Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g097980.3.1
CDS Infomation	CTR1-like protein kinase 2
Sequence	ATGAAACACATTTTCAAGAAGCTTCATCATTCAAATCGATCGAACGATGCTCAATCTACT TCATCAATATCATCGTCATCTTCACCTGCATCATCGTTGTCTTCGGCGTCATGTACTACT GATCATCGGAATTCCAATTCGGTTTCTCAATCACCGTTGAGTCCTTCCACGATTTCAACT GCGTCAACGACGACCACTCCTGCTGCTCCAGTGGGGGCTGGTGGTGGTGGTGGAGGAGGG AATTTATCTACGATCAACAGACAGCAGGACTATTATACTTCGGAGGAAGAGTATCAAGTG CAACTTGCCCTAGCTTTGAGTGTGTCATCCTCCCAGTCTCAAGATCCTTTTCCCTCTGAT GTTAATTCAAGCAATGGTCATGGTGTAGGGCGAACCGCTGTTGACTTGGCACGTGATAGA GAGGATGCCGCTGCGGACTTGCTATCGAGGCAGTATTGGGATTATGGTGTGATGGATTAT GAGGAGAAAGTTGTTGATGGCTTCTATGATGTATATAATCTCTTTACAGATCCAGCAAGT CGTGGGAAAATGCCATCTCTTTCTGAACTTGAAACAAATCCTGGGACTTCTAACTTTGAA GGCGTGATAATTAATCAGAGAATTGACCCCTCCTTGGAAGAGTTGATGCAGATTGCACAC TGTATTACATTGGACTGCCCTGCCAGTGAGATTAGTCTGTTAGTACTGAGGCTTTCTGAA CTTGTAACTGGGCATTTAGGTGGCCCAGTAAAGGATGCAAATATCATATTGGCCAAATGG ATGGAAATTAGCACTGAGTTGAGGACATCACTTCACACCAGTGTGTTGCCAATCGGATCC CTAAAAATTGGGCTTTCACGTCACCGTGCACTGCTTTTTAAGGTACTAGCTGACCATGTT GGAATACCCTGTAGACTTGTTAAAGGGAGTCACTACACTGGTGTTGAAGATGATGCTGTC AACATTGTGAAGTTACCGAATGATAGCGAGTTTTTGGTTGATCTCATGGGAGCACCAGGC ACACTCATACCGGCTGATGTTCTGAGTGCAAAGGATGCTTCTTTTAACAGTCCGAAATTG AACAAGATTCCAAGTTTGCCGTCCAATAGTCATTCTGGAGTTTCCTACCCGAGACGGAAC TTGTTATCTGGTCAAAATTCTGTGTTAGGAGATGATTTCTCCGGTAGATCTAAGCCCGAG AAGATAGAATCAGTTCATTCAATCTCTGATGCAGGTGGTAGCTCCACTGCTGGTTCTTCA GGAATCAACAAAAGACCATCTTCTAATCAGGTTGATTGGACTTCACCGTTAGCAATTGGA ACTTCTTTGTACAAAGGAGGCCGTGGACCCAATGCCGCTGGTGATGGCTTGAGGTTGAAT GTAAATGTTGTTCCTTATGATCAGAATAACCCTGAGGATCCAAAAAATCTTTTTGCTGAT CTTAATCCGTTTCAAATAAAAGGCTCTGGCAACACATTACTGCAGAAAAATCCTGCTAGA AACAAAGTCAGTGAGTTGCAACAGCCAATAAATACTTTGATCCCCGGACGGCCTCCTGCC CCTATGATGTGGAAAAATCGATATGCACCCAATGAGGTGCCCCGGAAAAACGAATCTGAT TCTGAGGGACTTTTTCCAAAGAAGAACGGTGGATCTAGTGGGTATAATATATCATCAATC GCATCTACCAGCTCAAATATACCGCAGAAGTCTTCTACTGATACCTCCAGGTTACATGGA AATTCACGGCCTGCCTATAGAGGAAATGATGAGGTTGCTTCCACTAGGAATAACAGTTCC ATATTATCAGCTGAGCTTGAATTTAGAAGGTTGTCTGTTCAGAACAGTCAAAACAATAAT AGAGAAACAAGTCAATGGGAGGGGCACAGTTTGCAGAGTGACGACTTAAATAGGACACAA GCATATGGAGATGATATTATTGTGGAAAGTGATCACACAAGAAATTTGCAAGCTCAGTCA ATAGGAACCAATATTAAATTGAAGGAGCCAGAAAATCCAACTTCTTCAGGGAATCTAGGT CCAAGTCAGGTTGATCCTGTGTTTGATGATGTTGGTGATTGTGAGATTCCATGGGAAGAT CTTGTCATTGGCGAGAGGATTGGTCTTGGTTCCTATGGAGAGGTTTACCATGCAGATTGG AATGGCACTGAGGTTGCTGTAAAGAAGTTCCTCGATCAGGATTTCTCAGGTGCAGCGTTG GCTGAGTTTAAGAGAGAGGTGCGCATCATGCGTCGATTACGACATCCAAATGTTGTTCGT TTTATGGGTGCTATAACTCGGCCGCCCCACCTTTCTATTATCACTGAATTCCTACCACGA GGTAGCTTATATCGGATAATTCATCGTCCTCATTTTCAAATTGATGAAAGGCAGAGAATC AAAATGGCCCTTGATGTGGCAAAGGGCATGGATTGCTTACATACAAGCAACCCTACAATT GTTCACCGTGATCTGAAGTCACCTAATCTTTTGGTTGATACGGACTGGAATGTTAAGGTA TGTGATTTTGGCTTGTCTCGGTTGAAGCACAACACATTTTTGTCTTCCAAATCAACAGCT GGAACGCCTGAGTGGATGGCACCAGAAGTTCTCCGCAATGAACCTTCGAATGAGAAGTGT GACATATACAGTTTTGGTGTCATTCTATGGGAACTTGCTACCTTAAGATTACCTTGGAGT GGAATGAATCCTATGCAAGTGGTGGGAGCTGTTGGCTTCCAGAATAAACGCCTTGAAATT CCCAAGGAACTTGATCCTATAGTAGCAAGAATAATATGGGAATGTTGGCAAACCGATCCA AACTTGCGTCCATCATTTGCACAGCTAACTGTGGCTTTAACACCATTGCAACGACTTGTC ATTCCTGCCTATGTAGATCAGCTGAACTCCCGCTTGCCTCAGGAAATCTCAGTAAATTCT ACCCCGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g097980.3.1
PEP Infomation	CTR1-like protein kinase 2
Sequence	MKHIFKKLHHSNRSNDAQSTSSISSSSSPASSLSSASCTTDHRNSNSVSQSPLSPSTIST ASTTTTPAAPVGAGGGGGGGNLSTINRQQDYYTSEEEYQVQLALALSVSSSQSQDPFPSD VNSSNGHGVGRTAVDLARDREDAAADLLSRQYWDYGVMDYEEKVVDGFYDVYNLFTDPAS RGKMPSLSELETNPGTSNFEGVIINQRIDPSLEELMQIAHCITLDCPASEISLLVLRLSE LVTGHLGGPVKDANIILAKWMEISTELRTSLHTSVLPIGSLKIGLSRHRALLFKVLADHV GIPCRLVKGSHYTGVEDDAVNIVKLPNDSEFLVDLMGAPGTLIPADVLSAKDASFNSPKL NKIPSLPSNSHSGVSYPRRNLLSGQNSVLGDDFSGRSKPEKIESVHSISDAGGSSTAGSS GINKRPSSNQVDWTSPLAIGTSLYKGGRGPNAAGDGLRLNVNVVPYDQNNPEDPKNLFAD LNPFQIKGSGNTLLQKNPARNKVSELQQPINTLIPGRPPAPMMWKNRYAPNEVPRKNESD SEGLFPKKNGGSSGYNISSIASTSSNIPQKSSTDTSRLHGNSRPAYRGNDEVASTRNNSS ILSAELEFRRLSVQNSQNNNRETSQWEGHSLQSDDLNRTQAYGDDIIVESDHTRNLQAQS IGTNIKLKEPENPTSSGNLGPSQVDPVFDDVGDCEIPWEDLVIGERIGLGSYGEVYHADW NGTEVAVKKFLDQDFSGAALAEFKREVRIMRRLRHPNVVRFMGAITRPPHLSIITEFLPR GSLYRIIHRPHFQIDERQRIKMALDVAKGMDCLHTSNPTIVHRDLKSPNLLVDTDWNVKV CDFGLSRLKHNTFLSSKSTAGTPEWMAPEVLRNEPSNEKCDIYSFGVILWELATLRLPWS GMNPMQVVGAVGFQNKRLEIPKELDPIVARIIWECWQTDPNLRPSFAQLTVALTPLQRLV IPAYVDQLNSRLPQEISVNSTP*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g097980.3.1
Transcript Infomation	CTR1-like protein kinase 2
Sequence	CAACTCCATGCCCTAATTTAGTCGCCCCAATATCCACCTCCTTAAGCTTTCCCTCCTCTC TTTCTCTCTCTAGAATGCCCTTTACCTTTTTACAGTCAATATGAGAGAGAGAGTGTATGA AGACTAACAGTAGTAGCAGTTGATTAGTATATACTGAAAGGAAAAAGTAAAGGTATGATA TAGAGAGAGAAACAATGAAACACATTTTCAAGAAGCTTCATCATTCAAATCGATCGAACG ATGCTCAATCTACTTCATCAATATCATCGTCATCTTCACCTGCATCATCGTTGTCTTCGG CGTCATGTACTACTGATCATCGGAATTCCAATTCGGTTTCTCAATCACCGTTGAGTCCTT CCACGATTTCAACTGCGTCAACGACGACCACTCCTGCTGCTCCAGTGGGGGCTGGTGGTG GTGGTGGAGGAGGGAATTTATCTACGATCAACAGACAGCAGGACTATTATACTTCGGAGG AAGAGTATCAAGTGCAACTTGCCCTAGCTTTGAGTGTGTCATCCTCCCAGTCTCAAGATC CTTTTCCCTCTGATGTTAATTCAAGCAATGGTCATGGTGTAGGGCGAACCGCTGTTGACT TGGCACGTGATAGAGAGGATGCCGCTGCGGACTTGCTATCGAGGCAGTATTGGGATTATG GTGTGATGGATTATGAGGAGAAAGTTGTTGATGGCTTCTATGATGTATATAATCTCTTTA CAGATCCAGCAAGTCGTGGGAAAATGCCATCTCTTTCTGAACTTGAAACAAATCCTGGGA CTTCTAACTTTGAAGGCGTGATAATTAATCAGAGAATTGACCCCTCCTTGGAAGAGTTGA TGCAGATTGCACACTGTATTACATTGGACTGCCCTGCCAGTGAGATTAGTCTGTTAGTAC TGAGGCTTTCTGAACTTGTAACTGGGCATTTAGGTGGCCCAGTAAAGGATGCAAATATCA TATTGGCCAAATGGATGGAAATTAGCACTGAGTTGAGGACATCACTTCACACCAGTGTGT TGCCAATCGGATCCCTAAAAATTGGGCTTTCACGTCACCGTGCACTGCTTTTTAAGGTAC TAGCTGACCATGTTGGAATACCCTGTAGACTTGTTAAAGGGAGTCACTACACTGGTGTTG AAGATGATGCTGTCAACATTGTGAAGTTACCGAATGATAGCGAGTTTTTGGTTGATCTCA TGGGAGCACCAGGCACACTCATACCGGCTGATGTTCTGAGTGCAAAGGATGCTTCTTTTA ACAGTCCGAAATTGAACAAGATTCCAAGTTTGCCGTCCAATAGTCATTCTGGAGTTTCCT ACCCGAGACGGAACTTGTTATCTGGTCAAAATTCTGTGTTAGGAGATGATTTCTCCGGTA GATCTAAGCCCGAGAAGATAGAATCAGTTCATTCAATCTCTGATGCAGGTGGTAGCTCCA CTGCTGGTTCTTCAGGAATCAACAAAAGACCATCTTCTAATCAGGTTGATTGGACTTCAC CGTTAGCAATTGGAACTTCTTTGTACAAAGGAGGCCGTGGACCCAATGCCGCTGGTGATG GCTTGAGGTTGAATGTAAATGTTGTTCCTTATGATCAGAATAACCCTGAGGATCCAAAAA ATCTTTTTGCTGATCTTAATCCGTTTCAAATAAAAGGCTCTGGCAACACATTACTGCAGA AAAATCCTGCTAGAAACAAAGTCAGTGAGTTGCAACAGCCAATAAATACTTTGATCCCCG GACGGCCTCCTGCCCCTATGATGTGGAAAAATCGATATGCACCCAATGAGGTGCCCCGGA AAAACGAATCTGATTCTGAGGGACTTTTTCCAAAGAAGAACGGTGGATCTAGTGGGTATA ATATATCATCAATCGCATCTACCAGCTCAAATATACCGCAGAAGTCTTCTACTGATACCT CCAGGTTACATGGAAATTCACGGCCTGCCTATAGAGGAAATGATGAGGTTGCTTCCACTA GGAATAACAGTTCCATATTATCAGCTGAGCTTGAATTTAGAAGGTTGTCTGTTCAGAACA GTCAAAACAATAATAGAGAAACAAGTCAATGGGAGGGGCACAGTTTGCAGAGTGACGACT TAAATAGGACACAAGCATATGGAGATGATATTATTGTGGAAAGTGATCACACAAGAAATT TGCAAGCTCAGTCAATAGGAACCAATATTAAATTGAAGGAGCCAGAAAATCCAACTTCTT CAGGGAATCTAGGTCCAAGTCAGGTTGATCCTGTGTTTGATGATGTTGGTGATTGTGAGA TTCCATGGGAAGATCTTGTCATTGGCGAGAGGATTGGTCTTGGTTCCTATGGAGAGGTTT ACCATGCAGATTGGAATGGCACTGAGGTTGCTGTAAAGAAGTTCCTCGATCAGGATTTCT CAGGTGCAGCGTTGGCTGAGTTTAAGAGAGAGGTGCGCATCATGCGTCGATTACGACATC CAAATGTTGTTCGTTTTATGGGTGCTATAACTCGGCCGCCCCACCTTTCTATTATCACTG AATTCCTACCACGAGGTAGCTTATATCGGATAATTCATCGTCCTCATTTTCAAATTGATG AAAGGCAGAGAATCAAAATGGCCCTTGATGTGGCAAAGGGCATGGATTGCTTACATACAA GCAACCCTACAATTGTTCACCGTGATCTGAAGTCACCTAATCTTTTGGTTGATACGGACT GGAATGTTAAGGTATGTGATTTTGGCTTGTCTCGGTTGAAGCACAACACATTTTTGTCTT CCAAATCAACAGCTGGAACGCCTGAGTGGATGGCACCAGAAGTTCTCCGCAATGAACCTT CGAATGAGAAGTGTGACATATACAGTTTTGGTGTCATTCTATGGGAACTTGCTACCTTAA GATTACCTTGGAGTGGAATGAATCCTATGCAAGTGGTGGGAGCTGTTGGCTTCCAGAATA AACGCCTTGAAATTCCCAAGGAACTTGATCCTATAGTAGCAAGAATAATATGGGAATGTT GGCAAACCGATCCAAACTTGCGTCCATCATTTGCACAGCTAACTGTGGCTTTAACACCAT TGCAACGACTTGTCATTCCTGCCTATGTAGATCAGCTGAACTCCCGCTTGCCTCAGGAAA TCTCAGTAAATTCTACCCCGTAAATTTCCTCGTCTTCCTCAAGTGCTGATCACTTGGGAA AAAGAAGGTTTCTGGTTTCGCTCATTTGCAAAAATGGAAAGATTCTTGGCGAAGTGGGTA AATGGTTCTTGTTGCTCAGAGATGATTTAGGAAGAAAAAGCAAAAGCAACCTTGGTAGTG GTCCTTAAATGTGTTGTTACTTGTATAGTGGTTGTGTATAAGTTGATCCCAAAGGGAACG GGTGTCTTTCTGAGTTGTATAGTCTTAATGATCATAAATTCGTTGGTTGAAAAACCCCCC TTCGAAATAATGGGGTGGTGCCGCACATAATCCCTGTATAGTCTATACAACAGAAGCTAA GTTGTCTCTTATAATGAATATATATGGTTGCCTTCAAAAACAGTACTACAATATCTCACG TATTATGCC