Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc01g060450.3.1

CDS Infomation

transmembrane protein, putative (DUF1218) (AHRD V3.3 *** AT5G49320.1)

Sequence

ATGGCTGTGACTCATGCTGATCTTGAACCAAGTCGCCCTAGCACCAATTTAGGTAGCAAA
ATGGGTGCATTTCTTATGGTTTTGTCAATACTTCTTGGCCTCTTTTGCTTCATTCTCTCC
CTCATTGCTGAGGCTACGCGTTCTCAGGTGAGAATGAGAGGTAAAGATGAATGCACATAT
AGTGGTAGTGGGAAGACACCTCTGTTGTGTGCTAGTGCTGCATTTTTTGTTCTGGCTATT
GCTATGGTGATTGAGCACACTTACTTGTTGATTGTTGTGAGCAAAACAACTCCTCCTCAT
GTACTTTATTGGGATCCTAATTCCCCATCTGTCAAAACTCTTGTTTGGCAAGCCGGATTC
TTCTTTGTTTCTACCTGGGTTTCATTTGCTGTTGGGGAGATATTATTACTGATAGGGCTA
AGTGTTGAGTCTGGACACCTAAGACACTGGGAAACACCAAGAGAAAGTTGTTTAGTACTT
GGACAGGGGTTATTCTCTGCTGCTGGAGTTTTTGGCCTATTGACAGTTATCTTGGCTGCT
GGTTTATACGTCACAGCTCTCCGTGCACAACAACTCTTACTTCATCAAGAAAGCATTAGT
CGTCAAATCCTGGAAACCTCTATGCCTTTTGCATCTCCGCCAAGATCTCCTCGAACAATC
ATTAGACCTGTTCCTAATGAAAATCCCATTTTAAGAACAGATCAGAGTAATATTGAACAT
GATACTACTTCACTAGCACAGTACTTATCTGACTTTGACAAGTACTTGCACTTGGTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc01g060450.3.1

PEP Infomation

transmembrane protein, putative (DUF1218) (AHRD V3.3 *** AT5G49320.1)

Sequence

MAVTHADLEPSRPSTNLGSKMGAFLMVLSILLGLFCFILSLIAEATRSQVRMRGKDECTY
SGSGKTPLLCASAAFFVLAIAMVIEHTYLLIVVSKTTPPHVLYWDPNSPSVKTLVWQAGF
FFVSTWVSFAVGEILLLIGLSVESGHLRHWETPRESCLVLGQGLFSAAGVFGLLTVILAA
GLYVTALRAQQLLLHQESISRQILETSMPFASPPRSPRTIIRPVPNENPILRTDQSNIEH
DTTSLAQYLSDFDKYLHLV*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc01g060450.3.1

Transcript Infomation

transmembrane protein, putative (DUF1218) (AHRD V3.3 *** AT5G49320.1)

Sequence

ATAAATTAACCATACTTTCTTAATTTTAAATTTATCTCAAACCTTTGGGAGTTCTTCATC
GGTCATATATAAAATAAATGAGGATAGTTAATATTTTATGCTAAAACTATCGTATAATTG
AATTTCCTATCGTTTGTCTATCTCTTATCGAAAGTTCTCCTATATGCCCTATAGATTATA
ATCAGGCGATGGCCTTTTAAGGCTTCACTTTCTTTATTTACAAGTTCACACAGCTAATGT
TTTAGGATGCTAACATTTCATTCAATAAGTAGTAAGTATAAAATTCAAACCAATATCATC
TCAATAGACAAATATTTTCCACCAAAAGAAACGTGGAAAAGAGGTCAAGAGTTTCAAATG
TTTTTAAATTCAAAATTTTAATATTCATTATGACAAAGGACTAGATAAATTATTCCTTGA
GTGCAAAAGTTGGTAAAGAAACAAAAATAAGATGCCTCCTCGTGCTATATTTTTTTTTAT
ACATGTATATATTTTGGTCGACAAATGATAAAAAGTGATTCAAAATTTTGCACTAGTACT
TAATAAAGTCCTCCATTGTATAAAATATAATCAATCGTTTTGAAAGAAAGCTTCTTTACA
TTAAGCTAATATGTTATTTCCCTTTCTTAGATCAAGAATAAAAGGTTAATCTTTTAGGGT
ATATAGCTTTAACTAAGATGAATAAAGTTGGTATCACTTTTTTTTACTTTTTTTTGTATT
TAGATTAAGCTTAAAAAGCTTTGAACTATAACAACCTTATGTGTGAAAACTTAGATAGAA
AGAAGAAGAACAAAAGAATATTTGGCCTTTAAGCAACCTTTGTTCCAAGTAATTCTAAAA
CTCTTATCCTCTTTATGGGTAATTGTGAAATTAAAGTTGTATATATATTTTTTTGTAGAA
TTCAAATTTGTTTTCCTATTGTTGCACAATGGCTGTGACTCATGCTGATCTTGAACCAAG
TCGCCCTAGCACCAATTTAGGTAGCAAAATGGGTGCATTTCTTATGGTTTTGTCAATACT
TCTTGGCCTCTTTTGCTTCATTCTCTCCCTCATTGCTGAGGCTACGCGTTCTCAGGTGAG
AATGAGAGGTAAAGATGAATGCACATATAGTGGTAGTGGGAAGACACCTCTGTTGTGTGC
TAGTGCTGCATTTTTTGTTCTGGCTATTGCTATGGTGATTGAGCACACTTACTTGTTGAT
TGTTGTGAGCAAAACAACTCCTCCTCATGTACTTTATTGGGATCCTAATTCCCCATCTGT
CAAAACTCTTGTTTGGCAAGCCGGATTCTTCTTTGTTTCTACCTGGGTTTCATTTGCTGT
TGGGGAGATATTATTACTGATAGGGCTAAGTGTTGAGTCTGGACACCTAAGACACTGGGA
AACACCAAGAGAAAGTTGTTTAGTACTTGGACAGGGGTTATTCTCTGCTGCTGGAGTTTT
TGGCCTATTGACAGTTATCTTGGCTGCTGGTTTATACGTCACAGCTCTCCGTGCACAACA
ACTCTTACTTCATCAAGAAAGCATTAGTCGTCAAATCCTGGAAACCTCTATGCCTTTTGC
ATCTCCGCCAAGATCTCCTCGAACAATCATTAGACCTGTTCCTAATGAAAATCCCATTTT
AAGAACAGATCAGAGTAATATTGAACATGATACTACTTCACTAGCACAGTACTTATCTGA
CTTTGACAAGTACTTGCACTTGGTTTGAAGGAAACCACAACATATGAGTAAATTGTAAAT
GCATATACTATGTGTGATCTTGAATGTGTGGGCAGAAAATCTTGATTCCACTGCAATTCA
TCATGTAGCTGAGGAAAAAAAAACATATAGCGTGTGTTTTTTCTGTTTCCTAACAAGATT
GATTTGTATATAATTTTTACCAATCTTTTTTTGGTTTATGGACATAACTGTTTCTAAGTG
TAACTACTTCACATTCTTCATATTGATACCAAAAAACAGTTCTATGTAAGGGGGGCTTTC
ACTTTTATACGATTACTCGTTGTAGGTGTTTCTTAATATCCTGAAAGTAAGATACGATAC
CTACATAATGATAACTTGGTAATCATGTGAAGATATTTGTACAATGAATCCAATTTTCCA
TCACAGAATTGACTAATTACTACTATCTTCAACTTGAAACAAATATATATATATATATAC
CATGAGGCTTGAGCCAAATACAATGGTGTTACGGATATGCTTCACAGATAAAGGAGCAAA
AGACTTTTCACAGTTCTGGAACAAAAAAATGATAGGCAAAACCATGTTTATACAGTTACA
AGAACATCTTCTGGTTGATGAAAACTCGTATCTGCAACTATAGAATCAGCTTAACCAGTT
GGTGAATCAGCACATTGTTGCATTCTTTTCTTTTCACAAAAACTGTACAACTGCATCAAA
AAGCCTGAAATCGGAAGGAAAGGAATAAGAAAAAGATAAAACTGTTTTTTTTAAAAGAAC
TTCTTCATGTCTAAAAAGCAGCATTTTGTAAAGTTTGTATTCAGTATAAACAACTCAATT
GCAATGTAGTAGTATCAAATGAAAGTATAATAGTCATAATTTGGTTAAGAGTGTCGCCAG
TTAATAATAGTAATACGAATTATAACTAGTTTGCTTATCGACAAACGCAAGGCACTAGTT
ACTAATGAAGTTTTCTGGTGTCCTGGGATCATTCATTGGTAATATCATAATATCATTAAT
TCATTGGTAATATCATTAACAAGGAAACAATTACAGTAGTACTTATGAATACATCTTTTA
GCATCTTCAGAAAAAAATCTTACTGATTGAATGATTGTGTACCTGTCATAAAGCACCTCA
CAGTAGGATGGCTTCAAAATTATGCCCAACAGGTTTCATCAATTCGCAACCAAAAAAAAT
GCTCCAACT