Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g056520.3.1
CDS Infomation	ARM repeat superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT5G06120.6)
Sequence	ATGGAGAGCTTAGCGCACCTTGAAGCATTGTGTGAGAGGCTTTACAATTCACAGGATTCT GCTGAGCGAGCTCATGCAGAGAATACACTAAAATGCTTCTCAGTTAATAGCAGCTATATT TCGCAATGTCAGTATATTCTGGATAATGCATCAACTCCTTATGCATTGATGCTGGCTAGT TCAAGCTTATTGAAGCAAGTGACAGAACAGTACCTATCTTTGCAGACCCGGCTTGATATT CGCAACTATCTCATAAATTACCTGGCAACAAGAGGAATTGACCTGGAGCCTTTTGTAACT GCATCTTTGATTCAACTGTTTTGCCGAGTTACGAAGTATGGGTGGTTTGAGGATGACATT TTTAGAGAGGTGGTCAAAGAATCCACAAGATTTCTGAATCAGACAGAATCTCATTATGCA ACTGGTTTGAAGATATTGAATCAACTCGTGTCAGAGATGAATCAGCCCAGTCCTGGATTG CCATCAGCACAGCATCGTAGGGTGGCTTGCTCCTTCAGAGATCAATCGCTTCTTCAAGTA TTCCAAGTATCCTTGACATCAATGGCCCAACTGAAAAATGATGTAAAAGTTCCTAAGAAC GCGGCTAGCAGCAAACTACATGAACTGGCGCTTGCTCTGTCCCTGAAATGTTTATCATTC GACTTTATGGGAACAACGGTTGATGAAAGTTCTGATGATTTTAACACTATTCAGATCCCA TCTTCATGGAAGCAAGTCCTGGAGGATCAATCAACGGTGCAGATTTTTTTTGACTATTAT GAAATCAATAAGCCAAACATATCGAAGGAGGCTTTAGAGTGTTTAGTCCGTCTGGCTTCA GCGAGGAGATCTCTGTTTTCAAATGACACTTCTAGAGTGAAATACTTGGCACACCTGATG ACAGGAACCAAAGACATTATGCAAACTGGGAAAGGTCTGGCTTGTCATGATAATTATCAC GAGTTCTGTCGGCTTCTTGGACGTTTTAAAGTCAATTATCAGTTATCAGAGCTTGTGAAT GTGGAAAGTTATGGGGACTGGATACGCCTGGTTGCTGAATTTACTTTGCGATCTTTGCAG TCTTGGCAGTGGGCTAGCAGCAGCGTTTACTACCTTCTTGGGCTGTGGTCTAGATTGGTT TCGTCGGTTCCATATTTGAAGGGAGACACTCCAAGCCTGCTTAGTGATTTCGTGCCAGAG ATTGTCAAAAGTTTTATCACATCTCGATTTGGTTCCTTTCAGGGTGAAGTCTCTGATCTC TCAGAGAACCCCCTTGACAATGTTGAACTTCTTCAAGATCAGCTCGACTGCCTTCCTAAT CTTTGCAGATTTCAGTATGAAAGCTGTAGCTCATACATTATGCAGATTACTGATCCTCTG CTTCAGATGTATATGGAATCTGCTGATCCCCAGGTTCTTGCAGTGGTGGAAACAAAATTT GCTTGGATAGTTCACATTATTGCAGCTATTGTTAAGACTAAGCAGCTTAGTGGATACAGT GGTGAATCTCAAGAAATCCATGATGCAGAACTTTCAGCACGTGTACTGCGGCTGATAAAT GTTACTGATAGTGGCTTACGCAGTCAGCGATATGCAGAAACAACCAAACAACGCCTTGAT CTAGCTATTCTTGTGTTCTTCCAGAACTTCAGAAAGTCGTATGTTGGAGATCAGGCAATA CATTCATCAAAGCAACTATATACTAAATTGGCTGAGCTTCTTGGGCTCCATGATCATCTG CTTATATTGAATCTCATTGTTGGGAAGATAGCAACAAATCTTAAGTTTTACAGAGAGAGT GATGGAGTTATCAGTCAAACATTAAATCTCATGTTGGAAATGGCGTCTGGATATATGACT GCAAAACTTCTGGTAAAGTTGGATACCACTCAATTAATAATCTCCAATCAGAATAGGGAA GAATTCCCCTTTTTGGGGGACTACAGGTGCTCTCGTAGTAGAACTACCTTCTACTATATT ATTGGCTTGTTGATCTTCATGGAAGATAGTTTTTTGAAATTTAAAGCATCAATGGATCCA CTTCTGCAGGTCTTGCTCAGTTTGGAATTGATACCAGATGCCTTGTTTCACACTGATGAT GTTAAACAAGCATTAATTGGGTTGATGAGGGATCTTAGAGGAATTGCAATGGCTACAAGT AGCCGAAGGACATATGGTTTCCTATTTGATTGGTTATATCCAGCACATATTCCTCTTCTT CTCAAGGCCATAACAATATGGGCAGACACTCCAGAGGTGACAACACCATTACTTAAATTC GTAGCTGAGTTTGTGCTGAACAAGTCCCAGCGACTGACTTTTGAAACTTCATCTCCCTGT GGCATTCTTCTTTTTCGTGAAGTCAGCAAATTGATTGTTGCATATGGATCCAGAATTCTC TCTCTGCCTAATCATGTTGATATGTATCAGTTCAAATATAAGGGTGTTTGGATTTCCTTG ACAATTCTTTCAAGAGCACTTGCTGGTAACTACGTCAATTTTGGGGTGTTTGAGATTTAT GGAGACAGAGCGCTTGCAGATGCTTTTGACATAACTATGAGGATGACACTATCTATTCCT TTGGCAGATATACTCTCGTACAGAAAGCTTTCAGGAGCTTACTTCTCATTTCTGGAGATC ATGATGAAAAACCAGATCCAGTTGATACTTAACTTGGACTCAAGTAGCTTTACATTTATT GCTGGATCTCTTGAGTCTGGACTTAAAGTACTGGATGAAAATATCAAATCACAGTGTGCA TCTGCGGTGGACAACTTAGCTACATTTTATTTCGAACACATAACAACTGGAGAGTCACCT ACCACCCCTGTGGCGCTTAACCTGGCGCAGCATTTAGCAGACTGTCCAAACATATTTCTT GAAATATTGAAGACTGTGTTGGAGATTGTTTTATTTGAAGATTGTGGCAACCAGTGGAGC CTAAGTCGACCGATGCTGAGTATGATACTCATTAGCGAAGAGATGTTCTCAAACTTAAGA GCTCAGATTTTGTCTTCACAGCCAGCAGACCAACAACACCGTCTTTCACTGTGCTTTGAC AAACTTATGGCTGACATAACTCGAAGCTTGGATCAGAAGAACAGAGATAAGTTCTCCCAC AATCTGACTAGATTCAGGAATGAGTTCCGAACCAGATAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g056520.3.1
PEP Infomation	ARM repeat superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT5G06120.6)
Sequence	MESLAHLEALCERLYNSQDSAERAHAENTLKCFSVNSSYISQCQYILDNASTPYALMLAS SSLLKQVTEQYLSLQTRLDIRNYLINYLATRGIDLEPFVTASLIQLFCRVTKYGWFEDDI FREVVKESTRFLNQTESHYATGLKILNQLVSEMNQPSPGLPSAQHRRVACSFRDQSLLQV FQVSLTSMAQLKNDVKVPKNAASSKLHELALALSLKCLSFDFMGTTVDESSDDFNTIQIP SSWKQVLEDQSTVQIFFDYYEINKPNISKEALECLVRLASARRSLFSNDTSRVKYLAHLM TGTKDIMQTGKGLACHDNYHEFCRLLGRFKVNYQLSELVNVESYGDWIRLVAEFTLRSLQ SWQWASSSVYYLLGLWSRLVSSVPYLKGDTPSLLSDFVPEIVKSFITSRFGSFQGEVSDL SENPLDNVELLQDQLDCLPNLCRFQYESCSSYIMQITDPLLQMYMESADPQVLAVVETKF AWIVHIIAAIVKTKQLSGYSGESQEIHDAELSARVLRLINVTDSGLRSQRYAETTKQRLD LAILVFFQNFRKSYVGDQAIHSSKQLYTKLAELLGLHDHLLILNLIVGKIATNLKFYRES DGVISQTLNLMLEMASGYMTAKLLVKLDTTQLIISNQNREEFPFLGDYRCSRSRTTFYYI IGLLIFMEDSFLKFKASMDPLLQVLLSLELIPDALFHTDDVKQALIGLMRDLRGIAMATS SRRTYGFLFDWLYPAHIPLLLKAITIWADTPEVTTPLLKFVAEFVLNKSQRLTFETSSPC GILLFREVSKLIVAYGSRILSLPNHVDMYQFKYKGVWISLTILSRALAGNYVNFGVFEIY GDRALADAFDITMRMTLSIPLADILSYRKLSGAYFSFLEIMMKNQIQLILNLDSSSFTFI AGSLESGLKVLDENIKSQCASAVDNLATFYFEHITTGESPTTPVALNLAQHLADCPNIFL EILKTVLEIVLFEDCGNQWSLSRPMLSMILISEEMFSNLRAQILSSQPADQQHRLSLCFD KLMADITRSLDQKNRDKFSHNLTRFRNEFRTR*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g056520.3.1
Transcript Infomation	ARM repeat superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT5G06120.6)
Sequence	TCATTGAACTCTCTACACTTCCTTTTCCAAAAATATTGTCTCATACGTTTCCTACTTATT TCTTTCTCCGGCGACCTCCTAACGATTCCTTCCTCCGGCGATATCGACTTTGAGCAACAC TTTTGGTTAATCTACAGGAGCAAAGCTGACCTTGTTTTGGTTTTCATAGCAGTTCAATGG GCACTATCTGAATCATCCTTATATGTAGTGATAGTTGTAATGTAAAACAGTCAAAATACA AAGTTCCTGTAATCTATAACTTTGTTATATTTACTTGATCTGTGCAATTTTAAAGAAGTA TGATGACCTGAAATGGATTGAGGCCTTCCGTATCTCTTCTTTCCCTCTTGAATTTAGAAA TTATAACTGTTCATTGGTTATTTTAGAAAGAATTTGGCATCTTTAACTTGTGTTGTTTGA TTGACTGAGCTCTGAGAAATTGTCTTACTACTTCATCAAATGGAGAGCTTAGCGCACCTT GAAGCATTGTGTGAGAGGCTTTACAATTCACAGGATTCTGCTGAGCGAGCTCATGCAGAG AATACACTAAAATGCTTCTCAGTTAATAGCAGCTATATTTCGCAATGTCAGTATATTCTG GATAATGCATCAACTCCTTATGCATTGATGCTGGCTAGTTCAAGCTTATTGAAGCAAGTG ACAGAACAGTACCTATCTTTGCAGACCCGGCTTGATATTCGCAACTATCTCATAAATTAC CTGGCAACAAGAGGAATTGACCTGGAGCCTTTTGTAACTGCATCTTTGATTCAACTGTTT TGCCGAGTTACGAAGTATGGGTGGTTTGAGGATGACATTTTTAGAGAGGTGGTCAAAGAA TCCACAAGATTTCTGAATCAGACAGAATCTCATTATGCAACTGGTTTGAAGATATTGAAT CAACTCGTGTCAGAGATGAATCAGCCCAGTCCTGGATTGCCATCAGCACAGCATCGTAGG GTGGCTTGCTCCTTCAGAGATCAATCGCTTCTTCAAGTATTCCAAGTATCCTTGACATCA ATGGCCCAACTGAAAAATGATGTAAAAGTTCCTAAGAACGCGGCTAGCAGCAAACTACAT GAACTGGCGCTTGCTCTGTCCCTGAAATGTTTATCATTCGACTTTATGGGAACAACGGTT GATGAAAGTTCTGATGATTTTAACACTATTCAGATCCCATCTTCATGGAAGCAAGTCCTG GAGGATCAATCAACGGTGCAGATTTTTTTTGACTATTATGAAATCAATAAGCCAAACATA TCGAAGGAGGCTTTAGAGTGTTTAGTCCGTCTGGCTTCAGCGAGGAGATCTCTGTTTTCA AATGACACTTCTAGAGTGAAATACTTGGCACACCTGATGACAGGAACCAAAGACATTATG CAAACTGGGAAAGGTCTGGCTTGTCATGATAATTATCACGAGTTCTGTCGGCTTCTTGGA CGTTTTAAAGTCAATTATCAGTTATCAGAGCTTGTGAATGTGGAAAGTTATGGGGACTGG ATACGCCTGGTTGCTGAATTTACTTTGCGATCTTTGCAGTCTTGGCAGTGGGCTAGCAGC AGCGTTTACTACCTTCTTGGGCTGTGGTCTAGATTGGTTTCGTCGGTTCCATATTTGAAG GGAGACACTCCAAGCCTGCTTAGTGATTTCGTGCCAGAGATTGTCAAAAGTTTTATCACA TCTCGATTTGGTTCCTTTCAGGGTGAAGTCTCTGATCTCTCAGAGAACCCCCTTGACAAT GTTGAACTTCTTCAAGATCAGCTCGACTGCCTTCCTAATCTTTGCAGATTTCAGTATGAA AGCTGTAGCTCATACATTATGCAGATTACTGATCCTCTGCTTCAGATGTATATGGAATCT GCTGATCCCCAGGTTCTTGCAGTGGTGGAAACAAAATTTGCTTGGATAGTTCACATTATT GCAGCTATTGTTAAGACTAAGCAGCTTAGTGGATACAGTGGTGAATCTCAAGAAATCCAT GATGCAGAACTTTCAGCACGTGTACTGCGGCTGATAAATGTTACTGATAGTGGCTTACGC AGTCAGCGATATGCAGAAACAACCAAACAACGCCTTGATCTAGCTATTCTTGTGTTCTTC CAGAACTTCAGAAAGTCGTATGTTGGAGATCAGGCAATACATTCATCAAAGCAACTATAT ACTAAATTGGCTGAGCTTCTTGGGCTCCATGATCATCTGCTTATATTGAATCTCATTGTT GGGAAGATAGCAACAAATCTTAAGTTTTACAGAGAGAGTGATGGAGTTATCAGTCAAACA TTAAATCTCATGTTGGAAATGGCGTCTGGATATATGACTGCAAAACTTCTGGTAAAGTTG GATACCACTCAATTAATAATCTCCAATCAGAATAGGGAAGAATTCCCCTTTTTGGGGGAC TACAGGTGCTCTCGTAGTAGAACTACCTTCTACTATATTATTGGCTTGTTGATCTTCATG GAAGATAGTTTTTTGAAATTTAAAGCATCAATGGATCCACTTCTGCAGGTCTTGCTCAGT TTGGAATTGATACCAGATGCCTTGTTTCACACTGATGATGTTAAACAAGCATTAATTGGG TTGATGAGGGATCTTAGAGGAATTGCAATGGCTACAAGTAGCCGAAGGACATATGGTTTC CTATTTGATTGGTTATATCCAGCACATATTCCTCTTCTTCTCAAGGCCATAACAATATGG GCAGACACTCCAGAGGTGACAACACCATTACTTAAATTCGTAGCTGAGTTTGTGCTGAAC AAGTCCCAGCGACTGACTTTTGAAACTTCATCTCCCTGTGGCATTCTTCTTTTTCGTGAA GTCAGCAAATTGATTGTTGCATATGGATCCAGAATTCTCTCTCTGCCTAATCATGTTGAT ATGTATCAGTTCAAATATAAGGGTGTTTGGATTTCCTTGACAATTCTTTCAAGAGCACTT GCTGGTAACTACGTCAATTTTGGGGTGTTTGAGATTTATGGAGACAGAGCGCTTGCAGAT GCTTTTGACATAACTATGAGGATGACACTATCTATTCCTTTGGCAGATATACTCTCGTAC AGAAAGCTTTCAGGAGCTTACTTCTCATTTCTGGAGATCATGATGAAAAACCAGATCCAG TTGATACTTAACTTGGACTCAAGTAGCTTTACATTTATTGCTGGATCTCTTGAGTCTGGA CTTAAAGTACTGGATGAAAATATCAAATCACAGTGTGCATCTGCGGTGGACAACTTAGCT ACATTTTATTTCGAACACATAACAACTGGAGAGTCACCTACCACCCCTGTGGCGCTTAAC CTGGCGCAGCATTTAGCAGACTGTCCAAACATATTTCTTGAAATATTGAAGACTGTGTTG GAGATTGTTTTATTTGAAGATTGTGGCAACCAGTGGAGCCTAAGTCGACCGATGCTGAGT ATGATACTCATTAGCGAAGAGATGTTCTCAAACTTAAGAGCTCAGATTTTGTCTTCACAG CCAGCAGACCAACAACACCGTCTTTCACTGTGCTTTGACAAACTTATGGCTGACATAACT CGAAGCTTGGATCAGAAGAACAGAGATAAGTTCTCCCACAATCTGACTAGATTCAGGAAT GAGTTCCGAACCAGATAATCAGAGTGATATCAGCAAGTGGTGAATCCCTTTAAACATACA TACCAGCCTTCCCTGCGCCTACCCAAGCACATACAAAAAGAAAAGACGTAACAGGGGAAG GGAGAGCCAAGGAAAAACAAACATGAAAAATAATTTCAAGAAAAATGAAATAGTGAAGTT GGCTGAAGTTTTGTTCTCCCTTTGTTTTTCCCCAGCTGGTGAAATGCATTCTGTGAGGTG ATTCTGTCACTTTTTGCTAAATCCGTGCTGTAATTTTTATCACAACAGTGTACAGTCCAA CAACAGAAGATCTTTCTTTTTGCTATTAAGAATTTGTAGCATCTTGCTAGATTATAAGAA TCTATTGGTGTAATGGTATTGCCTATGCATTAGCTATAGAATAGTTTCATACTAATGAAG AGCCTGTTTTGCTCTTGAGCCTCTGCCCTAGCCGCTTGGACCTTCATCAAATTACTATGC AGGATTTTGGCTTGGGTGTTTTATTTTGCCATACTTTGGGCAATCAAATTCCTTTTATTA TTTGGTTTGTCACTGAAGAATCTTCCTATGGTCCACATTTGCCACTTTGATTGTAACAGG GCACGTATAGCCTGCATACTCGCAAGGAAAATCCTTTAAACTAGGAAATGACTTGAACAG TAAAGAATGATCTGACATGATTTCGAAATATAAATGCCGAAAAAATAGAAACATCAGTTT GAACACAAAAATCCATAGTATGCGAAGGACACAAAATCAATGGTGCAACTCTGATATAAT GTTTGTCTGATACGATTGTCTGACCATAACTTGGATATAGATGAATAGATATATTGTATT GATATTATAAATCAATATGGATTTATATATAAATCG