Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g080450.3.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT1G16830.1)
Sequence	ATGTTATGGAAATGGTTCTCCATTGGAAGAATTGCTTCACATCGATTGCTCAAAATGGAA TCTTTGGCCTCATTTCGAAGTCTATGCTCACAGATTCAATGTTTTGCTGATACCCCACAA GGTTCTTTTTCTTGTAGCCATTACCAGAAAATTCCTGAAAATTCCAGAATCATATTAACC CCTACAATTGTACATACAACTATATCAAATTGCCATTCTGACATTCTTGCTTTTTCTTTT TTCTTGTGGTGTGCAAGGCAACCCAATTACTTTCATGATAGGGGCACATTGACCCTTATA GTTAGTATCGTGTCTCGGTTGATGAAGAGGTATAGAACAGTGAAAGGGATTATTAAGGGA TTAGAGGAGGTTGGTTGTGTAATAAAGCCACAAACTTTGTTGTTTTTATTGAGAATTTAC TGGTTTGGTGGAATGTATGATAGAGTTTTCGAGGCATTTGAGGAAATACTTAGATATGGT TATACACCAAATACTTTTTCTAGGAATATTGTAATGGATGTATTGTTCAAGATTGAGCGT GTCGAAGTGGCACTTAGAGTTTTGAAAGAAACCGAGGTTCCAAATTTTTTGTCGTATAGC ATTGCTGTGTGTAACTTGTGTAAGCTCAATGATTTGGTTAATCTTCAGGATGTACTTACA GTAATGTTGAGGAAAAGGTATTATCCTAATGAGGAAACATTTTTTGTGATTTTGCATTGT TATTGTAAAGGAGGTTGCATAGCAGAGGCAATACAGATATTGGGTCTGATGATAGTTTTG GGTGTTCCTATATGTGAGAGAATTTGGAGTATATTAATTGATGTTCACTGTAAAGCTGGG AACATGGATGCTGCGAGCCATTTACTTAAGAAGATGGTAGAGAGTGGGTATTCACCAAAC GTTGTAACTTGCACATCATTGATCAAGGGATTTTTTGAGTCCCAGATGCCAAGCAAGGCA TTTGGGATCTTGAATACCATGGAATCAAAAGGATGCTCCCCTGATTTGGTTCTTTGTAAT GTGTTAATACACTGCCTCTCTAAAATGGGGAGGTATGAAGATGCAATTAATGCTTTCTTT CTTTTGCGGGAGCAAAGACTATCACCTGATTCTTATACTCTTTGTTCTTTGATTACAACC GTTTGCCTCTCTAAGCAATTCGTTGAACTACCTTTGCTCATAACTGGCTTCAAGATCCAA CCTGATTTAGTTGCTTGTAACTCTTTCCTTAGCTATTTCTGTAAAGCTGGTTATCCTGCT GGTGCCATTGAATTTTACAATGACATGATAGATAGAGGTTTTGAAGCAGATAAGTATACC TTTGCCGGATTATTGACTGGATTATGCAGGTCAGGTAGGATAGCCGAGGCAGTCAAGGTG TACCATGGACTTGTTAGAAGTCACGTTGGGCTTGATTCTCACATAATTACTGTGATAATA AATGGGCTGATAAAATCTGGTAAGTTTCACAAAGCTATTAGTTTAATCAGGAAAGCCGCT TCAGGGAAGTCCCAACTAGATGATGTTTCTTACACTATTGCGATTAGTGGACTTCTTACT GGTGGTGAAGTTAGAGAAGCTTATGCTTTGTTCCGCCAAATGAAGGAGGTTGGTCTAGCC CCAAGTAAACAGACCTATAATCTGATTCTCTCGGATTTCTGTAAAAGAAGTGATTTTAGC ATGGTTGAAGAGATCTTACTTGAAATGGTTAATGCTAGCGTTGAAGTTGACCATTTAAGT CTGAGGTTTATGAAGAATCTCCTGTATAAATCCCGCCATTCTGCTTCACTCTTTACTCTA TTGACTGATGTTTCAACTTCTGGAATCCTTTCAAGGGAAGCATATGCAGAATTGATTGAT GAGATAGTTCATCAGGTAAACATCAGCAATGTGCACACAGGCAGGTCTACTAGCGTTGAT TTTGGCTCATCCAGCTCAGATGAAATCCTGGAGGAGGAGGTATTGAACCATGGAAGAGTG CCTGAAGTGATAATACAGCAAAAGGAATTCATGAGATGTGATCTTGTGAACCCTGGGGCT CGGCAGACTGTTCTTGTTGCTCCAACAAGTGGAGGATATGAGCCAAGATGGAGGTGGAAC ATACCAAGTTGCCTTTCTAGTTGGAGCCTGAAGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g080450.3.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT1G16830.1)
Sequence	MLWKWFSIGRIASHRLLKMESLASFRSLCSQIQCFADTPQGSFSCSHYQKIPENSRIILT PTIVHTTISNCHSDILAFSFFLWCARQPNYFHDRGTLTLIVSIVSRLMKRYRTVKGIIKG LEEVGCVIKPQTLLFLLRIYWFGGMYDRVFEAFEEILRYGYTPNTFSRNIVMDVLFKIER VEVALRVLKETEVPNFLSYSIAVCNLCKLNDLVNLQDVLTVMLRKRYYPNEETFFVILHC YCKGGCIAEAIQILGLMIVLGVPICERIWSILIDVHCKAGNMDAASHLLKKMVESGYSPN VVTCTSLIKGFFESQMPSKAFGILNTMESKGCSPDLVLCNVLIHCLSKMGRYEDAINAFF LLREQRLSPDSYTLCSLITTVCLSKQFVELPLLITGFKIQPDLVACNSFLSYFCKAGYPA GAIEFYNDMIDRGFEADKYTFAGLLTGLCRSGRIAEAVKVYHGLVRSHVGLDSHIITVII NGLIKSGKFHKAISLIRKAASGKSQLDDVSYTIAISGLLTGGEVREAYALFRQMKEVGLA PSKQTYNLILSDFCKRSDFSMVEEILLEMVNASVEVDHLSLRFMKNLLYKSRHSASLFTL LTDVSTSGILSREAYAELIDEIVHQVNISNVHTGRSTSVDFGSSSSDEILEEEVLNHGRV PEVIIQQKEFMRCDLVNPGARQTVLVAPTSGGYEPRWRWNIPSCLSSWSLK*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g080450.3.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT1G16830.1)
Sequence	ATGTTATGGAAATGGTTCTCCATTGGAAGAATTGCTTCACATCGATTGCTCAAAATGGAA TCTTTGGCCTCATTTCGAAGTCTATGCTCACAGATTCAATGTTTTGCTGATACCCCACAA GGTTCTTTTTCTTGTAGCCATTACCAGAAAATTCCTGAAAATTCCAGAATCATATTAACC CCTACAATTGTACATACAACTATATCAAATTGCCATTCTGACATTCTTGCTTTTTCTTTT TTCTTGTGGTGTGCAAGGCAACCCAATTACTTTCATGATAGGGGCACATTGACCCTTATA GTTAGTATCGTGTCTCGGTTGATGAAGAGGTATAGAACAGTGAAAGGGATTATTAAGGGA TTAGAGGAGGTTGGTTGTGTAATAAAGCCACAAACTTTGTTGTTTTTATTGAGAATTTAC TGGTTTGGTGGAATGTATGATAGAGTTTTCGAGGCATTTGAGGAAATACTTAGATATGGT TATACACCAAATACTTTTTCTAGGAATATTGTAATGGATGTATTGTTCAAGATTGAGCGT GTCGAAGTGGCACTTAGAGTTTTGAAAGAAACCGAGGTTCCAAATTTTTTGTCGTATAGC ATTGCTGTGTGTAACTTGTGTAAGCTCAATGATTTGGTTAATCTTCAGGATGTACTTACA GTAATGTTGAGGAAAAGGTATTATCCTAATGAGGAAACATTTTTTGTGATTTTGCATTGT TATTGTAAAGGAGGTTGCATAGCAGAGGCAATACAGATATTGGGTCTGATGATAGTTTTG GGTGTTCCTATATGTGAGAGAATTTGGAGTATATTAATTGATGTTCACTGTAAAGCTGGG AACATGGATGCTGCGAGCCATTTACTTAAGAAGATGGTAGAGAGTGGGTATTCACCAAAC GTTGTAACTTGCACATCATTGATCAAGGGATTTTTTGAGTCCCAGATGCCAAGCAAGGCA TTTGGGATCTTGAATACCATGGAATCAAAAGGATGCTCCCCTGATTTGGTTCTTTGTAAT GTGTTAATACACTGCCTCTCTAAAATGGGGAGGTATGAAGATGCAATTAATGCTTTCTTT CTTTTGCGGGAGCAAAGACTATCACCTGATTCTTATACTCTTTGTTCTTTGATTACAACC GTTTGCCTCTCTAAGCAATTCGTTGAACTACCTTTGCTCATAACTGGCTTCAAGATCCAA CCTGATTTAGTTGCTTGTAACTCTTTCCTTAGCTATTTCTGTAAAGCTGGTTATCCTGCT GGTGCCATTGAATTTTACAATGACATGATAGATAGAGGTTTTGAAGCAGATAAGTATACC TTTGCCGGATTATTGACTGGATTATGCAGGTCAGGTAGGATAGCCGAGGCAGTCAAGGTG TACCATGGACTTGTTAGAAGTCACGTTGGGCTTGATTCTCACATAATTACTGTGATAATA AATGGGCTGATAAAATCTGGTAAGTTTCACAAAGCTATTAGTTTAATCAGGAAAGCCGCT TCAGGGAAGTCCCAACTAGATGATGTTTCTTACACTATTGCGATTAGTGGACTTCTTACT GGTGGTGAAGTTAGAGAAGCTTATGCTTTGTTCCGCCAAATGAAGGAGGTTGGTCTAGCC CCAAGTAAACAGACCTATAATCTGATTCTCTCGGATTTCTGTAAAAGAAGTGATTTTAGC ATGGTTGAAGAGATCTTACTTGAAATGGTTAATGCTAGCGTTGAAGTTGACCATTTAAGT CTGAGGTTTATGAAGAATCTCCTGTATAAATCCCGCCATTCTGCTTCACTCTTTACTCTA TTGACTGATGTTTCAACTTCTGGAATCCTTTCAAGGGAAGCATATGCAGAATTGATTGAT GAGATAGTTCATCAGGTAAACATCAGCAATGTGCACACAGGCAGGTCTACTAGCGTTGAT TTTGGCTCATCCAGCTCAGATGAAATCCTGGAGGAGGAGGTATTGAACCATGGAAGAGTG CCTGAAGTGATAATACAGCAAAAGGAATTCATGAGATGTGATCTTGTGAACCCTGGGGCT CGGCAGACTGTTCTTGTTGCTCCAACAAGTGGAGGATATGAGCCAAGATGGAGGTGGAAC ATACCAAGTTGCCTTTCTAGTTGGAGCCTGAAGTAAATCTCTCCATCGGAAAACCTTTGA CAGACTTAATGAATATAGAATATTATGGTTATTTTATAGCATACTCTAAATGTTTTAGCC ACCCTTATTGTTAGACTAGGGGCTTTTCCAAAACTTAGCTGTTACATGCAAAAAGTAAGA TAATGTCTACTATGTACTGCAGTATTGGGATCTTCTTTATCTAAGGGATATAATTCAGCT TGACAAATAAAAAGAAACTTACTGGTGCTTGTCTCGAAGTGGTCTTGGCTTATGCAATGT CAGCGTGAACTGGTCATGCCTTGTGGGTCGACATGATTCCGTCATTCAAGTCCATTTAAA ACGTGCTTAATCATTATTATTTCTATTTATTCAGCATTTGTCTGATGGACCGTGTATCAT GTTCTTTAACTTTGCAGCAATACACTGTGGAAGATGATTGCTGCTCCCCCACAAAACCTG GTTAGTAGCTTATCCAATCTGGAAGTGTACCAGATACAAAACACATAGTGTCCTGTTAGG CCAATCTTCCTAGTATAATGCCCATGTGATTAATCATATCATTAGTCACATATTTGGCAA GTACTTGGAATACAATACAGGAGGTTTCCAACTATGATGCATGCTTATTTCTTGGTCCTG TCATACTATAAGAAGCATTTCGTCGGAGTAGGAAAGAAAAACCAATACAGTTAAAGCTAG AAGATGGGAAAAGAATATGTTTCTGGTATGAGATTGGGTGGGGAAGGAATACTCCTCCAC GAGACTGGTTCACGTTCTCTTTAGTTTTGCAGAAAACAGCAGGGTAACAGTCAATGTAGA AGCAATCAAGTCTGGTTAGTAAAATTTAGAAGAAATTGTAGTGATTGAGAAGTGGAGAAT ATGGCTCAAACTTCTTCAAGACACATATTCAGCCTAACAAAGCTGATTCTCATAGGGATA TTGTGTATCCTATAAGATTTTATTTTTACAGAGAACTGTATTTTCTAGTAGGACTAGATA GAACTTTATGCCTCAATGTTCTTTTTCTTTTAGTATATCCAAGAGATTGGGACACATATA TCTTACATTTTATTGAGAGATCATTTCATTTCAAGTTTGAATTTGACAAAAATGATCATT TCATTTTGATAGTTTTTCATCAACCTCCATTCGTATTTATTCGTATTTGTAAATCGTCAT CTTCCTACATTTCTTTATTCCTCTTTCAGTATGAGATTTTGTTTATGTATATTATTAATT ATTGGAAAAGCAAATTATTATTATACTGATCTTCATGAAGTACATAATTTTCAAGGAAAA CTGTATTTTCTGATTCATATGTTTTTGTTGGTTTACCTTTGCATATTTTGTTTCTTTGTG GGGGCAAAATTTTCATGAAACACAAAATCAAAGCACATAATCTAATAAAGATGATTATCT CTGAAACACTATTTCTAGATTATTTTCTTTAAAAAATTTCATCAACATGCAAGGTCCGTA TATTTGTTATTAAATAGTATTTTTTTTTTGGTTTTATATAATTTATTTGAATGAGAGATT TAGAAGATACAATGTGGTATAAAAAAATTCATATTTCTTTTCTTTAGGATTGTATCCGTG CTTCGCGCGAGGATTAATAGATAGGTGTCAGGTTTTTTTTTCTTTTGAATCAATTGTATG ATTATATTATTTGAGCATATCATTATCTTTTTATTTGAAATGAGGATACATGATGGAACT TATCAACTTTAATATCTATTTAACGAGAATAATACATTGTTAATGAATAATTCAGAATAT ATACTCTATTAAAAAAGTTCTTTATTTCCATTGCTAAAATATATAAAGAAATAAATCAAC AATGCCCTATTATTGTTTATAAGATTGATGGTTAGAGAATACATTCTCTAATCATAAATT GTCAAATTTCATATTGAGGTCCTCATTTCTTACACACACAAAAAAAAAAAGTTGTTGCAC AACCTTCTTCACACACTTCAAAATTCCATCAGAAACACAAACATACATTTCACAATATTT TAGACAAAAACAGAGTCTACCTCCATTTATTCTAATAGCTAAAATGGCAGGTTGTTCACC ATCCTCTCCCCAAACAAAAAGACTTTGCCCATCTCGTTGTTGTTGCGCAAATGTTTTTTT CTTCTCTGGCTTCTTTCTTCGATTCCCTACGGGCTTTCTTTTGCCGTCTTCTTTTCTTTC CTGTTTAGAAAGGACAGCTCCTCACCAGACTCCTCAAC