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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc01g079130.2.1

CDS Infomation

Pectin lyase-like superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT1G02460.1)

Sequence

ATGGCATCACTATCAAGTACCCTACTTGTTACATTTTACATGACATTTGCATTATTATTA
TTATTATTATGTAGTCATGTTGTTAGTGCCAGGTACCATCACCACGGACACCGCGGTCAT
CATAATAACAAGAAACAACATAAGCATAATTCACACATATCGTATCCACCTTCAATTTCA
CCTGAGCCTTCACCCTCCGCGGGGGACGAAGGGGTTTATGATGTGAGGTCTTTTGGTGCC
GTAGGTGATGGTGTTACGGATGATACTGAAGGTTTTAAGGCAGCGTGGGATGCTGCCTGC
CAAGTTCAATCAGCTGTTATTCATGTTCCCCTTGGTTACTCTTTTATGATTCAATCTACT
ATTTTTACTGGTCCTTGTCAAAGTGGATTGGTGTTTCAGTTGGAAGGAACAATAATGCCA
CCAGATGGACCAGAGTCGTGGCCAAGCAAAACCAGTAAGCGGCAGTGGCTGGTATTTTAT
AGAGTAAATGAGTTGTCATTACAAGGTGGAGGCGTCATAGATGGAAGAGGAGAAGAGTGG
TGGAATCTTCCTTGTAAACCCCATAAGGGACCTAAAGGAAGTACACTACCTGGACCATGT
GACAGCCCAATTGCCATTAGATTCTTCATGAGCTCAAATCTAACGGTGCAAGGAATTAAA
ATGAAGAATAGCCCCCAATTTAATTTCAGATTTGATAACTGCAAAAATGTGCATATTGAA
TCCCTTCACATTACAGCTCCCATTTGGAGTCCCAACACTGATGGCATTCACATTGAGCAA
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GGAGCAGGATGTTACGATGTGGATATTAGGAATCTCACATGTGGACCTGGAGGACATGGA
ATAAGCATCGGGAGTTTAGGCAACCACAACTCGCGAGCATGTGTATCAAACATCACAGTT
CGTGACTCAGTAATAAAGCAATCAGACAACGGTGTGAGGATCAAGACATGGCAAGGGGGA
TTTGGAGCAGTATCAGGAGTTTCGTTTCTCAACATTCATATGGACAATGTACGTAACCCC
ATTATAATCGATCAATTTTACTGTCTTTCGAAAGATTGCAGCAATCGGACCTCAGCAGTG
TCTGTTTCAGATATTGAATACTCAAGTATTAAAGGAACGTATGATATAAGAAGCCCGCCA
ATGCGTTTTGCTTGTAGTGACACTATCCCTTGCACGAATATAACACTCTCAGACATAGAA
CTTTTGCCTGCGAAAGGCGAATTAGTGTTGGATCCCTTCTGCTGGAACGCCTATGGAGGA
CAAGAGACATTAACAATTCCGCCTATTTTTTGTTTGTTAGAGGGAAATCCTCCAAAAGTG
TTTGAAAATAATGACTTAGGGTATTGTTCTTCGTCCTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc01g079130.2.1

PEP Infomation

Pectin lyase-like superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT1G02460.1)

Sequence

MASLSSTLLVTFYMTFALLLLLLCSHVVSARYHHHGHRGHHNNKKQHKHNSHISYPPSIS
PEPSPSAGDEGVYDVRSFGAVGDGVTDDTEGFKAAWDAACQVQSAVIHVPLGYSFMIQST
IFTGPCQSGLVFQLEGTIMPPDGPESWPSKTSKRQWLVFYRVNELSLQGGGVIDGRGEEW
WNLPCKPHKGPKGSTLPGPCDSPIAIRFFMSSNLTVQGIKMKNSPQFNFRFDNCKNVHIE
SLHITAPIWSPNTDGIHIEQTSNVEIYDSLISNGDDCVSIGAGCYDVDIRNLTCGPGGHG
ISIGSLGNHNSRACVSNITVRDSVIKQSDNGVRIKTWQGGFGAVSGVSFLNIHMDNVRNP
IIIDQFYCLSKDCSNRTSAVSVSDIEYSSIKGTYDIRSPPMRFACSDTIPCTNITLSDIE
LLPAKGELVLDPFCWNAYGGQETLTIPPIFCLLEGNPPKVFENNDLGYCSSS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc01g079130.2.1

Transcript Infomation

Pectin lyase-like superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT1G02460.1)

Sequence

CATAAAAACTCTACCAATGCTAAGTTCCTTTCCACTTTCTGAACAACTCACAGTCCTTTC
CTTTAATTCTTGAAATTCCCTCATTCTCCAGTATCCAATTTGAAAGTAACGTTTCAACAC
ATAAGTCATTTTCATCAATTTGTTCACTTAAGACAGATTGACATGGCATCACTATCAAGT
ACCCTACTTGTTACATTTTACATGACATTTGCATTATTATTATTATTATTATGTAGTCAT
GTTGTTAGTGCCAGGTACCATCACCACGGACACCGCGGTCATCATAATAACAAGAAACAA
CATAAGCATAATTCACACATATCGTATCCACCTTCAATTTCACCTGAGCCTTCACCCTCC
GCGGGGGACGAAGGGGTTTATGATGTGAGGTCTTTTGGTGCCGTAGGTGATGGTGTTACG
GATGATACTGAAGGTTTTAAGGCAGCGTGGGATGCTGCCTGCCAAGTTCAATCAGCTGTT
ATTCATGTTCCCCTTGGTTACTCTTTTATGATTCAATCTACTATTTTTACTGGTCCTTGT
CAAAGTGGATTGGTGTTTCAGTTGGAAGGAACAATAATGCCACCAGATGGACCAGAGTCG
TGGCCAAGCAAAACCAGTAAGCGGCAGTGGCTGGTATTTTATAGAGTAAATGAGTTGTCA
TTACAAGGTGGAGGCGTCATAGATGGAAGAGGAGAAGAGTGGTGGAATCTTCCTTGTAAA
CCCCATAAGGGACCTAAAGGAAGTACACTACCTGGACCATGTGACAGCCCAATTGCCATT
AGATTCTTCATGAGCTCAAATCTAACGGTGCAAGGAATTAAAATGAAGAATAGCCCCCAA
TTTAATTTCAGATTTGATAACTGCAAAAATGTGCATATTGAATCCCTTCACATTACAGCT
CCCATTTGGAGTCCCAACACTGATGGCATTCACATTGAGCAAACCAGCAATGTTGAAATT
TATGACTCCCTCATCTCTAACGGTGACGATTGTGTGTCAATAGGAGCAGGATGTTACGAT
GTGGATATTAGGAATCTCACATGTGGACCTGGAGGACATGGAATAAGCATCGGGAGTTTA
GGCAACCACAACTCGCGAGCATGTGTATCAAACATCACAGTTCGTGACTCAGTAATAAAG
CAATCAGACAACGGTGTGAGGATCAAGACATGGCAAGGGGGATTTGGAGCAGTATCAGGA
GTTTCGTTTCTCAACATTCATATGGACAATGTACGTAACCCCATTATAATCGATCAATTT
TACTGTCTTTCGAAAGATTGCAGCAATCGGACCTCAGCAGTGTCTGTTTCAGATATTGAA
TACTCAAGTATTAAAGGAACGTATGATATAAGAAGCCCGCCAATGCGTTTTGCTTGTAGT
GACACTATCCCTTGCACGAATATAACACTCTCAGACATAGAACTTTTGCCTGCGAAAGGC
GAATTAGTGTTGGATCCCTTCTGCTGGAACGCCTATGGAGGACAAGAGACATTAACAATT
CCGCCTATTTTTTGTTTGTTAGAGGGAAATCCTCCAAAAGTGTTTGAAAATAATGACTTA
GGGTATTGTTCTTCGTCCTGAATTTTAATATTGCCTGACTGAGCGTTTTGTTTGTTTTTT
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