Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g065530.3.1
CDS Infomation	Protein COBRA, putative (AHRD V3.3 *** B9RZK6_RICCO)
Sequence	ATGGCACTCACCACAACATTTTTCTCTCTCTTTCTCCTAATCATCACCGTCGCCGGACAA ACAACTCCGATGGCTGAAGCTCCGGCACCGGCAGCCGACGACTGTAACGGTATATTCTTG CAGTATGTGTTTAATTCCGGATCTAAAATCAAACCCACTTTGAAAACTCGTCAACCCTAC AAGTTTCAGTCTATTCTCAGTATAACTAACAACGGACTTGAGGAACTTAAGTTATGGAGG GTTTTTGTTGGGTTTCAACATGATGAGATTTTGGTTTCTGCTTCTAACGCTCTGCTTGCT GATGGGGAATCATTTCCTGCTTTAGTTGGTAATGGTACTGTTTTTGCTGGATTTCCGGCT GCCGATCTTAAGACAGCTGTGGAAACTGCTGGAGATACTACACAGACGAGTGTTCAAATC AAAATTGTGGGTACCCAGTTTGGAGTTGGCTCTCCTAATGTACCTATGCCCTCCAATATC TCTTTGGAAAATGATGGGTTTATTTGCCCTAAACCCTCTATGCAAGGAAAGAGTGTTATG CAAGTATGCTGTATTAAAGACGAAAATTTCAAGACAAATTTGACGTTGGGTGAGAAATTT AGTCCACGCCAAGATGGGGATCTTACAATTATGTATGATATCCTAAGAACATATGATTCA AATTACTGGGCTCAGGTTACCATTGCAAACCATAATCCCCTTGGTCGCCTTGATAACTGG AAACTAAGTTGGGACTGGATGAAGGATGAGTTTATTTGGGAAATGAAAGGCGCATATCCC TCTGTTGTTGATACTTCTGAGTGTGTTTTTGGGCCACAGGCAAAATTTTATCAAAACCTT GACTTTTCCACTGGTTTGAACTGTCAGAGAAGGCCGACACTAATTGATCTGCCGCTGGAG AAGACCAATGATACAAAGTTGGGAATGATACCTTTTTGTTGTCGGAATGGGACAATCTTG CCACCTGCTATGGACCCAAGCAAGTCTGTTTCAGCATTCCAGATGAATGTCTTTAAAATG CCTCCAGATCTTAATCGATCCTCATTCACTCCTCCACAGAATTGGAAGATCGAAGGCAGA CTGAATCCAGATTACAAGTGTGGACCTCCAGTCCGTGTAAGCCCCACCCAAGTCCCTGAT CCTAGTGGATTGTTACCTGCTACATCAGTATTTGCTAGCTGGCAAGTTGTATGCAACATC ACCCAACCAAAAGGAGCTAGCCCCAGATGCTGTGTTTCTTTCTCTGCTTTCTACAATGAA TCTATCATTCCTTGTCCAACATGCGCCTGTGGTTGTCCTTCCAATACTGCTCGTACATGT AGCACGAAAGCCCCAGCTCTTCTCCTCCCATCTCAGGCTCTTCTGGTTCCATTTGACAAT AGAACCAAGATGTCCCTTGCCTGGGCTGAAATTAATCATCTTCCAGTTTCAAACCCATTG CCATGTGGAGATAACTGTGGTGTAAGCATCAACTGGCATTTGTTCACAGACTATAGGGGT GGATGGTCTGCCAGGATCACCATCTTCAACTGGGAGGATGCTGCTTTTGCTGATTGGTTC ACTGCGGTGGAATTGGACAAAGCAGCGGCTGGTTTTGACGCAGTGTATTCATTCAATGGA ACTATGTTAGATGGGGTTAATAATACCATATTCATGCAGGGCCTTCCAGGCTTGAACTAT ATAGTAGCAGAAGCAGATGGAGCTAATCCAGCGAAAGATCCCCGAGTACCTGGGAAACAA CAATCAGTAATCTCATTCACAAAGAAGAATATCCCAAACATCAACGTTGCTGCTGGTGAT GGGTTTCCAACAAAATTATACTTCAATGGAGAAGAGTGCTCATTGCCAAAGCTACTCCCA ACAAGCAGTTCATCTAGAATATCTTCATTCACTGTCACTACTTCCATTCTTGCAGCAGTT GTGGTTTTTATGTTGGTGCGACAATAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g065530.3.1
PEP Infomation	Protein COBRA, putative (AHRD V3.3 *** B9RZK6_RICCO)
Sequence	MALTTTFFSLFLLIITVAGQTTPMAEAPAPAADDCNGIFLQYVFNSGSKIKPTLKTRQPY KFQSILSITNNGLEELKLWRVFVGFQHDEILVSASNALLADGESFPALVGNGTVFAGFPA ADLKTAVETAGDTTQTSVQIKIVGTQFGVGSPNVPMPSNISLENDGFICPKPSMQGKSVM QVCCIKDENFKTNLTLGEKFSPRQDGDLTIMYDILRTYDSNYWAQVTIANHNPLGRLDNW KLSWDWMKDEFIWEMKGAYPSVVDTSECVFGPQAKFYQNLDFSTGLNCQRRPTLIDLPLE KTNDTKLGMIPFCCRNGTILPPAMDPSKSVSAFQMNVFKMPPDLNRSSFTPPQNWKIEGR LNPDYKCGPPVRVSPTQVPDPSGLLPATSVFASWQVVCNITQPKGASPRCCVSFSAFYNE SIIPCPTCACGCPSNTARTCSTKAPALLLPSQALLVPFDNRTKMSLAWAEINHLPVSNPL PCGDNCGVSINWHLFTDYRGGWSARITIFNWEDAAFADWFTAVELDKAAAGFDAVYSFNG TMLDGVNNTIFMQGLPGLNYIVAEADGANPAKDPRVPGKQQSVISFTKKNIPNINVAAGD GFPTKLYFNGEECSLPKLLPTSSSSRISSFTVTTSILAAVVVFMLVRQ*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g065530.3.1
Transcript Infomation	Protein COBRA, putative (AHRD V3.3 *** B9RZK6_RICCO)
Sequence	CTCCCAACTAAATACTCTGAAACTTTTACAAATTATTCAAATGAACATTCTAACAAATAA TACTCCTAATAAATTAATATCACCTACTCTCTATATTTCAATTTATTTTAAAATATAAAA AATAAAAACCCTTTGTATTTTACAAATTTGCAGAATTACTCTTTTTCCTAAGAACAAGAA AGAAAACTAATACAGCTTTATCTAAGCTGTCTATGCTCTTTTCATCTTCGTTTCTTTTAC CTTCTCCGCGTTATCTTTCACATATACACGCACACCACTAATACATTTTCAGACATATAT AATACTCTTTTCAATCCAAAATCACATTATTCAAACAACATGGCACTCACCACAACATTT TTCTCTCTCTTTCTCCTAATCATCACCGTCGCCGGACAAACAACTCCGATGGCTGAAGCT CCGGCACCGGCAGCCGACGACTGTAACGGTATATTCTTGCAGTATGTGTTTAATTCCGGA TCTAAAATCAAACCCACTTTGAAAACTCGTCAACCCTACAAGTTTCAGTCTATTCTCAGT ATAACTAACAACGGACTTGAGGAACTTAAGTTATGGAGGGTTTTTGTTGGGTTTCAACAT GATGAGATTTTGGTTTCTGCTTCTAACGCTCTGCTTGCTGATGGGGAATCATTTCCTGCT TTAGTTGGTAATGGTACTGTTTTTGCTGGATTTCCGGCTGCCGATCTTAAGACAGCTGTG GAAACTGCTGGAGATACTACACAGACGAGTGTTCAAATCAAAATTGTGGGTACCCAGTTT GGAGTTGGCTCTCCTAATGTACCTATGCCCTCCAATATCTCTTTGGAAAATGATGGGTTT ATTTGCCCTAAACCCTCTATGCAAGGAAAGAGTGTTATGCAAGTATGCTGTATTAAAGAC GAAAATTTCAAGACAAATTTGACGTTGGGTGAGAAATTTAGTCCACGCCAAGATGGGGAT CTTACAATTATGTATGATATCCTAAGAACATATGATTCAAATTACTGGGCTCAGGTTACC ATTGCAAACCATAATCCCCTTGGTCGCCTTGATAACTGGAAACTAAGTTGGGACTGGATG AAGGATGAGTTTATTTGGGAAATGAAAGGCGCATATCCCTCTGTTGTTGATACTTCTGAG TGTGTTTTTGGGCCACAGGCAAAATTTTATCAAAACCTTGACTTTTCCACTGGTTTGAAC TGTCAGAGAAGGCCGACACTAATTGATCTGCCGCTGGAGAAGACCAATGATACAAAGTTG GGAATGATACCTTTTTGTTGTCGGAATGGGACAATCTTGCCACCTGCTATGGACCCAAGC AAGTCTGTTTCAGCATTCCAGATGAATGTCTTTAAAATGCCTCCAGATCTTAATCGATCC TCATTCACTCCTCCACAGAATTGGAAGATCGAAGGCAGACTGAATCCAGATTACAAGTGT GGACCTCCAGTCCGTGTAAGCCCCACCCAAGTCCCTGATCCTAGTGGATTGTTACCTGCT ACATCAGTATTTGCTAGCTGGCAAGTTGTATGCAACATCACCCAACCAAAAGGAGCTAGC CCCAGATGCTGTGTTTCTTTCTCTGCTTTCTACAATGAATCTATCATTCCTTGTCCAACA TGCGCCTGTGGTTGTCCTTCCAATACTGCTCGTACATGTAGCACGAAAGCCCCAGCTCTT CTCCTCCCATCTCAGGCTCTTCTGGTTCCATTTGACAATAGAACCAAGATGTCCCTTGCC TGGGCTGAAATTAATCATCTTCCAGTTTCAAACCCATTGCCATGTGGAGATAACTGTGGT GTAAGCATCAACTGGCATTTGTTCACAGACTATAGGGGTGGATGGTCTGCCAGGATCACC ATCTTCAACTGGGAGGATGCTGCTTTTGCTGATTGGTTCACTGCGGTGGAATTGGACAAA GCAGCGGCTGGTTTTGACGCAGTGTATTCATTCAATGGAACTATGTTAGATGGGGTTAAT AATACCATATTCATGCAGGGCCTTCCAGGCTTGAACTATATAGTAGCAGAAGCAGATGGA GCTAATCCAGCGAAAGATCCCCGAGTACCTGGGAAACAACAATCAGTAATCTCATTCACA AAGAAGAATATCCCAAACATCAACGTTGCTGCTGGTGATGGGTTTCCAACAAAATTATAC TTCAATGGAGAAGAGTGCTCATTGCCAAAGCTACTCCCAACAAGCAGTTCATCTAGAATA TCTTCATTCACTGTCACTACTTCCATTCTTGCAGCAGTTGTGGTTTTTATGTTGGTGCGA CAATAGCAGTGAGCTGTGGCGTTTTCTCTTCGTTTCATACCTGCCAATTGATTCATTCTT TAGCGTCTGCTACCAGGTTTTAATGCTGGTGACCAATCTTTCAATCAGTTTGTCGGATTA TGTATTCAGGGACGTGGGTTTTTCGGCGAGTTTTGATTTGTAACTATTTATTACACTCTG GAATTCTCATTCCAGACAATATTTGACTTTAAAGTTAATACCTGTTATATTAGCAGATAA GATAAGAATACCTCAGTTTGTTCATCATCATCCTCAATACCTCAGTTTGTTCATCATCAT CCTTCTCTATGTCTCACGTCTCGATCTCCTACTACACGCGACGTTTGCCAAGAGTTCCGA ACCTGTATGCAACTCAGATGAAACATGGTTTGTTTGTCTGAAATAGATAACTGAAGCCAG TTGTTGCAATTTGTTAAAATTTGGGTATGTCAGTTTCTCGTTGAAGGAATTGCATTTGAC TCTT