Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g099040.3.1
CDS Infomation	GDSL esterase/lipase (AHRD V3.3 *** A0A199UFA2_ANACO)
Sequence	CTTTGATCACTATTTACCCCTATACTCTATATAAACCAACCACAGTATTGTACTAATTAT AACATTTCAAGTTGGATCATGGCATTCACAATAAGAGTTGCGGTGCTTCATCTGTTGATA CTAGAAATAACAATAATAAGTTCGTTGTTTCTTCAAGCTAACGCACAAGAATTATTAATA AAGCTCGAAGAACCAAAATTGAAGAAATGCGGAATTAATAGAATTTATCAGTTTGGTGAT TCACTTTCCGATACCGGAAATTGCCTGAGAGAGAGCTATTGTGGAGCTCATACTGGGTGT AGATTCCCTCCTTATGGAATGAATTTTTACCAGAAAGAAATAACGGGGCGTTGTTCTAAT GGATTGCTCATGGTTGATTTCATGGCGCTGGAATGTGGTCTTCCTCTCCTAAATCCGTCC TTAGAAGAAAATGCAAATTTTAGTCAGGGTTCGAATTTTGCAGTAGCAGGGGCTACGGCT TTATCAGTTGAACAACTTGCAGAAAGGAACATTTCTATGTCTTATACAAATAGTACATTA ACTGTGCAGCTTCATTGGATGTCTTCTCATTTCAATTCCATTTGCTCTACGGATTGCCCA AAATATTTGGAAAAGTCACTTTTCCTAGTTGGAGAAATAGGAGGAGATGAACTTGCGTAT GGGTTTATCCAAGGTAAAACCATACAAGAGTTGCGAACAATGGTGCCTGACATTGTTCAT GCCATTATTCGCGGTGTTACAAGAGTTATAAGTTTTGGAGCTACTCGAATTGTAGTTCCA GGTAATATTCCAGCTGGTTGTAACCCGGTTATCCTGACGATATTTGGTACCACATACGAT GAGTATGGTTGCGTCAAAGAGTGGAACAATTTTATGATGTATTACAACAATCATTTGAAA CGAGGAGTTTACATGCTCAAGAGAGAATATCCAAACATTTCAATCAGTTACGGCGACTAC TACAACGCTTATCTGTGGCTTCGACAAAATGTTGTTGCTCTTGGATTCGACAAAAATTCT GTACTGAAAGCATGTTGTGGAATAGGTGGAGAGTACAATTATAGAGCAGATATGAGATGT GGTAATCCAGGAGTCAAAGCGTGTGCAGACCCCAATAGTTACATAAGTTGGGATGGAATT CATTTAACACAAAGGGCATACAGTTGGTTAACAAAATGGCTAATCGATGACATAATACCA CAATTAAACTGCCTTGTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g099040.3.1
PEP Infomation	GDSL esterase/lipase (AHRD V3.3 *** A0A199UFA2_ANACO)
Sequence	LSLFTPILYINQPQYCTNYNISSWIMAFTIRVAVLHLLILEITIISSLFLQANAQELLI KLEEPKLKKCGINRIYQFGDSLSDTGNCLRESYCGAHTGCRFPPYGMNFYQKEITGRCSN GLLMVDFMALECGLPLLNPSLEENANFSQGSNFAVAGATALSVEQLAERNISMSYTNSTL TVQLHWMSSHFNSICSTDCPKYLEKSLFLVGEIGGDELAYGFIQGKTIQELRTMVPDIVH AIIRGVTRVISFGATRIVVPGNIPAGCNPVILTIFGTTYDEYGCVKEWNNFMMYYNNHLK RGVYMLKREYPNISISYGDYYNAYLWLRQNVVALGFDKNSVLKACCGIGGEYNYRADMRC GNPGVKACADPNSYISWDGIHLTQRAYSWLTKWLIDDIIPQLNCLV

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g099040.3.1
Transcript Infomation	GDSL esterase/lipase (AHRD V3.3 *** A0A199UFA2_ANACO)
Sequence	CTTTGATCACTATTTACCCCTATACTCTATATAAACCAACCACAGTATTGTACTAATTAT AACATTTCAAGTTGGATCATGGCATTCACAATAAGAGTTGCGGTGCTTCATCTGTTGATA CTAGAAATAACAATAATAAGTTCGTTGTTTCTTCAAGCTAACGCACAAGAATTATTAATA AAGCTCGAAGAACCAAAATTGAAGAAATGCGGAATTAATAGAATTTATCAGTTTGGTGAT TCACTTTCCGATACCGGAAATTGCCTGAGAGAGAGCTATTGTGGAGCTCATACTGGGTGT AGATTCCCTCCTTATGGAATGAATTTTTACCAGAAAGAAATAACGGGGCGTTGTTCTAAT GGATTGCTCATGGTTGATTTCATGGCGCTGGAATGTGGTCTTCCTCTCCTAAATCCGTCC TTAGAAGAAAATGCAAATTTTAGTCAGGGTTCGAATTTTGCAGTAGCAGGGGCTACGGCT TTATCAGTTGAACAACTTGCAGAAAGGAACATTTCTATGTCTTATACAAATAGTACATTA ACTGTGCAGCTTCATTGGATGTCTTCTCATTTCAATTCCATTTGCTCTACGGATTGCCCA AAATATTTGGAAAAGTCACTTTTCCTAGTTGGAGAAATAGGAGGAGATGAACTTGCGTAT GGGTTTATCCAAGGTAAAACCATACAAGAGTTGCGAACAATGGTGCCTGACATTGTTCAT GCCATTATTCGCGGTGTTACAAGAGTTATAAGTTTTGGAGCTACTCGAATTGTAGTTCCA GGTAATATTCCAGCTGGTTGTAACCCGGTTATCCTGACGATATTTGGTACCACATACGAT GAGTATGGTTGCGTCAAAGAGTGGAACAATTTTATGATGTATTACAACAATCATTTGAAA CGAGGAGTTTACATGCTCAAGAGAGAATATCCAAACATTTCAATCAGTTACGGCGACTAC TACAACGCTTATCTGTGGCTTCGACAAAATGTTGTTGCTCTTGGATTCGACAAAAATTCT GTACTGAAAGCATGTTGTGGAATAGGTGGAGAGTACAATTATAGAGCAGATATGAGATGT GGTAATCCAGGAGTCAAAGCGTGTGCAGACCCCAATAGTTACATAAGTTGGGATGGAATT CATTTAACACAAAGGGCATACAGTTGGTTAACAAAATGGCTAATCGATGACATAATACCA CAATTAAACTGCCTTGTTTGAATTAAATCTTTTAATTTATTTTTGTGAGAAAAAAAACTG ATATTGTTGGGTGGCCAATTACAAAATGATAGGGGTTTAATTTGTTGGATCTGGCACTAT TTTTCATGAACAATGTATTGGATTGTGGTAGATGCATCTTTATGTGATGTGTGTGAGTCT TTTATATTCTGGTCATGTATTTGTTTCTCAAGTTAGTTATACTTTGCGTCTTTTAACGTC TAGTTAGTGATAAGATTTGCCTACATTCTATTCTCTTCGAACTCTATTTTGTAAAGTTTC ACTCAATATGTTAATGTTGTGTTACTAGTGTCAAATGTTAATAAGTGAATATTTTTGCTG GTAAATGTATGTATGCAAAGTTTATGTGGTTCAAGATAATAAACACTTTGGTTTAATTGT ATGGAAGAGCTCTTGTCCAACAAACTGTTCATATCTGTTGTAGCAGGGGACGGGAAGAGA TGAGAGGTGAAAGACGGACGAGATTAATTTATTTATTTTTTTATAATGGAGTATAGTTAT AAGAGACCACTTTCTAAAATAAAATTATGTATAATAAATAGTATAGCAACTTCTCTTGTC TTTTATTATTTGTCTATTTTTTCTATTTTTTTTTTAGAAAGTCCGTATAACTTCAAAAGA ATCATTCTTTATGAATCAAGTACCATTCAAACAAAGGGTGCATTGCCTCTTTGAGTGAAG AAGAGAGGGGCTTTGTACTTGGGTTACTGTTACATATTATTTACATAGTTTAGTCTCCAA AGCGAGTAGCAGTGTGAAGAAGAAATGAATAGTATCCAAATGACCTTGAGGAGGCCCTGA CGTAGCACCTTTCTCGCTCGAAGGATCTATGAAAAGAACGTCCCACTACGAATTCCAGCC TTTTCCATCGTCTTTCGTGACCCTGGTTCTATCAAACGCGCTTCTTCAATTTTGGTGCTC TTTAGACGGGGCAGAGCCGGGTTTGACCACTACAAAGCCCACGGCATATGACATGTGCAC TTTCTCTATCTGATCAATATCGGACTCTACCAGAATGGTTTCAGTATCTGCAACAATGAA GGATCTTCTTTCCTCATTTTTTTTCTAATTAACGTGGATGGGGGTGGTGCCGGTTTCCAA CAACTTGCTAAATTCCATCATGCAGCGGCCATCGCCTACCCTAATGCTCTTGCTCCGGAC CTTACTGCTGGCTTACTTATTCATCTTGACAAAAATAAGAAAGGACAATATTTTTATCTA T