Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc01g087250.3.1

CDS Infomation

carotenoid cleavage dioxygenase 1A

Sequence

ATGGGGAGAAAAGAAGATGATGGAGTAGAGAGAATTGAAGGAGGAGTAGTGGTGGTGAAC
CCAAAGCCACGGAGAGGAATAACTGCGAAAGCCATAGACTTGTTGGAATGGGGAATCGTC
AAATTAATGCACGATTCCTCTAAGCCACTTCACTATCTTCAAGGCAATTTTGCACCTACC
GATGAAACTCCTCCTCTTAATGACCTTGTTGTACAAGGTCATCTTCCGGAGTGCCTTAAT
GGTGAATTTGTTAGAGTTGGTCCAAATCCAAAGTTTGCTCCGGTTGCTGGATATCACTGG
TTTGATGGGGATGGCATGATTCATGGCTTGCGCATTAAAGATGGAAAAGCAACGTATGTC
TCACGTTATGTGAGGACTTCACGTCTAAAGCAAGAAGAGTTCTTTGGTGGAGCTAAGTTT
ATGAAGGTTGGAGATCTTAAAGGGCTGTTTGGTCTGTTCACAGTTTATATGCAAATGCTC
AGAACAAAGCTGAAAGTATTGGACATCTCCTATGGAAATAGCACAGCTAATACAGCTCTA
GTATATCACCATGGGAAGCTGTTGGCACTTTCAGAGGCTGATAAACCTTATGCACTTAAA
GTTCTAGAGGATGGAGATCTTCAAACACTTGGCATGCTGGATTATGACAAACGATTGACG
CATTCCTTCACTGCCCATCCAAAAGTTGATGCTGTAACTGGTGAGATGTTTACCTTTGGA
TATGCTCACACCCCACCTTACATCACTTATAGGGTTATATCCAAGGATGGAATTATGCAG
GACCCGGTCCCAATAACAATACCAGAGCCTATCATGATGCATGATTTTGCTATTACTGAA
AATTATGCAATTATGATGGATCTTCCTTTGTGTTTTCGTCCGAAGGAAATGGTGAAAAAG
AATAAGCTAGCTTTTACCTTTGATGCTACTAAAAAAGCTCGATTTGGAGTCCTTCCACGA
TATGCCAACAATGAGGCTCTAATCAGGTGGTTCGAGCTTCCTAATTGCTTCATTTTTCAC
AATGCCAATGCTTGGGAGGAGGGAGATGAAGTCGTGTTGATTACCTGCCGCCTTGTGAAC
CCAGACCTAGACATGGTCAATGGAGCTGTTAAAGAAAAGCTTGAGAATTTCTGCAATGAG
CTATATGAAATGAGATTTAACATGAAGAGTGGTGCAGCTTCACAGAAGAAATTATCGGAG
TCTGCTGTTGATTTTCCAAGGATCAACGAGAACTACACAGGCAGGAAGCAGCGTTATGTG
TATGGAACCACTTTGAACAGCATTGCTAAGGTAACTGGAGTCATCAAATTTGATTTGCAT
GCTGAACCAGAGACTGGAAAATCACAGCTTGAAGTTGGAGGGAATGTTCAAGGTATCTTT
GATCTAGGACCTGGCAGATTTGGTTCGGAGGCTGTATTTGTTCCCAGTCGGCCTGGTACA
GAACGTGAAGAGGATGATGGCTACTTGATATTCTTCGTTCATGACGAGAACACCGGAAAG
TCAGCTGTGAATGTAATTGATGCAAAAACAATGTCCGCGGAGCCTGTGGCAGTGGTTGAA
TTACCCAAAAGAGTTCCTTATGGGTTCCATGCTTTCTTTGTCACAGAGGAACAAATTCAA
GAACAAGCCAAACTGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc01g087250.3.1

PEP Infomation

carotenoid cleavage dioxygenase 1A

Sequence

MGRKEDDGVERIEGGVVVVNPKPRRGITAKAIDLLEWGIVKLMHDSSKPLHYLQGNFAPT
DETPPLNDLVVQGHLPECLNGEFVRVGPNPKFAPVAGYHWFDGDGMIHGLRIKDGKATYV
SRYVRTSRLKQEEFFGGAKFMKVGDLKGLFGLFTVYMQMLRTKLKVLDISYGNSTANTAL
VYHHGKLLALSEADKPYALKVLEDGDLQTLGMLDYDKRLTHSFTAHPKVDAVTGEMFTFG
YAHTPPYITYRVISKDGIMQDPVPITIPEPIMMHDFAITENYAIMMDLPLCFRPKEMVKK
NKLAFTFDATKKARFGVLPRYANNEALIRWFELPNCFIFHNANAWEEGDEVVLITCRLVN
PDLDMVNGAVKEKLENFCNELYEMRFNMKSGAASQKKLSESAVDFPRINENYTGRKQRYV
YGTTLNSIAKVTGVIKFDLHAEPETGKSQLEVGGNVQGIFDLGPGRFGSEAVFVPSRPGT
EREEDDGYLIFFVHDENTGKSAVNVIDAKTMSAEPVAVVELPKRVPYGFHAFFVTEEQIQ
EQAKL*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc01g087250.3.1

Transcript Infomation

carotenoid cleavage dioxygenase 1A

Sequence

TGTAGCGTTTTTTGTTAAAATTAAGCCCGCTAATGGAGAAGATGCCCCGCGAATACAAAC
AAACAAACAAGAGTACCGTGTCCATGGCATCTCCGTCAATGGTGAATGGTGGAATCTCCA
ATGTTCAATCAATTTAGTATATTCAAAGCGAGAGAGAAAAAGTTGGTTATCAAAAAAAAA
TGGGGAGAAAAGAAGATGATGGAGTAGAGAGAATTGAAGGAGGAGTAGTGGTGGTGAACC
CAAAGCCACGGAGAGGAATAACTGCGAAAGCCATAGACTTGTTGGAATGGGGAATCGTCA
AATTAATGCACGATTCCTCTAAGCCACTTCACTATCTTCAAGGCAATTTTGCACCTACCG
ATGAAACTCCTCCTCTTAATGACCTTGTTGTACAAGGTCATCTTCCGGAGTGCCTTAATG
GTGAATTTGTTAGAGTTGGTCCAAATCCAAAGTTTGCTCCGGTTGCTGGATATCACTGGT
TTGATGGGGATGGCATGATTCATGGCTTGCGCATTAAAGATGGAAAAGCAACGTATGTCT
CACGTTATGTGAGGACTTCACGTCTAAAGCAAGAAGAGTTCTTTGGTGGAGCTAAGTTTA
TGAAGGTTGGAGATCTTAAAGGGCTGTTTGGTCTGTTCACAGTTTATATGCAAATGCTCA
GAACAAAGCTGAAAGTATTGGACATCTCCTATGGAAATAGCACAGCTAATACAGCTCTAG
TATATCACCATGGGAAGCTGTTGGCACTTTCAGAGGCTGATAAACCTTATGCACTTAAAG
TTCTAGAGGATGGAGATCTTCAAACACTTGGCATGCTGGATTATGACAAACGATTGACGC
ATTCCTTCACTGCCCATCCAAAAGTTGATGCTGTAACTGGTGAGATGTTTACCTTTGGAT
ATGCTCACACCCCACCTTACATCACTTATAGGGTTATATCCAAGGATGGAATTATGCAGG
ACCCGGTCCCAATAACAATACCAGAGCCTATCATGATGCATGATTTTGCTATTACTGAAA
ATTATGCAATTATGATGGATCTTCCTTTGTGTTTTCGTCCGAAGGAAATGGTGAAAAAGA
ATAAGCTAGCTTTTACCTTTGATGCTACTAAAAAAGCTCGATTTGGAGTCCTTCCACGAT
ATGCCAACAATGAGGCTCTAATCAGGTGGTTCGAGCTTCCTAATTGCTTCATTTTTCACA
ATGCCAATGCTTGGGAGGAGGGAGATGAAGTCGTGTTGATTACCTGCCGCCTTGTGAACC
CAGACCTAGACATGGTCAATGGAGCTGTTAAAGAAAAGCTTGAGAATTTCTGCAATGAGC
TATATGAAATGAGATTTAACATGAAGAGTGGTGCAGCTTCACAGAAGAAATTATCGGAGT
CTGCTGTTGATTTTCCAAGGATCAACGAGAACTACACAGGCAGGAAGCAGCGTTATGTGT
ATGGAACCACTTTGAACAGCATTGCTAAGGTAACTGGAGTCATCAAATTTGATTTGCATG
CTGAACCAGAGACTGGAAAATCACAGCTTGAAGTTGGAGGGAATGTTCAAGGTATCTTTG
ATCTAGGACCTGGCAGATTTGGTTCGGAGGCTGTATTTGTTCCCAGTCGGCCTGGTACAG
AACGTGAAGAGGATGATGGCTACTTGATATTCTTCGTTCATGACGAGAACACCGGAAAGT
CAGCTGTGAATGTAATTGATGCAAAAACAATGTCCGCGGAGCCTGTGGCAGTGGTTGAAT
TACCCAAAAGAGTTCCTTATGGGTTCCATGCTTTCTTTGTCACAGAGGAACAAATTCAAG
AACAAGCCAAACTGTGAGAGCAATAGCTACTGGCTATTTGGTTATTTAGTTACGCATAGC
TTGAAACGTAATAAATGTCCTGTGGATTGTATAGTTTGTAACTTTCAGCATCTTCTTTCA
GTTATATCAGAAACAAAATTAAATCTGTGAACCTTTGCTTTGTCAGGGAAAATGTATTGA
GAGAGCAAACATGCAATGTATATCATATGTTCTTGCTCACTTGATATGTAATACAATCCC
AGAAATATACATAAATTTTCTTTGTTAGGATGGCTAAGAATGTTCTAAGAAAATAGTAAT
AACTGCAAGTAAAATCAAAATTCTACATATTCCATATCTATAGAAACATGGCATGTACTA
AAAGTTAAAGAACTCATTTAGTCAAGTGAATATCCCTCAGAATGCCTAGTATCCACAATG
GTGAAATGCGATGGTTCCTCAACCTTTTTTTTAGTTCAAAGGGAGCACCAATCATCTAAC
ATTTTCAGATTACTAAATGATTCATCACTGGGATAATTTTATGAATTCATAAATCATAAT
CCATTATTGTTTAAATTCACATCAAATTTCTATCTAAACGTAAAAAAATAATATAATTAA
AATTACCTTAAATAAAACCAAATCGAAAGAAGAAGTTCAAAGATGGCGGCACATAGGGTA
ACGGCGACTGACGATAA