Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g107740.3.1
CDS Infomation	Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein (AHRD V3.3 *** AT4G34150.1)
Sequence	ATGTCAATGATATCTGGCATCCAAGGCCAACTTCTTGAAATCACAGTGGTTTCTTGCAAT AAATTAAAGGACACTGAATGGATTTCAAGACAAGATCCCTATGTTTGTCTTGAATATGGT AGCACCAAATTTCGAACTCGTACTTGTACAGATGGTGGCAAAAACCCCACATTTCAAGAG AAATTCGTGTTTACCCTTATTGAAGGATTGCAAGAGATTAATGTTGTCGTCTGGAATAGC AATACCCTTACTTATGATGATTTTATCGGAAGCGGAAAGATTCAACTACAGAAAGTTCTA TCAATGGGATATGATGATACTGCTTGGCCAATCCAGACCAAGACTGGCAGGCATGCGGGA GAAGTTCGGCTCATAATGTTCTATGCTAATGCCAATAAGCCGGCAACAAGTTACGCTCCA TCATACACTGCACCACAGCCGCATACGCCTATGTACTCTGCTCCATCATACGCAGCACCA GCAGCAGCTTATCAAACACTGTCTCCATATCCCGCGTACCCACCTCATTCAGCAGCATAT CCACCAACACCTTATCCTCCTCCTCAAACAACTGCTTACACTCCAGTCTATCCACCGCCT TCAGCATATCCTCCCATTTCGTATCCACCACATTCAGCGTATCCTCCCGCGTCTTATCCA CCACCAACACAGGACTATTCTTATTCTCCAGGTCCATATCCTCCGCGACCTTACTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g107740.3.1
PEP Infomation	Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein (AHRD V3.3 *** AT4G34150.1)
Sequence	MSMISGIQGQLLEITVVSCNKLKDTEWISRQDPYVCLEYGSTKFRTRTCTDGGKNPTFQE KFVFTLIEGLQEINVVVWNSNTLTYDDFIGSGKIQLQKVLSMGYDDTAWPIQTKTGRHAG EVRLIMFYANANKPATSYAPSYTAPQPHTPMYSAPSYAAPAAAYQTLSPYPAYPPHSAAY PPTPYPPPQTTAYTPVYPPPSAYPPISYPPHSAYPPASYPPPTQDYSYSPGPYPPRPY*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g107740.3.1
Transcript Infomation	Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein (AHRD V3.3 *** AT4G34150.1)
Sequence	CCGCCTTAAACAAATTCTATATAAGCCCCTCCTCGGTTAAACTTAGATACTAATTTTCTG TCAAAAATCAGTTGAAAAAAAAGTGAGAACATTTTCCTTCAATTTTTCTTGATTGGAAAA TTAAAAAGAAGTTAAATTCTTGCTACTCCCATGTCAATGATATCTGGCATCCAAGGCCAA CTTCTTGAAATCACAGTGGTTTCTTGCAATAAATTAAAGGACACTGAATGGATTTCAAGA CAAGATCCCTATGTTTGTCTTGAATATGGTAGCACCAAATTTCGAACTCGTACTTGTACA GATGGTGGCAAAAACCCCACATTTCAAGAGAAATTCGTGTTTACCCTTATTGAAGGATTG CAAGAGATTAATGTTGTCGTCTGGAATAGCAATACCCTTACTTATGATGATTTTATCGGA AGCGGAAAGATTCAACTACAGAAAGTTCTATCAATGGGATATGATGATACTGCTTGGCCA ATCCAGACCAAGACTGGCAGGCATGCGGGAGAAGTTCGGCTCATAATGTTCTATGCTAAT GCCAATAAGCCGGCAACAAGTTACGCTCCATCATACACTGCACCACAGCCGCATACGCCT ATGTACTCTGCTCCATCATACGCAGCACCAGCAGCAGCTTATCAAACACTGTCTCCATAT CCCGCGTACCCACCTCATTCAGCAGCATATCCACCAACACCTTATCCTCCTCCTCAAACA ACTGCTTACACTCCAGTCTATCCACCGCCTTCAGCATATCCTCCCATTTCGTATCCACCA CATTCAGCGTATCCTCCCGCGTCTTATCCACCACCAACACAGGACTATTCTTATTCTCCA GGTCCATATCCTCCGCGACCTTACTGAGGCCATCTTCTTACATGCTTGGGTGAAGAATGT GCATATAAGTTTATGGAAAAAGAGGAAAGAATTGTGCATACAGATTTTCACTGAACAGTT TTGCTTAGGCATCTTTGTGTTTGTAAATAATTGAAAAATACAAGGGTTGGATGACTTGTT TGTGATTGTTTGTGCTAAACTGTTCCATACAATCTTAAGAAAGAAATATTAGTTTTGTTG GCTGTTGTTTGTCGTCTGTAGGATATAAGGAAATCCTAATCGCGTTTGATGATCGGAAAG AGGCCTTGCAGGAGAGTATTCTATATGCGTTTGAATCAACAAGTTGAGAGCGACTGTATG AATGTATGAATACAATATGAACAATTATTCTTCATTTTTAAACAAGTTGTGATCGGCTAT ATGAATTTATGTTTATTTCAGTGGACAAAGGGTACGTAGTCGTGTCACATCAGGTTGAAT TTTGCAATAATCTATATGAATGGACATATGAACAAGAAAAACTCAATTGGTCGTTTTGAC CATGTGATTAAGCCACTAAATCTCAAAAAGTTTTTTCTACTCATATAAGATTCAACGTTT CACTGTGTAAAGTTTATGAGGTGGCTTTCGGTGTTCCACCATCATTGATTGCCCTTTCAA GTAAATGTGACTTCTAGTTGTGTCCCATTACATTATTTGCTTAAACGTTCAAAAGTCCTT TCCTTAGAGTGGTCAACCTCACGATGGTGGTTATTACTTTTCTCTACTCACTAGTTAGAA AAAAGCACATCTCCCTTCTGACTTTTCTCAAATTATCATGTGTTCTTATTAACTCAATCA CGATGTTAAGAGTATCTTTTGGTTGGTTTCGCATAATAATTGATATCTCAACGAGATAGA ATAAGAGAAGAATTAACTTAATATCGCCATGCTAGTTTGTAGCGTGGTCCGTGGAGATGC TTACTCAAAAAGATGTGTGTATGCTTCGGTGACCATAAATACTCAGTTAATAAACCGCTA AATAAGTTCATAGGTTAGTGATTGATCATGTACAACTTAGTTAAAGGGAAAGATTAACGG GTGGGTGAATAAATTTGAGAAAAATATATATATTTCCATGAGTAGCGATAATATTACTGA TGAAGTCTTTGATAAGAGAATTGCGTGAAATAATTAAAATGAACAATATCACATCATATT TAGAGTATTTTTAGCGAAAACAGTTTGCACTAGAGGAATTAGTGTTTTTTTAGTGCTAAA TCAGGTTCAACATGGCACTATAGTGATTTGGAAAAGAGGAGAAATTATAGAAGAATTTGG AATGAAATGAACCAACAACCTACCCAATTACATGGCATGAGGGGGCCTATTTTGACTTTT GAAAAATAATGATGTAAAGATATGGTCTCCTTTTTTTCTTTTTTTTTTGGTTAAGATGTT AGTGATTGCCAGGCATTATTACTGTTAATCTTAAAATTAATGATGCATTATAACCTTAAT TAACACTATAAAAACAGCTGTATAACTAACTCTATCTCCTCTCTCTTCTTTTACTTTCTT AGTTGGTTTAGGCTGTCCATTACCCCACTTTCTTAATTACAAATACATCAACTAATAATA GCCCTCTTAATCTGTATTTTTAAACCATTTCTAGCATGTTTTTACTGCAATTGTTGCAAT GACAATCGTATGTCAAAAAGGAAATTATTAAAATGTTAGATTGATTTGGTTTATTACGTG TCTTTTTTATTACCATGACAAACAACATAGAATGATTTATAACGATTATTCATACTTTTA GATCGTCAAATCGATTCTATTTTTTTTCCAGTTACGTGAATTTGATATTTATAAGTTGAC TTTAGTATTTTCTAGAATGTTTTTTATTTATATAATAAAAAATTGTTAATTTGTTGCTGT TGCTTTTACCAAATTTTTACGTCCATAATTATGACTAGAGTATTATTTACAAGTAGTATG GTTTTAATTGTTTAAAAGTTTTGGAAGCCAACAAATGTTGCAGAGAGTACGTTAAAAAAG ACAAAGAGTACTGACTGACAAAGACGAAATCATTTATGACTTTTGAACTAGGACGAAACC ATAGCTAACACATTATTTACTTTATCTTAGTTAAATCTTATCAGTACAATTACAACTTTA ATTATAATTGTTTACTTCCATACCACCGTATTTTCCTTGGAAGATCGAACATCAATAAAC GATTTACTCTTTCCGTCTCATATTATTTATTCATGTTATCATAATAAAAAAAAGTATATG TTTTAAATTATTTGTTCTTATTAAAAATATTGGTATTATAAAATTTCAAATGTTGATCTC GATATTGATAAATCAAATATATGAATAACATGTATTAAAAAAATTTTAAAAGGATAAATT AATTAAAATATTTTCTTAAGAATTCTTAAAATGAGCGTAAAATATTAATGAATAAGTAAT GTGAGATGAAGAAAATATC