Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g102790.3.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A0K9NUC3_ZOSMR)
Sequence	ATGTCACACTTGCACACGGCTGCATTGAAAGCCACCAAATTAATCCACTTGAAACAGTTT CATGCGCAGCTCTTTCAACGCTCTCTCTGTTCCGACAATTATTGGGTGGCGCAGCTCATC AAACTCTGCACGCGCCTCCACGCTCCGTCCACTTATGTTAGCCGAGTTTTTGATTCAGTC CACCAACCCAATGTCTTTGTTTTCACTAATATTCTCAAGTTCTACTCTCAATTGGGTGCC TACAGTGATGTTCTCTACCTGTTTGACAAAATGCAGAAATCCAATGTAGCCCCTGATGCA TTTGTATACCCGATTCTCATCAAAGCATCTGGAAAATGGGGCATTGTGTTCCATGCTCAT TGTATCAAGATGGGTCATGATTGGGATAGGTTTGTTCGCAATGCGATTATGGATGTGTAT GGAAAGTTTGGGCCTTTGGAGATTGCGCGGGAACTGTTTGATGAAATTCCTGAGAGAGCT GTTGCAGATTGGAATGCTATGATTTCTGGGTGTTGGAATTGGGGGGATGAAGTTGAAGCG AGGAGTTTGTTTGATTTGATGCCTGAGAAGAATGTGGTTACTTGGACTGCAATGGTTACT GGTTATTCAAGAAGGAAAGATTTGGAGAATGCTAGGAAGTATTTTGATCAAATGCCGGAG AGGAGTGTTGTGTCTTGGAATGCAATGCTGTCGGGGTATGCTCAAAATGGGTGTGCTGAA GAGGTTATAAAGTTGTTTAATGAGATGATGAGTTGTGAGGTTTGCCCTGATGAAACTACA TGGGTTACTGTCATTTCTTTGTGTTCTTCGCATGGTGATGTTAGCCTTGCCGAAGGGCTT GTTAAGATGATAAATGAGAAGGGTGTTCGCTTAAATTGTTTTGCAAAGACTGCTCTACTT GACATGTATGCTAAGTGTGGGAACCTTGCTATGGCTAGAAAGATCTTTGACGAATTAGGT ACGTACAAGAACTTAGTTACATGGAATGCAATGATTTCAGCATATGCAAGAGTTGGTGAT TTGGCTTCTGCGAGAGGGCTCTTTGATAAGGTGCCTGAGAAGAATGTCATCTCTTGGAAT TCAATAATAGCTGGTTACGCTCAAAATGGAGAATCAAAAGTGGCTATTGACCTTTTCAAA GATATGATAGCAAAGGATGTGCTGCCAGACGAAGTCACCATGGTTAGTGTGATCTCGGCC TGTGGCCACCTTGGGGCTTTGGAATTTGGTAATTGGGCAGTAAATTTCCTGGAAAAGCAT CAAATCAAACTGAGCATTTCAGGTTATAATGCTCTGATCTTCATGTATTCCAAGTGTGGT AATATGAAAGACGCGGAGAAAGTTTTCCAATCGATGGAAGCCAGAGATGTGATTTCTTAT AACACATTGATTACAGGTGTTGCAGCTTATGGCAATGCCATTGAAGCTGTTGAATTGTTG TGGAAGATGAAGAAAGAAAATATTGAACCAGATCGAATAACCTATATAGGGGTACTAACA GCATGTAGTCATGGTGGACTGCTAAAAGAAGGTCAAAGGATATTTGATTCAATCAAAGAT CCAGACTCCGATCACTATGCATGCATGGTTGATTTGTTAGGTAGAAATGGTAAACTAGAC GAAGCAAAATGTTTGATTGGAAGTATGGCAATGCATCCACATGCAGGAGTATATGGTTCC CTTTTACATGCTAGTCGAGTTCACAAAAGGATAGACCTGGGAGAGTTTGCAGCTAGTAAG CTCTTTGAAATAGAACCAGAAAATTCAGGTAATTACGTTTTGCTTTCAAATATATACGCC TCAGCAAGAAGATGGGAAGATGTAGACAGGGTGAGAGGGTTGATGACAATTGGAGGAGTA AAGAAAACGACTGGATGGAGTTGGATTGAACACAAGGGGGAGATGCACAAGTTTATAGTG GGTGACAGGTCACACGAGCGAACTGCAGATATTCATAGAGTGCTCTTTGAAACAGAAAAG AAGATGAAGTTAGCTGGATATATGGCTGATAAGAGCTGTGTTCTAAAAGATGTTGAAGAA GAAGAGATGGAAGAGATGGTAGGGACCCATAGCGAGAAGATGGCTGTCGCTTTTGCTCTT CTTGTTACTGAACCACACTCGGTCATAAGGGTGGTGAAGAATCTCAGGATATGTAGGGAT TGCCACACAGCAATCAAAATCATTTCAAAGATGGAGGGGAGGGAGATCATTGTTAGAGAT AATAATCGGTTTCACTGCTTCAGTGAAGGGCAGTGTTCTTGTAAAGACTATTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g102790.3.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A0K9NUC3_ZOSMR)
Sequence	MSHLHTAALKATKLIHLKQFHAQLFQRSLCSDNYWVAQLIKLCTRLHAPSTYVSRVFDSV HQPNVFVFTNILKFYSQLGAYSDVLYLFDKMQKSNVAPDAFVYPILIKASGKWGIVFHAH CIKMGHDWDRFVRNAIMDVYGKFGPLEIARELFDEIPERAVADWNAMISGCWNWGDEVEA RSLFDLMPEKNVVTWTAMVTGYSRRKDLENARKYFDQMPERSVVSWNAMLSGYAQNGCAE EVIKLFNEMMSCEVCPDETTWVTVISLCSSHGDVSLAEGLVKMINEKGVRLNCFAKTALL DMYAKCGNLAMARKIFDELGTYKNLVTWNAMISAYARVGDLASARGLFDKVPEKNVISWN SIIAGYAQNGESKVAIDLFKDMIAKDVLPDEVTMVSVISACGHLGALEFGNWAVNFLEKH QIKLSISGYNALIFMYSKCGNMKDAEKVFQSMEARDVISYNTLITGVAAYGNAIEAVELL WKMKKENIEPDRITYIGVLTACSHGGLLKEGQRIFDSIKDPDSDHYACMVDLLGRNGKLD EAKCLIGSMAMHPHAGVYGSLLHASRVHKRIDLGEFAASKLFEIEPENSGNYVLLSNIYA SARRWEDVDRVRGLMTIGGVKKTTGWSWIEHKGEMHKFIVGDRSHERTADIHRVLFETEK KMKLAGYMADKSCVLKDVEEEEMEEMVGTHSEKMAVAFALLVTEPHSVIRVVKNLRICRD CHTAIKIISKMEGREIIVRDNNRFHCFSEGQCSCKDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g102790.3.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A0K9NUC3_ZOSMR)
Sequence	ATGTCACACTTGCACACGGCTGCATTGAAAGCCACCAAATTAATCCACTTGAAACAGTTT CATGCGCAGCTCTTTCAACGCTCTCTCTGTTCCGACAATTATTGGGTGGCGCAGCTCATC AAACTCTGCACGCGCCTCCACGCTCCGTCCACTTATGTTAGCCGAGTTTTTGATTCAGTC CACCAACCCAATGTCTTTGTTTTCACTAATATTCTCAAGTTCTACTCTCAATTGGGTGCC TACAGTGATGTTCTCTACCTGTTTGACAAAATGCAGAAATCCAATGTAGCCCCTGATGCA TTTGTATACCCGATTCTCATCAAAGCATCTGGAAAATGGGGCATTGTGTTCCATGCTCAT TGTATCAAGATGGGTCATGATTGGGATAGGTTTGTTCGCAATGCGATTATGGATGTGTAT GGAAAGTTTGGGCCTTTGGAGATTGCGCGGGAACTGTTTGATGAAATTCCTGAGAGAGCT GTTGCAGATTGGAATGCTATGATTTCTGGGTGTTGGAATTGGGGGGATGAAGTTGAAGCG AGGAGTTTGTTTGATTTGATGCCTGAGAAGAATGTGGTTACTTGGACTGCAATGGTTACT GGTTATTCAAGAAGGAAAGATTTGGAGAATGCTAGGAAGTATTTTGATCAAATGCCGGAG AGGAGTGTTGTGTCTTGGAATGCAATGCTGTCGGGGTATGCTCAAAATGGGTGTGCTGAA GAGGTTATAAAGTTGTTTAATGAGATGATGAGTTGTGAGGTTTGCCCTGATGAAACTACA TGGGTTACTGTCATTTCTTTGTGTTCTTCGCATGGTGATGTTAGCCTTGCCGAAGGGCTT GTTAAGATGATAAATGAGAAGGGTGTTCGCTTAAATTGTTTTGCAAAGACTGCTCTACTT GACATGTATGCTAAGTGTGGGAACCTTGCTATGGCTAGAAAGATCTTTGACGAATTAGGT ACGTACAAGAACTTAGTTACATGGAATGCAATGATTTCAGCATATGCAAGAGTTGGTGAT TTGGCTTCTGCGAGAGGGCTCTTTGATAAGGTGCCTGAGAAGAATGTCATCTCTTGGAAT TCAATAATAGCTGGTTACGCTCAAAATGGAGAATCAAAAGTGGCTATTGACCTTTTCAAA GATATGATAGCAAAGGATGTGCTGCCAGACGAAGTCACCATGGTTAGTGTGATCTCGGCC TGTGGCCACCTTGGGGCTTTGGAATTTGGTAATTGGGCAGTAAATTTCCTGGAAAAGCAT CAAATCAAACTGAGCATTTCAGGTTATAATGCTCTGATCTTCATGTATTCCAAGTGTGGT AATATGAAAGACGCGGAGAAAGTTTTCCAATCGATGGAAGCCAGAGATGTGATTTCTTAT AACACATTGATTACAGGTGTTGCAGCTTATGGCAATGCCATTGAAGCTGTTGAATTGTTG TGGAAGATGAAGAAAGAAAATATTGAACCAGATCGAATAACCTATATAGGGGTACTAACA GCATGTAGTCATGGTGGACTGCTAAAAGAAGGTCAAAGGATATTTGATTCAATCAAAGAT CCAGACTCCGATCACTATGCATGCATGGTTGATTTGTTAGGTAGAAATGGTAAACTAGAC GAAGCAAAATGTTTGATTGGAAGTATGGCAATGCATCCACATGCAGGAGTATATGGTTCC CTTTTACATGCTAGTCGAGTTCACAAAAGGATAGACCTGGGAGAGTTTGCAGCTAGTAAG CTCTTTGAAATAGAACCAGAAAATTCAGGTAATTACGTTTTGCTTTCAAATATATACGCC TCAGCAAGAAGATGGGAAGATGTAGACAGGGTGAGAGGGTTGATGACAATTGGAGGAGTA AAGAAAACGACTGGATGGAGTTGGATTGAACACAAGGGGGAGATGCACAAGTTTATAGTG GGTGACAGGTCACACGAGCGAACTGCAGATATTCATAGAGTGCTCTTTGAAACAGAAAAG AAGATGAAGTTAGCTGGATATATGGCTGATAAGAGCTGTGTTCTAAAAGATGTTGAAGAA GAAGAGATGGAAGAGATGGTAGGGACCCATAGCGAGAAGATGGCTGTCGCTTTTGCTCTT CTTGTTACTGAACCACACTCGGTCATAAGGGTGGTGAAGAATCTCAGGATATGTAGGGAT TGCCACACAGCAATCAAAATCATTTCAAAGATGGAGGGGAGGGAGATCATTGTTAGAGAT AATAATCGGTTTCACTGCTTCAGTGAAGGGCAGTGTTCTTGTAAAGACTATTGGTAA