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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc01g088670.2.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XUK0_CYNCS)

Sequence

ATGTGTGCTACCTTGCGCCTTATGCGCATCAATTTTAAGGTAGGTCATTTCCCCCTGTTT
CGGACATCATTGTACACTTCACAATTGTTAGTCTTACACTCCCTCACTCCACCCCACAAA
ACCATAAACCCTAAAGTTTCCAGGTTTTCTACTGATAGCTCATATTGTAGTTCAAAATCA
TTAGTGTTTGTAAAAGGGTATGATTTTCTTGAGCAATTTACCCCTTTTAAAAATTTAGCA
AAATCTTGTACTTACACTGTCATTACCTCAAATGAGAAGCGTAAAATTATTGTGGGGTTG
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CCATCATTTTTGGTAAAAATTATGAAGTTGTTTGATGATAGAGAAGTCGCATTTGCATTT
TTTAAGTACGTTCTTCAAGATTATTCTGAGAATACTCTGAAGTCATGTTGTATTAGTGCG
CATGTTTTGGCTGCTGAGGAGTTGAGGCTATTGGCACAGGATATGCTTTCTTGGATCATT
AGGAAGGTTGGAAAATGTAGGAGTGATGAAGTGGTGGAGTTCATGTGGAGGGAGCATTAT
AAGTATGAGAGTGAATTTTCTGTTCTTGATTCATTAATGCGGGCTTTTTTAACCGCAGAA
ATGGTTTCGGGTGCATTAGAGATTTGGAGTAAGATGAGAGACAATGGGTTGAGGCCGAGT
TCATCTGCTGTCTGCATCCTATTTAAGTTGTTGCTTAGGATCGGTGATTATGGTAGTGTC
TGGAAGTTATTTCGGGACATGTTGCAAAAAGGGCCTCGTCCTACTGACGCTCTCTTTAAT
GCAATGATTCTTGGATATTGTAGAAAAGGTAGGCTTCAGACAGGAGAAAGTTTGTTTCAT
CTGATGCGGAAGTTTGGATGTGAGCCAGATGTTTTTACATATAATATTTTGATCAATGCT
TACTGTACCAGGGGATGGACTTCAGATGCATTGGAATGGGTGCATATGATGGTCGAACAT
GGATGTCATCCTAGTATCTCTACCTTTACTACAGTTATCAGTGCTCTATGTAAGGAAGGG
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ATTTTGGTGGCAGGTCACTATAAGTATGGTAGGGAAGAGGACGGTGACCGGTTATTATGG
GATCTAACAGTGGGGGGACTTTCTTCAGATTATTTATCATCTGATGTATCTATTGCAGGG
TTGTGTTGGGTAGGAAGGTTAAATGAGGCTGTGACATTGTTGGATAATCTGCTAGAAAAG
GGGATACCTGTTAGTGTAATAGCTTTTAATTCCATTATTGCTGCATACAGCAAAGAAGGG
TTAGAAGAAAAGGCATTTGAAGTCTATAATATTATGGTTCAATTTGGTCAGTCTCCTTCA
GCTTTGACATGTGCTTCTCTGCTCCTCAGCTTGTCAATGACGGGGAGGCTGCAAGAAGCA
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GAGATGGAAAAGATGGGAATCGCACCTGATGCTGTTGCTTTTTCTGCATTAATAGATGGG
CTTGTCAAAGCTGGCTCTGTTGGAGACGCTTATGATGCCTTTCTTCAGATGATTAGGAAA
GGACTTGTACCAAATAATTTTGTTTATAATTCGCTAATTACTGGTTTTTGTTATAGCGGA
AATATGAATGAGGCTCAGAAATTAGAAAGGGACATGAGGGAAAGGGGTCTTCTCCCAGAT
ATCTTTACAATTAATACCATCATTAATGGTTTCTGCAAACAGGGAAGGATGAAACTTGCT
ACTGATTGTTTCGTGGAAATGCATCGAAGTGGTTTACAGCCTGATATTGCTACGTATAAC
ACCTTGATCAATGGATTCTGTAAGGCATTCGATGTGGTTAATGCAGATAACTTTATGACA
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TTCTGTAGTACTAGGAGGATAAATCAAGCTGTTATGATTCTGGATGAGCTTGTATCTGCT
GGTGTGGTGCCAAATACTGTTACATACAACATTATGATGAATAGTGCTTGCAATGACATA
TTGGACCGTGCAATGATTTTGGCTGCAAAGTTGCTTAAGATGGCGTTCATTCCAAATACT
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GTTTGGGGGCAGAAGTTGAGCGAAATTGGATTTGAGTTTGACGAAATAACACATAAAATA
TTGGACAAATCTTCTCATTGTATACAAGAAAACACAGATTATTGTACAGAAACAACAGAG
AAGAGTCTTTTTCTAGACTTCCTCATGTACATTACCTACGACCACATACGTAGAAGTAGG
GCTTATAGTGATAATAATGACAGCTCTTTCGAACTAGTTGAAGATGGACCTTGTGGGTCC
TTCAAGTTAGTCAATAAGGCTACTGTTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc01g088670.2.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XUK0_CYNCS)

Sequence

MCATLRLMRINFKVGHFPLFRTSLYTSQLLVLHSLTPPHKTINPKVSRFSTDSSYCSSKS
LVFVKGYDFLEQFTPFKNLAKSCTYTVITSNEKRKIIVGLSRMIKDENGWLLEAFSRDFC
PSFLVKIMKLFDDREVAFAFFKYVLQDYSENTLKSCCISAHVLAAEELRLLAQDMLSWII
RKVGKCRSDEVVEFMWREHYKYESEFSVLDSLMRAFLTAEMVSGALEIWSKMRDNGLRPS
SSAVCILFKLLLRIGDYGSVWKLFRDMLQKGPRPTDALFNAMILGYCRKGRLQTGESLFH
LMRKFGCEPDVFTYNILINAYCTRGWTSDALEWVHMMVEHGCHPSISTFTTVISALCKEG
NVVEARKLFDGMQDVGVFPSTVTYNALMDGYVKARDIFQASMLYEEMKRKGVAPDAITFN
ILVAGHYKYGREEDGDRLLWDLTVGGLSSDYLSSDVSIAGLCWVGRLNEAVTLLDNLLEK
GIPVSVIAFNSIIAAYSKEGLEEKAFEVYNIMVQFGQSPSALTCASLLLSLSMTGRLQEA
RDLMAKMITMSFPINITACTVLLDGYFKKGDVMGARTLWEEMEKMGIAPDAVAFSALIDG
LVKAGSVGDAYDAFLQMIRKGLVPNNFVYNSLITGFCYSGNMNEAQKLERDMRERGLLPD
IFTINTIINGFCKQGRMKLATDCFVEMHRSGLQPDIATYNTLINGFCKAFDVVNADNFMT
RMYASGWEPDITTYNIRIHSFCSTRRINQAVMILDELVSAGVVPNTVTYNIMMNSACNDI
LDRAMILAAKLLKMAFIPNTVTANLLLSHLWKQGLPQRALVWGQKLSEIGFEFDEITHKI
LDKSSHCIQENTDYCTETTEKSLFLDFLMYITYDHIRRSRAYSDNNDSSFELVEDGPCGS
FKLVNKATV*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc01g088670.2.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XUK0_CYNCS)

Sequence

TAAATTAAATATTGACTTTCACTACGCAACCACTATTTATCTTCACCATGAATGAGCCTG
TCCAAAATCTTGATCAGCCCAATTGCTAGTAGCACTGGCCACTGCCACTATTTTATTCCC
TTAGTTATTTATTATTATTAAATTGATATATTTATTACTAAAATAATTATAAATATAGTA
AGTTTATCAGTTGTATTTTGTATTTTTTTTTTGCATTGTATTCTATATCAATTATATACG
AAATACAACAAAATTGTGTTTTATATTTATTTTGCATTGTATTCTTCATTTATTTTGTAT
GATTAACGAACAAAACTTTATTCATCCTGTGTTTGATTGGATACAAATACATTTGACAAA
AAGGATGAATGCATATTGTATTCGTATGAATATGAATACAATTGATACAAAAAAATAAAA
TAAAGTTTTTCATATACAATTAAAACAAATCATAAAATTCTCACCTATATTTAATTGAAT
ACAATTGATACGCAACAAATTTGAATGTATTTCTAGTTATTAACAGGAGAGAAAAACGTA
GAGAGGAGAGGGCGCGCACGAGAGCGAGAGAGGGGGGGAGTAAGTTGGGCTTTGAATGTT
GGCAGGAAAGCCCAACTTTTTGTTGGGTTGGCCCATCTGAAAATTGAAAAAGCCCAATGT
TGACATTTTAGTCATGGACATGAGTCACTCGAGATTTTGCTGGCCCGTTCACAGAAAAAA
CTTCAAGAGCTTTGTTCGGCTCGCCGGAAAAATCTTCGCCGACGACTTCTCTGGCGAATT
CCCGGATGTGTGCTACCTTGCGCCTTATGCGCATCAATTTTAAGGTAGGTCATTTCCCCC
TGTTTCGGACATCATTGTACACTTCACAATTGTTAGTCTTACACTCCCTCACTCCACCCC
ACAAAACCATAAACCCTAAAGTTTCCAGGTTTTCTACTGATAGCTCATATTGTAGTTCAA
AATCATTAGTGTTTGTAAAAGGGTATGATTTTCTTGAGCAATTTACCCCTTTTAAAAATT
TAGCAAAATCTTGTACTTACACTGTCATTACCTCAAATGAGAAGCGTAAAATTATTGTGG
GGTTGTCAAGAATGATAAAAGATGAAAACGGTTGGCTTTTGGAAGCATTTTCAAGAGATT
TTTGCCCATCATTTTTGGTAAAAATTATGAAGTTGTTTGATGATAGAGAAGTCGCATTTG
CATTTTTTAAGTACGTTCTTCAAGATTATTCTGAGAATACTCTGAAGTCATGTTGTATTA
GTGCGCATGTTTTGGCTGCTGAGGAGTTGAGGCTATTGGCACAGGATATGCTTTCTTGGA
TCATTAGGAAGGTTGGAAAATGTAGGAGTGATGAAGTGGTGGAGTTCATGTGGAGGGAGC
ATTATAAGTATGAGAGTGAATTTTCTGTTCTTGATTCATTAATGCGGGCTTTTTTAACCG
CAGAAATGGTTTCGGGTGCATTAGAGATTTGGAGTAAGATGAGAGACAATGGGTTGAGGC
CGAGTTCATCTGCTGTCTGCATCCTATTTAAGTTGTTGCTTAGGATCGGTGATTATGGTA
GTGTCTGGAAGTTATTTCGGGACATGTTGCAAAAAGGGCCTCGTCCTACTGACGCTCTCT
TTAATGCAATGATTCTTGGATATTGTAGAAAAGGTAGGCTTCAGACAGGAGAAAGTTTGT
TTCATCTGATGCGGAAGTTTGGATGTGAGCCAGATGTTTTTACATATAATATTTTGATCA
ATGCTTACTGTACCAGGGGATGGACTTCAGATGCATTGGAATGGGTGCATATGATGGTCG
AACATGGATGTCATCCTAGTATCTCTACCTTTACTACAGTTATCAGTGCTCTATGTAAGG
AAGGGAATGTGGTGGAAGCCAGAAAATTGTTTGATGGAATGCAAGATGTGGGTGTCTTTC
CTAGCACTGTCACGTATAACGCTCTGATGGATGGCTATGTCAAAGCTCGGGATATTTTTC
AAGCAAGTATGCTATATGAAGAAATGAAAAGGAAGGGTGTAGCTCCAGATGCTATAACTT
TTAACATTTTGGTGGCAGGTCACTATAAGTATGGTAGGGAAGAGGACGGTGACCGGTTAT
TATGGGATCTAACAGTGGGGGGACTTTCTTCAGATTATTTATCATCTGATGTATCTATTG
CAGGGTTGTGTTGGGTAGGAAGGTTAAATGAGGCTGTGACATTGTTGGATAATCTGCTAG
AAAAGGGGATACCTGTTAGTGTAATAGCTTTTAATTCCATTATTGCTGCATACAGCAAAG
AAGGGTTAGAAGAAAAGGCATTTGAAGTCTATAATATTATGGTTCAATTTGGTCAGTCTC
CTTCAGCTTTGACATGTGCTTCTCTGCTCCTCAGCTTGTCAATGACGGGGAGGCTGCAAG
AAGCAAGAGATTTAATGGCTAAGATGATTACAATGTCCTTCCCTATTAACATAACTGCTT
GCACTGTGCTTCTGGATGGTTATTTTAAGAAAGGGGATGTAATGGGAGCTAGAACATTGT
GGGAAGAGATGGAAAAGATGGGAATCGCACCTGATGCTGTTGCTTTTTCTGCATTAATAG
ATGGGCTTGTCAAAGCTGGCTCTGTTGGAGACGCTTATGATGCCTTTCTTCAGATGATTA
GGAAAGGACTTGTACCAAATAATTTTGTTTATAATTCGCTAATTACTGGTTTTTGTTATA
GCGGAAATATGAATGAGGCTCAGAAATTAGAAAGGGACATGAGGGAAAGGGGTCTTCTCC
CAGATATCTTTACAATTAATACCATCATTAATGGTTTCTGCAAACAGGGAAGGATGAAAC
TTGCTACTGATTGTTTCGTGGAAATGCATCGAAGTGGTTTACAGCCTGATATTGCTACGT
ATAACACCTTGATCAATGGATTCTGTAAGGCATTCGATGTGGTTAATGCAGATAACTTTA
TGACAAGAATGTATGCCAGTGGATGGGAACCTGACATCACAACCTACAATATAAGGATTC
ATAGTTTCTGTAGTACTAGGAGGATAAATCAAGCTGTTATGATTCTGGATGAGCTTGTAT
CTGCTGGTGTGGTGCCAAATACTGTTACATACAACATTATGATGAATAGTGCTTGCAATG
ACATATTGGACCGTGCAATGATTTTGGCTGCAAAGTTGCTTAAGATGGCGTTCATTCCAA
ATACTGTTACAGCTAATTTACTACTTTCTCATCTATGGAAGCAGGGACTACCTCAGCGTG
CGTTGGTTTGGGGGCAGAAGTTGAGCGAAATTGGATTTGAGTTTGACGAAATAACACATA
AAATATTGGACAAATCTTCTCATTGTATACAAGAAAACACAGATTATTGTACAGAAACAA
CAGAGAAGAGTCTTTTTCTAGACTTCCTCATGTACATTACCTACGACCACATACGTAGAA
GTAGGGCTTATAGTGATAATAATGACAGCTCTTTCGAACTAGTTGAAGATGGACCTTGTG
GGTCCTTCAAGTTAGTCAATAAGGCTACTGTTTAG