Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g087890.3.1
CDS Infomation	Plasma-membrane choline transporter family protein (AHRD V3.3 *** AT5G13760.1)
Sequence	ATGGGTGCTGTAGAACCTGTAGTTGACGAGGAAAATGGAGAAAAGGAGACGAAGATACGA GATGTGGAGAAAGGTGAAATGGATAGTCAACAAAGGGGATTTCAAGGTCAGCCTACGCCG GCGCCGGCGCCGGCAGAATCAGGCGGTGAGAATTTTCACATGTCGAGAATGCAGAGATTG AGTGCTACGAATCCTCTGAGGCTTGTGATGAATGCCGGAACTAGAGTTGCTTCTCCTTCT CCTTATAACGCTCCGCCACCTGCTCAACATCGTCCGCACCGTTCTTTTCCGAATCCTTTT CACCACCGTCATCCTCCGGCTCCGGCGCCGTCTCAGCAACGCCATGCTCCGGTGCCGGAG CCGGCTCCGGTTCCAGCTCCGTCTCAGCACCACCCTTCTCCGGCTCCTTCTCAGACTCGC TCTACCCCTGCTGTTACCCCTCAACCTTCAGTAATAACACTGAATTCAAGATCCTACACA AACAAGTTTTCACTATTTCTGTTCCTTATACACATGATTGGTGCAATTGGGCTAGTTTGT TTTCTTGTATTCAAAGGGATACAAGGTTTACTAGAAGCAGGGGAAGCACAAAGAAAAGAA AAGAGGCTATTAAAGTTTTTTCTACCACAAGTAGAAGCAGTTTCTTTACTTAGCATAACA CTAGCATTTACATGGCAAAAGGCAATGAGATTGTGGCCAACATTCATGGTTCATTTCATA CTTTGGGGTTCGTTTATCTTCACATTAGCAGCTGGAATCCTATTAATATGCTTCCAAAGA CCATCAACTGATGGTGTTGGAGTTGTTTTAATCATATTTGCAATTGGAAATGGATTGTAT TCTTGTTGGGTAACACCAAGAATTAAGTTCTGTACAAAGATTTTAATTAAATCACTTGAA CCTGTACCTAAATTTGGCGATTTGAATCGTCCAACTTATCTAACATTAGCTGCTGGATTC TTATGGATGTCAATGTGGATTTTGGCTGTGATTGGGGCTATAAATTTCTATTTCCCACCG TTGGTTATCATCGGGTTGGTTTTTAGTATGGCTTGGGTTACTGAGGTGATGAGGAATGTA GTGAATTTGACGGTTAGCAGAGTGATTGGGTTGTATTATCTTAGAGGAATGCAATCCAGT ACACAGTTTTGTTTTCAGAGGGCATTGTCTGTGAATCTTGGAAGTGCTTGTCTTGGTTCT TTGTTTGTTCCTACAATAGAAGTTCTGAGGGTTGTGGCTCGCGCGTTGAATTTGCTTGAA GGTGAAGATGAGTTCATGTTTTGTTGTGCTCATTGTGGATTGAAAATCATGGATTCTGTC TTCAAGCGCGGCAATGGCTGGGCATATGTTCAGATTGCTACGTATGGTAAGAGCTTTGTG AAGGCATCACAAGACACTTGGGAGCTATTTCAAAAAAGAGAAATGGAGACAATTGTAGAT TCAGACATGACAAGTGCTATTTGCTTCTTGACTGGAGTTTGTAGCGGTTCTATTTGTGTT ATTGTCATTGGTGCTTGGACTTTCACTGTTTATCCCAATTTCACAGCCACACTGTCTCTT CTATCAGCCTACGTTGGTTACCTTCTGACGAGGATTGCGATGGCTTTGCCTCACGCTTGT GTGAGTAGTTACTACGTTTGTTATGCTGAGAATCCAGATAACAGACTTTTTGATAAGACC ATTCAAGATCGACTCAATTCAATGAAGACGGATCGTGATGTTATTGTGCCAACTCCTAGA TCTGTACCTTCTCGATTCGCACGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g087890.3.1
PEP Infomation	Plasma-membrane choline transporter family protein (AHRD V3.3 *** AT5G13760.1)
Sequence	MGAVEPVVDEENGEKETKIRDVEKGEMDSQQRGFQGQPTPAPAPAESGGENFHMSRMQRL SATNPLRLVMNAGTRVASPSPYNAPPPAQHRPHRSFPNPFHHRHPPAPAPSQQRHAPVPE PAPVPAPSQHHPSPAPSQTRSTPAVTPQPSVITLNSRSYTNKFSLFLFLIHMIGAIGLVC FLVFKGIQGLLEAGEAQRKEKRLLKFFLPQVEAVSLLSITLAFTWQKAMRLWPTFMVHFI LWGSFIFTLAAGILLICFQRPSTDGVGVVLIIFAIGNGLYSCWVTPRIKFCTKILIKSLE PVPKFGDLNRPTYLTLAAGFLWMSMWILAVIGAINFYFPPLVIIGLVFSMAWVTEVMRNV VNLTVSRVIGLYYLRGMQSSTQFCFQRALSVNLGSACLGSLFVPTIEVLRVVARALNLLE GEDEFMFCCAHCGLKIMDSVFKRGNGWAYVQIATYGKSFVKASQDTWELFQKREMETIVD SDMTSAICFLTGVCSGSICVIVIGAWTFTVYPNFTATLSLLSAYVGYLLTRIAMALPHAC VSSYYVCYAENPDNRLFDKTIQDRLNSMKTDRDVIVPTPRSVPSRFAR*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g087890.3.1
Transcript Infomation	Plasma-membrane choline transporter family protein (AHRD V3.3 *** AT5G13760.1)
Sequence	ACCCAAAAACATTTTTTAGTGTCCGATTACTAGGGGAAAAAAAGTTAAGATGAAGATGAC TTCCCAATGATGAACGGTAGTAATTTCATGTTAAAACAAATTATTTTTAATTTTATATTA CTTGTTTCGATTCCTATCAATACATAATAAATTCTAAATATTAATATAAGCATTCTACTT CAATAAAAAGGGAGAAATTGCGTGTTTCATAGTGAGTCTTTCTTACCGTCAAGTAATTTA TTAAAATATTTTAATAATAATTAAAAAAAATATCTTGTATTTATAAAGGTTCGAAGAGAT TTATTACTATTACATTAAACTAATAAGATATATTTTATTAATATATTGGCACTCACTGAT CAGCCACCAAAAGGAACTTTTTATTTGCATTAAAATGTAAAATAACTTTATTTACATCAT GCACACTAATATAAAATTTCTCTAAAAAGTTAAATACAGTAAAATAATAAAAGTAAATTA GCTTTTACTCTAAAAATGAATCGGATATTTTTGTGCCACATCAATTACCACTTTAGCAGC CTCCATCTTGGTCTTTAGTCTTTTATATTTTATCGACAAAATCAAAAGTTTATAAATAAA TTAATTTTTTAATAAAAAATAAATATATTTTTATTTAATCAAAATACTATAAAAATATTT AAAATAAATCGACCAAACAAGCTCTTAATCCCATAATAACAGCTCTTTAAAACACGAAAC TGGTGCAAAATATTTTCAACTAAAATGAAACACGTGCGAGAAACAGCCGCAGCAGTGGAT CGTGTAGACACGCGCCGTACGATGCACGTTTGGAATGTTTTTACCAAATTGGTGTTCAAA CAAGTAAATAAAAGCAACACTTTGATGCGCCCACCAATAGCATCAGTCACCCCCACAATT CACATACCAACAAAATCTAAACGTTCCTCTCCTCCATAACGGAATAATCATCTACTTTAT CCACGCGCCGCCGCACTCTTCCCGTCGTTCATGGGTGCTGTAGAACCTGTAGTTGACGAG GAAAATGGAGAAAAGGAGACGAAGATACGAGATGTGGAGAAAGGTGAAATGGATAGTCAA CAAAGGGGATTTCAAGGTCAGCCTACGCCGGCGCCGGCGCCGGCAGAATCAGGCGGTGAG AATTTTCACATGTCGAGAATGCAGAGATTGAGTGCTACGAATCCTCTGAGGCTTGTGATG AATGCCGGAACTAGAGTTGCTTCTCCTTCTCCTTATAACGCTCCGCCACCTGCTCAACAT CGTCCGCACCGTTCTTTTCCGAATCCTTTTCACCACCGTCATCCTCCGGCTCCGGCGCCG TCTCAGCAACGCCATGCTCCGGTGCCGGAGCCGGCTCCGGTTCCAGCTCCGTCTCAGCAC CACCCTTCTCCGGCTCCTTCTCAGACTCGCTCTACCCCTGCTGTTACCCCTCAACCTTCA GTAATAACACTGAATTCAAGATCCTACACAAACAAGTTTTCACTATTTCTGTTCCTTATA CACATGATTGGTGCAATTGGGCTAGTTTGTTTTCTTGTATTCAAAGGGATACAAGGTTTA CTAGAAGCAGGGGAAGCACAAAGAAAAGAAAAGAGGCTATTAAAGTTTTTTCTACCACAA GTAGAAGCAGTTTCTTTACTTAGCATAACACTAGCATTTACATGGCAAAAGGCAATGAGA TTGTGGCCAACATTCATGGTTCATTTCATACTTTGGGGTTCGTTTATCTTCACATTAGCA GCTGGAATCCTATTAATATGCTTCCAAAGACCATCAACTGATGGTGTTGGAGTTGTTTTA ATCATATTTGCAATTGGAAATGGATTGTATTCTTGTTGGGTAACACCAAGAATTAAGTTC TGTACAAAGATTTTAATTAAATCACTTGAACCTGTACCTAAATTTGGCGATTTGAATCGT CCAACTTATCTAACATTAGCTGCTGGATTCTTATGGATGTCAATGTGGATTTTGGCTGTG ATTGGGGCTATAAATTTCTATTTCCCACCGTTGGTTATCATCGGGTTGGTTTTTAGTATG GCTTGGGTTACTGAGGTGATGAGGAATGTAGTGAATTTGACGGTTAGCAGAGTGATTGGG TTGTATTATCTTAGAGGAATGCAATCCAGTACACAGTTTTGTTTTCAGAGGGCATTGTCT GTGAATCTTGGAAGTGCTTGTCTTGGTTCTTTGTTTGTTCCTACAATAGAAGTTCTGAGG GTTGTGGCTCGCGCGTTGAATTTGCTTGAAGGTGAAGATGAGTTCATGTTTTGTTGTGCT CATTGTGGATTGAAAATCATGGATTCTGTCTTCAAGCGCGGCAATGGCTGGGCATATGTT CAGATTGCTACGTATGGTAAGAGCTTTGTGAAGGCATCACAAGACACTTGGGAGCTATTT CAAAAAAGAGAAATGGAGACAATTGTAGATTCAGACATGACAAGTGCTATTTGCTTCTTG ACTGGAGTTTGTAGCGGTTCTATTTGTGTTATTGTCATTGGTGCTTGGACTTTCACTGTT TATCCCAATTTCACAGCCACACTGTCTCTTCTATCAGCCTACGTTGGTTACCTTCTGACG AGGATTGCGATGGCTTTGCCTCACGCTTGTGTGAGTAGTTACTACGTTTGTTATGCTGAG AATCCAGATAACAGACTTTTTGATAAGACCATTCAAGATCGACTCAATTCAATGAAGACG GATCGTGATGTTATTGTGCCAACTCCTAGATCTGTACCTTCTCGATTCGCACGGTAGCAC CAATTTGCTTTTTTGTAATCTGCTTACCATCCGAGCAATTCCGATAGAATGTATATAAGA TTAATTTTTTGCCAAACATAACCATATGTTAGATGATCAGTATTTATTGTAAGGACCAAA AGGTTCAACTGTGAAATAACTTTCCAAGTTGGAGTTGCCCACTCAGATGAAGAGGTGTCT TTATAGTCCTGTCCTTTTGTATTTATATAATAATTGATATACTTTGGGATATTGTAGAGT CGTGGTAAGGACCCACCACTAGTTTATTGTCAACATCTTAGTTAGGTAAACGTAATGTAT ATTTAATTAAATTACATTTCATTCTTTACGTAATCATGTAAACTTTGAATTATTTGTTTT CATTTTTTTATAATTTTTATCTTTTACTTTTGTTGGTGGAACCATGCAGAGGAAGATATA TAATCTAACGGAAAATCACCTTCGATTGTTCTAATTGCATATTTTTATTAAAGTTTCAAA TTTTACTCTTTTTTTTGGTCAATGATATTTAAAGTAAAGATATAATACGTAAATGTGTGT TTTAATT