Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g101150.2.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9RFQ7_RICCO)
Sequence	ATGGTGATAAAGCTCTCAACTTTAATTCTTCCCAAGAAAATTCCCAAATGGGTTTGTTCA AAACCCTATTTTTCTTCACTTTCTTGTGCTTGTAAAATTCAGAACAATCCAGAATCCAAA CAAACCTCTACCAGTTCTTCTGACTTTGAAACCAAAATTCAATATTTAAAGAATAAGCTT CACCCAGAAACATTAGTAGGCGTTCTTCATTCCACAGCTGATTTGGATTCTTCATTGAAG TTATTCAAATGGGCTTCCCTTCAAAAAAGGTTTCATCACTCTGCTGATACTTATTTTCAA ATTATCTTGAAGTTAGGTATGGCTGGGAAAGTAGAAGATATTGAAGGATTTTGTAATGAA ATGGTAAAGGATAAATGCCCAAATTTTGAACAAGTTCTTTTGGATTTGCTAGATATATTT GTTAGAAATAGTAGGCTTAGTGAGGCTTTATGTGTTCTTTCTTGTATAAATTTGTGTTCC TTAAATCCCTCTATATCTGTATTTAATCAATTACTGGGCGCACTTGTCAAGGAAAAGAAG GAATTTAAGGATGTATTGTTCGTATATAAAGAGATTGTGAAAGCTGGAATTGCTCCCAAT ATTGATACACTTAATTCTCTGATAGAGGCTTTATTTGCTGCTGATCGCGCTGATGCTGCA TTGGAGCAATACAAACGACTTCATAAGAAAGGTTGTAGTCCTAACGGTAGGACTTTTCAG ATAATTATTGGTCAACTTGTTGAAAGGGGTAGAGTGGATGAGGCACTTGTAATTTTAGAT GATATGTTTCGTATACAGTGTGAACCGGATTATTCTAGCTTTTATGCTCATATAATACCT TTATTTTGTGATATGAATAAATTAGATGTAGTGAGGAGGTTGTTTCCTGTGATGAGAGCG TCTAAAGTTCTTCCGGATTCATCCACTTATGGGGCAATGATAAAGTGTTTGTGTTGGAAT CTTCTCGTGGATGATGCTGTAAAACTTGTAGATGAGATGGTGTATAATGATGTTAGGCCA GATGATGATGTGTTCATGAGTATAATAGATGGATTATGTGAATTGAATATGTTAAGTGAA GCTAAGGAGTTTTTGAATGACAAAGAAGTTGCAAGTGTATTGCCTTACAATGCGCTTCTT GAAGCTATTCTAAATGATGGCACCTTTAATATGGCAAGAGATCTGTTTGATGAAATGTTT GACAGAAACATCACAGATCATTGTTCTTGGAATATCATGATTCTGTTCTTGTGTGATAAT AAGAGACTGAAAGATGCCTTGAAATATGTTGGTAGAATGATTGTTTCCTCCGTTAGTCTT GATTCATCTACATATTCTGCTCTCATCGTTGGCTACTGCAAATTAGGTGAATGTGAGAAT GCTTTGGCATTGTTTCATCAGCTTAGGTCCAAATCTGGGTTATTAGATTTGGTATCATAT GCTCAACTTATTGAGTGTCTTTGCCAGAAGGAAGAGATTCAGGAAGCCACCAAAGTGTTT TGGTTCATGTCAACAAAGAGACTTGCTCTTCAATCGACCTCGTTTGGCAAGATTATGGAG GGACTTTGTGCTAGTGGGTACACAGTTAGAGCAATCAAATTGCTACCAGTTGCATATTAT TGTGGTACATTGTCTTCTCCTTCTGCTTACAACAGCATAATGCGAGGGCTATTCAGTTTA GGAAGAGCAAGTGATCTCTTTATGGTGCTCTCAAGAATGGTTGTGGATGGTTGTAAGATG GATGGGGAAACATATTGCATTCTTATTCAGAGCATGATTTCGCTTGGACATATAGAGAAG TTGGCTCTACTATTGGATATGATGCTTAGTCAGGGTCTATTACCGAATTCGGAAACACTT TCTAAACTTCTGGAGTATCTGGTGGAAAACAATCAGGTCCGCATGATATTTTCTTCAATA GATAAGCTTGTCTCAGAATTTGAAGTTGTTGATTCATCAATGTACAATATGCTGACAAAT AGTCTTTTGAAAGAGGGATACAATGACAAGGCCTCTTTCTTGCTGGATTTAATGTTGGAA AAGGGCTGGGTTCCTGATGCTGATACTCATGCTTTATTAGTGGGTTCCAGTGTGGAAGAT GAAACAGATGGTCAAAATTCTTCATGTGATAGATTTATCACACAGGATAATGTTGGCAAT ATACTTGCTGAGGCAATTTGCGTCTCTGTTTTCCACATCATCCATTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g101150.2.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9RFQ7_RICCO)
Sequence	MVIKLSTLILPKKIPKWVCSKPYFSSLSCACKIQNNPESKQTSTSSSDFETKIQYLKNKL HPETLVGVLHSTADLDSSLKLFKWASLQKRFHHSADTYFQIILKLGMAGKVEDIEGFCNE MVKDKCPNFEQVLLDLLDIFVRNSRLSEALCVLSCINLCSLNPSISVFNQLLGALVKEKK EFKDVLFVYKEIVKAGIAPNIDTLNSLIEALFAADRADAALEQYKRLHKKGCSPNGRTFQ IIIGQLVERGRVDEALVILDDMFRIQCEPDYSSFYAHIIPLFCDMNKLDVVRRLFPVMRA SKVLPDSSTYGAMIKCLCWNLLVDDAVKLVDEMVYNDVRPDDDVFMSIIDGLCELNMLSE AKEFLNDKEVASVLPYNALLEAILNDGTFNMARDLFDEMFDRNITDHCSWNIMILFLCDN KRLKDALKYVGRMIVSSVSLDSSTYSALIVGYCKLGECENALALFHQLRSKSGLLDLVSY AQLIECLCQKEEIQEATKVFWFMSTKRLALQSTSFGKIMEGLCASGYTVRAIKLLPVAYY CGTLSSPSAYNSIMRGLFSLGRASDLFMVLSRMVVDGCKMDGETYCILIQSMISLGHIEK LALLLDMMLSQGLLPNSETLSKLLEYLVENNQVRMIFSSIDKLVSEFEVVDSSMYNMLTN SLLKEGYNDKASFLLDLMLEKGWVPDADTHALLVGSSVEDETDGQNSSCDRFITQDNVGN ILAEAICVSVFHIIH*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g101150.2.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9RFQ7_RICCO)
Sequence	ATGGTGATAAAGCTCTCAACTTTAATTCTTCCCAAGAAAATTCCCAAATGGGTTTGTTCA AAACCCTATTTTTCTTCACTTTCTTGTGCTTGTAAAATTCAGAACAATCCAGAATCCAAA CAAACCTCTACCAGTTCTTCTGACTTTGAAACCAAAATTCAATATTTAAAGAATAAGCTT CACCCAGAAACATTAGTAGGCGTTCTTCATTCCACAGCTGATTTGGATTCTTCATTGAAG TTATTCAAATGGGCTTCCCTTCAAAAAAGGTTTCATCACTCTGCTGATACTTATTTTCAA ATTATCTTGAAGTTAGGTATGGCTGGGAAAGTAGAAGATATTGAAGGATTTTGTAATGAA ATGGTAAAGGATAAATGCCCAAATTTTGAACAAGTTCTTTTGGATTTGCTAGATATATTT GTTAGAAATAGTAGGCTTAGTGAGGCTTTATGTGTTCTTTCTTGTATAAATTTGTGTTCC TTAAATCCCTCTATATCTGTATTTAATCAATTACTGGGCGCACTTGTCAAGGAAAAGAAG GAATTTAAGGATGTATTGTTCGTATATAAAGAGATTGTGAAAGCTGGAATTGCTCCCAAT ATTGATACACTTAATTCTCTGATAGAGGCTTTATTTGCTGCTGATCGCGCTGATGCTGCA TTGGAGCAATACAAACGACTTCATAAGAAAGGTTGTAGTCCTAACGGTAGGACTTTTCAG ATAATTATTGGTCAACTTGTTGAAAGGGGTAGAGTGGATGAGGCACTTGTAATTTTAGAT GATATGTTTCGTATACAGTGTGAACCGGATTATTCTAGCTTTTATGCTCATATAATACCT TTATTTTGTGATATGAATAAATTAGATGTAGTGAGGAGGTTGTTTCCTGTGATGAGAGCG TCTAAAGTTCTTCCGGATTCATCCACTTATGGGGCAATGATAAAGTGTTTGTGTTGGAAT CTTCTCGTGGATGATGCTGTAAAACTTGTAGATGAGATGGTGTATAATGATGTTAGGCCA GATGATGATGTGTTCATGAGTATAATAGATGGATTATGTGAATTGAATATGTTAAGTGAA GCTAAGGAGTTTTTGAATGACAAAGAAGTTGCAAGTGTATTGCCTTACAATGCGCTTCTT GAAGCTATTCTAAATGATGGCACCTTTAATATGGCAAGAGATCTGTTTGATGAAATGTTT GACAGAAACATCACAGATCATTGTTCTTGGAATATCATGATTCTGTTCTTGTGTGATAAT AAGAGACTGAAAGATGCCTTGAAATATGTTGGTAGAATGATTGTTTCCTCCGTTAGTCTT GATTCATCTACATATTCTGCTCTCATCGTTGGCTACTGCAAATTAGGTGAATGTGAGAAT GCTTTGGCATTGTTTCATCAGCTTAGGTCCAAATCTGGGTTATTAGATTTGGTATCATAT GCTCAACTTATTGAGTGTCTTTGCCAGAAGGAAGAGATTCAGGAAGCCACCAAAGTGTTT TGGTTCATGTCAACAAAGAGACTTGCTCTTCAATCGACCTCGTTTGGCAAGATTATGGAG GGACTTTGTGCTAGTGGGTACACAGTTAGAGCAATCAAATTGCTACCAGTTGCATATTAT TGTGGTACATTGTCTTCTCCTTCTGCTTACAACAGCATAATGCGAGGGCTATTCAGTTTA GGAAGAGCAAGTGATCTCTTTATGGTGCTCTCAAGAATGGTTGTGGATGGTTGTAAGATG GATGGGGAAACATATTGCATTCTTATTCAGAGCATGATTTCGCTTGGACATATAGAGAAG TTGGCTCTACTATTGGATATGATGCTTAGTCAGGGTCTATTACCGAATTCGGAAACACTT TCTAAACTTCTGGAGTATCTGGTGGAAAACAATCAGGTCCGCATGATATTTTCTTCAATA GATAAGCTTGTCTCAGAATTTGAAGTTGTTGATTCATCAATGTACAATATGCTGACAAAT AGTCTTTTGAAAGAGGGATACAATGACAAGGCCTCTTTCTTGCTGGATTTAATGTTGGAA AAGGGCTGGGTTCCTGATGCTGATACTCATGCTTTATTAGTGGGTTCCAGTGTGGAAGAT GAAACAGATGGTCAAAATTCTTCATGTGATAGATTTATCACACAGGATAATGTTGGCAAT ATACTTGCTGAGGCAATTTGCGTCTCTGTTTTCCACATCATCCATTAGATACCTGCTTCA ATTTTGAAGGGCTAATCAATTTCTCAAAGCATACCTAGAATGACAGTAAAAGCTGGTATA ACATCAACTGTTTAGCATTCCTATCAGCAGCGCTGAACTGTAATATACCTTTCTTTTTCT CTTTTGGCTGAGATCAATTGTAGCATCTGCTCATATCAGTGCTGGTGAATAAGTTTTTTT CTGTTGGAAGGCACAATATATGCTCAGGAAAGTTCTAGCTCAGTTAGAAGGAATAAGAAG GAAGATCAGAACACTGCTTAGCTAGTCACTTGAGCTGTGAGTTCCGCTATTACTAGCTTT CTCGTTTTAGCTATTTCACCAACCACATCATGTATATAGGGAGCTCACATTCTGTATATC ATACTCCAAACACAAATGAGTGAAGTACTGAGCCTTTTGTTGCTCATTTCGTTGACAGTT TGATGTAAATTTGTTGTTTTCCTTGTCAAAACAAGATAAATTCA