Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g107790.2.1
CDS Infomation	Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase family (AHRD V3.3 *** A0A0K9PL83_ZOSMR)
Sequence	ATGAAGCTCTTTTATTCACTCATTATTTTTTCAATTCTCAACAATGTTAATTGCCAATTA CTACCACCTTTACCATCACCAAATTTAACCTTCATAGACCAAAGTTTAGCTCTAATATTC CCAATAATACAAAACTTCAAGAACACAATTACTCTTGATCCTTTTGGTGTGACAAAAACT TGGACAGGCCCTGATATTTGCAATTATAAAGGCTTTTATTGTGATAATCCACCTAATAAT TCCTCAGCAATTTCTCTTGCTTCTATAGATTTCAATGGATTTCAACTTAGTGCACCTACA TTAGATGGTTTCATTGATCAACTCCCTGATTTAGCCATTTTTCATGCTAATACCAACAAT TTTTCAGGCATAATTTCTTCAAAAATTTCTAATCTTCCATATCTTTACGAACTTGATCTT AGTAACAACCAATTCATCGGTACATTTCCCATGTCAATTCTCAATATCAAGACTCTAACT TTCTTGGATATTCGTTACAATCTCTTGACAGGAATAATCCCACCTCAAATTTTCTTACAA TATCTTGATGCATTTTTTCTTAACAATAATAATTTCATTCAAAAACTCCCTGACAGCATA GGATCCACCTCTGCTTTTTATTTAACCTTAGCCAACAACAAATTCGTTGGTCCAATCCCA CCTACCATTGGACAAGCTCCGAATTTGTTGGAAATTCTGTTATTGAACAACTTGCTTACT GGTTGCATTCCTTACGAATTAGGCCTTTTGAAAAAAGCAATTGTGATTGACGTTGGATTT AACACGTTAACTGGTCCATTGCCGTGTTCGTTAGGGTGTTTGGAAAATGTGGAACAACTG AATTTTGCTGGAAATTTGCTATACGGACAAGTTCCAGAAGTGATATGTTCACTGAAAAAT TTAGTGAATTTTACTTTGTCGTATAATTATTTTACAAAAGTAGGACCATTATGTAGGGAA TTGATCGAAAATGGAGTTCTTAATGTTGAAAAAAACTGTATTAATGGTCTTCCTAATCAG AGACCAATATTGGAGTGTGTATTATTTAGAATGCGAATTAAATTATGTCCATTACAGAAG AGTTTGAGGATCATACCTTGTAATATTTCTAAATTTAGTCCCCATAGACCAGAAAGACAT TTAATTTCATACTCTGCTTTGTCAAAACATACAAAGTTGTATTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g107790.2.1
PEP Infomation	Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase family (AHRD V3.3 *** A0A0K9PL83_ZOSMR)
Sequence	MKLFYSLIIFSILNNVNCQLLPPLPSPNLTFIDQSLALIFPIIQNFKNTITLDPFGVTKT WTGPDICNYKGFYCDNPPNNSSAISLASIDFNGFQLSAPTLDGFIDQLPDLAIFHANTNN FSGIISSKISNLPYLYELDLSNNQFIGTFPMSILNIKTLTFLDIRYNLLTGIIPPQIFLQ YLDAFFLNNNNFIQKLPDSIGSTSAFYLTLANNKFVGPIPPTIGQAPNLLEILLLNNLLT GCIPYELGLLKKAIVIDVGFNTLTGPLPCSLGCLENVEQLNFAGNLLYGQVPEVICSLKN LVNFTLSYNYFTKVGPLCRELIENGVLNVEKNCINGLPNQRPILECVLFRMRIKLCPLQK SLRIIPCNISKFSPHRPERHLISYSALSKHTKLY*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g107790.2.1
Transcript Infomation	Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase family (AHRD V3.3 *** A0A0K9PL83_ZOSMR)
Sequence	TCATCTCTCCTCACTAACTAAGTAACCAAAACACCATGAAGCTCTTTTATTCACTCATTA TTTTTTCAATTCTCAACAATGTTAATTGCCAATTACTACCACCTTTACCATCACCAAATT TAACCTTCATAGACCAAAGTTTAGCTCTAATATTCCCAATAATACAAAACTTCAAGAACA CAATTACTCTTGATCCTTTTGGTGTGACAAAAACTTGGACAGGCCCTGATATTTGCAATT ATAAAGGCTTTTATTGTGATAATCCACCTAATAATTCCTCAGCAATTTCTCTTGCTTCTA TAGATTTCAATGGATTTCAACTTAGTGCACCTACATTAGATGGTTTCATTGATCAACTCC CTGATTTAGCCATTTTTCATGCTAATACCAACAATTTTTCAGGCATAATTTCTTCAAAAA TTTCTAATCTTCCATATCTTTACGAACTTGATCTTAGTAACAACCAATTCATCGGTACAT TTCCCATGTCAATTCTCAATATCAAGACTCTAACTTTCTTGGATATTCGTTACAATCTCT TGACAGGAATAATCCCACCTCAAATTTTCTTACAATATCTTGATGCATTTTTTCTTAACA ATAATAATTTCATTCAAAAACTCCCTGACAGCATAGGATCCACCTCTGCTTTTTATTTAA CCTTAGCCAACAACAAATTCGTTGGTCCAATCCCACCTACCATTGGACAAGCTCCGAATT TGTTGGAAATTCTGTTATTGAACAACTTGCTTACTGGTTGCATTCCTTACGAATTAGGCC TTTTGAAAAAAGCAATTGTGATTGACGTTGGATTTAACACGTTAACTGGTCCATTGCCGT GTTCGTTAGGGTGTTTGGAAAATGTGGAACAACTGAATTTTGCTGGAAATTTGCTATACG GACAAGTTCCAGAAGTGATATGTTCACTGAAAAATTTAGTGAATTTTACTTTGTCGTATA ATTATTTTACAAAAGTAGGACCATTATGTAGGGAATTGATCGAAAATGGAGTTCTTAATG TTGAAAAAAACTGTATTAATGGTCTTCCTAATCAGAGACCAATATTGGAGTGTGTATTAT TTAGAATGCGAATTAAATTATGTCCATTACAGAAGAGTTTGAGGATCATACCTTGTAATA TTTCTAAATTTAGTCCCCATAGACCAGAAAGACATTTAATTTCATACTCTGCTTTGTCAA AACATACAAAGTTGTATTAA