Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g103230.3.1
CDS Infomation	Non-lysosomal glucosylceramidase (AHRD V3.3 *** K4B1P9_SOLLC)
Sequence	ATGAGTGATTCAGTTACTTTTCCAGGAGATATGTTGATTAATGGATCTAACAAAGGAGGA AGAGAATGTTGTAAGGATAGCGAGGTCACGGTTGACCCAGCAAAACTTCCATCTTTGACT TGGCAGCGCAAGTTAAACTGTGATGATATTTCCCTTTCAGAATTCGATCTTAAGCTGAAA GAAGTGGTTTCTCTGGCTCCATTAGGGTTCCGTCTATGGAAATTTCTACAAGAAGAAAAA GCCAAAGGAAAGGATGCTCTGTTTATCAATCCTTTCATAAAAAGGGTCTACTCATCATGC CAAGGAGTTCCTTTAGGTGGTATGGGTGCAGGAAGCATAGGAAGAAGTTTCAAAGGAGAA TTTTTGCGCTGGCAAATATTTCCTAGGATATGTGAAGATAAACCAGTTCTTGCAGACCAA TTTTCTATATTTGTAACACGGCCGAATGGTGAAAAATATTCTACTGTGTTATGCCCGAGA ACTCCAAATGATTCTTCAGCTTCTGGAATAGGATCTTGGGACTGGAATTTGGGTGGCCAA AATTCTACATATCATGGTCTCTATCCAAGAGCGTGGACTGTATACGATGGGGAACCTGAT CCAGCACTCAGGATAGTATGCCGTCAGATCTCTCCTTTTATCCCCCACAACTACAAAGAG AGCAGCTTACCTACATCAGTCTTTACATTCACGTTGCATAACTTGGGAAATACGTCTGCA GATGTCACTTTGCTTTTCACCTGGGCAAATTCTGCTGGTGGAGATTCTGGAATTTCTAGC CATCATTTCAATTCCAAGTTTAGAACGGATGATGGAGTCCAAGGCGTACTCTTGCACCAC ATGACTTCCAAAGAACTCCCTTCTGTAACTTTTGCAATTGCAGCAGAGGAAAATGATGCA GTTCACGTCTCTGAGTGCCCTTTCTTTGTGATATCTGGCGACTCCCAGGGTATTACAGCA AAAGACATGTGGAATGAAGTTAAAAAGCATGGATCCTTTGACCACCTTCAATCTGAGGAA AAGTCAATGCCTTCTGAACCGGGATCACTTGTTGGAGCGGCAGTTGCAGCTTCACTAACT ATTCCAGCAGATGATGTAAGAAGTGCAACATTCTCATTGGCATGGGCCTGCCCTGAAATT AATTTTGGAGATGGTAAAACTTATCAGAGGCGCTACACTAAGTTCTATGGTACTACGGGT CATGCTGCTGCAGAAATTGCACATGATGCTATCCAAGAGCATACTCAGTGGGAGTCACAA ATAGAAGAATGGCAAAAACCTATTATTGAAGACAAGAGGCTTCCCGAATGGTACCCAGTA ACACTCTTCAATGAGCTCTATTATTTAAATGCAGGAGGGACAATTTGGACAGATGGATTG CCACCAGTTCAAAGTGTATCAACAATTGGGAAAAGATTTTCCATTGAAAGATCTAGTTCG GATGTTAAGAAAAATGCTCATTTAACCCATTCAGATGGCACTGCTGTTAGTATTCTTGAG AGGATGGGTTCGGTGTTTGAGGAACTTCATACTCCTGTCTCAGTAAATGCTGCTGTCGGA ACAAATCTTCTTCAGAAGGGAGAGGAAAATATTGGCCAGTTCCTCTACCTTGAAGGAATT GAATATCATATGTGTAATACATATGATGTTCATTTTTATGCATCGTTTGCTTTGGCCATG CTCTTCCCAAAAGTTGAACTTAGCATACAACGAGACTATGCAGCTGCTGTGATGATGCAT GATCCTAGTAAGAGAAAACTCTTGGATGATGGAATGTCAGCGACAAGGAATGTTCTTGGT GCTCTTCCTCATGATATTGGAATGGATGATCCATGGTTTGAAGTAAATTACTATTGCCTG TATAACACAGATAGGTGGAAAGATTTGAACCCAAAATTTGTTCTTCAAGTTTACAGGGAT TTTGTTGCGACAGGTGACAAAAAGTTTGCCGAAGCTGTTTGGCCGTCTGTGTATATGGCA ATAGCTTTCATGGACCAATTTGATAAGGATGGGGATGGGATGATCGAAAATGAAGGATTT CCTGATCAGACATATGATGTATGGTCTGTCTCTGGTGTGAGTGCTTACTGTGGTGGCCTA TGGGTGGCAGCTTTGCAGGCTGCATCAGCCCTAGCTCGAGAAGTAGGTGATAAGGGTTCT GAAGACTACTTTTGGTTTAAGTTTCAAAAGGCAAAGGAAGTTTATCAAAAATTGTGGAAC GGTTCTTACTTCAACTATGATAATAGTGGCAGTGCCGTAAGCTCATCTATTCAAGCTGAT CAATTGGCTGGCCAATGGTATGCTCGAGCATGTGGTCTTCTACCAATTGTTGATGAAGAA AAAGCCAAAACCGCACTTGAGACAGTGTTCAATTTCAATGTCATGAAGGTCAAGGATGGG AGGCGTGGAGCAGTGAATGGAATGCGGCCCAGTGGAGAACCTGACTTGTCTAGTTTGCAG TCAAGGGAGATATGGTCTGGAGTTACATATGCTGTAGCTGCAGCCATGATTCTTGAAGGC ATGGTGGATACGGGATTTAAAACTGCATCTGGAGTCTATGAAACTGTTTGGTCTGAAGAT GGCTTTGGCTATGCTTTTCAGACCCCAGAAGGTTGGACCACAGAAGGCCGATACAGAGCT CTGGGTTACATGCGTCCTTTGGCAATCTGGGCTATGCAGTGGGCATTAAACCCACCTAAG ATTCCCAAGCAAGAGGCGAAGCCAAAACTGGAGGCAGATTCATTGTCTAGGCAACATGCT GGTTTTCAAGCGGTAGCTCGTCTTCTAAAGCTGCCCAAAGAGAAAGATGCTAGAAGTGTT TTTCAGGTCCTTTTCGATTACACCTGTAAAAGAATAACAGGCTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g103230.3.1
PEP Infomation	Non-lysosomal glucosylceramidase (AHRD V3.3 *** K4B1P9_SOLLC)
Sequence	MSDSVTFPGDMLINGSNKGGRECCKDSEVTVDPAKLPSLTWQRKLNCDDISLSEFDLKLK EVVSLAPLGFRLWKFLQEEKAKGKDALFINPFIKRVYSSCQGVPLGGMGAGSIGRSFKGE FLRWQIFPRICEDKPVLADQFSIFVTRPNGEKYSTVLCPRTPNDSSASGIGSWDWNLGGQ NSTYHGLYPRAWTVYDGEPDPALRIVCRQISPFIPHNYKESSLPTSVFTFTLHNLGNTSA DVTLLFTWANSAGGDSGISSHHFNSKFRTDDGVQGVLLHHMTSKELPSVTFAIAAEENDA VHVSECPFFVISGDSQGITAKDMWNEVKKHGSFDHLQSEEKSMPSEPGSLVGAAVAASLT IPADDVRSATFSLAWACPEINFGDGKTYQRRYTKFYGTTGHAAAEIAHDAIQEHTQWESQ IEEWQKPIIEDKRLPEWYPVTLFNELYYLNAGGTIWTDGLPPVQSVSTIGKRFSIERSSS DVKKNAHLTHSDGTAVSILERMGSVFEELHTPVSVNAAVGTNLLQKGEENIGQFLYLEGI EYHMCNTYDVHFYASFALAMLFPKVELSIQRDYAAAVMMHDPSKRKLLDDGMSATRNVLG ALPHDIGMDDPWFEVNYYCLYNTDRWKDLNPKFVLQVYRDFVATGDKKFAEAVWPSVYMA IAFMDQFDKDGDGMIENEGFPDQTYDVWSVSGVSAYCGGLWVAALQAASALAREVGDKGS EDYFWFKFQKAKEVYQKLWNGSYFNYDNSGSAVSSSIQADQLAGQWYARACGLLPIVDEE KAKTALETVFNFNVMKVKDGRRGAVNGMRPSGEPDLSSLQSREIWSGVTYAVAAAMILEG MVDTGFKTASGVYETVWSEDGFGYAFQTPEGWTTEGRYRALGYMRPLAIWAMQWALNPPK IPKQEAKPKLEADSLSRQHAGFQAVARLLKLPKEKDARSVFQVLFDYTCKRITG*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g103230.3.1
Transcript Infomation	Non-lysosomal glucosylceramidase (AHRD V3.3 *** K4B1P9_SOLLC)
Sequence	AAACAAAATAATTTAAAAAGTCACTCCCAAACACACTCCCTTTGATAAATAAAAAGATAC ATAACGCCTATTTTCATGCTTGTTGGATTCTGAAGTATGAGTGATTCAGTTACTTTTCCA GGAGATATGTTGATTAATGGATCTAACAAAGGAGGAAGAGAATGTTGTAAGGATAGCGAG GTCACGGTTGACCCAGCAAAACTTCCATCTTTGACTTGGCAGCGCAAGTTAAACTGTGAT GATATTTCCCTTTCAGAATTCGATCTTAAGCTGAAAGAAGTGGTTTCTCTGGCTCCATTA GGGTTCCGTCTATGGAAATTTCTACAAGAAGAAAAAGCCAAAGGAAAGGATGCTCTGTTT ATCAATCCTTTCATAAAAAGGGTCTACTCATCATGCCAAGGAGTTCCTTTAGGTGGTATG GGTGCAGGAAGCATAGGAAGAAGTTTCAAAGGAGAATTTTTGCGCTGGCAAATATTTCCT AGGATATGTGAAGATAAACCAGTTCTTGCAGACCAATTTTCTATATTTGTAACACGGCCG AATGGTGAAAAATATTCTACTGTGTTATGCCCGAGAACTCCAAATGATTCTTCAGCTTCT GGAATAGGATCTTGGGACTGGAATTTGGGTGGCCAAAATTCTACATATCATGGTCTCTAT CCAAGAGCGTGGACTGTATACGATGGGGAACCTGATCCAGCACTCAGGATAGTATGCCGT CAGATCTCTCCTTTTATCCCCCACAACTACAAAGAGAGCAGCTTACCTACATCAGTCTTT ACATTCACGTTGCATAACTTGGGAAATACGTCTGCAGATGTCACTTTGCTTTTCACCTGG GCAAATTCTGCTGGTGGAGATTCTGGAATTTCTAGCCATCATTTCAATTCCAAGTTTAGA ACGGATGATGGAGTCCAAGGCGTACTCTTGCACCACATGACTTCCAAAGAACTCCCTTCT GTAACTTTTGCAATTGCAGCAGAGGAAAATGATGCAGTTCACGTCTCTGAGTGCCCTTTC TTTGTGATATCTGGCGACTCCCAGGGTATTACAGCAAAAGACATGTGGAATGAAGTTAAA AAGCATGGATCCTTTGACCACCTTCAATCTGAGGAAAAGTCAATGCCTTCTGAACCGGGA TCACTTGTTGGAGCGGCAGTTGCAGCTTCACTAACTATTCCAGCAGATGATGTAAGAAGT GCAACATTCTCATTGGCATGGGCCTGCCCTGAAATTAATTTTGGAGATGGTAAAACTTAT CAGAGGCGCTACACTAAGTTCTATGGTACTACGGGTCATGCTGCTGCAGAAATTGCACAT GATGCTATCCAAGAGCATACTCAGTGGGAGTCACAAATAGAAGAATGGCAAAAACCTATT ATTGAAGACAAGAGGCTTCCCGAATGGTACCCAGTAACACTCTTCAATGAGCTCTATTAT TTAAATGCAGGAGGGACAATTTGGACAGATGGATTGCCACCAGTTCAAAGTGTATCAACA ATTGGGAAAAGATTTTCCATTGAAAGATCTAGTTCGGATGTTAAGAAAAATGCTCATTTA ACCCATTCAGATGGCACTGCTGTTAGTATTCTTGAGAGGATGGGTTCGGTGTTTGAGGAA CTTCATACTCCTGTCTCAGTAAATGCTGCTGTCGGAACAAATCTTCTTCAGAAGGGAGAG GAAAATATTGGCCAGTTCCTCTACCTTGAAGGAATTGAATATCATATGTGTAATACATAT GATGTTCATTTTTATGCATCGTTTGCTTTGGCCATGCTCTTCCCAAAAGTTGAACTTAGC ATACAACGAGACTATGCAGCTGCTGTGATGATGCATGATCCTAGTAAGAGAAAACTCTTG GATGATGGAATGTCAGCGACAAGGAATGTTCTTGGTGCTCTTCCTCATGATATTGGAATG GATGATCCATGGTTTGAAGTAAATTACTATTGCCTGTATAACACAGATAGGTGGAAAGAT TTGAACCCAAAATTTGTTCTTCAAGTTTACAGGGATTTTGTTGCGACAGGTGACAAAAAG TTTGCCGAAGCTGTTTGGCCGTCTGTGTATATGGCAATAGCTTTCATGGACCAATTTGAT AAGGATGGGGATGGGATGATCGAAAATGAAGGATTTCCTGATCAGACATATGATGTATGG TCTGTCTCTGGTGTGAGTGCTTACTGTGGTGGCCTATGGGTGGCAGCTTTGCAGGCTGCA TCAGCCCTAGCTCGAGAAGTAGGTGATAAGGGTTCTGAAGACTACTTTTGGTTTAAGTTT CAAAAGGCAAAGGAAGTTTATCAAAAATTGTGGAACGGTTCTTACTTCAACTATGATAAT AGTGGCAGTGCCGTAAGCTCATCTATTCAAGCTGATCAATTGGCTGGCCAATGGTATGCT CGAGCATGTGGTCTTCTACCAATTGTTGATGAAGAAAAAGCCAAAACCGCACTTGAGACA GTGTTCAATTTCAATGTCATGAAGGTCAAGGATGGGAGGCGTGGAGCAGTGAATGGAATG CGGCCCAGTGGAGAACCTGACTTGTCTAGTTTGCAGTCAAGGGAGATATGGTCTGGAGTT ACATATGCTGTAGCTGCAGCCATGATTCTTGAAGGCATGGTGGATACGGGATTTAAAACT GCATCTGGAGTCTATGAAACTGTTTGGTCTGAAGATGGCTTTGGCTATGCTTTTCAGACC CCAGAAGGTTGGACCACAGAAGGCCGATACAGAGCTCTGGGTTACATGCGTCCTTTGGCA ATCTGGGCTATGCAGTGGGCATTAAACCCACCTAAGATTCCCAAGCAAGAGGCGAAGCCA AAACTGGAGGCAGATTCATTGTCTAGGCAACATGCTGGTTTTCAAGCGGTAGCTCGTCTT CTAAAGCTGCCCAAAGAGAAAGATGCTAGAAGTGTTTTTCAGGTCCTTTTCGATTACACC TGTAAAAGAATAACAGGCTAATAGAAGCTTTCTGGGAAAGAACCTGCATTCTCATATGCC AGAACAAATATTTCTTGTGGATACATTCATTGTTATTTAACTGAATAAGAGATGGGAAGA GTCAAAGTTACAAATGTGTATCTGTTTGTACAAGACAGAATTCATGTGGAAAAAGAGTTG GCAATTTGTGGGTTCATAGATTATGATTCATATGTTTTT