Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g090280.3.1
CDS Infomation	Leucine carboxyl methyltransferase, putative (AHRD V3.3 *** B9RCZ7_RICCO)
Sequence	ATGGCGAAACCGGTTACCGATTCACGCAGCAACAGAGCCGCCGTTCAAGCCACCAACGAC GACGCTTCCGCCAGCAAACTGTCGTGTGTGAAAAAAGGATATATGAAAGATGATTATGTT CATCTGTTTGTTAAAAAGCAGCTGAGGCGAGCTCCGATTATTAACCGTGGTTATTTTGCC CGCTGGGCTGCTCTTCGAAAGATGCTTTATCAATTTCTTGATTGTGAGCCGAGTGCTGAT GGAAATGGAAATATCAGGAAGCAGATACTGTCACTTGGAGCTGGCTTCGACACACTGTTT TTTCAGTTGCAGGACGAAGGAAAAGCTCCTCATCTTTATGTGGAACTGGATTTCATTGAG GTAACAAGTAAGAAGGCAGCTCTTATTGAAACCTACAGTCAGTTAAGGGATAAAGTTGGT GAAACAGCATCAATATCCTTAGAAAAGGGGGAAGTCCATAGTGATCATTACAAATTGCTG CCTGTAGATTTGCGCAACATAGAAAATTTGATTGATATTATAGCCCGAGCAAATTTAGAC CCCAGTTTGCCAACATTTATAATTGCAGAATGCGTTCTTATATATTTGGATCCTGATTCA AGCCGTGCTATTGTTGGATGGGCTTCAAGAACCTTTTCCACGTCAATATTTTTCTTGTAT GAGCAGATCCACCCAGATGATGCTTTCGGTCAGCAAATGATTCGGAATTTGGAGAGCCGA GGTTGCGGACTATTAGGAATATATGCTACACCAACTTTACAAGAGAAAGAAAATCTTTTT CTTGATCAAGGATGGCAGAAAGCAGTTGCTTGGGACATGCTACAGGTTTATAGTGATTTT ATTGAAGCTCAAGAAAGACGCAGGAGCACTATTGTGTTACATATGCAGTCAATGATGCTA TGGGTTTGTTCAATGAATTTGGTTTCCCTAAAACACATCCTACAACAAATACCTCCATTG CAACATCCACATGAGAAGAGGATCCTATCTTTAGACAAAATCACTCTTTCCAATCTCAGG TCATCGGAATATGAACGGGAAGCTTGTTACCAGTTGTCAATTGTCAGGATAAGAAGTGTT TCAGGTACCGAAAAGGTCTCAACCAGTTCTGGCTCCTTATTAGGTGTATTAGGACGATCC TTAGTGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g090280.3.1
PEP Infomation	Leucine carboxyl methyltransferase, putative (AHRD V3.3 *** B9RCZ7_RICCO)
Sequence	MAKPVTDSRSNRAAVQATNDDASASKLSCVKKGYMKDDYVHLFVKKQLRRAPIINRGYFA RWAALRKMLYQFLDCEPSADGNGNIRKQILSLGAGFDTLFFQLQDEGKAPHLYVELDFIE VTSKKAALIETYSQLRDKVGETASISLEKGEVHSDHYKLLPVDLRNIENLIDIIARANLD PSLPTFIIAECVLIYLDPDSSRAIVGWASRTFSTSIFFLYEQIHPDDAFGQQMIRNLESR GCGLLGIYATPTLQEKENLFLDQGWQKAVAWDMLQVYSDFIEAQERRRSTIVLHMQSMML WVCSMNLVSLKHILQQIPPLQHPHEKRILSLDKITLSNLRSSEYEREACYQLSIVRIRSV SGTEKVSTSSGSLLGVLGRSLV*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g090280.3.1
Transcript Infomation	Leucine carboxyl methyltransferase, putative (AHRD V3.3 *** B9RCZ7_RICCO)
Sequence	TATTAAATTTTAATAAATTTCAATAATAATATATTCAATATGATAACGTAGAGTGAATGT CATGTTAATCAAATCATGTATACTGAAGAAAGATTTTTGACATTGACATACTATTAATCT TAATGGCTTTGTCGTATGCTTTAGGTTGATTTCATGTCAATGTATTTAAATTTGAATATA CCATTATTATATGATAACTTATCAATAAAATAGTATTTTGTATTTATACAATTAGATAGA GAGTTACTTAACAAGTAAGGGGTTGCATTTTACGAAAAATTCATCAAAGAGCTCTTAGCA AATGTGAGACAATCACTTCTTTCAATCTTTCTCGATCATAGATATTATTGTTTTTCACTT GACACCTTGATAATAATGAATAACTTGTATCATCTTTCCTCAAACTTTTATGATTTAATT TTATGTTTTTAATCATGTATGTTATGTCATTTTCAATCGTGGCATATTTCGGATGCTTGA AGGTCCCGCTGACACGAAGTGATTTAGAAATATTCTTCTTTTGTCGATGGTGATCGGTCA TGGTATACACAACCTTGCTTTTTTTTCGTTCAAATCCTGATTTCGTTTTGCTTCTCCCGA TCGTCGAGCCTGATCGATTTGACTCTTTTCCATGCCCCCGACCTCTCACTCTATTTCGTT CTACTTCTGTACCATTGCTTGAATAAAGACACCCGGCCGACCCGACTTTCCCAAATCCCC CCCCCCGACCCTTCTCCTTTACGGGGTCTAGATTTTTCGCGTCGTTTCAATCGTCGTGGT CGACGGAGAAGAAAGAAATGAATGAATATTCTTTTGGGTTATATATATATTTTGAAAATA GTTGCAAGACAAAAACTGAAACCTTTCTTTTATTGTTGTTCCTCCCAGATACATGGCTTA CATATGTGGCTCAACATTCTTGGAAAACAACCGAATCGAGGGTTCGGGAGCCTATAAAAC GTTTGTTATGATATAAGGATCGTGCGCCTACCCGAATTGACTTCGCTATTGCTTCCGTGT AGGGGTCGATCCCAAAATAGGGATTTTTTTATGTGAAAGGAATTTTGAAGCGAGTATTAT TTTATAATAAATCTGTAAATGTAAATTATAGTCAACTTGCTATTAACTAATTAAGCACAA ATTATTACTTTAAATATAGATAAAATAGTCAAATAAATAATGTTTTAATATCGAAAATTT TTTTATTGAAAATTTGTGTTATTTTAATTAATAGTTATATCATATTAGTCATCATGAAAA TTTGTATTGTTTTAATCAATAGTTATATCATACTAGTTATAATTGGAAAGAACATTTAAA CAATAGAAGAATTAAGATCTATTGATTTCGTCCACTCCAAGTAACAAGAAAATTCATTCA TGGATAAAATTTTTAAAAAATAATATTTGAGACATTATTTTATTCTTTTCAACATAAATA TATATTTTTTAAAATTTTTATTATTCAAGAATTCGACCTAATTTTTTTCAATTTCATAAT TGTACATTTTGACAACACTTTCATATCCTAAAAGTACGAATTTATTAATCAATTAGTGTA TGTTAACTAGACCTAAAAATATTAATAGCTTAGAATAAAATAACTAACATTTAATGTCTT TTTTTGTAAAAAAAAGGTTAAAAATTGACATTCTAAATCATTTAGCTTTATATCAAGAGT TAAACAATCTAAAAATAGTTGACATTTTGACTTTTAAGCCTATTCAAAGCATGTAAACAA AATAAAAATTATAAAATAATACTACGAAGGTCATTTTAATTGTTGCTAATTAAACCTATG CTTTTTCTTTTTCTAGTTTACATTTAGAATTCGATAGCTATATTGTTACTTGAATTAAAA AAAATTTAAATGTAATTTTTTTATTAAAAATAAAATATTTTACTACTATATCATAATCTG AACGCATTTGTGAAATAACATTGAAAAAGAAAAAGTGAGGACTAAAATGGTCATAACATA ATCTATTGTGAATGAAAAAGTAATAACGAGTAAGTAGAAGGATCAAATCCTCCGCCCAAA TTCTGCTCCCCATTTTCAAAGCTCTGTATCAAAACTTGGCCAAGAGGATGGCGAAACCGG TTACCGATTCACGCAGCAACAGAGCCGCCGTTCAAGCCACCAACGACGACGCTTCCGCCA GCAAACTGTCGTGTGTGAAAAAAGGATATATGAAAGATGATTATGTTCATCTGTTTGTTA AAAAGCAGCTGAGGCGAGCTCCGATTATTAACCGTGGTTATTTTGCCCGCTGGGCTGCTC TTCGAAAGATGCTTTATCAATTTCTTGATTGTGAGCCGAGTGCTGATGGAAATGGAAATA TCAGGAAGCAGATACTGTCACTTGGAGCTGGCTTCGACACACTGTTTTTTCAGTTGCAGG ACGAAGGAAAAGCTCCTCATCTTTATGTGGAACTGGATTTCATTGAGGTAACAAGTAAGA AGGCAGCTCTTATTGAAACCTACAGTCAGTTAAGGGATAAAGTTGGTGAAACAGCATCAA TATCCTTAGAAAAGGGGGAAGTCCATAGTGATCATTACAAATTGCTGCCTGTAGATTTGC GCAACATAGAAAATTTGATTGATATTATAGCCCGAGCAAATTTAGACCCCAGTTTGCCAA CATTTATAATTGCAGAATGCGTTCTTATATATTTGGATCCTGATTCAAGCCGTGCTATTG TTGGATGGGCTTCAAGAACCTTTTCCACGTCAATATTTTTCTTGTATGAGCAGATCCACC CAGATGATGCTTTCGGTCAGCAAATGATTCGGAATTTGGAGAGCCGAGGTTGCGGACTAT TAGGAATATATGCTACACCAACTTTACAAGAGAAAGAAAATCTTTTTCTTGATCAAGGAT GGCAGAAAGCAGTTGCTTGGGACATGCTACAGGTTTATAGTGATTTTATTGAAGCTCAAG AAAGACGCAGGAGCACTATTGTGTTACATATGCAGTCAATGATGCTATGGGTTTGTTCAA TGAATTTGGTTTCCCTAAAACACATCCTACAACAAATACCTCCATTGCAACATCCACATG AGAAGAGGATCCTATCTTTAGACAAAATCACTCTTTCCAATCTCAGGTCATCGGAATATG AACGGGAAGCTTGTTACCAGTTGTCAATTGTCAGGATAAGAAGTGTTTCAGGTACCGAAA AGGTCTCAACCAGTTCTGGCTCCTTATTAGGTGTATTAGGACGATCCTTAGTGTGAATGC ATCTATACATCTATTTGTTTTGACGTAAAGGGGAAGATCTTCTCCAGATAT