Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g068070.3.1
CDS Infomation	Transducin/WD-like repeat-protein (AHRD V3.3 *** G7KTS0_MEDTR)
Sequence	ATGGAGCAAAGCCGCTGTAGCCTCCAGACAGGGCAGTACCTTGGCGAAATCTCTGCCCTC TGCTTTCTACACCTTCCGCCGGACTTCTCTTCACTTCCTTTTCTACTAGCTGGAACTGGT TCACAAATTCTCGTTTATGATTTGATGGTTGGGAAATTGATAAAATCATTTGATGTATTC GATGGAATTCGTGTGCATGGAGTTTCGTTGGAGGCATTTAATGAACACTTATCAGATACA CATATTACTTTTAAGATTGCAGTCTACGGTGAGAGGAGAGTTAAACTTTTCAGCTTGCAA ATTCAAAGGGTTTCTAATTCTCAAACTGAGCAACAAACATGTTTCGAGTTAACGTTAAGT CTCGTGGTCTTGCTGCCAAAGTTTACCCACTGGGTTTTGGATGTTAGCTTTTTGAAGTGG GATGGTGCGACTTCTTCAAACAAAGGTAGTCATTGTCTTGCTATAGGATGCAGTGACAAT TCTGTACATATCTGGGATATGTTGAGGTGTTCTCTGCTTTCCACAGTAAGATGCTCAGAG AAGTGTTTGTTGTACTCCATGAGGATTTGGGGCGACGATGTTGGATCTCTCCGAGTGGCA TCTGGTACAATCTTAAATGAGGTTCTTGTTTGGAAAGTGGGTCGTAAAGCTGGTCCTGAT GTTATTGGAAATCCTAATTTGATTTTGACCACTTACGAGGGTCTCCAGCTTCCTTATCAG CAATATGAAGCCATAAATATATGTAAACTAATTGGACATGAAGGCTCAATTTTCCGCCTT GCATGGTCAGCTGATGGATTTAAACTAGTATCTGTATCTGATGATCGCAGTGCTCGTATA TGGACGCTTGGTGCTGATGGTCCCAACCACGTGGTTGACGACTCAGTTTTATTTGGTCAC AGTGCTAGAATTTGGGACTGCTGTATATTCGACTCTTTAATCATAACTGCTGGCGAGGAT TGCACATGTCGTGTATGGGGAATGGATGGCACACAACTTACAAGAATCAAAGAGCATGTC GGGAGAGGGATCTGGCGCTGTCTGTATGATCCTGATGCTGCACTCCTTGTGACTGCGGGG TTTGATTCTTCAATAAAAGTACACCGGCTGCAAGCATCATTTTCTAATGGATCAGCTGGA GGTATTGTGGAAGTACAAGACTCAACTGTCAAAAAGGAGGAATTTGCTCTTTATATTCCA AATTTTAGAGAGCATGTTGGCCTCATGAACAGCAAAAGTGAATATGTAAGATGCTTGCAT TTTTCTAGGGAAGATTCTCTTTATGTTGCCACAAACAATGGATATGTGTACCATGCTAAA CTATATGATGCCAAGGAGGTGAAATGGACTGAACTTCTTCATATTGGGGAAGAAGGACCA ATAGTTTGCATGGACTTGTTGTCACACTGTTCTAATGTTACTAAAGATATTGAAAATTGG GTTGCTGTTGGCAATGGTAAAGGCACTATGATGATCGCCAAAGTTGTTGGTGATGTCTTG AATCCTAGAGTTGAACTCACTTCTACATGGTCAGCTGAACCAGAGAGGCAACTACTTGGA ACTTATTGGTGCAAATCTTTGGGACCAATGTTCCTCTTCACTTCTGATCCTAGAGGCACA TTGAAATTATGGAGGCTGTTCAACCCTTTGCCCTCTGTTTCTGACGATGTCATGAGAAGG TGTTGTGTATCCCTAATAGCGGAATTCCGCTCTTGCTTTGGGATGCGAATAATGTGCTTG GATGCATCAGTAGAGAATGAGGTTCTAGTGTGTGGTGACATTCGTGGTAATCTTTTGTTA TTTCCATTGCAAAGAGACATTCTATTTAGCATGTCTACAGCTTCAGAAATATATATAACT CCCCTCAACAACTTCAGAGGAGCTCATGGAATATCAACTGTGTGCAGCATCTCCATTGCT AGTTTTAGTCCTACACAACTTGAAATTCATTCGACCGGAGGAGATGGGTGCATATGCTAC TTTGAACATGATAGAAGTCATCATAACTTGGAATTCATTGGAATCAAGCAAGTGAAAGAG CTAAGTACAATACGATCTGTCTTCACTAATGCTGACCAACAAGATGATTTACCTAGTGGC AGCTGTGCGATAGGATTTTCTTCATCAGACTTTATCATATGGAATTTAATTTCTGAGACA AAGGTTTTGCAAGTAACTTGTGGTGGATGGAGGCGCCCTCATTCTTATTTTCTTGGTGAT GTACCAGAGATGAAAAATTGCCTTGCATATGTCAAGGATGGAGTCATTTATGTTCATAGA CACTGGGTGACCACTAATGAGAGGGTGATGTATCCCAAAAATTTTCATCTGCAATTCCAT GGCAGGGAGATACATACCATATGTTTTATCTCTCGAGATTCATTGTGCAGTCTAAATGAA AAGCAGGACACTTTTTCTGAGATGATTTGGGTTGCAACAGGTTGTGAAGATGGAACTGTG AGATTGACAAGGTATGCTTCAGAAACTGAAAATTGGTCAACTTCCAAGCTGCTTGGTGAA CATGTTGGTGGATCAGCTGTGAGATCTATATTCTTTGTCTCAAGGCTACATAGAATGGTG CTGGATGCAAGTGACGTGCATGAGAGTGTTAACAGTGAAAAATGGTTCTTAGAGGACCCA GAGGATTGTTCTTTACTAATATCAGTAGGTGCAAAAAGGGTAGTAACTGCTTGGAAACAA AAAAATAAGATGAGAATAAGGGAAGAAGGAACCCTTGGCACGGAGTGCCATATTAAAAAT GATTTACATTTTCACGGTTCATCATTATCTGCATCTTTTCAGTGGCTTTCTACTGATATG CCAACCAGAGAAAGAAATAATGGAAAACAACAAATCAAAAAAGTTAGAGAAACAGTCGAA AACGGCGGATCATTTTCCTCAGAAGACAAGAGAAGCTATTCAGAATCATGCCTTCCAGAT ATATTTGAAAATGATTGGAGATATCTCGCAGTTACTGCTTTTCTTGTTCAGGTTGCAGGC ATCAGGTGTTCAGTCTGTTTCGTAGTTGTTGCATGTTCAGACGCCACAGTTACACTACGA GCTCTTTTATTACCCTATCGACTCTGGTTTGATGTTGCTTTGTTGACTCCTTTGTCATCA CCGGTGCTTGCTTTGCGACATATAGTTGTTCCTACATGTCCCCCAGTTCAAGGCACTATT CAGTTTGGAAGTCGGTATATTATTATTAGCGGATCTACTGATGGAAGTATTGCCTTTTGG GATCTTACTGATCATGTTGATAAATTTATGCAGCAATTATCAGCACTTCAGATCGGTAAA GGTCTAGACAGTCAGAAAAGGCCGCGTACGGGTAGAGGAAGCCAAGGTGGACGACAATGG AGATTCTTGGGCAGTCAAGTTTCTAATAAAACAACAAGTGATGAACAATTGTCAGAAGTT CCTTTCTCAAGGGAAAAGCCAGATAATGGTTTTTGTGCAACTGTCACAGGAACCGGCAAA AATGTGCAACATCATGCTTTGCAAGGGATTTCCCGTTCGGTAGAAAACACACATGTATTT TCTCCAGATACCCCCACTAGGATTAAGGAAGTATTACAGAAAGCATGTCCCCTGCATATC TTCAAAGATGTTCACCAATCAGGGGTTAACTGTCTTCATGTTTCAGACATAGATGGTCCT GAAGTTTCTGATCGGAAGTTTACATTTTATATTCTGAGTGGGGGTGATGACCAGTCACTT AACTGTCTTAGTTTAGATTTCTCTCCGACATCAATGAGGCAGAGTTCTGAAAATTCGACT TTGGAGCAAAATAGCACCAGCACATCACAGAATATAGGTGGTGATGTTCATAATTATCAA GTGGGAAATCATCATATTAAATTTATGTTGCATGATAATATCACCTCAGCTCACAGCTCT GCCGTTAAAGGTGTTTGGACAGATGGTCGTTGGGTATTTTCTACTGGTCTTGATCAGCGC ATCAGGTGTTGGCATCTTGAAGAGCGAGGCAAATTAACTGAGCACAAACATATGGTTGTT AGTGTACCAGAGCCCGAGGCATTGGATGCTCGGGTCTGTGGAAGGAACCATTATCAGATT GTAGTCGCTGGGAGGGGAATGCAAATGTTTGATTTTTTCGCACCTGATGACATGAAGGAT GGAAACTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g068070.3.1
PEP Infomation	Transducin/WD-like repeat-protein (AHRD V3.3 *** G7KTS0_MEDTR)
Sequence	MEQSRCSLQTGQYLGEISALCFLHLPPDFSSLPFLLAGTGSQILVYDLMVGKLIKSFDVF DGIRVHGVSLEAFNEHLSDTHITFKIAVYGERRVKLFSLQIQRVSNSQTEQQTCFELTLS LVVLLPKFTHWVLDVSFLKWDGATSSNKGSHCLAIGCSDNSVHIWDMLRCSLLSTVRCSE KCLLYSMRIWGDDVGSLRVASGTILNEVLVWKVGRKAGPDVIGNPNLILTTYEGLQLPYQ QYEAINICKLIGHEGSIFRLAWSADGFKLVSVSDDRSARIWTLGADGPNHVVDDSVLFGH SARIWDCCIFDSLIITAGEDCTCRVWGMDGTQLTRIKEHVGRGIWRCLYDPDAALLVTAG FDSSIKVHRLQASFSNGSAGGIVEVQDSTVKKEEFALYIPNFREHVGLMNSKSEYVRCLH FSREDSLYVATNNGYVYHAKLYDAKEVKWTELLHIGEEGPIVCMDLLSHCSNVTKDIENW VAVGNGKGTMMIAKVVGDVLNPRVELTSTWSAEPERQLLGTYWCKSLGPMFLFTSDPRGT LKLWRLFNPLPSVSDDVMRRCCVSLIAEFRSCFGMRIMCLDASVENEVLVCGDIRGNLLL FPLQRDILFSMSTASEIYITPLNNFRGAHGISTVCSISIASFSPTQLEIHSTGGDGCICY FEHDRSHHNLEFIGIKQVKELSTIRSVFTNADQQDDLPSGSCAIGFSSSDFIIWNLISET KVLQVTCGGWRRPHSYFLGDVPEMKNCLAYVKDGVIYVHRHWVTTNERVMYPKNFHLQFH GREIHTICFISRDSLCSLNEKQDTFSEMIWVATGCEDGTVRLTRYASETENWSTSKLLGE HVGGSAVRSIFFVSRLHRMVLDASDVHESVNSEKWFLEDPEDCSLLISVGAKRVVTAWKQ KNKMRIREEGTLGTECHIKNDLHFHGSSLSASFQWLSTDMPTRERNNGKQQIKKVRETVE NGGSFSSEDKRSYSESCLPDIFENDWRYLAVTAFLVQVAGIRCSVCFVVVACSDATVTLR ALLLPYRLWFDVALLTPLSSPVLALRHIVVPTCPPVQGTIQFGSRYIIISGSTDGSIAFW DLTDHVDKFMQQLSALQIGKGLDSQKRPRTGRGSQGGRQWRFLGSQVSNKTTSDEQLSEV PFSREKPDNGFCATVTGTGKNVQHHALQGISRSVENTHVFSPDTPTRIKEVLQKACPLHI FKDVHQSGVNCLHVSDIDGPEVSDRKFTFYILSGGDDQSLNCLSLDFSPTSMRQSSENST LEQNSTSTSQNIGGDVHNYQVGNHHIKFMLHDNITSAHSSAVKGVWTDGRWVFSTGLDQR IRCWHLEERGKLTEHKHMVVSVPEPEALDARVCGRNHYQIVVAGRGMQMFDFFAPDDMKD GN*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g068070.3.1
Transcript Infomation	Transducin/WD-like repeat-protein (AHRD V3.3 *** G7KTS0_MEDTR)
Sequence	ACACTTTTTAAAAATACTACTAGCCCACTGGCCATTAGCATTTGAACACTGCCGCAGGGA GGCATTGGCGACTGCTAGACTAGTAGTGCGACGCAGCAGCGACCATGGAGCAAAGCCGCT GTAGCCTCCAGACAGGGCAGTACCTTGGCGAAATCTCTGCCCTCTGCTTTCTACACCTTC CGCCGGACTTCTCTTCACTTCCTTTTCTACTAGCTGGAACTGGTTCACAAATTCTCGTTT ATGATTTGATGGTTGGGAAATTGATAAAATCATTTGATGTATTCGATGGAATTCGTGTGC ATGGAGTTTCGTTGGAGGCATTTAATGAACACTTATCAGATACACATATTACTTTTAAGA TTGCAGTCTACGGTGAGAGGAGAGTTAAACTTTTCAGCTTGCAAATTCAAAGGGTTTCTA ATTCTCAAACTGAGCAACAAACATGTTTCGAGTTAACGTTAAGTCTCGTGGTCTTGCTGC CAAAGTTTACCCACTGGGTTTTGGATGTTAGCTTTTTGAAGTGGGATGGTGCGACTTCTT CAAACAAAGGTAGTCATTGTCTTGCTATAGGATGCAGTGACAATTCTGTACATATCTGGG ATATGTTGAGGTGTTCTCTGCTTTCCACAGTAAGATGCTCAGAGAAGTGTTTGTTGTACT CCATGAGGATTTGGGGCGACGATGTTGGATCTCTCCGAGTGGCATCTGGTACAATCTTAA ATGAGGTTCTTGTTTGGAAAGTGGGTCGTAAAGCTGGTCCTGATGTTATTGGAAATCCTA ATTTGATTTTGACCACTTACGAGGGTCTCCAGCTTCCTTATCAGCAATATGAAGCCATAA ATATATGTAAACTAATTGGACATGAAGGCTCAATTTTCCGCCTTGCATGGTCAGCTGATG GATTTAAACTAGTATCTGTATCTGATGATCGCAGTGCTCGTATATGGACGCTTGGTGCTG ATGGTCCCAACCACGTGGTTGACGACTCAGTTTTATTTGGTCACAGTGCTAGAATTTGGG ACTGCTGTATATTCGACTCTTTAATCATAACTGCTGGCGAGGATTGCACATGTCGTGTAT GGGGAATGGATGGCACACAACTTACAAGAATCAAAGAGCATGTCGGGAGAGGGATCTGGC GCTGTCTGTATGATCCTGATGCTGCACTCCTTGTGACTGCGGGGTTTGATTCTTCAATAA AAGTACACCGGCTGCAAGCATCATTTTCTAATGGATCAGCTGGAGGTATTGTGGAAGTAC AAGACTCAACTGTCAAAAAGGAGGAATTTGCTCTTTATATTCCAAATTTTAGAGAGCATG TTGGCCTCATGAACAGCAAAAGTGAATATGTAAGATGCTTGCATTTTTCTAGGGAAGATT CTCTTTATGTTGCCACAAACAATGGATATGTGTACCATGCTAAACTATATGATGCCAAGG AGGTGAAATGGACTGAACTTCTTCATATTGGGGAAGAAGGACCAATAGTTTGCATGGACT TGTTGTCACACTGTTCTAATGTTACTAAAGATATTGAAAATTGGGTTGCTGTTGGCAATG GTAAAGGCACTATGATGATCGCCAAAGTTGTTGGTGATGTCTTGAATCCTAGAGTTGAAC TCACTTCTACATGGTCAGCTGAACCAGAGAGGCAACTACTTGGAACTTATTGGTGCAAAT CTTTGGGACCAATGTTCCTCTTCACTTCTGATCCTAGAGGCACATTGAAATTATGGAGGC TGTTCAACCCTTTGCCCTCTGTTTCTGACGATGTCATGAGAAGGTGTTGTGTATCCCTAA TAGCGGAATTCCGCTCTTGCTTTGGGATGCGAATAATGTGCTTGGATGCATCAGTAGAGA ATGAGGTTCTAGTGTGTGGTGACATTCGTGGTAATCTTTTGTTATTTCCATTGCAAAGAG ACATTCTATTTAGCATGTCTACAGCTTCAGAAATATATATAACTCCCCTCAACAACTTCA GAGGAGCTCATGGAATATCAACTGTGTGCAGCATCTCCATTGCTAGTTTTAGTCCTACAC AACTTGAAATTCATTCGACCGGAGGAGATGGGTGCATATGCTACTTTGAACATGATAGAA GTCATCATAACTTGGAATTCATTGGAATCAAGCAAGTGAAAGAGCTAAGTACAATACGAT CTGTCTTCACTAATGCTGACCAACAAGATGATTTACCTAGTGGCAGCTGTGCGATAGGAT TTTCTTCATCAGACTTTATCATATGGAATTTAATTTCTGAGACAAAGGTTTTGCAAGTAA CTTGTGGTGGATGGAGGCGCCCTCATTCTTATTTTCTTGGTGATGTACCAGAGATGAAAA ATTGCCTTGCATATGTCAAGGATGGAGTCATTTATGTTCATAGACACTGGGTGACCACTA ATGAGAGGGTGATGTATCCCAAAAATTTTCATCTGCAATTCCATGGCAGGGAGATACATA CCATATGTTTTATCTCTCGAGATTCATTGTGCAGTCTAAATGAAAAGCAGGACACTTTTT CTGAGATGATTTGGGTTGCAACAGGTTGTGAAGATGGAACTGTGAGATTGACAAGGTATG CTTCAGAAACTGAAAATTGGTCAACTTCCAAGCTGCTTGGTGAACATGTTGGTGGATCAG CTGTGAGATCTATATTCTTTGTCTCAAGGCTACATAGAATGGTGCTGGATGCAAGTGACG TGCATGAGAGTGTTAACAGTGAAAAATGGTTCTTAGAGGACCCAGAGGATTGTTCTTTAC TAATATCAGTAGGTGCAAAAAGGGTAGTAACTGCTTGGAAACAAAAAAATAAGATGAGAA TAAGGGAAGAAGGAACCCTTGGCACGGAGTGCCATATTAAAAATGATTTACATTTTCACG GTTCATCATTATCTGCATCTTTTCAGTGGCTTTCTACTGATATGCCAACCAGAGAAAGAA ATAATGGAAAACAACAAATCAAAAAAGTTAGAGAAACAGTCGAAAACGGCGGATCATTTT CCTCAGAAGACAAGAGAAGCTATTCAGAATCATGCCTTCCAGATATATTTGAAAATGATT GGAGATATCTCGCAGTTACTGCTTTTCTTGTTCAGGTTGCAGGCATCAGGTGTTCAGTCT GTTTCGTAGTTGTTGCATGTTCAGACGCCACAGTTACACTACGAGCTCTTTTATTACCCT ATCGACTCTGGTTTGATGTTGCTTTGTTGACTCCTTTGTCATCACCGGTGCTTGCTTTGC GACATATAGTTGTTCCTACATGTCCCCCAGTTCAAGGCACTATTCAGTTTGGAAGTCGGT ATATTATTATTAGCGGATCTACTGATGGAAGTATTGCCTTTTGGGATCTTACTGATCATG TTGATAAATTTATGCAGCAATTATCAGCACTTCAGATCGGTAAAGGTCTAGACAGTCAGA AAAGGCCGCGTACGGGTAGAGGAAGCCAAGGTGGACGACAATGGAGATTCTTGGGCAGTC AAGTTTCTAATAAAACAACAAGTGATGAACAATTGTCAGAAGTTCCTTTCTCAAGGGAAA AGCCAGATAATGGTTTTTGTGCAACTGTCACAGGAACCGGCAAAAATGTGCAACATCATG CTTTGCAAGGGATTTCCCGTTCGGTAGAAAACACACATGTATTTTCTCCAGATACCCCCA CTAGGATTAAGGAAGTATTACAGAAAGCATGTCCCCTGCATATCTTCAAAGATGTTCACC AATCAGGGGTTAACTGTCTTCATGTTTCAGACATAGATGGTCCTGAAGTTTCTGATCGGA AGTTTACATTTTATATTCTGAGTGGGGGTGATGACCAGTCACTTAACTGTCTTAGTTTAG ATTTCTCTCCGACATCAATGAGGCAGAGTTCTGAAAATTCGACTTTGGAGCAAAATAGCA CCAGCACATCACAGAATATAGGTGGTGATGTTCATAATTATCAAGTGGGAAATCATCATA TTAAATTTATGTTGCATGATAATATCACCTCAGCTCACAGCTCTGCCGTTAAAGGTGTTT GGACAGATGGTCGTTGGGTATTTTCTACTGGTCTTGATCAGCGCATCAGGTGTTGGCATC TTGAAGAGCGAGGCAAATTAACTGAGCACAAACATATGGTTGTTAGTGTACCAGAGCCCG AGGCATTGGATGCTCGGGTCTGTGGAAGGAACCATTATCAGATTGTAGTCGCTGGGAGGG GAATGCAAATGTTTGATTTTTTCGCACCTGATGACATGAAGGATGGAAACTAAGGTTTTT ACCTTATTGTATCACAAATTTTGATGAATACAAAGTGGGCGAGTTTCCTCTGTTTTGAGT AAGAAGTATGAAAACACATACAAGTTTTCTCTTGTAGCATATGTTATTATACATACAAGA AATTCTTATTTCTTGTAGACTGTACAATCATTAATATTTGGTACTACGGCATTTAGAAGG TAAATTATATGGGGTACCAACGATTACTGCAATACTTGTCACAAGAAAATAATCTTGTAT GTTTTAGTTATTAGATAGCTTTTGCAGGCCAAGAAAACACTAGTGGTTAGTGAGATACGA GAGAATTTGTATAATATCCTGAGGCATCTTAGAAGGTGAAACTTTTGATGTACCTTTCAC CATTAGCATTGTAATGGTCGTATTGCTGCTGATGTTCAATTTTCTTCTGCTTGTCATATA ATGCTTTTCTTGTCTATGCACATCCAATTATTTTTGATGTTATCAATGTAAAAAAATTCT GTTCTTGTTGTGTAATTATTTTGGATGGATTTGGAGTTATGCGGGTGT