Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g081240.3.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103Y130_CYNCS)
Sequence	ATGTATATACTGCTCAAATGGGCTTCACATATTTGCTTTAGGAACGCAAATTCTTGTTTT TTGATTCGATATGTGGGTTCAATTGCAAACTCTTTGTACAATTGGAACTCAAAAATTACT AATTCTTTCAAGAAAGGTGATGTTGAGGGGGCACGCAAGTTGTTTGATGAAATGCCTCAG AGGAATGTAGTAACTTGGAACTGTATGATTTCTGGGTATGTAACAAATGGGATGATGTGT GATGCTCAACAAGTGTTTGACACAATGCCGAGTAGAAATGTTGTTTCTTGGACAGCCTTG TTAAGTGGGTATGCAAAGAATGGGAATTTACAAGTGGCACGGCGGATGTTTGATGGAATG GATGATAAGAATGTGGTTTGCTGGAATTCAATGATCTCGGGGTACGTGAGCAATGGGAGA ATAGAGGAAGGTAGAGCGTTGTTTGATGCAATGCGGATTAAGAATGATGTATCGTTTGGG GTTATGATTGAAGGATACTTCAAGTATGGGGATGTGAGTGAAGCTGAGAGGTTGTTTAGT GAAGCACAAGTGAAAAGTGTGCCACTTTATAATGTTATGTTAGCAGGTTATGGTGTGATG GGGCGGACTGAGGATTCGTATAAGTTATTTATGAGAATGGCTAGGCGTGATGTGGCATCT TGGACTAGTATGATCACGTGTTTCTTAAGAGCCAGGGAGGTGGAGAAAGCGAGAAGGTTG TTTGAGGACATGCCTGACAAGGATGTTGTGGCTTGGACTGTAATGATTAAAGGGTATTGT GAAAATAATAACGTGGAGGAGGCTGGAAAACTTTTTGCTGCAATGCCTCAAAAGGATAAT ATTGCATGGAACTCAATGCTAAGTGGTTATCTGCAACATGGAAGACTGAAAGATGCTCTA CACCTGTTTCATACGATGCCATGGAGGAACACAGTATCATGGAATTCGATATTGTGCGGT TTCATCCAACAAGGCGATATAACTAGTGCTCGAGAGTTGTTTGAGCAGATGCCTAGAAAA GATGAAACCTCATGGAACACTATCATTTCAGGATATCAAAATGAGGAAGCTTTGGCTTTA TATATCCGGATGTTGCAAAACAATTACAAGCCAGATCAGACCACATTTTCCAATGTGGTC TCGTTATGTGGAGTTCTTGCTTTATATGGTTGGGGAAGAGCTTTGCATGCCAGTGTAACT AAGAGTGGTTTTGAAAATGATACGATGGTTATGAGTGCATTCATATCCATGTACTCTAGG TGTGGATTTATATATGAAGCTTCCTCACTTTTCAGAAGTATGAAAAAACGAGACACAATA TCATGGAATGCCATGATTGTAGCACAAGCATGTCATGGTTCGGCTAAAGAAGCCCTCGAT CTTTTTCCTTCTATGATTCAAGCTGGATATGAACCAGACCATGTAACTTTTCTTGGTGTC CTAACTGCTTGTGCTCATTCTGGATTAGTGGACGAGGGTTGGAGCTACTTTGTATCAATG GAGAGAAGGTGGAGTATAACTCCAAAGGCTGAGCACTATAACTGCATGGTTGATCTCCTT GGAAGATCAGGGATGCTAGCTGAAGCCTTCGAACTTATCAAGCAAATTCCTCTTGATCCC CCTGCTCATGCTCAGGAGACATTACTTAGTTGTTGTAGAGTCCATGAGAATTTTGATTTA AGTGATCTTGTGGAACAGAAACTTCTAAGCCTTCAGCCTTCTAATACAGGAATATGTGTA CTTCTATCAAATATGTATTCTGCAAGAGGAATGTGGAAAGATGCAGCTCGAGTGAGAACA CTACTTAAAAAGTATGATTTGAAGAAAGAATTGGCGTGTAGCTGGATTGAGATAAATGGT TGTATTTCTCAGTTTGTTTCAAATGACAGATGCAATCCTAGAGAAATGGACATATACAAA GCATTAGGAAGTCTTTCGGCATTGATTGAAGATAGTGGCACATTAGTTTATCGGGGATGT TATTCAAAATTCGGTTCTTCAGAAGAAATTAATGTTCGCTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g081240.3.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103Y130_CYNCS)
Sequence	MYILLKWASHICFRNANSCFLIRYVGSIANSLYNWNSKITNSFKKGDVEGARKLFDEMPQ RNVVTWNCMISGYVTNGMMCDAQQVFDTMPSRNVVSWTALLSGYAKNGNLQVARRMFDGM DDKNVVCWNSMISGYVSNGRIEEGRALFDAMRIKNDVSFGVMIEGYFKYGDVSEAERLFS EAQVKSVPLYNVMLAGYGVMGRTEDSYKLFMRMARRDVASWTSMITCFLRAREVEKARRL FEDMPDKDVVAWTVMIKGYCENNNVEEAGKLFAAMPQKDNIAWNSMLSGYLQHGRLKDAL HLFHTMPWRNTVSWNSILCGFIQQGDITSARELFEQMPRKDETSWNTIISGYQNEEALAL YIRMLQNNYKPDQTTFSNVVSLCGVLALYGWGRALHASVTKSGFENDTMVMSAFISMYSR CGFIYEASSLFRSMKKRDTISWNAMIVAQACHGSAKEALDLFPSMIQAGYEPDHVTFLGV LTACAHSGLVDEGWSYFVSMERRWSITPKAEHYNCMVDLLGRSGMLAEAFELIKQIPLDP PAHAQETLLSCCRVHENFDLSDLVEQKLLSLQPSNTGICVLLSNMYSARGMWKDAARVRT LLKKYDLKKELACSWIEINGCISQFVSNDRCNPREMDIYKALGSLSALIEDSGTLVYRGC YSKFGSSEEINVR*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g081240.3.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103Y130_CYNCS)
Sequence	TTTTTTTTTTGATGTTAATTGAAAATTAAAAAACTAGTAATACGCGTAGGATGTTTGTTA TTCTTTTCTTTTTTCTTTCCCCTCTTTGAAATCAATCTTTAACTAATTAAGCAGTAGAGT ATATTATGTATATACTGCTCAAATGGGCTTCACATATTTGCTTTAGGAACGCAAATTCTT GTTTTTTGATTCGATATGTGGGTTCAATTGCAAACTCTTTGTACAATTGGAACTCAAAAA TTACTAATTCTTTCAAGAAAGGTGATGTTGAGGGGGCACGCAAGTTGTTTGATGAAATGC CTCAGAGGAATGTAGTAACTTGGAACTGTATGATTTCTGGGTATGTAACAAATGGGATGA TGTGTGATGCTCAACAAGTGTTTGACACAATGCCGAGTAGAAATGTTGTTTCTTGGACAG CCTTGTTAAGTGGGTATGCAAAGAATGGGAATTTACAAGTGGCACGGCGGATGTTTGATG GAATGGATGATAAGAATGTGGTTTGCTGGAATTCAATGATCTCGGGGTACGTGAGCAATG GGAGAATAGAGGAAGGTAGAGCGTTGTTTGATGCAATGCGGATTAAGAATGATGTATCGT TTGGGGTTATGATTGAAGGATACTTCAAGTATGGGGATGTGAGTGAAGCTGAGAGGTTGT TTAGTGAAGCACAAGTGAAAAGTGTGCCACTTTATAATGTTATGTTAGCAGGTTATGGTG TGATGGGGCGGACTGAGGATTCGTATAAGTTATTTATGAGAATGGCTAGGCGTGATGTGG CATCTTGGACTAGTATGATCACGTGTTTCTTAAGAGCCAGGGAGGTGGAGAAAGCGAGAA GGTTGTTTGAGGACATGCCTGACAAGGATGTTGTGGCTTGGACTGTAATGATTAAAGGGT ATTGTGAAAATAATAACGTGGAGGAGGCTGGAAAACTTTTTGCTGCAATGCCTCAAAAGG ATAATATTGCATGGAACTCAATGCTAAGTGGTTATCTGCAACATGGAAGACTGAAAGATG CTCTACACCTGTTTCATACGATGCCATGGAGGAACACAGTATCATGGAATTCGATATTGT GCGGTTTCATCCAACAAGGCGATATAACTAGTGCTCGAGAGTTGTTTGAGCAGATGCCTA GAAAAGATGAAACCTCATGGAACACTATCATTTCAGGATATCAAAATGAGGAAGCTTTGG CTTTATATATCCGGATGTTGCAAAACAATTACAAGCCAGATCAGACCACATTTTCCAATG TGGTCTCGTTATGTGGAGTTCTTGCTTTATATGGTTGGGGAAGAGCTTTGCATGCCAGTG TAACTAAGAGTGGTTTTGAAAATGATACGATGGTTATGAGTGCATTCATATCCATGTACT CTAGGTGTGGATTTATATATGAAGCTTCCTCACTTTTCAGAAGTATGAAAAAACGAGACA CAATATCATGGAATGCCATGATTGTAGCACAAGCATGTCATGGTTCGGCTAAAGAAGCCC TCGATCTTTTTCCTTCTATGATTCAAGCTGGATATGAACCAGACCATGTAACTTTTCTTG GTGTCCTAACTGCTTGTGCTCATTCTGGATTAGTGGACGAGGGTTGGAGCTACTTTGTAT CAATGGAGAGAAGGTGGAGTATAACTCCAAAGGCTGAGCACTATAACTGCATGGTTGATC TCCTTGGAAGATCAGGGATGCTAGCTGAAGCCTTCGAACTTATCAAGCAAATTCCTCTTG ATCCCCCTGCTCATGCTCAGGAGACATTACTTAGTTGTTGTAGAGTCCATGAGAATTTTG ATTTAAGTGATCTTGTGGAACAGAAACTTCTAAGCCTTCAGCCTTCTAATACAGGAATAT GTGTACTTCTATCAAATATGTATTCTGCAAGAGGAATGTGGAAAGATGCAGCTCGAGTGA GAACACTACTTAAAAAGTATGATTTGAAGAAAGAATTGGCGTGTAGCTGGATTGAGATAA ATGGTTGTATTTCTCAGTTTGTTTCAAATGACAGATGCAATCCTAGAGAAATGGACATAT ACAAAGCATTAGGAAGTCTTTCGGCATTGATTGAAGATAGTGGCACATTAGTTTATCGGG GATGTTATTCAAAATTCGGTTCTTCAGAAGAAATTAATGTTCGCTAACATGTTTTTTCCC TTCATTCCAGTCTATAGAAGTTCCAGAGTAGAATTTCTGGTTTCCTCTTGGTGAATCTCT CTGGGATTGGAAACTTACTCACTAAAAAACCATTCAAGGTATTGTGAAGTCTCATCGAAA GATGTTGCTTGATATCTCTGATAGATGCTAGCCCAGTATGTGCTTCTATGAGGACCTGCA ACCTAATGCTTGATGAAAGTACACCTGTGATAGACACACTTAGGGTGCAATTATTGGTGA TAGCTCCGCGTTTTGGAAGGAAAACAGGTTAACCAAAAAAAGTAAAGGAAAAGAAAAAAG AAAAGTAAAAAGAGAGATCTTGATTGCATGATCTCCATTAGAGAAGGAGGAGGAGGTGGA GAAGGAAGAATCTGAATGAGAGAAAACTGACGACAATGAAAGAAAAGTAGAGAACATATT AGAGTAAGGAAAAGGAAAAGAAAGTAGAGAAGAAAAGAAACAACGGTAAAAGGAAGAAAG ACGGATTGATCCTTTTGTAGGGATATAAAAGGAGAAAATTTGAAGGACAATGGAGGAGAG GGTGGGGGATTTGAGGGTTCCTCTGATCTCTTCCTTGTTCTGTCTTTGTTTATTAACTGG TGGTGTCCTCCTTGTTCTCTACCTTTTCGTGCCAGATTACTCTCAGCCGTGGTTTGCTCC TGCAGGATTGATCTTGGTTGGTTCTCCTTACATATTTTGGCTCCTGACTTACATTTACAC CTGTTTGAAACACTGCTGTTTTGGCAACAGCAGCATTGATGACAACCGCCAGATTTCAAG GCGGACCTCAAGGGCTGCCACAATGGGGAAACCTGGTGTTGCCAGGACTGATTCCAAGGC AAACTCTGCTACTTCTAATAGCAATAACATCAATGATGGTAAACAATATGGAGGAGATTC ATCATCTACCAACTCCGCAAAGGAAATTGAGATGCCTTTAGCCGTATGAATATGAATCGA CATTATGCATGAGCTAAAGCATGAAAGATATATTAATAAATATGTAATCGAAGGATCATG TCATCATTCAGGAGCTGTTAAGGATGGCGAAGATTGCGCGCAAATGGTGAATGTAAGTAG AAATAGCAGAAAATGATATTTAACTTTGTCTTGGTATTTACAAAAATTGAACAAACCAAA AATTGCTCTTCTTGTTTCCTAGGCAGTTGTTCTCTCTTATTTCCTATTATATTTCCTCCC TTCTTCCTGCCACAACTTGTCTCAATTTCTGTTGAAACTTCAATTTCAACTAAATACAGA ATGAGATAAATTTAACATATAGTATATAC