Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g096940.3.1
CDS Infomation	Receptor-like kinase 17 (AHRD V3.3 *** A5A0Y6_SOLCH)
Sequence	ATGGGAATTGCAAAAACAGGGCAGGGTTCATGTTGGCTTCTTGTATACATGGTGTTTCTT CTGTTTAATTTATCAGATGAGTTCTTAGAACCTTCACAATCTGAAGCCATAGTGAAAATT AAGCAGCTTTTGAACTTCCCTCAAGATTTGAGTAGTTGGAGTGACAATACAGATTTTTGT AACAGTGAGCCAAACACTGCCTTAACACTAATGTGTTATGAAGATAACATAACACAGCTT CATATTTCTGGCTATAACTGGTTCCCTAATTTGCCTCAGGGGTTTTCTACAGATACCCTT TTCTCTAATCTTGCTCTTTTGCCTAATTTAAAGGTGCTTTCTTTGGTTTCTTTAGGTTTG AGAGGAACTTTACCTAAAAAGATTGGATTTTTATCTTCTTTGGAGATTGTTAATATCAGT TCAAACTTCTTTTATGGTGAGATTCCAGGACAGATTTCATATTTGAAGAGTCTTCAGACA CTTATATTGGATAATAATGAGTTTACAGGCCAAGTTCCTGAAGGGGTAGGCTTACTTCAT TCGTTGTCTGTTTTGAGTATCAAGAACAATTCATTTTCTGGTTCATTGCCTAATTCTTTG TCAAATTTACAAACCCTAAGAATCCTTTCTATTTCTGGTAATAATTTTTCTGGGGTTGTT CCAAACCTTCATAATCTGTCAAATCTTCAAGTTCTTGATTTGGAAAGTAACAATCTTGGA CCTAATTTCCCTAATATTCCAACCAAGTTGGTATCTTTGGTACTTAGGAAGAATAAGTTC AGTTTAGGGGTACCAAAAGAACTGAGTTCATGTTATCAGTTAAAGAAACTGGACATTTCT TCTAATGAGTTTGTTGGACCCTTTTCACCAACAATTTTATCATTGCCATCACTCAGCTAT TTCGATATTTCTGGAAATAAACTAACTGGGAAGCTTCTAAAGAATGTGACATGTAGTCAA GACCTTTCATTTGTGAATTTATCATCAAATTACTTGACAGGGGAGTTGCCTGATTGCTTG CACCCTAGTTCTGGTTCCAAGATTGTATTGTTTTCTGGAAATTGTCTGTCGAATAAAGAG CAATGGCAGCATCCTTATTCATTTTGCCATAATGAAGCTTTGGCTGTTAGTATTGAGCCT CATAAGAGAAAGGTTAAAGGGGGAAATGGTAAAGCTGTTCTTGCATCAAGTATGGTAGGA GGTTTTGTTGGAGTAGTAGCGATTGTCGGTTTGGCTTTCGTGGTTGTTAGAAGGGAGTAT GTCAAGCAGAAAGCTAGCAAAGCCCCTCAAACAAGATTGATACTTGAAAAGGTCTCTCCT GCTCACACACTTAAGCTGCTTAATGATGCAAGGTATCTTTCTGAAACGAGGAAGTTGGGT TTGCTTGGGGCCCCTCCTTATCGAACGTTTGTCTTGGATGAGCTTCGAGAGGCTACTAAT AACTTCGATATATCAAATCTAATTGGTGCAAGCTCCAGTGGGCAGATTTACAAAGGGCGT CTCACAGATGGCACTGTGGTTGCTATAAGAAGCATAAAAATGAAGAGGAGGCATACTGTC CAGTCCTACACTCACCAACTAGGGCGTATTTCAAAGATCAGATACAGCCACTTAGTTAGT ACTATTGGACACTGCTTTGAGTGCTACCAAGATGACTCAAGTGTTAGCCGAATATGTTTA GTCTTTGAATTCGTGCCAAATGTGACGCTGCGGGGGGTCATATCAGAAGCAAATTCAGCT CAAAAGTTTACTTGGACGCAACGGATGTCAGCTGCAATAGGGATAGCGAAGGGAATTCAG TTCCTTCATACTGGAATAGTACCAGGGATATTCTCCAATCAATTGAAGATTACAGATGTA TTACTGGATCAGAATTTCCACGTTAAGATTAGCAAATACAACCTGCCTTTGTTAATTGAA AATAAGAAAATGGATGCTGGACCGTCTTCTAGTGGATCAAAGGGAAATGATGGACAAAGG TTAAAATACGAGGAGAAAGATGATGTGTATGACTTTGGAGTAATCTTACTTGAAATCATA TCGGGAAGGACAATCGATACAAAAAATGATATAGATGTTTCTAAAGACATTCTAATAGTT AGCTTAACAGCTGACGAGATAGCACGGAGGAACATCATTGATCCAGCTGTTCGGAAGGAA TGCTCAGATAGTTCTCTTAGAACATTAATGGAACTATGCATAAAATGTCTTTCAGATGAA CCATCGCAGCGTCCTTCTGTAGAAGACTTGATATGGAACTTGCAGTTTGCAGCTCAGGTC CAAGACCCTTGGAATAGAGACACTTATGGCAACCAAGAGTCCCCTGGTCATGTGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g096940.3.1
PEP Infomation	Receptor-like kinase 17 (AHRD V3.3 *** A5A0Y6_SOLCH)
Sequence	MGIAKTGQGSCWLLVYMVFLLFNLSDEFLEPSQSEAIVKIKQLLNFPQDLSSWSDNTDFC NSEPNTALTLMCYEDNITQLHISGYNWFPNLPQGFSTDTLFSNLALLPNLKVLSLVSLGL RGTLPKKIGFLSSLEIVNISSNFFYGEIPGQISYLKSLQTLILDNNEFTGQVPEGVGLLH SLSVLSIKNNSFSGSLPNSLSNLQTLRILSISGNNFSGVVPNLHNLSNLQVLDLESNNLG PNFPNIPTKLVSLVLRKNKFSLGVPKELSSCYQLKKLDISSNEFVGPFSPTILSLPSLSY FDISGNKLTGKLLKNVTCSQDLSFVNLSSNYLTGELPDCLHPSSGSKIVLFSGNCLSNKE QWQHPYSFCHNEALAVSIEPHKRKVKGGNGKAVLASSMVGGFVGVVAIVGLAFVVVRREY VKQKASKAPQTRLILEKVSPAHTLKLLNDARYLSETRKLGLLGAPPYRTFVLDELREATN NFDISNLIGASSSGQIYKGRLTDGTVVAIRSIKMKRRHTVQSYTHQLGRISKIRYSHLVS TIGHCFECYQDDSSVSRICLVFEFVPNVTLRGVISEANSAQKFTWTQRMSAAIGIAKGIQ FLHTGIVPGIFSNQLKITDVLLDQNFHVKISKYNLPLLIENKKMDAGPSSSGSKGNDGQR LKYEEKDDVYDFGVILLEIISGRTIDTKNDIDVSKDILIVSLTADEIARRNIIDPAVRKE CSDSSLRTLMELCIKCLSDEPSQRPSVEDLIWNLQFAAQVQDPWNRDTYGNQESPGHV*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g096940.3.1
Transcript Infomation	Receptor-like kinase 17 (AHRD V3.3 *** A5A0Y6_SOLCH)
Sequence	GTGCTTACAGAGTATCCTAAATTTACTATCAAGAAACATAATTCTCTACTTTTTAGTGAC TGTATTCTTTAAAAATGCATGCAGCTTCTTCAACCCCAAGTATTTCTTGAAGTTTACAGC TTTAATTCCTCAAAAAGATAAGCAAAAAAATTGCATTTGTCATGGGAATTGCAAAAACAG GGCAGGGTTCATGTTGGCTTCTTGTATACATGGTGTTTCTTCTGTTTAATTTATCAGATG AGTTCTTAGAACCTTCACAATCTGAAGCCATAGTGAAAATTAAGCAGCTTTTGAACTTCC CTCAAGATTTGAGTAGTTGGAGTGACAATACAGATTTTTGTAACAGTGAGCCAAACACTG CCTTAACACTAATGTGTTATGAAGATAACATAACACAGCTTCATATTTCTGGCTATAACT GGTTCCCTAATTTGCCTCAGGGGTTTTCTACAGATACCCTTTTCTCTAATCTTGCTCTTT TGCCTAATTTAAAGGTGCTTTCTTTGGTTTCTTTAGGTTTGAGAGGAACTTTACCTAAAA AGATTGGATTTTTATCTTCTTTGGAGATTGTTAATATCAGTTCAAACTTCTTTTATGGTG AGATTCCAGGACAGATTTCATATTTGAAGAGTCTTCAGACACTTATATTGGATAATAATG AGTTTACAGGCCAAGTTCCTGAAGGGGTAGGCTTACTTCATTCGTTGTCTGTTTTGAGTA TCAAGAACAATTCATTTTCTGGTTCATTGCCTAATTCTTTGTCAAATTTACAAACCCTAA GAATCCTTTCTATTTCTGGTAATAATTTTTCTGGGGTTGTTCCAAACCTTCATAATCTGT CAAATCTTCAAGTTCTTGATTTGGAAAGTAACAATCTTGGACCTAATTTCCCTAATATTC CAACCAAGTTGGTATCTTTGGTACTTAGGAAGAATAAGTTCAGTTTAGGGGTACCAAAAG AACTGAGTTCATGTTATCAGTTAAAGAAACTGGACATTTCTTCTAATGAGTTTGTTGGAC CCTTTTCACCAACAATTTTATCATTGCCATCACTCAGCTATTTCGATATTTCTGGAAATA AACTAACTGGGAAGCTTCTAAAGAATGTGACATGTAGTCAAGACCTTTCATTTGTGAATT TATCATCAAATTACTTGACAGGGGAGTTGCCTGATTGCTTGCACCCTAGTTCTGGTTCCA AGATTGTATTGTTTTCTGGAAATTGTCTGTCGAATAAAGAGCAATGGCAGCATCCTTATT CATTTTGCCATAATGAAGCTTTGGCTGTTAGTATTGAGCCTCATAAGAGAAAGGTTAAAG GGGGAAATGGTAAAGCTGTTCTTGCATCAAGTATGGTAGGAGGTTTTGTTGGAGTAGTAG CGATTGTCGGTTTGGCTTTCGTGGTTGTTAGAAGGGAGTATGTCAAGCAGAAAGCTAGCA AAGCCCCTCAAACAAGATTGATACTTGAAAAGGTCTCTCCTGCTCACACACTTAAGCTGC TTAATGATGCAAGGTATCTTTCTGAAACGAGGAAGTTGGGTTTGCTTGGGGCCCCTCCTT ATCGAACGTTTGTCTTGGATGAGCTTCGAGAGGCTACTAATAACTTCGATATATCAAATC TAATTGGTGCAAGCTCCAGTGGGCAGATTTACAAAGGGCGTCTCACAGATGGCACTGTGG TTGCTATAAGAAGCATAAAAATGAAGAGGAGGCATACTGTCCAGTCCTACACTCACCAAC TAGGGCGTATTTCAAAGATCAGATACAGCCACTTAGTTAGTACTATTGGACACTGCTTTG AGTGCTACCAAGATGACTCAAGTGTTAGCCGAATATGTTTAGTCTTTGAATTCGTGCCAA ATGTGACGCTGCGGGGGGTCATATCAGAAGCAAATTCAGCTCAAAAGTTTACTTGGACGC AACGGATGTCAGCTGCAATAGGGATAGCGAAGGGAATTCAGTTCCTTCATACTGGAATAG TACCAGGGATATTCTCCAATCAATTGAAGATTACAGATGTATTACTGGATCAGAATTTCC ACGTTAAGATTAGCAAATACAACCTGCCTTTGTTAATTGAAAATAAGAAAATGGATGCTG GACCGTCTTCTAGTGGATCAAAGGGAAATGATGGACAAAGGTTAAAATACGAGGAGAAAG ATGATGTGTATGACTTTGGAGTAATCTTACTTGAAATCATATCGGGAAGGACAATCGATA CAAAAAATGATATAGATGTTTCTAAAGACATTCTAATAGTTAGCTTAACAGCTGACGAGA TAGCACGGAGGAACATCATTGATCCAGCTGTTCGGAAGGAATGCTCAGATAGTTCTCTTA GAACATTAATGGAACTATGCATAAAATGTCTTTCAGATGAACCATCGCAGCGTCCTTCTG TAGAAGACTTGATATGGAACTTGCAGTTTGCAGCTCAGGTCCAAGACCCTTGGAATAGAG ACACTTATGGCAACCAAGAGTCCCCTGGTCATGTGTAAGAACTTATGCAAATATCCAATG ATCAATGGACCTTTTCTTGTACAAAATGTAACTTTATACCACTAGGATAGTAGTAATTAG TTTCAATTATTTAGTAGCCTCTATTGCAGCACTTTTGGCTATGAGGTTTCAGTACTCTTT TGAGGTTAAACTCTACATTTGAGCCAAAATTTGTAAGCAAATAGCTATTCCTTGTACCTT TTTTTTAAGGAGCCTAAAATTTAAAAGGTGGGCCTTGCACCGATCATCCAATGGACCATG GACTAAACCGCACCCAAAAATGCTATTTGTGAAAACCACCCCTTAGTCAAATGATTATTA TTACACTACTATAAATCAATCTTTTGTACTTTTTAGAAAACTGTTCAGATTCTTATTGAT TTTAGTCACTTTTTTATTATGCTTAGATAACTCTATCCATCAAAATTTATAAACACACAC AAAAAAGAAAGTATAAACTAAAAATTTCTGTAGAGAGATGTTCTTTTATGGAAACTTCTG TGAAATATGAGACAATAGTCAATAGAGACTCGTTCAACCATAATTTTCATTGACAAGATA TCATGTTACGTTTCAAAATGGGGGCTGAATTCATGGAAAATCATGTGGAGGTGCATTCTT TCATGACATTTCATAAATTAAAGATTTCAAACTTTGACTTTTTATACTCATATTCATTTC TTTAAGCTTGTTTCTGGGCAAATCAATCGAGATTTAAGATTTAAATTGTGCAAGTTTTTA CAACAATCGCAAATTATTAATATACTATAATGATTGAGCTTACACAAGCTACTACATCTC TGTAAACCTATACCTTTAAGATCCACCATTGCTTAATCATACCGTAGAGGTGAATCTAAA ATGAGTTTAACGTTCGAATGAATCAATTACTTTTAACTGAAATTATAGGTAATATAAAAA AGTTGAAATGCGTACATACAATAAGATCACCTCTTCTCAACCACATAACATACACTTTCA AACACATAATATGGTTGACTAATGAAGCCTACCACAGAGAGTTTCTTGGTTACTAAGCAA ATTAGATAAACTAGAATTAAAATTGTAGTCAATCATAATACATGGAACTTTCTTCTCAAT GTAAACCTTGAAAGGTATCAATGACCCTTTTATAACAGTCAACACAATGGGCAATTTCAC AATTCACTGGCTTGGTACTAACATCATGCAAGGAGTAGCAATAAGTTAAAGAACAACGTA ACAACATACCCAGTGAAATCCACTAAGTAGGGTTTGGGGAGAGTAGAGTTTACGCAGACC TTACCACTATTTCGTGGAGGTAGAGAGGTTGTTTAGATAAAGTGTAACATGATGCAATAA TCTAGATAGAGACAGGGAAGTGATTCAACAAAAAACTTGAGTGTGTATGCTCATTCTATT GATGAAAATTGGTGTTACATGAAGGTATATAACCAGTATTGTACAGTTTTTTAATGTACA ATTAATGTGCATGAATAGCAAAGAATGGGGACCTGAATACTAACTACTCCTATCCTTTGG ATACCAAAACAAACAAAATCCGGTAACAAGGAGGAAATCTCCAAAGTAACCAAAAGAAAT ATAAAGAAAAACCTTTTTACAAGCAGAAGTGATGGAGAAGAGAACTCAGTAAAAAGCTCA ATCATCGTCGAGGAGGGTCAACAATTGG