Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g094580.3.1
CDS Infomation	Beta-amylase (AHRD V3.3 *** K4AZJ9_SOLLC)
Sequence	ATGGCATCAGAGATGCAGAGATATGATACAAACGAAGATGACGAAGAGATGGGAATGGAT GTGAAAGAAGAAGATGATGAGGATGAGGACGATGAAGAGAAGAACACTGCCATGCATGCA ATAGCAGGTTTTGATGGGGTACATGGATCTAACAGCAGTAGTAGGTTTCAACACCATCAG CAATATCAGGAGCAACCAACCCCAGGGGGATCCCGTAGATGTAGGCCATTAGAAGAGAAG GAAAGAACAAAGCTTAGGGAGCGACAGCGAAGAGCTATTACTGCAAAGATCTTGGCTGGA CTCCGAAGGCATGGGAACTATAACCTTAGAGTTAGGGCCGATATCAATGATGTAATTTCT GCTTTGGCAAGGGAAGCAGGTTGGGTTGTTCTTCCAGATGGAACCACCTTTCCCTCAAGA TCACAACCACAGGGCACAGGTTCTGCTGGTGGAACACCCACCACAATGGTGACTTCATCA TCTTCACATATACCTACACAACATATTCCACCTGGTTCGTTGAAAGGTGTGCCTTCTGGG TTTCAGAACACAGATGATCAGAGTGCCTGTCAAATGAAAAGTGTTCTTGTTCCTACTTCA TCCCCTTATGATTCATCATCCACTGCGCGATCACAAACTTCAGCCATGGTGGCAGATGGA CTAGACACACAAAATGACCCATTTCTTGTAGGGTCTGCGGATTCAATCGACAAGCAGGTT GTTGACATCCACACAAAACTACAGGAGCGTGATTTTGCTGGGACACCCTACATTCCTGTT TATGTTATGCTACCTTTAGGAGTTATTAATATGAAGTCTGAGCTTGTTGATGCGGATGGT CTAGTAAAGCAGTTGAGAGTGCTGAAATCAATAAATGTTGATGGTGTGATGGTGGATTGC TGGTGGGGCATAGTAGAGGCAAATGCTCCACAGGATTATAACTGGAATGGATATAAACTG CTTTTTCAAGTTGTGAGGGAGCATAAACTCAAAATAAAGGTTGTGATGTCTTTCCACGAA TGTGGAGGTAACATTGGTGATGATGTTTGCATTCCACTGCCTCACTGGGTCTCCGAAGTC GGTCGAAGCAATCCTGATATATACTTTACAGACAGAGCAGGACGACGGAACCCTGAATGT CTCTCATGGGGAATAGACAAAGAACGAGTTTTGCGAGGCCGCACTGCTGTAGAGGTCTAC TTTGATTATATGAGAAGCTTTCGAGTTGAATTTGATGAGTTCTTTGAAGATGGTATTATT TCCATGGTTGAAGTTGGACTAGGACCATGTGGGGAGCTAAGATATCCCTCTAATCCTGTA AAGCATGGGTGGAGGTATCCTGGAGTTGGTGAATTCCAGTGTTATGACCAGTATCTGCTG AAAAACCTGCGGAAGGCAGCTGAAGCAAGAGGACACTCATTCTGGGCACGAGGACCCGAT AATGCTGGTTCTTACAATTCACGGCCACAAGAGACTGGATTTTTTTGTGACGGGGGTGAT TATGATGGGTATTATGGTAGGTTTTTCCTGAATTGGTACTCTCATGTTCTGATTGACCAT GCAGATCGCGTGCTTTCTTTGGCCAAGTTAGCTTTTGATGGGACATGCATTGCTGCAAAG CTATCAGGAATTCATTGGTGGTATAAGACAGCTAGCCATGCTGCTGAATTAACAGCTGGT TTTTATAACCCGAGCAATCGAGATGGTTATGTTGTGATTGCTGCAATGCTGAAGAAGCAT GGAGCTGCATTGAACTTCAAGTGTGCTGAAATGAGGATGTTAGAGGAGCCAGTGGACTTC TGTGACGCACTAGGTGATCCTGAAGGATTAGCCTGGCAAGTGCTGAATGCGGCTTGGGAT GTTTCTCTGCCAGTTTGCAGTGAAAACGCACTTCTGTGTCATGATAGAGGAGGCTACAAT TGTTTGCTGGAAAAAGCGAAACCCCTGAATGATCCGGATGGGAAACATATTTTTGCTTTT ACCTACCTTAGGCTCAGTCCCCTTCTCATGGACGGACAGAACTACATGGAATTTGAACGA TTTGTTAAGCGAATGCATGGGGAAGCAGTCCTTGAGTTCCCATCGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g094580.3.1
PEP Infomation	Beta-amylase (AHRD V3.3 *** K4AZJ9_SOLLC)
Sequence	MASEMQRYDTNEDDEEMGMDVKEEDDEDEDDEEKNTAMHAIAGFDGVHGSNSSSRFQHHQ QYQEQPTPGGSRRCRPLEEKERTKLRERQRRAITAKILAGLRRHGNYNLRVRADINDVIS ALAREAGWVVLPDGTTFPSRSQPQGTGSAGGTPTTMVTSSSSHIPTQHIPPGSLKGVPSG FQNTDDQSACQMKSVLVPTSSPYDSSSTARSQTSAMVADGLDTQNDPFLVGSADSIDKQV VDIHTKLQERDFAGTPYIPVYVMLPLGVINMKSELVDADGLVKQLRVLKSINVDGVMVDC WWGIVEANAPQDYNWNGYKLLFQVVREHKLKIKVVMSFHECGGNIGDDVCIPLPHWVSEV GRSNPDIYFTDRAGRRNPECLSWGIDKERVLRGRTAVEVYFDYMRSFRVEFDEFFEDGII SMVEVGLGPCGELRYPSNPVKHGWRYPGVGEFQCYDQYLLKNLRKAAEARGHSFWARGPD NAGSYNSRPQETGFFCDGGDYDGYYGRFFLNWYSHVLIDHADRVLSLAKLAFDGTCIAAK LSGIHWWYKTASHAAELTAGFYNPSNRDGYVVIAAMLKKHGAALNFKCAEMRMLEEPVDF CDALGDPEGLAWQVLNAAWDVSLPVCSENALLCHDRGGYNCLLEKAKPLNDPDGKHIFAF TYLRLSPLLMDGQNYMEFERFVKRMHGEAVLEFPS*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g094580.3.1
Transcript Infomation	Beta-amylase (AHRD V3.3 *** K4AZJ9_SOLLC)
Sequence	CGCACTACATCCTTTCGTGGTCTTAAATATCGATATTGATATACAAATGACAAAAATATA TACAATGTAGTTTATACACAGAGTAAACAAATTCTATGTACACATAATATTATAGAAATC GAATAGATTACATAAAGTCTCTTAAACTAGTACTTTATTTTAAAAAAAGACGTTTAAATT ATCCGATGAAAAAATAAATGGTATATGGGCTAACAATTTTATCAAATGTTTCTTAAATTA TAATTTTAAGTTATATAAGCTTAACAATATACAAATGTATACTAAAAGCTATTAAAAAGT AGTTGCAGATTCCACCCCTCTCTTGTGGAACTTCAATACTTTTGCTTATTTTGGCACGTG CAGTACGTGTGAATCGCACGCTCCAAAGATAAGGTCAGAAAACACTTCATCCGTGCCAAG CATATGCTTAGACACGCTTGGCTTCCTTCACACGCGTGAGAAACCTAGCCTTCGCATGCT CGCCGTCCACCACCATCGATCTCTCCCTCCTCCGCCGGATCTTCGCCGGAAAATCTTCCG GAACACATAACTCTCCTCTCCTCTCCTTCTGGTTCTGTCTGTTGGAAATATACTTCCTTC ACTCTGCTCCGGCTAATTCGCCGGAATATTTATTCTTGTATAGATATGAATCTGGTTACT CAGCGATAACCGTCGGCTTCGGTGCATGTCTTACAACAATTAGATAGACCGGTTTCTTTT GTTGAAATCAGGGAGCTGAAGAACCAAGCTTCACTAATCATATCAAAAATGTCTTCTGGA ATACTTTAGTCCAATTATTATGCTGAAGCATGGTAAGTGTAAGCAATGTCATCTATATCT GAGGTTTGTAAAACTCGAGTAAAAGAAGTGGAAGAAAGCTGGAATGGCATCAGAGATGCA GAGATATGATACAAACGAAGATGACGAAGAGATGGGAATGGATGTGAAAGAAGAAGATGA TGAGGATGAGGACGATGAAGAGAAGAACACTGCCATGCATGCAATAGCAGGTTTTGATGG GGTACATGGATCTAACAGCAGTAGTAGGTTTCAACACCATCAGCAATATCAGGAGCAACC AACCCCAGGGGGATCCCGTAGATGTAGGCCATTAGAAGAGAAGGAAAGAACAAAGCTTAG GGAGCGACAGCGAAGAGCTATTACTGCAAAGATCTTGGCTGGACTCCGAAGGCATGGGAA CTATAACCTTAGAGTTAGGGCCGATATCAATGATGTAATTTCTGCTTTGGCAAGGGAAGC AGGTTGGGTTGTTCTTCCAGATGGAACCACCTTTCCCTCAAGATCACAACCACAGGGCAC AGGTTCTGCTGGTGGAACACCCACCACAATGGTGACTTCATCATCTTCACATATACCTAC ACAACATATTCCACCTGGTTCGTTGAAAGGTGTGCCTTCTGGGTTTCAGAACACAGATGA TCAGAGTGCCTGTCAAATGAAAAGTGTTCTTGTTCCTACTTCATCCCCTTATGATTCATC ATCCACTGCGCGATCACAAACTTCAGCCATGGTGGCAGATGGACTAGACACACAAAATGA CCCATTTCTTGTAGGGTCTGCGGATTCAATCGACAAGCAGGTTGTTGACATCCACACAAA ACTACAGGAGCGTGATTTTGCTGGGACACCCTACATTCCTGTTTATGTTATGCTACCTTT AGGAGTTATTAATATGAAGTCTGAGCTTGTTGATGCGGATGGTCTAGTAAAGCAGTTGAG AGTGCTGAAATCAATAAATGTTGATGGTGTGATGGTGGATTGCTGGTGGGGCATAGTAGA GGCAAATGCTCCACAGGATTATAACTGGAATGGATATAAACTGCTTTTTCAAGTTGTGAG GGAGCATAAACTCAAAATAAAGGTTGTGATGTCTTTCCACGAATGTGGAGGTAACATTGG TGATGATGTTTGCATTCCACTGCCTCACTGGGTCTCCGAAGTCGGTCGAAGCAATCCTGA TATATACTTTACAGACAGAGCAGGACGACGGAACCCTGAATGTCTCTCATGGGGAATAGA CAAAGAACGAGTTTTGCGAGGCCGCACTGCTGTAGAGGTCTACTTTGATTATATGAGAAG CTTTCGAGTTGAATTTGATGAGTTCTTTGAAGATGGTATTATTTCCATGGTTGAAGTTGG ACTAGGACCATGTGGGGAGCTAAGATATCCCTCTAATCCTGTAAAGCATGGGTGGAGGTA TCCTGGAGTTGGTGAATTCCAGTGTTATGACCAGTATCTGCTGAAAAACCTGCGGAAGGC AGCTGAAGCAAGAGGACACTCATTCTGGGCACGAGGACCCGATAATGCTGGTTCTTACAA TTCACGGCCACAAGAGACTGGATTTTTTTGTGACGGGGGTGATTATGATGGGTATTATGG TAGGTTTTTCCTGAATTGGTACTCTCATGTTCTGATTGACCATGCAGATCGCGTGCTTTC TTTGGCCAAGTTAGCTTTTGATGGGACATGCATTGCTGCAAAGCTATCAGGAATTCATTG GTGGTATAAGACAGCTAGCCATGCTGCTGAATTAACAGCTGGTTTTTATAACCCGAGCAA TCGAGATGGTTATGTTGTGATTGCTGCAATGCTGAAGAAGCATGGAGCTGCATTGAACTT CAAGTGTGCTGAAATGAGGATGTTAGAGGAGCCAGTGGACTTCTGTGACGCACTAGGTGA TCCTGAAGGATTAGCCTGGCAAGTGCTGAATGCGGCTTGGGATGTTTCTCTGCCAGTTTG CAGTGAAAACGCACTTCTGTGTCATGATAGAGGAGGCTACAATTGTTTGCTGGAAAAAGC GAAACCCCTGAATGATCCGGATGGGAAACATATTTTTGCTTTTACCTACCTTAGGCTCAG TCCCCTTCTCATGGACGGACAGAACTACATGGAATTTGAACGATTTGTTAAGCGAATGCA TGGGGAAGCAGTCCTTGAGTTCCCATCGTAG