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JA

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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc01g102990.3.1

CDS Infomation

ATP-dependent clp protease ATP-binding subunit clpx, putative (AHRD V3.3 *** B9SPA4_RICCO)

Sequence

ATGTCTGCCATATTCAGATACAAATCAAAGCTCCATTCTTTCACCTTCAGAACATCTCTT
TTTTCCATATCGTCTTCCAAATTTCATTCCTCTACTTCTTCCTCTTCTCTCAAACCTAGA
AGAAAACCCTCGCTCTTCTTCAACCCACTTGAAGGTTCTAGAGTAGGGCTAGTGTTTAGG
TTCGAGGGTTCTAGACTAGGGTTAGGGTTTAGGCATAAATGGGAGGGAAGTTCCGACAAC
TACGATCACATAAAATCAGAGGTGAACTGCCCACGCTGTTCGAAGATGATGACAGTGTTA
TTCTCTAACAGGCCGTTGTCGATCACCGCCGGGGAGACTGGTATTTACCAGGCGGTGAAT
TTATGTCCTCATTGCCGGACAGCGTTTTACTTTAGACCGTTTAAGTTGGAGCCTTTGCAA
GGGACTTTCATTGAGATTGGGAGGGTTAAGGGAGGTGAAAAGGAGAGTGACGATGAAATG
GCTGGGAGTTCTGGGAAGAATGATGGCAAGATTTGGGAAAAGTTGAGGTCTTATAGTGGG
ACCAATGGTAGTGATGATGGTGGACAGGGTACTTGTGAAACTGAAATGAAGGATTCGGAG
GCGAGAAAGGAAGAAGGGTGGGGAGGTACTAATTTGGGGATTGAGTTGCTTACACCAAAG
GAGATATGTAAAGGCCTTGATCAGTTTGTTGTTGGGCAAGAGAGAGCCAAGAAGGTGCTT
TCTGTTGCAGTTTACAACCATTATAAAAGAATATACCACTCCTCTTTGAATAAAAAGTCA
GATTCTCGTAAAGTTAGAGATGAGCTGGAAAATATTGATAATGATTCGGTCGAATTAGAG
AAGAGCAATGTTTTGCTGATGGGCCCCACTGGCTCAGGGAAAACATTACTTGCCAAGACA
CTTGCTCGTCTCATCAATGTCCCTTTTGTAATTGCGGACGCAACAACTTTAACACAGGCT
GGTTATGTTGGAGAGGATGTGGAATCCGTATTATACAAATTACTCGAGGCTGCTGACTTC
AATATCGAAGCAGCTCAGCAAGGGATTGTCTACATTGACGAAGTTGATAAAATAACCAAA
AAGGCTGAGAGCCTGAACATTGGCAGAGATGTATCTGGGGAGGGCGTCCAACAGGCGCTG
CTGAAGATGCTTGAAGGAACAATCGTAAGTGTACCTGACAATAGAGCACGGAAGCATCCA
CGTGGCGATACTATTCAGATAGATACTAAAGATATCCTTTTTATCTGTGGTGGAGCTTTT
GTTGGTTTAGAGAAGACAATTTCAGAAAGACGACAAGATTCTTCAATCGGATTTGGAGCA
CCTGTTCGTACTAACATGAGAGCTGGTGGTCTAACTGATGCTGTAGTCACATCATCACTT
TTGGAATCTGTAGAAAGTGATGATCTCACTTCATATGGACTCATACCTGAATTTGTGGGA
CGGTTTCCAGTTTTAGTGAGTTTATCTTCCCTTGATGTGGATCAGCTTGTTCAGGTTCTC
ACCGAACCCAAAAATGCTCTTTGCAAGCAATACAAGCAAATGTTCAACTTGAATAATGTC
AAATTACAGTTTACCGGGAATGCACTTCGACTTGTTGCTGAGAAAGCCATTGCCAAAAAC
ACTGGTGCACGTGGCTTAAGATCTATACTAGAAAGTATACTGACTGAAGCCATGTTTGAG
GTTCCTGGAAGCAAGCCAGGCGAGGAATCTGTAGAGGTTGTCTTGGTTGATGAAGAGGCT
GTCGGAACAGCTGATACAATTGGATGTGGAGCAAAAATTCTTTGTGGTAGCAGTGGGCTG
GAGAATATCTCCCCTACTACTGGATCTTCAATGACAATGGAAAAGAAAGAAGCAACCAAA
GAAGACTTGGACTCAGAGTCTGAGGCTCCGGCAAGAGCCTTGAGTTTGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc01g102990.3.1

PEP Infomation

ATP-dependent clp protease ATP-binding subunit clpx, putative (AHRD V3.3 *** B9SPA4_RICCO)

Sequence

MSAIFRYKSKLHSFTFRTSLFSISSSKFHSSTSSSSLKPRRKPSLFFNPLEGSRVGLVFR
FEGSRLGLGFRHKWEGSSDNYDHIKSEVNCPRCSKMMTVLFSNRPLSITAGETGIYQAVN
LCPHCRTAFYFRPFKLEPLQGTFIEIGRVKGGEKESDDEMAGSSGKNDGKIWEKLRSYSG
TNGSDDGGQGTCETEMKDSEARKEEGWGGTNLGIELLTPKEICKGLDQFVVGQERAKKVL
SVAVYNHYKRIYHSSLNKKSDSRKVRDELENIDNDSVELEKSNVLLMGPTGSGKTLLAKT
LARLINVPFVIADATTLTQAGYVGEDVESVLYKLLEAADFNIEAAQQGIVYIDEVDKITK
KAESLNIGRDVSGEGVQQALLKMLEGTIVSVPDNRARKHPRGDTIQIDTKDILFICGGAF
VGLEKTISERRQDSSIGFGAPVRTNMRAGGLTDAVVTSSLLESVESDDLTSYGLIPEFVG
RFPVLVSLSSLDVDQLVQVLTEPKNALCKQYKQMFNLNNVKLQFTGNALRLVAEKAIAKN
TGARGLRSILESILTEAMFEVPGSKPGEESVEVVLVDEEAVGTADTIGCGAKILCGSSGL
ENISPTTGSSMTMEKKEATKEDLDSESEAPARALSL*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc01g102990.3.1

Transcript Infomation

ATP-dependent clp protease ATP-binding subunit clpx, putative (AHRD V3.3 *** B9SPA4_RICCO)

Sequence

AATATGTCAGATATATCCTCTTCTTTCATAAGGGAATTGGGATTAATAAAGCCCATTTAA
GTTCTATTTTAACACTGACCGTTCGAAAAACACAACAAAAAGGCCTATTGGGCCAACACT
CGAGACTCGGGGCGGGTATCGGATGACCCATTTTGTTCCACAACTCCGCCACATCAATTC
ACTGGCCGTCGTGAAACCTCCATTGAAATGCTCGTGAGTGAGCTCAGAAGAACCATAGAA
GAAGAAGAAGGCTTAACAAATGTCTGCCATATTCAGATACAAATCAAAGCTCCATTCTTT
CACCTTCAGAACATCTCTTTTTTCCATATCGTCTTCCAAATTTCATTCCTCTACTTCTTC
CTCTTCTCTCAAACCTAGAAGAAAACCCTCGCTCTTCTTCAACCCACTTGAAGGTTCTAG
AGTAGGGCTAGTGTTTAGGTTCGAGGGTTCTAGACTAGGGTTAGGGTTTAGGCATAAATG
GGAGGGAAGTTCCGACAACTACGATCACATAAAATCAGAGGTGAACTGCCCACGCTGTTC
GAAGATGATGACAGTGTTATTCTCTAACAGGCCGTTGTCGATCACCGCCGGGGAGACTGG
TATTTACCAGGCGGTGAATTTATGTCCTCATTGCCGGACAGCGTTTTACTTTAGACCGTT
TAAGTTGGAGCCTTTGCAAGGGACTTTCATTGAGATTGGGAGGGTTAAGGGAGGTGAAAA
GGAGAGTGACGATGAAATGGCTGGGAGTTCTGGGAAGAATGATGGCAAGATTTGGGAAAA
GTTGAGGTCTTATAGTGGGACCAATGGTAGTGATGATGGTGGACAGGGTACTTGTGAAAC
TGAAATGAAGGATTCGGAGGCGAGAAAGGAAGAAGGGTGGGGAGGTACTAATTTGGGGAT
TGAGTTGCTTACACCAAAGGAGATATGTAAAGGCCTTGATCAGTTTGTTGTTGGGCAAGA
GAGAGCCAAGAAGGTGCTTTCTGTTGCAGTTTACAACCATTATAAAAGAATATACCACTC
CTCTTTGAATAAAAAGTCAGATTCTCGTAAAGTTAGAGATGAGCTGGAAAATATTGATAA
TGATTCGGTCGAATTAGAGAAGAGCAATGTTTTGCTGATGGGCCCCACTGGCTCAGGGAA
AACATTACTTGCCAAGACACTTGCTCGTCTCATCAATGTCCCTTTTGTAATTGCGGACGC
AACAACTTTAACACAGGCTGGTTATGTTGGAGAGGATGTGGAATCCGTATTATACAAATT
ACTCGAGGCTGCTGACTTCAATATCGAAGCAGCTCAGCAAGGGATTGTCTACATTGACGA
AGTTGATAAAATAACCAAAAAGGCTGAGAGCCTGAACATTGGCAGAGATGTATCTGGGGA
GGGCGTCCAACAGGCGCTGCTGAAGATGCTTGAAGGAACAATCGTAAGTGTACCTGACAA
TAGAGCACGGAAGCATCCACGTGGCGATACTATTCAGATAGATACTAAAGATATCCTTTT
TATCTGTGGTGGAGCTTTTGTTGGTTTAGAGAAGACAATTTCAGAAAGACGACAAGATTC
TTCAATCGGATTTGGAGCACCTGTTCGTACTAACATGAGAGCTGGTGGTCTAACTGATGC
TGTAGTCACATCATCACTTTTGGAATCTGTAGAAAGTGATGATCTCACTTCATATGGACT
CATACCTGAATTTGTGGGACGGTTTCCAGTTTTAGTGAGTTTATCTTCCCTTGATGTGGA
TCAGCTTGTTCAGGTTCTCACCGAACCCAAAAATGCTCTTTGCAAGCAATACAAGCAAAT
GTTCAACTTGAATAATGTCAAATTACAGTTTACCGGGAATGCACTTCGACTTGTTGCTGA
GAAAGCCATTGCCAAAAACACTGGTGCACGTGGCTTAAGATCTATACTAGAAAGTATACT
GACTGAAGCCATGTTTGAGGTTCCTGGAAGCAAGCCAGGCGAGGAATCTGTAGAGGTTGT
CTTGGTTGATGAAGAGGCTGTCGGAACAGCTGATACAATTGGATGTGGAGCAAAAATTCT
TTGTGGTAGCAGTGGGCTGGAGAATATCTCCCCTACTACTGGATCTTCAATGACAATGGA
AAAGAAAGAAGCAACCAAAGAAGACTTGGACTCAGAGTCTGAGGCTCCGGCAAGAGCCTT
GAGTTTGTGATCTCAGTGGTCTGTTACTTCTCAATTTTCTTTTTGTGTGAATTCTTGTAT
ATAAAGTATTGTCAGACATGCAAAGCTAGTTGGGGTTCCTTTTTCTTAAAAGAAGGCTTT
TTGTAAACCTGGATTTTTGAACTCCGGTTGAGTTTTTTTATATTAAGTTCGACAGGCTCT
TCCCCCGGATACCCGATCGAATCCATTTTGACTTCCAGGACGATGCTAAAAACTATGCAG
TTCCGTTTTCATTCCTATTTGATGCAACACGATTGGTTAGTTTGAATTGGAAACAGTGTT
AAGGAGGGATTCTATGTTGTAATTGTATGGTGAGTTTTTCTTTGATATGCTCGCCCTCTT
ATTCCTTTTCTCTGCAGCAACAGTAGATATATGTATGGATTTTGCATAAGTTGGACACTG
CGTTCTCCAATCATAATAGAACATCATCTCTCTTTGGAGATTAGTTAGAGCTTTGGTTAT
GTCAGTGATTCATGAAAATACTCGCTCAACTCCATGTACCCTTAATTCCAAGGAATGAGT
GCATGAGCTTAGTTCAAGTTCAAGCAGCTTCATTTGTACAGTAGCTATTTTCAAGAAATT
AATCACTCAAGCATCAGAAAGGACCGATGCAGTAGTGATGTTTCTTCTTTATCTTGTCTA
GCGAAGGTTTTTCGAGTTTCGAAGTTAACTAAGGATGGTTGAGCTGGTGCAGCGATAGCT
ATTTTTGTTCATCTGACTGCGATATTTATCTTCTCTAGCCTGACGACTTTAGCCTACATT
TAAAAGCTGAAATCCTTGACATATTGCTAATGTCCAACATTAAAATGCTGAATCCTTGAC
ATAATTTTTTACCATTTCAGTTTGCCTGGACTTTTTCAGACAATGAATTATGAATTAATC
CTTCAACCTTTTTTTTTTTGGGGGGGGAGTCATTTTCATGAATTATTCTTCAGAGTCCAA
GACTAACATACATAATTACGAGTTTCATCTTTTCTTAATGAATTCAGCGATCATGTCTAC
AGGATTCATCGTCTCTGTTGCTTCATTAGTTAGTCTAATGAATGCCTTTTAGTTTGCCCA
ACATTTCTCCTAATTTAGCACTACTTTGTCTTTCTTTTTTTTTTTCGAGTTTCAAACCTC
GTTTTGCTTTCATTCCGATGACAGATTTTTGTTTATCTAACTATGCAGAACAAATGACAA
ATAAAAGAGCAAACACGAATTTATATAATTTTCTTCCCAACCTTTTTGTCATTATTTTTT
TTTTATAAAAAAGACAAAAAAATGATAATTCAAATAATGATTAATTACATATATATTTTT
TAAAATCTGAATTATTGAACCCGCGGAAATAATTGTTTTGTAGAATTTTGAAATGTATAT
ATATGTGGTCCTTCTCGCTAAACTGAAAGAAACACACAAGCCTTCTCTCTCTCTCTTCCA
ATGGATTTTTCTTATGAAGCTTAGGTTCTTAGGTTTTTATGTGTTTTGTCTTAGGCTTAA
TTGTGTCTTAAGGTTCCTTAGGATTTTATGTTGGAGAATTTGACTTCTTGATGGATTTCG
TAATTGATATTGTTTTACCTCATTGGTTTGTTATGTTAAAAAATTTACAATGTCTTTGTG
ATTTTCGTCAAGATTCTACTATGTTTTTTTGTGTTTTTTTACCAAGATTCTACAATGTCT
TCGTGTTTTTCACCAAGATTCTACATTGTCTTTGTGATTTTTGCCAAGATTACAATGTCG
TTGTGTTTTTCACCAAGATTCTACAATGTCTTTGTGATTTTTCACCATGATTCTACATTG
TATTTGTGATTTTTTACCAAGATTCTACAATGTCTTTTCTGTAGTGAAGAATGCATGGTA
CCTATAGTTGTCTGATGGATATCTTGGTAACTAATTTTAGGCTTTTCTCTAGGGTTGTAA
ATGTTTGTGAAATCTGCAATGGTGAAGTACTTGATTAGATCAAATAGATGTCTGGGTTCT
TCATGTAAGCTTTCTCTTCTTCTTTTTTCTTGATGGATTTTCGTACTGCTATTTCAAAAT
TCTCTTATGCCTACTGTATTTTAATTGTGTCTTAGGTTCTTTAGGGCTTTATGTTGGAGA
ATCTGACTTCTTGATGTTTCTTGATTGGAATTCATCAGTAATTGATATTGTTTTGGTTTT
GGTCTGTTATGTTCTGAATTTACAATGTTTATGTGAATTTTTAACAAGATTGTACTATGT
CTTTTCTTTAGTGAAGAATGTATGGTACCTACAGTTGTCTGATGGATGTTTTAACTACTT
TTAGGCTTTTCTCTAGGGTTGTAACTGATTGTGGAATCTTTAATGGTGAAGTACTTGGAT
CAAAGAGATTACTGGGTTCTTTGTTGCTTTTTTTTCCCCTTTAAAATTTACCAAGAGTTG
AATGCCTGCTTCTATAAGATTGGATGGTATTATTTATTTTTAATAATCAGTGTGTGTTGT
CTTTGTCTTCAAGTAAGCTTCCTCTCTTCTTCTTCATTTTTTGATGGATTTTCTTACTGC
TATTTCAAGATTTTCTTATGATATCTACTGTATATTGTCTTAGGTTCTTTAGGGATTTAT
ATAAAGAATTTGACTTCTTGATGTTTCTTGATTGGCATTCAACAATGTAATTGATATTCT
TTTGCTTTAGTAGTTTATTATGTTCAAGTATTTACAATGTCTATGCGAATTTTCCACTTT
GATGGTTGTTTTCTTCTTTGGCGATGCCTATGCCTAATTCTAGTGCTAATATGCAAGAGG
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TTTGCAACTGGAGCATGGAAGATGGAACAATTTGCATTCCGATTCTGACATTGTCCAATA
GTTTGGTCGACAGCTATCATCTTGCTTCACCTAAATCTGTTGTAATTTCTCATCCTAAGC
ACCATTTAATTATTAAAATGCTGGTCAAAGCACTAAAAACATATGGTATAGAAAAAACTT
TGTATTCATTTTAGCAGATTGCTTTTGGTTCAAGGTGAATGAGTAGTAGAAAATCCTCGA
GTTCTTTGATAAGTAATCCTTGCAAACATTTGTATACAAATACTTCTTAATGTAGCATAT
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GATCCTCCTTTTTCATAATGACAGCACTAGTTTAGGCCTAGGCTATTTCACTGGTGAATC
TGTTTTGCTTTACTTATTACAGAAGTCAGAAACAGTAAGCATAAGAAGAAAAGTTGAAAG
CAAACTGAAGTAGTGTGTTTTGGAAGAACAGAGTAGATTTAATTGTTTTGGTCACTGATA
GTACGGGAGGCTCTTAGTATTCATCAATAACTGATAGTACTGATGTCAAGTCAGATTCCG
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ATGTTTTACTGATGGTCCCCACTGACTCAGATATGATATCTGATTTCTAGT