Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc01g104910.3.1

CDS Infomation

Loricrin-like protein (AHRD V3.3 *** A0A072UZF2_MEDTR)

Sequence

ATGATCACATCTATTGATCCTAATAAGAACAAAATGTACCGTGTTCCAGATGTTGATCTC
ACAAGGAGTGATACTACATTAAGATTAGATTGCTTTGGTTATGGAGGAAATGAGTGTGTC
AGATTTGGAGGCAGTGAAACCAATAGCGGAAGCCATGTTATGCAACAGAATGCTATTGAT
GATGGGTGTAAATTGGTCCTTGGTTTGGGGCCAACACCTACAATATGTTCTAACGACTAT
TATCCTGGTGGATCTAATAAAAATAAAGGGTTTACAGCCTTGTTGAATCAGGGACAATTC
TCTGAGAGTGATTCTATCCTCAAACTTGGCCTCTCAGGGAGCACCGGTGAAATTTCTAAT
GCACTTGACTTTTCGGCTATCACTCAGAGTACTGCTGGTGCACCTCATCATATCGATCAG
CTGTCTTCGGATGGTAAAAGGCCGGCGGTCCCTATCCTGGACGAAGGTTCAACATCAGCC
AAGAAGTCTGGTGGGTACATGCCTTCACTTCTTCTGGCTCCAAGAATTGAGAACAGCCAA
CTATCCTTCCAAAATAAGGAAGTTTCAGAGCTGGGTGCGAAATCCCATTTCCATCTCCCT
GAGCTGAGCTCTGAGCCTTCTTGTATCTCTGACTACTCAATGAGTAACCTCTCTGAACCA
ACGACAATGGCTACATCCTCACGCAAAATGACCAATCCCAAGAGATGCAAGTTTCCAGGA
TGCTGCAAAGGAGCTCGAGGAGCGACAGGTCTTTGCATTGGGCATGGCGGAGGACAGAGA
TGCCAGAAACCTGGATGCAACAAAGGTTCCGAGAGTAGGACTGCATACTGCAAGGCCCAT
GGAGGAGGGAAGAGGTGCGAACACCTGGGATGCACTAAAAGTGCAGAAGGTAAGACCGAC
TACTGCATAGCACATGGTGGTGGAAGGCGTTGTGGCTTTCCTCAAGGTTGCACTAGAGCA
GCACGTGGCAAGTCAGGCCTTTGCATCAAGCATGGTGGAGGTAAGAGGTGCAATGTGGAA
GGATGCACCCGTAGTGCTGAGGGGAAAGTTGGGTTGTGCATTTCACATGGTGGTGGACGC
CGTTGCCAATTCCCTAGTTGTTCAAAAGGTGCACAGGGGAGCACTTTGTTCTGCAAAGCA
CATGGTGGTGGAAAGCGTTGCATCTTTGCTGGCTGCACCAAAGGAGCTGAAGGGAGTACA
CCTCTTTGCAAAGCACATGGGGGTGGAAAGCGGTGTCTCTTTGATGGTGGTGGTATCTGC
CCCAAAAGTGTACACGGAGGCACAAACTTTTGTGTTGCCCATGGTGGTGGGAAGAGGTGT
TCTGTTCCAGGATGCACCAAGAGTGCTCGAGGGCGTACAGATTGTTGTGTTAGGCATGGG
GGAGGGAAACGCTGCAAGTTTGAAAACTGTGAAAAGAGTGCTCAAGGTAGCACCGACTTT
TGCAAGGCTCATGGTGGTGGTAAGCGTTGCAGCTGGGGAGAGGGGAAATGCGAGAAGTTT
GCTAGGGGCAGAGGAGGGCTATGTGCTGCTCATAGCAGCTTGTTACATGGGAGGAATACG
AATAAAGGAGGCATGATTGGACCAGGACTTTTCCATGGACTGGTCCCTGCTGCCTCCCCT
ATAAAGAGCACTTTTGAGAACAATCGTTCTTCGTCTATGGTGAGCATGGTATCAGATTCA
GTTCATTCGCTCAATAAGCCAGCTGAACGGCAGCTACTTATACCACCACAGGTATTGGTA
CCCTTGTCAATGAAGGCCTCACTAACTTGTTCAGAGAAGCTGGATGACAGAAGCATCAAC
CTTGGGATTGGAAGAAGCAACACAAACAGCAACTTTGAGTTTGTTGTCCCAGAGGGCAGA
GTTCATGGTGGTGGCCTAATGACTTTGCTTGGGGGAAACCTGAAAAATGCAATAATGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc01g104910.3.1

PEP Infomation

Loricrin-like protein (AHRD V3.3 *** A0A072UZF2_MEDTR)

Sequence

MITSIDPNKNKMYRVPDVDLTRSDTTLRLDCFGYGGNECVRFGGSETNSGSHVMQQNAID
DGCKLVLGLGPTPTICSNDYYPGGSNKNKGFTALLNQGQFSESDSILKLGLSGSTGEISN
ALDFSAITQSTAGAPHHIDQLSSDGKRPAVPILDEGSTSAKKSGGYMPSLLLAPRIENSQ
LSFQNKEVSELGAKSHFHLPELSSEPSCISDYSMSNLSEPTTMATSSRKMTNPKRCKFPG
CCKGARGATGLCIGHGGGQRCQKPGCNKGSESRTAYCKAHGGGKRCEHLGCTKSAEGKTD
YCIAHGGGRRCGFPQGCTRAARGKSGLCIKHGGGKRCNVEGCTRSAEGKVGLCISHGGGR
RCQFPSCSKGAQGSTLFCKAHGGGKRCIFAGCTKGAEGSTPLCKAHGGGKRCLFDGGGIC
PKSVHGGTNFCVAHGGGKRCSVPGCTKSARGRTDCCVRHGGGKRCKFENCEKSAQGSTDF
CKAHGGGKRCSWGEGKCEKFARGRGGLCAAHSSLLHGRNTNKGGMIGPGLFHGLVPAASP
IKSTFENNRSSSMVSMVSDSVHSLNKPAERQLLIPPQVLVPLSMKASLTCSEKLDDRSIN
LGIGRSNTNSNFEFVVPEGRVHGGGLMTLLGGNLKNAIM*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc01g104910.3.1

Transcript Infomation

Loricrin-like protein (AHRD V3.3 *** A0A072UZF2_MEDTR)

Sequence

CTTATGCTCATCCAATTGATAGCACGACAATTACCTTTGTAGGATAAATTAAGTAATTTA
TAATTAAAAATAAATTATATTGCTCTTCATGGTAAAGGGCAAAAATGGAAAATTGAACAA
GAAGAAGCCATTGGCCAATGGGGTGTAAGCTTGATGATGATGAAGAAATATTAATAAGAG
GTGAATGGAGCAGAATATGAATTTAATTTACTTGTATTTATCAAAACATACTCCTAATTA
TTGTTCTCTCTCTTTCCTTTGTCTTTTGTTTATACTCTCCACTTTGTGGGAGCACAAAAA
AGGTTCAGTTTCTCTTTCTAGAAGAAGAAGAATACTCAATTCTGAAAAAAATGGTGGCTT
TATTCAATTTGATTCTTGAAATTGTCATGGAAATCTGACTTCTAAAGGGTTATAAAACTA
AGATTTCTTCTGAGAGACATGATCTGCTATTCTCTTTTGGTATCTTCTGTCATCAGTTTT
TAATCCCGAAACCTGCTTTGGTCTTATTACTGTATAAGAGCATTAAACAGCCCTTGATGC
CCCTCTACAAGATTAGATAAAATGGATCGAGCAGACACATCAGGGTTTGTGAGTGGAGGA
GGTCAACGTTTTCTGTGTGTAGTATGATCACATCTATTGATCCTAATAAGAACAAAATGT
ACCGTGTTCCAGATGTTGATCTCACAAGGAGTGATACTACATTAAGATTAGATTGCTTTG
GTTATGGAGGAAATGAGTGTGTCAGATTTGGAGGCAGTGAAACCAATAGCGGAAGCCATG
TTATGCAACAGAATGCTATTGATGATGGGTGTAAATTGGTCCTTGGTTTGGGGCCAACAC
CTACAATATGTTCTAACGACTATTATCCTGGTGGATCTAATAAAAATAAAGGGTTTACAG
CCTTGTTGAATCAGGGACAATTCTCTGAGAGTGATTCTATCCTCAAACTTGGCCTCTCAG
GGAGCACCGGTGAAATTTCTAATGCACTTGACTTTTCGGCTATCACTCAGAGTACTGCTG
GTGCACCTCATCATATCGATCAGCTGTCTTCGGATGGTAAAAGGCCGGCGGTCCCTATCC
TGGACGAAGGTTCAACATCAGCCAAGAAGTCTGGTGGGTACATGCCTTCACTTCTTCTGG
CTCCAAGAATTGAGAACAGCCAACTATCCTTCCAAAATAAGGAAGTTTCAGAGCTGGGTG
CGAAATCCCATTTCCATCTCCCTGAGCTGAGCTCTGAGCCTTCTTGTATCTCTGACTACT
CAATGAGTAACCTCTCTGAACCAACGACAATGGCTACATCCTCACGCAAAATGACCAATC
CCAAGAGATGCAAGTTTCCAGGATGCTGCAAAGGAGCTCGAGGAGCGACAGGTCTTTGCA
TTGGGCATGGCGGAGGACAGAGATGCCAGAAACCTGGATGCAACAAAGGTTCCGAGAGTA
GGACTGCATACTGCAAGGCCCATGGAGGAGGGAAGAGGTGCGAACACCTGGGATGCACTA
AAAGTGCAGAAGGTAAGACCGACTACTGCATAGCACATGGTGGTGGAAGGCGTTGTGGCT
TTCCTCAAGGTTGCACTAGAGCAGCACGTGGCAAGTCAGGCCTTTGCATCAAGCATGGTG
GAGGTAAGAGGTGCAATGTGGAAGGATGCACCCGTAGTGCTGAGGGGAAAGTTGGGTTGT
GCATTTCACATGGTGGTGGACGCCGTTGCCAATTCCCTAGTTGTTCAAAAGGTGCACAGG
GGAGCACTTTGTTCTGCAAAGCACATGGTGGTGGAAAGCGTTGCATCTTTGCTGGCTGCA
CCAAAGGAGCTGAAGGGAGTACACCTCTTTGCAAAGCACATGGGGGTGGAAAGCGGTGTC
TCTTTGATGGTGGTGGTATCTGCCCCAAAAGTGTACACGGAGGCACAAACTTTTGTGTTG
CCCATGGTGGTGGGAAGAGGTGTTCTGTTCCAGGATGCACCAAGAGTGCTCGAGGGCGTA
CAGATTGTTGTGTTAGGCATGGGGGAGGGAAACGCTGCAAGTTTGAAAACTGTGAAAAGA
GTGCTCAAGGTAGCACCGACTTTTGCAAGGCTCATGGTGGTGGTAAGCGTTGCAGCTGGG
GAGAGGGGAAATGCGAGAAGTTTGCTAGGGGCAGAGGAGGGCTATGTGCTGCTCATAGCA
GCTTGTTACATGGGAGGAATACGAATAAAGGAGGCATGATTGGACCAGGACTTTTCCATG
GACTGGTCCCTGCTGCCTCCCCTATAAAGAGCACTTTTGAGAACAATCGTTCTTCGTCTA
TGGTGAGCATGGTATCAGATTCAGTTCATTCGCTCAATAAGCCAGCTGAACGGCAGCTAC
TTATACCACCACAGGTATTGGTACCCTTGTCAATGAAGGCCTCACTAACTTGTTCAGAGA
AGCTGGATGACAGAAGCATCAACCTTGGGATTGGAAGAAGCAACACAAACAGCAACTTTG
AGTTTGTTGTCCCAGAGGGCAGAGTTCATGGTGGTGGCCTAATGACTTTGCTTGGGGGAA
ACCTGAAAAATGCAATAATGTGAAGAAATATGTTCACTCTGCTGTGGGAAGACGATAAAT
TTGTGAATTTCTACTCTTTGGAACTCTGTATAAATGTTTGTATCAGTTTTGTGAGACTCC
TCTCTGTTAAATACTTAGGGTATAATATTGTAACCTGTAATTGTTATTTGTTTTATTCCT
TATTTTGGCTTCACAATCTCTCTTCATAATATCTCCATTTGGTGGACATTTTTTTTTCTT
TTTGGTTAGTTGCTAGTAATAATTTTCTTGGTGGATCAGCTGATGTAATGTAATTATGCT
ATCTATTACTGAAATAAGAAATGTGAACCATATCATATATGTGTTCATACAAGTGCTTTC
CTATACA