Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc01g087140.3.1

CDS Infomation

Late embryogenesis abundant protein (AHRD V3.3 *** G7II20_MEDTR)

Sequence

ATGGCTAACTATAGAATGGATTCGGAAGAAGAAGCATTGTTTAGAAATTCTCCATATCCA
CTTTATTTCGTTCAAAGTCCTTCAACTCTATCCCATGCAAATAGCGGAGAATTATGTCGT
CACAACAACAACATCAATAATACTACTAATGCTAATGAGTACTCCTCTGGATGTCATTCG
CCAATGCCTAGACCGGAGACCGGTCCGTTATCGCTCTCTCGATACTCATCGTCCCGTGGA
TCTAACCACTCCTTCTCGCATCACGAGAAGAAGATTTCATGTGATTCTCTGCAGAGCCAC
GGGACGGGGATCGATGAGAACATCGAGATTTGTCCAGAGAAACGTTGTGGTGCAGTTTTG
TTGGTTCATCAAGGAGGGAAAAATGGGCGTATTCGTGTTAACGAGGAAGAGGATGAGGAT
GACGATGGTGAAGATTATTATTACGGAAAAGGAAATTGGATGAGGTTTTTTTCGTTGGGA
TATTCGGATTCAACAGCGTGGATTGTTGTACAAGTAACATGGAGGCTTATTGTGAGTATG
ATAGTAGCTTTGGTTGTTTTCTACATTGCTACAAAACCCCCTTCACCTAAGGTTTCTCTT
GAGATTTCAGGTGTTCGTGAATTTGGATTGAGAGAAGGAGTTGATGGAACTGGTGTAAAC
ACAAAAATGTTAACATGCAATAGTTCAATGATCTTACAAATTGATAACAAGTCTAAGCTC
TTTGGGCTTTACATTAATCCCCCCACCATGGAAATGTACTTTGGAAGGGTCCCTTTTATA
AAAGCACAAGGAGAAGAGCTTTATGCAGGGAGCTATGGGCCAACATACTTCAAGTTAACT
ATAGGGACAAAGGACAAGGCATTGTATGGGGCAGGTAGACTTATGCAAGATATGCTTCAA
TCTTCTAAAGGATTGCCTTTGCTTATACGTGTGCATCTATCTTCAACTTTTCATGTTGTT
TGGGGTCTTATCAAACCCAAATTTCATCACCAAATTGAGTGCCTTGTTCTTCTTCATAAT
ACTTATAATAAAAAACATAGGACCCAAAAGTATAATAGCACTTGTTTGTTGATCCCTTCT
TAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc01g087140.3.1

PEP Infomation

Late embryogenesis abundant protein (AHRD V3.3 *** G7II20_MEDTR)

Sequence

MANYRMDSEEEALFRNSPYPLYFVQSPSTLSHANSGELCRHNNNINNTTNANEYSSGCHS
PMPRPETGPLSLSRYSSSRGSNHSFSHHEKKISCDSLQSHGTGIDENIEICPEKRCGAVL
LVHQGGKNGRIRVNEEEDEDDDGEDYYYGKGNWMRFFSLGYSDSTAWIVVQVTWRLIVSM
IVALVVFYIATKPPSPKVSLEISGVREFGLREGVDGTGVNTKMLTCNSSMILQIDNKSKL
FGLYINPPTMEMYFGRVPFIKAQGEELYAGSYGPTYFKLTIGTKDKALYGAGRLMQDMLQ
SSKGLPLLIRVHLSSTFHVVWGLIKPKFHHQIECLVLLHNTYNKKHRTQKYNSTCLLIPS
*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc01g087140.3.1

Transcript Infomation

Late embryogenesis abundant protein (AHRD V3.3 *** G7II20_MEDTR)

Sequence

CATTTCCCTCTCTTCTTCTTTCCCCCCCAAATTTCATCTCAGAAAAAAAAGCAAACAATG
GCTAACTATAGAATGGATTCGGAAGAAGAAGCATTGTTTAGAAATTCTCCATATCCACTT
TATTTCGTTCAAAGTCCTTCAACTCTATCCCATGCAAATAGCGGAGAATTATGTCGTCAC
AACAACAACATCAATAATACTACTAATGCTAATGAGTACTCCTCTGGATGTCATTCGCCA
ATGCCTAGACCGGAGACCGGTCCGTTATCGCTCTCTCGATACTCATCGTCCCGTGGATCT
AACCACTCCTTCTCGCATCACGAGAAGAAGATTTCATGTGATTCTCTGCAGAGCCACGGG
ACGGGGATCGATGAGAACATCGAGATTTGTCCAGAGAAACGTTGTGGTGCAGTTTTGTTG
GTTCATCAAGGAGGGAAAAATGGGCGTATTCGTGTTAACGAGGAAGAGGATGAGGATGAC
GATGGTGAAGATTATTATTACGGAAAAGGAAATTGGATGAGGTTTTTTTCGTTGGGATAT
TCGGATTCAACAGCGTGGATTGTTGTACAAGTAACATGGAGGCTTATTGTGAGTATGATA
GTAGCTTTGGTTGTTTTCTACATTGCTACAAAACCCCCTTCACCTAAGGTTTCTCTTGAG
ATTTCAGGTGTTCGTGAATTTGGATTGAGAGAAGGAGTTGATGGAACTGGTGTAAACACA
AAAATGTTAACATGCAATAGTTCAATGATCTTACAAATTGATAACAAGTCTAAGCTCTTT
GGGCTTTACATTAATCCCCCCACCATGGAAATGTACTTTGGAAGGGTCCCTTTTATAAAA
GCACAAGGAGAAGAGCTTTATGCAGGGAGCTATGGGCCAACATACTTCAAGTTAACTATA
GGGACAAAGGACAAGGCATTGTATGGGGCAGGTAGACTTATGCAAGATATGCTTCAATCT
TCTAAAGGATTGCCTTTGCTTATACGTGTGCATCTATCTTCAACTTTTCATGTTGTTTGG
GGTCTTATCAAACCCAAATTTCATCACCAAATTGAGTGCCTTGTTCTTCTTCATAATACT
TATAATAAAAAACATAGGACCCAAAAGTATAATAGCACTTGTTTGTTGATCCCTTCTTAA
AAACATCATCACTTTTTTAATTGCAAAATAGGTTGTTGAAAAAAGAAGAAGAAATGAGAT
CTATATTGGTTGTTATTAGGAAGGATCCATTAGTATATAAAATTAATGATATGTAATTTT
GATCGGTTGAATATTTGAATCCATGACTTTCAGCTGCTCTGACAACATGAA