Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g067530.3.1
CDS Infomation	GTPase obg (AHRD V3.3 *** W9RHI6_9ROSA)
Sequence	ATGGCTTTCTCTTTGTTCACAACTACATCAACCTTCTCTGTCTCTCTTCGCTGCCAAGCT CGACCCAATACCAGTCGCAGTAGAACCAACCCAAAGCGCCTGTCTACAAACACTAACAGA AGAAGGCAAAAACCCAATCCCCCTCAGCGAAAATCCGGTGAGTTTAGGCCACCATCGCCA ATTACCACAGCTGCCGGTGATACTGCCACTACCTTCACTCGTCTACCCCCAAAAGATGAC TTTTTTCTTCCGTCCCTCCAAGATTCAACTGAAATGACTCTCTCTGAGTTAACTATTCCC ACCCCAGCTAAGAATCGTAAGCAAGAGTTGGATGGTGAAAATGTAGAGAATGTAAGATTT GATTATGGAAAATTCGAGTTGTACGAGGTTGATGATGATATTGAGGATGAGAGCGAGGAT GATTTTGATGAAAATGATGATGTGGATGGTCAAATGGAAGGTACTGGAAGTAGGGTGTTT GAGGGTATTGGGAAATTTGAGCTGTATGAGGTTGACGATGAGTTTGATGAAGATGATGAT GAGGGCATTGAAATGGAAGGTTCTACAAGTGGGGTTTTTGAGGGTGGTGATGTGTTTGAA GGGGAAGGGAGTGATATAAAGGAGAAGGAGAAAGGGGTTCCAGCAGTAATGAGGTGTTTT GATAGGGCAAAAATATATGTAAAAGCAGGGGATGGAGGGAATGGGGTGGTGGCATTTAGG AGGGAGAAGTTTGTGCCATTGGGTGGACCATCTGGTGGTGATGGAGGGAGGGGAGGAAAT GTGTATGTGGAGGTAGATGGGTCGATGAATTCATTGTTGCCATTTAGGCAGAGTGTGCAT ATTAAAGCTGGAAGAGGAGGTCATGGTCATGGAAAGAAGCAATTTGGGGCAAAAGGCGAG GATGTAGTGGTAAAGGTGCCACCAGGTACTGTCATTAGGGAGGCTGGAGAGGGTGGAATT CAAGGGAATGTACTTCTTGAGTTGTTGCATCCAGGACAGAAGGCATTGCTGTTGCCTGGT GGAAGAGGTGGGAGAGGGAATGCCTCTTTTAAGACAGGATTGAATAGGGTGCCCAAGATT GCAGAGAATGGAGAAGAAGGTCCAGAGATGTGGTTAGACTTGGAGCTCAAGTTGGTTGCT GATGTTGGTATAGTCGGAGCGCCAAATGCAGGGAAAAGTACATTTCTCAGTGTTATAAGT GCTGCTCAGCCAGCTATTGCAAATTACCCCTTTACCACTTTGCTTCCAAATTTGGGCGTA GTTTCATTTGATTATGATGCTACTGTGGTCGTTGCTGATCTGCCTGGTCTACTCGAAGGG GCACACCGAGGTTTTGGTTTAGGCCATGAGTTTCTTCGGCACTCAGAAAGATGTTCAGTC CTGGTGCATGTGGTTGATGGTTCATCTCCACAACCAGAATATGAATATGAAGCTGTTCGT CTTGAATTGGAAATGTTTAGCCCTGAACTTGCTGAAAAACCTTATTTAGTGGTTTACAAC AAAATGGACCTTCCAGACGCATATGAGAATTGGAAGACATTCAGGGACAGTCTGAGATCT CGTGGAATTGAACCTTTTTGCATGAGTGCAGTGAAAAGAGAGGGTACACATGATGTTATT TGTGCTGCTTATGATCTTGTTTGTAGAAGAGAAGCTTCTAAAGAAGAAGTGAGAAGGGAC CCAGTAAACTTGAACTATGTTGCTGACATGGTGAAAAAGCAGCGAAATGCTCCCATAAAC GAGTTTGAGATCTCCCATGATAGTTCTTCCAAAACTTGGTATGTTCAAGGATTAGGCCTG CAACGTTTCGTCCAAATGACAAACTGGAGATATATGGATTCAGACAGAAGATTTCAACAC GTTTTGGAAGCATGTGGTGTGAATAAATCTCTGCTCAAGCTTGGCGTGAAAGAGGGTGAC ACTGTCGTTGTTGGAGATATGGAGTTGGAGTGGCATGATTATGATAGTGCAGGCTCTATA AGTAGGAGGAAGTGGTCTTCAGAACCAAGTCGATAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g067530.3.1
PEP Infomation	GTPase obg (AHRD V3.3 *** W9RHI6_9ROSA)
Sequence	MAFSLFTTTSTFSVSLRCQARPNTSRSRTNPKRLSTNTNRRRQKPNPPQRKSGEFRPPSP ITTAAGDTATTFTRLPPKDDFFLPSLQDSTEMTLSELTIPTPAKNRKQELDGENVENVRF DYGKFELYEVDDDIEDESEDDFDENDDVDGQMEGTGSRVFEGIGKFELYEVDDEFDEDDD EGIEMEGSTSGVFEGGDVFEGEGSDIKEKEKGVPAVMRCFDRAKIYVKAGDGGNGVVAFR REKFVPLGGPSGGDGGRGGNVYVEVDGSMNSLLPFRQSVHIKAGRGGHGHGKKQFGAKGE DVVVKVPPGTVIREAGEGGIQGNVLLELLHPGQKALLLPGGRGGRGNASFKTGLNRVPKI AENGEEGPEMWLDLELKLVADVGIVGAPNAGKSTFLSVISAAQPAIANYPFTTLLPNLGV VSFDYDATVVVADLPGLLEGAHRGFGLGHEFLRHSERCSVLVHVVDGSSPQPEYEYEAVR LELEMFSPELAEKPYLVVYNKMDLPDAYENWKTFRDSLRSRGIEPFCMSAVKREGTHDVI CAAYDLVCRREASKEEVRRDPVNLNYVADMVKKQRNAPINEFEISHDSSSKTWYVQGLGL QRFVQMTNWRYMDSDRRFQHVLEACGVNKSLLKLGVKEGDTVVVGDMELEWHDYDSAGSI SRRKWSSEPSR*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g067530.3.1
Transcript Infomation	GTPase obg (AHRD V3.3 *** W9RHI6_9ROSA)
Sequence	GTTGGTGTTTTTATTATTCTGTCATTGTACAATAGAAAAAATGTAGTTCTCTTTTGAGGA ATTATCTGAAGAAAATATATGGATTTGTGAAACACCCGCCCAAACGGATAATTTGTTGAG CTCTGGCAGCCATAGCCATGGCTTTCTCTTTGTTCACAACTACATCAACCTTCTCTGTCT CTCTTCGCTGCCAAGCTCGACCCAATACCAGTCGCAGTAGAACCAACCCAAAGCGCCTGT CTACAAACACTAACAGAAGAAGGCAAAAACCCAATCCCCCTCAGCGAAAATCCGGTGAGT TTAGGCCACCATCGCCAATTACCACAGCTGCCGGTGATACTGCCACTACCTTCACTCGTC TACCCCCAAAAGATGACTTTTTTCTTCCGTCCCTCCAAGATTCAACTGAAATGACTCTCT CTGAGTTAACTATTCCCACCCCAGCTAAGAATCGTAAGCAAGAGTTGGATGGTGAAAATG TAGAGAATGTAAGATTTGATTATGGAAAATTCGAGTTGTACGAGGTTGATGATGATATTG AGGATGAGAGCGAGGATGATTTTGATGAAAATGATGATGTGGATGGTCAAATGGAAGGTA CTGGAAGTAGGGTGTTTGAGGGTATTGGGAAATTTGAGCTGTATGAGGTTGACGATGAGT TTGATGAAGATGATGATGAGGGCATTGAAATGGAAGGTTCTACAAGTGGGGTTTTTGAGG GTGGTGATGTGTTTGAAGGGGAAGGGAGTGATATAAAGGAGAAGGAGAAAGGGGTTCCAG CAGTAATGAGGTGTTTTGATAGGGCAAAAATATATGTAAAAGCAGGGGATGGAGGGAATG GGGTGGTGGCATTTAGGAGGGAGAAGTTTGTGCCATTGGGTGGACCATCTGGTGGTGATG GAGGGAGGGGAGGAAATGTGTATGTGGAGGTAGATGGGTCGATGAATTCATTGTTGCCAT TTAGGCAGAGTGTGCATATTAAAGCTGGAAGAGGAGGTCATGGTCATGGAAAGAAGCAAT TTGGGGCAAAAGGCGAGGATGTAGTGGTAAAGGTGCCACCAGGTACTGTCATTAGGGAGG CTGGAGAGGGTGGAATTCAAGGGAATGTACTTCTTGAGTTGTTGCATCCAGGACAGAAGG CATTGCTGTTGCCTGGTGGAAGAGGTGGGAGAGGGAATGCCTCTTTTAAGACAGGATTGA ATAGGGTGCCCAAGATTGCAGAGAATGGAGAAGAAGGTCCAGAGATGTGGTTAGACTTGG AGCTCAAGTTGGTTGCTGATGTTGGTATAGTCGGAGCGCCAAATGCAGGGAAAAGTACAT TTCTCAGTGTTATAAGTGCTGCTCAGCCAGCTATTGCAAATTACCCCTTTACCACTTTGC TTCCAAATTTGGGCGTAGTTTCATTTGATTATGATGCTACTGTGGTCGTTGCTGATCTGC CTGGTCTACTCGAAGGGGCACACCGAGGTTTTGGTTTAGGCCATGAGTTTCTTCGGCACT CAGAAAGATGTTCAGTCCTGGTGCATGTGGTTGATGGTTCATCTCCACAACCAGAATATG AATATGAAGCTGTTCGTCTTGAATTGGAAATGTTTAGCCCTGAACTTGCTGAAAAACCTT ATTTAGTGGTTTACAACAAAATGGACCTTCCAGACGCATATGAGAATTGGAAGACATTCA GGGACAGTCTGAGATCTCGTGGAATTGAACCTTTTTGCATGAGTGCAGTGAAAAGAGAGG GTACACATGATGTTATTTGTGCTGCTTATGATCTTGTTTGTAGAAGAGAAGCTTCTAAAG AAGAAGTGAGAAGGGACCCAGTAAACTTGAACTATGTTGCTGACATGGTGAAAAAGCAGC GAAATGCTCCCATAAACGAGTTTGAGATCTCCCATGATAGTTCTTCCAAAACTTGGTATG TTCAAGGATTAGGCCTGCAACGTTTCGTCCAAATGACAAACTGGAGATATATGGATTCAG ACAGAAGATTTCAACACGTTTTGGAAGCATGTGGTGTGAATAAATCTCTGCTCAAGCTTG GCGTGAAAGAGGGTGACACTGTCGTTGTTGGAGATATGGAGTTGGAGTGGCATGATTATG ATAGTGCAGGCTCTATAAGTAGGAGGAAGTGGTCTTCAGAACCAAGTCGATAAGTTCATG GTTGATCTTAAGAATATGCTGCTAATCAAGAAATCGTACAAAGACTAAACATCCTTGTTG GTGGTGCATTTCCCAGCTCTTAAACCAGAGCTGCTGAAAATCTGATTATATTATACATCT GCACTACGGAAAAGACACATGTTCGTGCTCTCACGTTTTAAATAATATAATCACACCTCC AATTTAGCAGATCGATCGAAACACCTTACAGAGCTGCAAGAGGAATTGAGCCGGAAGATA TGGTACGATCTCCCATCATCTTTGGTTCATGCCATATTAATGCAGCTTTCTGCTTTCTAG TGCAATAAGGTGTATCACTATCCCCAGTAGTTAATTTATGACAGTGACAGTAGAGATGTG TGTTGTTTTTTTTTTATACATTTAGAAACATGGTTATGGTGGTCAGTGTGACCATATAAC CACCAATCCCTACTTATTTGGGATCATAGTTGTTGTGGTCACACTTAAGTTCCAAATATA AGTAAGTTGATAAAAGTTGTAGTAATTTTTTCGAAGAAGTTTCTCTTCTAATGTTGACTA TTGCGTTATTATAGAGGATTATGGATGTTATAAAATTTTTACATAATTATTCCAGGAATA ACTATCTCTGTATTATAATTATTATGTTAGGTACATTTTCTACAATGTTATAGGACGCCT GTTTGTTTAAGTACTGGAGAATGATTTAGTCTTCAGAAAAATTTCAAGAGTT