTCAGACATCACTGGGATTCTA
ATGGGGTGTTGCCAGATTAATGACAACCCAGATGGTCAGCAGGAAGATGAAGCAATACTG
TATAGGGGCCTCTCACAGAGCTACTATAACTCAAGGGAATTCTCAATGATATCACATTCT
CTGTCTGAATATAATACCACTGCAATTTCCATGCCATGTTATCCTACGGGTATGAGAACT
CATAGCCTTCCTTCTGGTTTAAATGAAGTTTCAGCTGGAGGTTCATCTTCACATGAGCAG
AGTGACTTGACATGGGTGCAGCCTGGGGATATAAATGGTTTGAAGGGGCAGCTGGTGAAG
TTGCTTGAATTATCTGGCGGCTGCTTGCCTCTTACACGTGTTCCTGCAGAATACCAGAAA
ATTTATGGGAGGCCTCTTTACATTTCAGAATATGGTGCAGCTAAGCTCGTGAATCTTCTC
AAGAAGATGAGTGATGCAATTTCTGTCGGGGGGAAAGGCCAAAAGAAGTTTGTCTACCTA
CATAATTCATGTGCTGTACCAAGTGCTCCCCCAATAACTATATTAAAAAGAGATAACAAA
GGAAAAGGAACACAAGAGGGAAATGCCGATGTTGTGACTGGGGTTGGATCTTCAGATGAG
TTCTCTGATGATGAAAGAGGACCCATAAAAGAGCATGGGGGGAGCTGTGAGAAATCTAAT
ATGGTTGAAAAAAGCCTTGAAAATTTCAAGTATGAACTTCAAGAGATACTTGTTAGCTAC
TCTTGTCGGATTTTTCTTGGTTGTTTTGACGCAATATATCAACAAAGGTACAAGAGGCAA
TTAGACTACGAGAGCTTTGGAGTGGTTGAACTTGAGCAGCTACTAGCAAAAGTGAAAGAT
ATAGTGATTGTGCAAGAGGAACCCGTTAGTAAGAGGAAGTTTCTGGCTGCTGTTGGTGCC
TAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc01g108010.3.1

PEP Infomation

Endonuclease or glycosyl hydrolase (AHRD V3.3 *** A0A061E1S3_THECC)

Sequence

MELPPTSSFGLSSESVEQSGKLMANTNAKALATFSLQSPNSSQGPVAILWDIENCPVPSD
VRPEDVAGNIRMTLRVHPVIKGAVTLFSAYGDFNSFPRRLREGCQRTGVKLVDVPNGRKD
AADKAILVDMFLFALDNPPPSSIMLISGDVDFAPALHILGQRGYTVILVIPSGVGVSSAL
CNAGRFVWDWPSVVRGEGFVPPAKALMPCRGGVSDITGILMGCCQINDNPDGQQEDEAIL
YRGLSQSYYNSREFSMISHSLSEYNTTAISMPCYPTGMRTHSLPSGLNEVSAGGSSSHEQ
SDLTWVQPGDINGLKGQLVKLLELSGGCLPLTRVPAEYQKIYGRPLYISEYGAAKLVNLL
KKMSDAISVGGKGQKKFVYLHNSCAVPSAPPITILKRDNKGKGTQEGNADVVTGVGSSDE
FSDDERGPIKEHGGSCEKSNMVEKSLENFKYELQEILVSYSCRIFLGCFDAIYQQRYKRQ
LDYESFGVVELEQLLAKVKDIVIVQEEPVSKRKFLAAVGA*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc01g108010.3.1

Transcript Infomation

Endonuclease or glycosyl hydrolase (AHRD V3.3 *** A0A061E1S3_THECC)

Sequence

ATGGAACTTCCTCCTACTTCATCTTTTGGTTTGTCATCAGAGTCCGTGGAACAAAGTGGG
AAGCTGATGGCAAACACAAATGCGAAAGCACTAGCAACTTTTTCCCTGCAAAGCCCAAAT
TCTTCACAGGGACCAGTGGCAATTCTTTGGGACATTGAGAACTGTCCTGTTCCAAGTGAT
GTACGGCCTGAGGATGTGGCTGGCAACATCAGAATGACTCTGCGGGTCCATCCTGTGATC
AAAGGAGCAGTTACACTGTTTTCTGCCTATGGAGATTTTAATTCTTTCCCGAGACGATTA
AGAGAGGGATGCCAGAGAACTGGTGTTAAACTTGTAGATGTCCCCAATGGCAGAAAGGAT
GCAGCTGACAAGGCCATCTTGGTTGACATGTTTCTTTTTGCTCTTGACAATCCTCCACCC
TCGTCCATTATGCTAATATCAGGAGATGTTGATTTTGCTCCTGCACTTCACATTCTTGGT
CAACGTGGATACACTGTAATCCTTGTCATTCCTTCAGGGGTTGGAGTTTCGTCTGCTCTA
TGTAATGCAGGGAGGTTTGTATGGGACTGGCCAAGTGTCGTTCGAGGCGAAGGTTTTGTG
CCTCCTGCAAAGGCCTTAATGCCTTGTCGTGGTGGCGTGTCAGACATCACTGGGATTCTA
ATGGGGTGTTGCCAGATTAATGACAACCCAGATGGTCAGCAGGAAGATGAAGCAATACTG
TATAGGGGCCTCTCACAGAGCTACTATAACTCAAGGGAATTCTCAATGATATCACATTCT
CTGTCTGAATATAATACCACTGCAATTTCCATGCCATGTTATCCTACGGGTATGAGAACT
CATAGCCTTCCTTCTGGTTTAAATGAAGTTTCAGCTGGAGGTTCATCTTCACATGAGCAG
AGTGACTTGACATGGGTGCAGCCTGGGGATATAAATGGTTTGAAGGGGCAGCTGGTGAAG
TTGCTTGAATTATCTGGCGGCTGCTTGCCTCTTACACGTGTTCCTGCAGAATACCAGAAA
ATTTATGGGAGGCCTCTTTACATTTCAGAATATGGTGCAGCTAAGCTCGTGAATCTTCTC
AAGAAGATGAGTGATGCAATTTCTGTCGGGGGGAAAGGCCAAAAGAAGTTTGTCTACCTA
CATAATTCATGTGCTGTACCAAGTGCTCCCCCAATAACTATATTAAAAAGAGATAACAAA
GGAAAAGGAACACAAGAGGGAAATGCCGATGTTGTGACTGGGGTTGGATCTTCAGATGAG
TTCTCTGATGATGAAAGAGGACCCATAAAAGAGCATGGGGGGAGCTGTGAGAAATCTAAT
ATGGTTGAAAAAAGCCTTGAAAATTTCAAGTATGAACTTCAAGAGATACTTGTTAGCTAC
TCTTGTCGGATTTTTCTTGGTTGTTTTGACGCAATATATCAACAAAGGTACAAGAGGCAA
TTAGACTACGAGAGCTTTGGAGTGGTTGAACTTGAGCAGCTACTAGCAAAAGTGAAAGAT
ATAGTGATTGTGCAAGAGGAACCCGTTAGTAAGAGGAAGTTTCTGGCTGCTGTTGGTGCC
TAGAAGTGTTTATCGTTTATTTCTGGACTATTTACTATCTTAACTTCTTCTGGACTTATG
CTGAGCTTAAGCCTTGTCGCATTGGAGGGATGTTGAAGTTAGAGAAGGCCCTTTCTCCTT
GCAAAAGCTCCCACAATGGTGTTAATTATGGCTGTCCAGTCTTTCGAAAGTCGAATCGTT
TTTGTCACTTCTTTCAGTTTGTTTATGGTTTGTGTACCAATTTGAAGCTCCTGCAGAAGT
CTGATGGGCGAAGATAATAAACTTCTGGTTGGATAACAAGGGATAAAAGATACAGGTCCC
AAGTGATCGGTAGCCTTATTTTACTGTTATCCGAAATGAACTTCAAGTGTAAGTTGGGCA
GCCATAAAGGATTGAATCTGGTCGTGTGAACATCTAAATTGATGGAGATATGCAACAATC
ATATGACCATGACAAGACTTAATTGGGTCTCAGCAGCAATAGCATATGGTCGTAGGGTCC
ATATGATCATGTCATATACAGTAACTTGAACAATCGTCAAGGACTTGAGTCGTATGATTG
CTTGCGCTTTGATGTTGCTCCTGCCTCCTTGAGATGTATCTTTGTCATGAAACTCCCAAC
TGTTCTCATCATTTGGATTGTTTCATTCTGCAGAAAATGGTGGCAATAGTTTAATCACAG
GCTGGATGAGGGCTAGGAGCACTCGCTCTATGTAATAGATGCTTTTACCACATGCAGAAG
CATCACAGAAGAGGGTTCTGAATTTCCAAAGGTTCTGTTTTTTCAAGGACTGTTGCTTTA
ACAGCTTCTGTTGCTGATTGTTAGTGTTAAAGCTTGGATCTATTTGTTTGCTTCTGTGTG
GAACATTTGTTTCTGTAAGGCAGATTATGCTGTATAATTGACTGGAAGGATTGTTGCATC
TCCCTTGCAGATGTTCATTTGTCAGCAAATTGTCATATGGTCTGTATTTCTTGAATGTTA
ATTAAACTGGTCTTCTTCTCTCCTCCCACAGCAAGTTTATTATGTATAAATTATGCAATT
CCCCTCCTTGTTCAGGCAAAGCCTTGGTCAACTTTCTTCTTATGATTCCTGTGGCATCTT
GATATTATTTTTCTGTTTAAGACTTTAGCCTATTTACCTGTCGGAATTGTAAGGTAATTT
TA