Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g094000.3.1
CDS Infomation	Poly(A) RNA polymerase cid11 (AHRD V3.3 *** W9RV71_9ROSA)
Sequence	ATGACCGGCGGTGGAGGCGATGCCGCATCGCCGCCTCTATCCTCACAGTCAACTCCATCC AACGGTGGGGAATTCCTTCTTCAATTGCTTCAGAATCATCCGCATCAACTTCACTCTCAG CCTCAACCGCCACTGCGGCCGGAGTTGCAGAATCTGCCGCATGATCCAGCAGTTGCAGCA GTAGGTCCTAGTATGCCCTACCCGCCATTGTTCCATACTCCTACAAACCCTTCTGTTTTG CCCTATTCTCACTCTCCTCCTCTGTTTGTACCTCATAACTTCTTCATTCGAGGGTTTCTC CAAAACCCTAATTCTGGCCATACCACTAACCCCAATTACTCATCTCCGCCTGCCCCAAGT GGGTTCAGTCAATATCACCATGCGAGTCCACTTGGATTTGGATCAGTCGGAGAAAACATG GGCAATTTGGGGATTTTCGGTGCCAATGCTAAGGCGAGTAATTCAAATAATGAGTTTGAT CATAATCTGATTTTTGGATCTTTACGTAGCCATATTCAAGGTAATGTGAGTATGATGAAT GACCGCTTTAGTGATGATTTAGCTAGTAAAGTTGGTAACTTTGAACAGAAAAACCATGAA TCAAGATTAGCGAATGTTAGGATGTTGAATGGTGTGGAGGGTAAGCTTGAGAATGTCATT GGTTCAGGTCGGAAACAGTTGGGCAATTTAAGAGGTCTTGAGCAACAGAATAGTGGTGGA GGTGGAGGTGAGAGTGAGAGTGAGAGTGGTGGTTTGGGGTGGGGAAGACAGTTTCATAGT GGGACTGTAAGAGGGGTTGTGCCACCACCAGGTTTTTCAAGCAAGCCAAGGAGCAGGGAT TTTGAGCATAATGTCGATAATGAGAAGAACAATTTTGTTGAGTTGAACCATAGGGGTATT GGCTTGAATCATAAGTATGAAAGGGAAAGTAAACATCTTTCCAGGAATGGTAAGAATTAT GCTATTGGTTCAGATGATCAAAGGGTTTTTCGTCGGCTGGATTCACCCGTCCCACCAGCA GGAAGTAAACTTCACTCTGTTTTGGCTTCTGATGTTGAGGATTCCACGTTGGAATTACGT GGTGAGGATGCTGAGAGTGGGGAAGAAACTGTCTCTGTGATGAGGGATGTTTTAGGTAGG AGTTCTGCTCAAGGCCAAAGCGAACTGGATGAATTGGGAGAACATGTTATCAGTTCTCTT GGACTTGAGGATGAACCAAATGAAAGAAGTGATAAAAAGAATCATCATGCCTCTCGAGAT AAGGACTATCGATCAGACAAGAGAGGAGCATACATACTTGGCCAGAGGATGAGGATGTTG AAAAGACAGATTGCATGTCGGAGTGACATTAATAGGATGAATGGTGCTTTCCTAGCAACA TTTCAATCCTTAATTCCTCCGGAGGAAGAAAGGACAAAGCAGAAACAGTTATTAGCACTG CTGGATGGAATTGTTAGCAAGGAATGGCCTAATGCTCGGCTCTATGTTTATGGATCATGT GCCAATTCTTTTGGATTCTCGAAAAGTGATATTGATATTTGCCTTGCAATTGAGGATGCA AATATTGACAAATCAGAGGTATTGTTGAAGTTGGCTGACATGTTGCAGTCAGGCAATCTC CAGAATGTGCAGGCACTTACACGTGCCAGGGTGCCGATAGTCAAGCTTATGGATCCAGAA ACTGGGATATCTTGCGACATATGTGTGAATAATGTTTTGGCTGTTGTTAACACAAAGCTG CTTCGAGATTATGCACAAATAGATGTACGATTAAGACAGTTGGCATTTATTGTTAAACAT TGGGCTAAGTCTAGAGGGGTGAACGAAACTTACCAGGGGACATTATCTAGCTATGCGTAT GTGTTAATGTGCATTCACTTTCTACAGCAGCGAAGACCTGCCATCCTTCCATGTCTACAG GGTATGGAAGCAACCTACTCTGTTACTGTTGGCAACATTGAATGTGCTTACTTTGATAAA GTGGAAAAGCTTTATGGTTTTGGATCTCAAAATGGTGAAAGTCTTGCTCGGTTGGTGTGG GCATTCTTCAGCTACTGGGCATATTGTCATGATTATGCAAATGATGTTATTTCCATTCGT TCAGGAAGTACAGTGAGCAAGCGAGCCAAAGACTGGACTAGGAGGATTGGGAATGACAGG CATCTGATATGCATAGAGGATCCATTTGAGGTTTCTCATGATCTTGGTCGGGTGGTAGAC AAGTTCAGCATAAGAGTTTTGAGGGAAGAATTCGAACGAGCTGCTGAAATAATGCAGTAT GACCCGAACCCATGTGTGAAACTTTTCGAACCTTATATACCTAGCTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g094000.3.1
PEP Infomation	Poly(A) RNA polymerase cid11 (AHRD V3.3 *** W9RV71_9ROSA)
Sequence	MTGGGGDAASPPLSSQSTPSNGGEFLLQLLQNHPHQLHSQPQPPLRPELQNLPHDPAVAA VGPSMPYPPLFHTPTNPSVLPYSHSPPLFVPHNFFIRGFLQNPNSGHTTNPNYSSPPAPS GFSQYHHASPLGFGSVGENMGNLGIFGANAKASNSNNEFDHNLIFGSLRSHIQGNVSMMN DRFSDDLASKVGNFEQKNHESRLANVRMLNGVEGKLENVIGSGRKQLGNLRGLEQQNSGG GGGESESESGGLGWGRQFHSGTVRGVVPPPGFSSKPRSRDFEHNVDNEKNNFVELNHRGI GLNHKYERESKHLSRNGKNYAIGSDDQRVFRRLDSPVPPAGSKLHSVLASDVEDSTLELR GEDAESGEETVSVMRDVLGRSSAQGQSELDELGEHVISSLGLEDEPNERSDKKNHHASRD KDYRSDKRGAYILGQRMRMLKRQIACRSDINRMNGAFLATFQSLIPPEEERTKQKQLLAL LDGIVSKEWPNARLYVYGSCANSFGFSKSDIDICLAIEDANIDKSEVLLKLADMLQSGNL QNVQALTRARVPIVKLMDPETGISCDICVNNVLAVVNTKLLRDYAQIDVRLRQLAFIVKH WAKSRGVNETYQGTLSSYAYVLMCIHFLQQRRPAILPCLQGMEATYSVTVGNIECAYFDK VEKLYGFGSQNGESLARLVWAFFSYWAYCHDYANDVISIRSGSTVSKRAKDWTRRIGNDR HLICIEDPFEVSHDLGRVVDKFSIRVLREEFERAAEIMQYDPNPCVKLFEPYIPS*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g094000.3.1
Transcript Infomation	Poly(A) RNA polymerase cid11 (AHRD V3.3 *** W9RV71_9ROSA)
Sequence	TAATTTTCCTACATCATTTAGGTTTCGGTAAACATCGTAGTGTTTTATACTTAAGTACTT ACTTTACTATATTATAGAAGACTGTTTTTAGTTTGCAGATATTTATATAAATAATTGAAA AAGTTAATCATCTTTTTTTTTGGGAGAAATCCAATGAACAGACGGAATAGGTAACGATTT GTGGTATTTGTTAGATCGAGAAAAAAACTGTAATTAGACTTCTCTGCTAAGTTTCTGCTG TATTTGGATTCTCCGGCGAACATTAATATCTAACCATGACCGGCGGTGGAGGCGATGCCG CATCGCCGCCTCTATCCTCACAGTCAACTCCATCCAACGGTGGGGAATTCCTTCTTCAAT TGCTTCAGAATCATCCGCATCAACTTCACTCTCAGCCTCAACCGCCACTGCGGCCGGAGT TGCAGAATCTGCCGCATGATCCAGCAGTTGCAGCAGTAGGTCCTAGTATGCCCTACCCGC CATTGTTCCATACTCCTACAAACCCTTCTGTTTTGCCCTATTCTCACTCTCCTCCTCTGT TTGTACCTCATAACTTCTTCATTCGAGGGTTTCTCCAAAACCCTAATTCTGGCCATACCA CTAACCCCAATTACTCATCTCCGCCTGCCCCAAGTGGGTTCAGTCAATATCACCATGCGA GTCCACTTGGATTTGGATCAGTCGGAGAAAACATGGGCAATTTGGGGATTTTCGGTGCCA ATGCTAAGGCGAGTAATTCAAATAATGAGTTTGATCATAATCTGATTTTTGGATCTTTAC GTAGCCATATTCAAGGTAATGTGAGTATGATGAATGACCGCTTTAGTGATGATTTAGCTA GTAAAGTTGGTAACTTTGAACAGAAAAACCATGAATCAAGATTAGCGAATGTTAGGATGT TGAATGGTGTGGAGGGTAAGCTTGAGAATGTCATTGGTTCAGGTCGGAAACAGTTGGGCA ATTTAAGAGGTCTTGAGCAACAGAATAGTGGTGGAGGTGGAGGTGAGAGTGAGAGTGAGA GTGGTGGTTTGGGGTGGGGAAGACAGTTTCATAGTGGGACTGTAAGAGGGGTTGTGCCAC CACCAGGTTTTTCAAGCAAGCCAAGGAGCAGGGATTTTGAGCATAATGTCGATAATGAGA AGAACAATTTTGTTGAGTTGAACCATAGGGGTATTGGCTTGAATCATAAGTATGAAAGGG AAAGTAAACATCTTTCCAGGAATGGTAAGAATTATGCTATTGGTTCAGATGATCAAAGGG TTTTTCGTCGGCTGGATTCACCCGTCCCACCAGCAGGAAGTAAACTTCACTCTGTTTTGG CTTCTGATGTTGAGGATTCCACGTTGGAATTACGTGGTGAGGATGCTGAGAGTGGGGAAG AAACTGTCTCTGTGATGAGGGATGTTTTAGGTAGGAGTTCTGCTCAAGGCCAAAGCGAAC TGGATGAATTGGGAGAACATGTTATCAGTTCTCTTGGACTTGAGGATGAACCAAATGAAA GAAGTGATAAAAAGAATCATCATGCCTCTCGAGATAAGGACTATCGATCAGACAAGAGAG GAGCATACATACTTGGCCAGAGGATGAGGATGTTGAAAAGACAGATTGCATGTCGGAGTG ACATTAATAGGATGAATGGTGCTTTCCTAGCAACATTTCAATCCTTAATTCCTCCGGAGG AAGAAAGGACAAAGCAGAAACAGTTATTAGCACTGCTGGATGGAATTGTTAGCAAGGAAT GGCCTAATGCTCGGCTCTATGTTTATGGATCATGTGCCAATTCTTTTGGATTCTCGAAAA GTGATATTGATATTTGCCTTGCAATTGAGGATGCAAATATTGACAAATCAGAGGTATTGT TGAAGTTGGCTGACATGTTGCAGTCAGGCAATCTCCAGAATGTGCAGGCACTTACACGTG CCAGGGTGCCGATAGTCAAGCTTATGGATCCAGAAACTGGGATATCTTGCGACATATGTG TGAATAATGTTTTGGCTGTTGTTAACACAAAGCTGCTTCGAGATTATGCACAAATAGATG TACGATTAAGACAGTTGGCATTTATTGTTAAACATTGGGCTAAGTCTAGAGGGGTGAACG AAACTTACCAGGGGACATTATCTAGCTATGCGTATGTGTTAATGTGCATTCACTTTCTAC AGCAGCGAAGACCTGCCATCCTTCCATGTCTACAGGGTATGGAAGCAACCTACTCTGTTA CTGTTGGCAACATTGAATGTGCTTACTTTGATAAAGTGGAAAAGCTTTATGGTTTTGGAT CTCAAAATGGTGAAAGTCTTGCTCGGTTGGTGTGGGCATTCTTCAGCTACTGGGCATATT GTCATGATTATGCAAATGATGTTATTTCCATTCGTTCAGGAAGTACAGTGAGCAAGCGAG CCAAAGACTGGACTAGGAGGATTGGGAATGACAGGCATCTGATATGCATAGAGGATCCAT TTGAGGTTTCTCATGATCTTGGTCGGGTGGTAGACAAGTTCAGCATAAGAGTTTTGAGGG AAGAATTCGAACGAGCTGCTGAAATAATGCAGTATGACCCGAACCCATGTGTGAAACTTT TCGAACCTTATATACCTAGCTGATTTGGTCTTCTGTTCAAGTAAAACAACCAATAATTAT AGGAATGTCCGGTCGTGCTGTAAATGTTATAAAGTTTGTTTCTTGTATCCCTTGTGGTTT TGGCTTTCACCTCTCAAGTGTATTTAGGCGCTTTTGATCTTCATCTATCATCTATCATCT AGGTGTTTTTGATGTAAAAGAACCATCTCCTTGAATTCTATGGTATGTATTCTGTTTATT TTGCATATTGTCAATTGGTCTTTATGGTTAATCAGCTATCGTTGGTTGGGTGATAGCAAC GCACAAAAATTGCAAAGGCAACTTGTTTGCCAAATATTTAGGTGAAA