Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g095870.2.1
CDS Infomation	Reduced male fertility, Probable F-box protein (AHRD V3.3 *** A0A0K9NUY5_ZOSMR)
Sequence	ATGCTTGCATCAACTAGCAAATGGTTCCATCGTATCATTATGGAGGACATCATATGGAAA CATGCCTGCTTGCGAGACCTCCAGGTTCCTGACCCTGGAAAAGTAGCATTCAAATGGATC AACTTATATGCAGCAGCCTTTAATGGATGTCATTCTTACAAGTTCCGCCAGCAGGATAAA CATATTGACTGGATGCGCATTGGAGCATTTTCCTTTGACTCGCAAAATGCACTCTTGACA GAGAATTTGATCCCTCCCTTGAAAGTCCTTAAGGAGAAGACAACAGAGAAGATGTTGGAG TCAAACGGGTGCTGTGTGGTCAGAAATGTCAAGAGTGGAATCTGGATTGCTGATTTGCAG CTTGTTCGTTGCCCAGTCTGTGACCTGAACACATGTGATGGAACAATGCAGGTATTAGAT GCAAGACATATTGAACTGTTCCTAAGTGAAGGATACCAGGATGGAAGCTGGGATTATGAG TTGCTAGGTTCCCACAACGAGAAGAAGCAAGCTAATGGAGCCTCTGCTGGTATATTTGAT ATCAAACATCTCAAAGATCACTCAACTTCTGCTGTCCTTGATCTCAAGTCATGGGTAGGA AAGCCCAATGATTGGCAACCGAAAGCTATGATAACCTCTTATGCAGTAGCAGTTAATACA AACTTGCAAGAGAATGAAGGTCTTCACGTAAAATTCCATGTCATGAAGTCCGGGAAGAAT GGTGAAATTGTTTCAATCAGAATGTCAGAGCAGCTCCAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g095870.2.1
PEP Infomation	Reduced male fertility, Probable F-box protein (AHRD V3.3 *** A0A0K9NUY5_ZOSMR)
Sequence	MLASTSKWFHRIIMEDIIWKHACLRDLQVPDPGKVAFKWINLYAAAFNGCHSYKFRQQDK HIDWMRIGAFSFDSQNALLTENLIPPLKVLKEKTTEKMLESNGCCVVRNVKSGIWIADLQ LVRCPVCDLNTCDGTMQVLDARHIELFLSEGYQDGSWDYELLGSHNEKKQANGASAGIFD IKHLKDHSTSAVLDLKSWVGKPNDWQPKAMITSYAVAVNTNLQENEGLHVKFHVMKSGKN GEIVSIRMSEQLQ*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g095870.2.1
Transcript Infomation	Reduced male fertility, Probable F-box protein (AHRD V3.3 *** A0A0K9NUY5_ZOSMR)
Sequence	ATTACCGTTAGACCTATAAAAAAGCAATAGCAAGTTGTGCAATTTTTTTTTTATTATTTT CTTTTATAGATTTTTTTTTTGTTTTAATGAAAATGAATAAAAATTTATATGAAGTGTAAT ATCCCATTACAATAATTACTCTTCATCCAAGACATTTAAGACAAATGTAAGATTCATATT AGATGTCATATCATTTAGAATTACATTAAAAAAAGAAGATCAGTAAAAAGGTAAAAGACG AAAATGGTTACTAGTACCTAATGATATTTATAGCAAAACAAGGTTTATTATTAGGCATTC TGAAATGCCAGAACTCAAGTAAATCCCCTTTTTTAAATTGGTTCTCTCTAACAAGATTGT TCCATCCTCTGTTAAACACAAGTCTCCCCAAACTCTTCCATCCAGTAAACTTCATGTCAT GTAAATTGCCCTTTGGATCAATTACACTCACGTTAATACCTCTATCATCTTTGTTTAGTA CCTTTTCTCTCTCCAACTTACTCATGTAGTAGAGTAATTTCGAGTAGCACTCAACTGGAA TTAAGAACCTGCTCAAGTTCGCGTTGATATCCGAGTTCTCCAAGTATTTCCAGCCCACGT AAACCGGTCTACTCCCATGGAATGACTCAATAGCTAAACACATACTTCGTGGAGGCAAAT CTGACCTATTTATAAATCTATCGCTACTGTTGTTCGCTGGAGACTGGAAAATACGTGTTC CGAATAACATTATGCTCTTTTCCTCCTTCTTCTCTGAGACTTTGATGTCATTGCCAAATA GTCTTATTGTAGTCATTGTTCAATTCATGTCTAAACTTTGCATGATGTTACTACTATTTA TAAAGGAATGACTTAATTAGGATGGTCTTCTTCTTTCTATTTCAGTTTGGATTAGGAAAC TTTATGTTATGTTCTTACTTTTTTTTTTTTTAACAATTCGGTGCGCGTTAGTTATAGTTA AACGGTACATACCATTAACGGACTAATAAAAGTTTCCTAATTCGCAACTCAGTAACAAAC TTTTTTTTTTAAAAAAAATGCGCTTTCCGTAAATTTCCTAATTTGACACACAAAAAGGAA ATTTACAGCAAGCACATATTTTAAAATGTTTATTACTTGCTGAAAAAGTACATCTGTAAT AGTATTATATCTGAAACACATTATTTTTTTAATATATTCAATGAATAACGAACAAGTTTT ATTGAACACTGACCTAAAGACGAAAAATAAATTGGAAGTATTGAGCTTTTGAATAATATT TTTTTTTTACTTAAATTAATTCTTCTAGGTTTTTTAAAAATGTAAATTGTTTATATAATT TCTAAAAATACGTTTTGAAATGCTGAGTTGTTTTTTTTCTTTTTATATGAAAAAATTGTT TAATTTGTTTGTCATATTTTGAATTGACATGATGTTAAAAGTTTAATATGATTTTTTATT TTTTTGAATCTTATAATGTTAAACTCAAAATGATAAGAAAAGTATATAAACAAATTAGAC TTGAATCTAACTTGTCCAAAAAATAATTTCATACGAGCTATATTGAAGGCACATTTAGGG ACAAAATCTCTAACTATAAGGCTTCAGGCTCAGAGTCGCAAGCAGCAGAACGATTAACAG GCTGAGATCCGCTTTATGGGCCTTCTTTTCTTGGGCCCAGTGGATGTTCCCTGATGAAAT GAAAGCCTCTGTAGTTTGAATCCAAGCATTGGCGCGCGTATAAATAGCTAACACGTCTTC AATTTGAACTTCGCATAGCCATTTCAAATCTTAGCACTATGGGGAAGCGTATGAGGAGAA CAAGACCGCTCTGTAGCTGTGTATCTCCTCGATTGAAATTTCTCACTCCTCACTCTATCT TCTCCTGGTTCTCTCTCTCTCTCTGCATATTTGTACTTTAATCCATTGCAAAAGTATTTG AAATTGGTGTTTGGTTCTTTCTGATTCAGTTAAATGCAAACTAGAAACGAATTGAATTTT GAGCTAATGTTCAGATGCTATGCTTGTTCTGATTCTATGTAATGCGGCAATTGTCAAATT CTATTTGATTGTCATTTCGCAGTTCAATGCTCACTGATGCATAAATTTGAGTGAGAAGCG ATATCTATTTGAATATTAGTGAAAAATTGATTGCTGAAATTACTCCTATAGTCGAATCTA TTCTTTCGCGGTATCATGCATATTTTATGGTATCTAGAAGATATAAGTCGTCCGGATTGA AAAAATTTGGCTGAGTAGATGCTTGGTATTGAATTTGAGCTAAAATTCTCAGCTGCTCTG CTTATTGCAACTTGTCTTGTACAGAAAATTGTTGAATACGTTTATTGGTTGAACAGTTCA AGCTCTTTGATCCACAAATTTGAGTTACAAATCAATTCAATTACTAATATTGGCTAAATA TTCCTAACTGATACATTATGCCTTCGAATCAATATGAAGGCGATCCGAAACAGTGTTAAA AGAAGTGTTATTAGACTCTCTCTGGCACTGCATCTATAGTGTGTATTTAGAAACTAAGTA ATCTGATTGCTGAAACTTCTGGATTCAAGGGCTTTCTGCTTTCTATAAGAGTTTGAATGC TCTATTTTCTAGAATTTAAATGTGGCACAAATTGCATTTGAGCTAAATTTTAGCTGCTCT GCTTATTACATGTGTGTTAGTAACAACTGTCAAATGCATTTACTGATTATGTTTTTGCAG TTCGATTCTCTCTGATCCACGAATTTGAGCAAAAAATGAATTCATCTTTGAATGTCAGCT AAGTAGATGATGTTAGTGAAATAATATTAAAATGCTCCTCACTAACAGATGATACTACAT TTAAGAAGGCCACTGTACTGTATATTAGACACTTTGTGTTGCCGCACATTTTAATTTTAT GTATCTATAGAAGAAAAGAAACAATCGTGGATACATTTGAAATCAACGCTTTCTGATTTC TCAATCAGTTCAATGCTCTATGTTCCATGGATTCAATAGTGAAGCACATTAATATCCTAG CTAAAATTCAGCTGCTCTGCATACTGAACTGCATGCTGTGCTGCAACTGTCAAATGCGTT TATTGGCTGAGGTTTTTCATTTGAATGCTCTTTGATCCACAAATTTTCTAGTACTCAATT CAAGTTCGAATATTATATGAGATCTGATAACTGATACTACACCATCTTTTCTATAAGAGG GTGAATAACTGTATTAAAAGTCCCATTCTCAACTCTTGTAAATGCAATTTTTAGCTTCAA ATTCAAAGCTTTAATTAAATTGAGTTTACAAATATCCTGGTTGGTGATAAGCATAAGGTT GTGAATACAAGTTCAAGAGCATTGTTATTGGCTGTCCTTCTTTTGACGTCACCTTAGTGT ATGTAGTACTGCGAATAAAAATCAAACAGTTAGCTATATCACAGAAGCCAATGCTTTGAA CTCTAGAATATCAGCTTCTTTGTTCAACTGACATCATCTGCATGACCATGAACATAACTG AGATTATCTTTGTTGTGTATCTTATGGTAGTTATCAAGTTGGTTGTGAATGTTGAGACTG AATTTATGGCTATTTGAATACCAAGGTACGAAGAGGACCTGTGGACAGAGATTGCTAAGT TCTTGGATGGAAGATCTTTGGTGATGCTTGCATCAACTAGCAAATGGTTCCATCGTATCA TTATGGAGGACATCATATGGAAACATGCCTGCTTGCGAGACCTCCAGGTTCCTGACCCTG GAAAAGTAGCATTCAAATGGATCAACTTATATGCAGCAGCCTTTAATGGATGTCATTCTT ACAAGTTCCGCCAGCAGGATAAACATATTGACTGGATGCGCATTGGAGCATTTTCCTTTG ACTCGCAAAATGCACTCTTGACAGAGAATTTGATCCCTCCCTTGAAAGTCCTTAAGGAGA AGACAACAGAGAAGATGTTGGAGTCAAACGGGTGCTGTGTGGTCAGAAATGTCAAGAGTG GAATCTGGATTGCTGATTTGCAGCTTGTTCGTTGCCCAGTCTGTGACCTGAACACATGTG ATGGAACAATGCAGGTATTAGATGCAAGACATATTGAACTGTTCCTAAGTGAAGGATACC AGGATGGAAGCTGGGATTATGAGTTGCTAGGTTCCCACAACGAGAAGAAGCAAGCTAATG GAGCCTCTGCTGGTATATTTGATATCAAACATCTCAAAGATCACTCAACTTCTGCTGTCC TTGATCTCAAGTCATGGGTAGGAAAGCCCAATGATTGGCAACCGAAAGCTATGATAACCT CTTATGCAGTAGCAGTTAATACAAACTTGCAAGAGAATGAAGGTCTTCACGTAAAATTCC ATGTCATGAAGTCCGGGAAGAATGGTGAAATTGTTTCAATCAGAATGTCAGAGCAGCTCC AGTGA