Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc01g102800.3.1

CDS Infomation

Histidyl-tRNA synthetase (AHRD V3.3 *** A0A072VJI1_MEDTR)

Sequence

ATGGCGGAAGAGAGACGCATGGTTACAGTGGGCGGAAAAGGCTCATCACTGTCATCTTCC
TCTGTATTTGATATTGCCAATGGGCTCAGTCGTCTGAGCATAGACTCTTCAGCACTCTCC
AAAGTATCGTCTTCCTCCAATGCTAAAACCAGCAAGACTAATGCGCCTACGGTGTCTGCA
TCATTTTCAATCCTCAGTAATTTAACATCCGATGAGGCTAGAGCTTCTCTCGTGGTCCTG
CTCAACAAGCTTTTGCTTTCTTCTTCCACTTCTGCAGCTGTTAATCAGCTCTCTGATATC
ATCCTTAAGGATGTATTGTCGTCCTCTAATGTGCAAATTTCGTTTGATAACACTATTGAT
GGCGTTTCTCCGGGTGATTTTTCTGTGGCAGCAATAGCTGGAATCTCCGCTATCTTGGAT
CATCGAAGTTCAGCTTTGTCTGTTATTACTGATGCTATTGCTGCCTTGTCCTGCGAGGCC
TTGGGGGCTGACATTTCAGCTTTCAATTTGAATGATTCCGGTGATGGTTCATCTGCCAAG
GACGTTGTTGCCGTGGCTTCTGACTTGAAGATCTTGCTTAACGGTTCTAAATTTGTTAAC
CGTGAGGGTGATGAACCTGCAGTTTCTGGTGTTCCCGTGGTGCACGGCAAGTTTAGGGAG
ATTTCCCGACTCCTGCACTCCAGCACCCGTGTCCAATTGAACTCTGCAACTGTATCCAAT
TCTGGATCTTCTGGTACAGCCAGCTCCATGTGCACCACGCTGTTTTCCTTGGCTGTGGCC
CTCAAGGATTTGGGTAACATCAGTTATAACCGAGCAAAGCGCATTGTCGATTCTCGCATT
ACTGGAGATGATGAATTTCCTGCAATGCTGATAAAAGAATGTCCTCGCCCTGATCAGCTA
AAAGCTCTTTTCGCATCTTTGGTGTCAGCTCACTCGGATGAGGAATATGTTAAGTTCTCA
CATGATGTCAGCTCTTTACTGGTGATGGTAGAGAAAATAATTTCCTGGGAAGCCCTGGCT
GCTTTCCTTTCCCTTGAAGGAAGGGACTTCATTCCTTCAGGCGATACGAGTGTAGGCGAA
GACAGTGCAAAGACAGCAGCTAAAAAAGGAGCAAAGAAAAAGAAGATTCTTGGTAAAGGT
ACCACCGCTCTGGTGCAGTTTTTGAAGGATAGGCTGCTGAGCATGCCAATTCAGACTGAA
GCGTCCCAGACTGTCATGGCTTTGGAGAATTTGGTTCGCAATTTCTTGTCACTACTGGAC
CCAAAGGACTTGGGATTTGACACTTTACTGAAAAAGGTGAAAGATATAGTGGAAAGCAAT
GAAAGCCGCCGGTTGCCTAAACTACCAAAGGGAACACGTGATTTTGCAAAGGAACAGATG
GCTATAAGAGAGAGAGCTTTCTCAATTATCACTGAAGTTTTTAAAAGACACGGTGCTGCT
GCTTTGGACACTCCTGCTTTTGAAATGCGAGAGACTCTGATGGGCAAATATGGAGAAGAC
TCAAAATTGATATATGATCTAGCGGATCAGGGAGGAGAACTTTGTTCTCTTCGTTATGAC
CTGACAGTACCATTTGCTAGATATGTAGCAATGAATGGTCTGACATCCTTCAAGCGTTAT
CAGATAGCTAAGGTGTACAGAAGAGATAATCCATCTAAGGGTAGATATCGTGAATTTTAC
CAGTGTGATTTTGACATAGCTGGTCAATTTGAGAAGATGATGCCTGATTTTGAGGTCATA
AAGATTTTGACCGAGTTGTTAGATGAGCTTGATATTGGAGAGTATGAGGTAAAGCTTAAT
CACAGAAAGCTGCTTGATGGTATGTTGGCTATATGTGGGGTGCCACAAGAGAAGTTCAGA
ACCATTTGTTCAAGCATTGACAAGCTAGATAAACAATCCTTTGAGCAGATAAAAAAAGAA
ATGGTGGATGAGAAAGGCTTAAGTAATGAGATATCAGACAGAATTGGTACATTTGTCAAA
TGGAGGGGACCTCCAGTGGAATTATTATCTAAGCTCAAGCAAGAACGCAGTTTTCTGGAG
AACAATGAATCTTCACTTGCTTTGGATGAATTAGAGATTATGTTTAAAGCTCTGGAGAAG
TCCAAGTGTATTGACAGAGTGGTTTTTGACTTGAGCCTTGCAAGAGGCCTTGATTACTAC
ACAGGAGTCATATTTGAAGCAGTCTTCAAAGGAGCTGCTCAGGTTGGTTCGATTGCTGCT
GGTGGACGTTATGACAACCTGATAGGGATGTTTGGGACACGGCAGGTTCCTTCTGTTGGG
ATCAGTCTGGGAATAGAGAGAGTATTTGCAATCATGGAACAGCTTCAGAAAGACAAAAAT
CAGGAAATTCGAGCCACTGAAACTCAAGTTCTCGTTAGCATTCTTGGTGATGACAGTGCT
TTGGCTGCTGAGCTAGCTGGTGAATTGTGGAATGCTAAAGTGAAAGCAGAATTCATGATC
CATAAAAAAGTGATGAAGCACATTGATCGGGCCAGAGATTCGAGGATCCCTTGGATGGTA
CTTGTTGGTGAACGCGAACTTAGTGAAGGAGTTGTAAAATTGAAGGATGTTGTTGCAGCT
ATTGACTATGAGATTCCCAGAGGTAAGCTCGTGGACGATCTATGCAAACGATTAGGCATG
TAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc01g102800.3.1

PEP Infomation

Histidyl-tRNA synthetase (AHRD V3.3 *** A0A072VJI1_MEDTR)

Sequence

MAEERRMVTVGGKGSSLSSSSVFDIANGLSRLSIDSSALSKVSSSSNAKTSKTNAPTVSA
SFSILSNLTSDEARASLVVLLNKLLLSSSTSAAVNQLSDIILKDVLSSSNVQISFDNTID
GVSPGDFSVAAIAGISAILDHRSSALSVITDAIAALSCEALGADISAFNLNDSGDGSSAK
DVVAVASDLKILLNGSKFVNREGDEPAVSGVPVVHGKFREISRLLHSSTRVQLNSATVSN
SGSSGTASSMCTTLFSLAVALKDLGNISYNRAKRIVDSRITGDDEFPAMLIKECPRPDQL
KALFASLVSAHSDEEYVKFSHDVSSLLVMVEKIISWEALAAFLSLEGRDFIPSGDTSVGE
DSAKTAAKKGAKKKKILGKGTTALVQFLKDRLLSMPIQTEASQTVMALENLVRNFLSLLD
PKDLGFDTLLKKVKDIVESNESRRLPKLPKGTRDFAKEQMAIRERAFSIITEVFKRHGAA
ALDTPAFEMRETLMGKYGEDSKLIYDLADQGGELCSLRYDLTVPFARYVAMNGLTSFKRY
QIAKVYRRDNPSKGRYREFYQCDFDIAGQFEKMMPDFEVIKILTELLDELDIGEYEVKLN
HRKLLDGMLAICGVPQEKFRTICSSIDKLDKQSFEQIKKEMVDEKGLSNEISDRIGTFVK
WRGPPVELLSKLKQERSFLENNESSLALDELEIMFKALEKSKCIDRVVFDLSLARGLDYY
TGVIFEAVFKGAAQVGSIAAGGRYDNLIGMFGTRQVPSVGISLGIERVFAIMEQLQKDKN
QEIRATETQVLVSILGDDSALAAELAGELWNAKVKAEFMIHKKVMKHIDRARDSRIPWMV
LVGERELSEGVVKLKDVVAAIDYEIPRGKLVDDLCKRLGM*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc01g102800.3.1

Transcript Infomation

Histidyl-tRNA synthetase (AHRD V3.3 *** A0A072VJI1_MEDTR)

Sequence

GATTCCAATCGCACTCAAGCCCAAGTGTAACGCAAAACAAAACAAACCCCAAAACTCTTG
GGTTGAAACCCATTTGCAAAACCTAATTCCCAAAATTCCGTTTCTGCAGCCCATTTCCCC
CCCAAAAAACCCTCAATCCGTCACCTTCTAAACCCCCATTAATCCCTTCGCCGGCGATTT
TGCCGGAAAACCCAACATCATCTTTCTGATTCGGTGACCCATGGCGGAAGAGAGACGCAT
GGTTACAGTGGGCGGAAAAGGCTCATCACTGTCATCTTCCTCTGTATTTGATATTGCCAA
TGGGCTCAGTCGTCTGAGCATAGACTCTTCAGCACTCTCCAAAGTATCGTCTTCCTCCAA
TGCTAAAACCAGCAAGACTAATGCGCCTACGGTGTCTGCATCATTTTCAATCCTCAGTAA
TTTAACATCCGATGAGGCTAGAGCTTCTCTCGTGGTCCTGCTCAACAAGCTTTTGCTTTC
TTCTTCCACTTCTGCAGCTGTTAATCAGCTCTCTGATATCATCCTTAAGGATGTATTGTC
GTCCTCTAATGTGCAAATTTCGTTTGATAACACTATTGATGGCGTTTCTCCGGGTGATTT
TTCTGTGGCAGCAATAGCTGGAATCTCCGCTATCTTGGATCATCGAAGTTCAGCTTTGTC
TGTTATTACTGATGCTATTGCTGCCTTGTCCTGCGAGGCCTTGGGGGCTGACATTTCAGC
TTTCAATTTGAATGATTCCGGTGATGGTTCATCTGCCAAGGACGTTGTTGCCGTGGCTTC
TGACTTGAAGATCTTGCTTAACGGTTCTAAATTTGTTAACCGTGAGGGTGATGAACCTGC
AGTTTCTGGTGTTCCCGTGGTGCACGGCAAGTTTAGGGAGATTTCCCGACTCCTGCACTC
CAGCACCCGTGTCCAATTGAACTCTGCAACTGTATCCAATTCTGGATCTTCTGGTACAGC
CAGCTCCATGTGCACCACGCTGTTTTCCTTGGCTGTGGCCCTCAAGGATTTGGGTAACAT
CAGTTATAACCGAGCAAAGCGCATTGTCGATTCTCGCATTACTGGAGATGATGAATTTCC
TGCAATGCTGATAAAAGAATGTCCTCGCCCTGATCAGCTAAAAGCTCTTTTCGCATCTTT
GGTGTCAGCTCACTCGGATGAGGAATATGTTAAGTTCTCACATGATGTCAGCTCTTTACT
GGTGATGGTAGAGAAAATAATTTCCTGGGAAGCCCTGGCTGCTTTCCTTTCCCTTGAAGG
AAGGGACTTCATTCCTTCAGGCGATACGAGTGTAGGCGAAGACAGTGCAAAGACAGCAGC
TAAAAAAGGAGCAAAGAAAAAGAAGATTCTTGGTAAAGGTACCACCGCTCTGGTGCAGTT
TTTGAAGGATAGGCTGCTGAGCATGCCAATTCAGACTGAAGCGTCCCAGACTGTCATGGC
TTTGGAGAATTTGGTTCGCAATTTCTTGTCACTACTGGACCCAAAGGACTTGGGATTTGA
CACTTTACTGAAAAAGGTGAAAGATATAGTGGAAAGCAATGAAAGCCGCCGGTTGCCTAA
ACTACCAAAGGGAACACGTGATTTTGCAAAGGAACAGATGGCTATAAGAGAGAGAGCTTT
CTCAATTATCACTGAAGTTTTTAAAAGACACGGTGCTGCTGCTTTGGACACTCCTGCTTT
TGAAATGCGAGAGACTCTGATGGGCAAATATGGAGAAGACTCAAAATTGATATATGATCT
AGCGGATCAGGGAGGAGAACTTTGTTCTCTTCGTTATGACCTGACAGTACCATTTGCTAG
ATATGTAGCAATGAATGGTCTGACATCCTTCAAGCGTTATCAGATAGCTAAGGTGTACAG
AAGAGATAATCCATCTAAGGGTAGATATCGTGAATTTTACCAGTGTGATTTTGACATAGC
TGGTCAATTTGAGAAGATGATGCCTGATTTTGAGGTCATAAAGATTTTGACCGAGTTGTT
AGATGAGCTTGATATTGGAGAGTATGAGGTAAAGCTTAATCACAGAAAGCTGCTTGATGG
TATGTTGGCTATATGTGGGGTGCCACAAGAGAAGTTCAGAACCATTTGTTCAAGCATTGA
CAAGCTAGATAAACAATCCTTTGAGCAGATAAAAAAAGAAATGGTGGATGAGAAAGGCTT
AAGTAATGAGATATCAGACAGAATTGGTACATTTGTCAAATGGAGGGGACCTCCAGTGGA
ATTATTATCTAAGCTCAAGCAAGAACGCAGTTTTCTGGAGAACAATGAATCTTCACTTGC
TTTGGATGAATTAGAGATTATGTTTAAAGCTCTGGAGAAGTCCAAGTGTATTGACAGAGT
GGTTTTTGACTTGAGCCTTGCAAGAGGCCTTGATTACTACACAGGAGTCATATTTGAAGC
AGTCTTCAAAGGAGCTGCTCAGGTTGGTTCGATTGCTGCTGGTGGACGTTATGACAACCT
GATAGGGATGTTTGGGACACGGCAGGTTCCTTCTGTTGGGATCAGTCTGGGAATAGAGAG
AGTATTTGCAATCATGGAACAGCTTCAGAAAGACAAAAATCAGGAAATTCGAGCCACTGA
AACTCAAGTTCTCGTTAGCATTCTTGGTGATGACAGTGCTTTGGCTGCTGAGCTAGCTGG
TGAATTGTGGAATGCTAAAGTGAAAGCAGAATTCATGATCCATAAAAAAGTGATGAAGCA
CATTGATCGGGCCAGAGATTCGAGGATCCCTTGGATGGTACTTGTTGGTGAACGCGAACT
TAGTGAAGGAGTTGTAAAATTGAAGGATGTTGTTGCAGCTATTGACTATGAGATTCCCAG
AGGTAAGCTCGTGGACGATCTATGCAAACGATTAGGCATGTAATATCTTAAGCTCTTTGT
ATTGGTAGATTGAATAATTTTTTAGCAAGATTCCATTTTTGGGGGGTTTAAAATCCACCA
TGTTGGTGGAGGGTTAGACATTGACCCTTGTCCATTAATCCACAAAATGTACTACATATT
TCAGTAACCTTACTATACTTTTGTTGAATATTAAGGAGATCAAATTTTCGAAACACTATA
TTTGATCCTACTTACGCAAAATTCACATCCAAGGCAAG