Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g099000.1.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A0B2P3V1_GLYSO)
Sequence	ATGAATACTGGATGGATGTTCTTGAATCCAAAGCCTGGATTTTCTTCATACTTATCATGT CTTTTCTTCCACTTCCGACCATTCTCCTCCATAAAGCCGCCAAGTTTTCCGGTGAATTCT GCACGAGGAATAAGCCTCCTTCTTTCTACTTCTGGAAGGGAAGGGAATGTCCGTCTTGGT TCTTCCATCCATGCTTCCATCCTCAAGGACCCAGAATTAGTTCTTTTGGGAAATCAATAT AGTACCCAGGACGCTTTTGTAGTTTGGAATTCTCTTTTGACGATGTATGCTAGATGTGGT AGGACACAAGATGCTTCCCAAGTGTTTGATGAAATGCCTGTGAAAGATACTGTTACGTGG AACTCGATTGTTTCAGGATTTTTAAGTAATGGGAACTTTAAGATGGGATTTGGGTATTTC AAACAAATGATGGGTTCTGATAGTTTAATGTTTGATCATGCTAGTGTGACTACTATTTTA TCAGCTTGTGATGGGCTTGATTTCATCATGGTTAACAAGATGATGCATGGATTGGTTCTT TTGAGTGGCTTAGAGAGGGAAATAGCTGTAAGTAATGCATTGATTACTTCTTATTTTCGA TGTGGCTGTGCTGATTCTGGCAGGCAGGTGTTTGATGAGATGGATATGAGGAATGTTATC TCTTGGACAGCTGTGATTTCTGGTCTTGCTCAAAATGAGTTTTGTGAGGAAAGCTTGGAT TTGCTTGTGAAGATGCAAAATGCTGCTGTTGTGCCTAATTATTTGACATACTTAAGTGCA TTGTTGGCATGTTCTGGCATGAAGGCACTCGGGGAGGCTCGTCAAATTCATGGGATCGTC TGGAAGTTGGGGTTTCAATCAGATTTGTGTATAGAGAGTGCATTGATGGATGTGTATTCT AAGTGTGGCAGTGTACAAGATGCTTGGCAGATGTTTGAATCTGCGGGGGTTCTTGACACA ATTGCTATGACAGTCATGCTTGTGGGGTTTGCCAAAAATGGATATGAAGAAGAGGCTTTG CAGATCTTTGTAAAAATGGTAAAAGCAGGGGTTGACATTGACCCTGATGTAGTGTCAGCC ATTCTTGGTGTCTTTGGTAGCGATACTTGTCTGGCTCTTGGTAAGCAAGTGCATTCTTTA ATCATCAAGAAAGGTTTCATTTCCAATTCGTTTGTACGTAATGGGCTAATTAACATGTAT TCCAAGTGCGGTGAACTGGAAGAATCTGTCAAAATCTTTAACAGTATAGCTCAAAGAAAT TCAGTCTCTTGGAATTCCATTATTGCAGCCTATGCTCGTCATGGGAATGGCTATAGGACA CTCCAGTTATACGAAGAAATGAGGTCATATGGTGTGGATCCAACTGATGTGACATTCATC TCTCTGCTTCATGCTTGTAGTCATGTAGGGCTAGTAAATAAGGGTATGGAATTCTTTGAA TCAATGCAGGTTATCTATGGGATGACTCCAAGAATGGAGCATTATGCTGCTGTAGTTGAC TTGCTTGGTCGAGCTGGACTGCTATGTGAAGCCAAGAGTTTCATTGAGGAGCTACCAGTA AAGCCAGACATATTTATTTGGCAAGCATTACTTGGTGCCTGTAGTATTCACGGTGATGCT GAGATAGGGAAATATGCAGCTGATCAGTGGCTCTTGACTTCACCTGATAATCCCGTGCCA TTTGTTCTACTGGCTAATATATATTCTTCCAGAGGGAGGTGGAAAGAGAGAGCTAGAACC ATAAGGAAAATGAAGGAGACAGGAGTGGCAAAGGAGACGGGGACAAGCTGGATAGAGATT GAGAAGGAAATCCATTGTTTCGTAGTTGCAGATCAAATGCATCCCAGAACCATGATCATT TATTCTACCTTGCTGGAGTTGTTTAGACACATGAGAGATGAAGGGTATGTACCAGATAAT AGGTTCATTCTATACTACATGGATGGTGATGAGACAGATTTTTCAGCCGATTTGCCAGAT ACCTCCGAACTGGTTGGTGGCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g099000.1.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A0B2P3V1_GLYSO)
Sequence	MNTGWMFLNPKPGFSSYLSCLFFHFRPFSSIKPPSFPVNSARGISLLLSTSGREGNVRLG SSIHASILKDPELVLLGNQYSTQDAFVVWNSLLTMYARCGRTQDASQVFDEMPVKDTVTW NSIVSGFLSNGNFKMGFGYFKQMMGSDSLMFDHASVTTILSACDGLDFIMVNKMMHGLVL LSGLEREIAVSNALITSYFRCGCADSGRQVFDEMDMRNVISWTAVISGLAQNEFCEESLD LLVKMQNAAVVPNYLTYLSALLACSGMKALGEARQIHGIVWKLGFQSDLCIESALMDVYS KCGSVQDAWQMFESAGVLDTIAMTVMLVGFAKNGYEEEALQIFVKMVKAGVDIDPDVVSA ILGVFGSDTCLALGKQVHSLIIKKGFISNSFVRNGLINMYSKCGELEESVKIFNSIAQRN SVSWNSIIAAYARHGNGYRTLQLYEEMRSYGVDPTDVTFISLLHACSHVGLVNKGMEFFE SMQVIYGMTPRMEHYAAVVDLLGRAGLLCEAKSFIEELPVKPDIFIWQALLGACSIHGDA EIGKYAADQWLLTSPDNPVPFVLLANIYSSRGRWKERARTIRKMKETGVAKETGTSWIEI EKEIHCFVVADQMHPRTMIIYSTLLELFRHMRDEGYVPDNRFILYYMDGDETDFSADLPD TSELVGG*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g099000.1.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A0B2P3V1_GLYSO)
Sequence	ATGAATACTGGATGGATGTTCTTGAATCCAAAGCCTGGATTTTCTTCATACTTATCATGT CTTTTCTTCCACTTCCGACCATTCTCCTCCATAAAGCCGCCAAGTTTTCCGGTGAATTCT GCACGAGGAATAAGCCTCCTTCTTTCTACTTCTGGAAGGGAAGGGAATGTCCGTCTTGGT TCTTCCATCCATGCTTCCATCCTCAAGGACCCAGAATTAGTTCTTTTGGGAAATCAATAT AGTACCCAGGACGCTTTTGTAGTTTGGAATTCTCTTTTGACGATGTATGCTAGATGTGGT AGGACACAAGATGCTTCCCAAGTGTTTGATGAAATGCCTGTGAAAGATACTGTTACGTGG AACTCGATTGTTTCAGGATTTTTAAGTAATGGGAACTTTAAGATGGGATTTGGGTATTTC AAACAAATGATGGGTTCTGATAGTTTAATGTTTGATCATGCTAGTGTGACTACTATTTTA TCAGCTTGTGATGGGCTTGATTTCATCATGGTTAACAAGATGATGCATGGATTGGTTCTT TTGAGTGGCTTAGAGAGGGAAATAGCTGTAAGTAATGCATTGATTACTTCTTATTTTCGA TGTGGCTGTGCTGATTCTGGCAGGCAGGTGTTTGATGAGATGGATATGAGGAATGTTATC TCTTGGACAGCTGTGATTTCTGGTCTTGCTCAAAATGAGTTTTGTGAGGAAAGCTTGGAT TTGCTTGTGAAGATGCAAAATGCTGCTGTTGTGCCTAATTATTTGACATACTTAAGTGCA TTGTTGGCATGTTCTGGCATGAAGGCACTCGGGGAGGCTCGTCAAATTCATGGGATCGTC TGGAAGTTGGGGTTTCAATCAGATTTGTGTATAGAGAGTGCATTGATGGATGTGTATTCT AAGTGTGGCAGTGTACAAGATGCTTGGCAGATGTTTGAATCTGCGGGGGTTCTTGACACA ATTGCTATGACAGTCATGCTTGTGGGGTTTGCCAAAAATGGATATGAAGAAGAGGCTTTG CAGATCTTTGTAAAAATGGTAAAAGCAGGGGTTGACATTGACCCTGATGTAGTGTCAGCC ATTCTTGGTGTCTTTGGTAGCGATACTTGTCTGGCTCTTGGTAAGCAAGTGCATTCTTTA ATCATCAAGAAAGGTTTCATTTCCAATTCGTTTGTACGTAATGGGCTAATTAACATGTAT TCCAAGTGCGGTGAACTGGAAGAATCTGTCAAAATCTTTAACAGTATAGCTCAAAGAAAT TCAGTCTCTTGGAATTCCATTATTGCAGCCTATGCTCGTCATGGGAATGGCTATAGGACA CTCCAGTTATACGAAGAAATGAGGTCATATGGTGTGGATCCAACTGATGTGACATTCATC TCTCTGCTTCATGCTTGTAGTCATGTAGGGCTAGTAAATAAGGGTATGGAATTCTTTGAA TCAATGCAGGTTATCTATGGGATGACTCCAAGAATGGAGCATTATGCTGCTGTAGTTGAC TTGCTTGGTCGAGCTGGACTGCTATGTGAAGCCAAGAGTTTCATTGAGGAGCTACCAGTA AAGCCAGACATATTTATTTGGCAAGCATTACTTGGTGCCTGTAGTATTCACGGTGATGCT GAGATAGGGAAATATGCAGCTGATCAGTGGCTCTTGACTTCACCTGATAATCCCGTGCCA TTTGTTCTACTGGCTAATATATATTCTTCCAGAGGGAGGTGGAAAGAGAGAGCTAGAACC ATAAGGAAAATGAAGGAGACAGGAGTGGCAAAGGAGACGGGGACAAGCTGGATAGAGATT GAGAAGGAAATCCATTGTTTCGTAGTTGCAGATCAAATGCATCCCAGAACCATGATCATT TATTCTACCTTGCTGGAGTTGTTTAGACACATGAGAGATGAAGGGTATGTACCAGATAAT AGGTTCATTCTATACTACATGGATGGTGATGAGACAGATTTTTCAGCCGATTTGCCAGAT ACCTCCGAACTGGTTGGTGGCTGA