Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g009280.3.1
CDS Infomation	Serine/threonine-protein phosphatase (AHRD V3.3 *** G8Z292_SOLLC)
Sequence	ATGGACTTAGATTCTTCAATGGCGTCAGAAGCCGATCAGGATCCAGTTCAGAATAACGGG CCAACATTGGTGAACAAGTCATCAAACGCCGGAGAATCGGCTCCGGTTGAGACTCCTAAT GCTACTCCGGTGGCTGGGCCGAGGTGTGCTCCGACTTATACGGTGGTGCAGTCTGTTATA GAGAAGAAGGAAGATGGTCCCGGCCCTAGGTGTGGACATACACTAACAGCGGTTCCAGCT GTTGGAGAGGAGGGAAGTCCGAATTATATTGGTCCTAGGTTGATTCTCTTTGGTGGTGCT ACTGCGCTTGAGGGGAATTCTGCTGCTGCAGCAGCTCCTTCTTCTCCTGGAGGTGCTGGA ATTCGCTTAGCAGGAGCTACTGCAGATGTGCACTCTTATGATGTTCTGACAAATAAATGG TCTAGGATCACACCAATTGGAGAGCCACCGACGCCGAGGGCTGCTCATGTTGCTACAGCT GTTGGAACTATGGTTGTCATTCAGGGTGGAATTGGTCCAGCTGGTTTGTCAGCTGAGGAT CTTCACGTTCTGGACCTTACACAACAACATCGACCAAGATGGCACAGGGTTGTGGTCCAA GGACCTGGTCCAGGGCCTCGTTATGGACATGTCATGGCTTTGGTAGGGCAAAGATATCTT ATGGCAATTGGTGGAAATGATGGAAAACGACCTCTAGCAGATGTTTGGGCTTTGGACACT GCTGCAAAACCATATGAATGGCGAAAATTGGAACCAGAGGGTGAAGGCCCTCCTCCTTGC ATGTACGCAACTGCAAGTGCACGCTCTGATGGTCTTCTTCTGCTTTGTGGAGGGCGGGAT GCCAATAGTGTGCCACTTGCAAGTGCATATGGACTGGCCAAACATAGAGATGGGCGGTGG GAATGGGCCATTGCTCCTGGTGTGTCACCATCTCCTAGATATCAGCATGCCGCAGTATTT GTAAATGCTCGGCTCCATGTTTCTGGAGGGGCTCTTGGTGGTGGACGCATGGTAGAAGAC TCTTCCAGTATAGCCGTTCTTGATACTGCTGCAGGAGTGTGGTGTGACATAAAATCTGTT GTCACCAGTCCTAGGACAGGTAGATACAGTGCAGATGCGGCTGGGGGAGATGCCGCAGTT GAATTGACCAGGCGTTGTCGGCATGCGGCTGCTGCTGTTGGTGACTTGGTATATATGTAT GGTGGTTTACGTGGAGGGGTACTGCTAGATGACTTGCTTGTCGCGGAAGACTTGGCTGCT GCTGAAACAACTAGTGCAGCTTCACATGCAGCCGCTGCAGCTGCAGCATCTAATGTTCAA GATGGAAGGATTACCGGAAGGTATGGATTTGGTGATGAAAGAACAAGGCAAACCATTCCA GAGGAAGTTAATGATGGTTCTGTTATATTGGGAAGTCCTGTTGCCCCTCCTGTAAATGGT GATATGTTTACTGATATAAGCACTGAAAATGCCATGCTACAAGGATGTCGGAAACTTGGC AAAGGTGTTGAATACCTTGTGGAGGCCTCTGCAGCAGAAGCAGAGGCCATTACTGCTGCA CTAGCAGCTGCCAAAGCTCGACAACAAGGTAATGGTGAAGTTGAACTTCCAGATAGGGAT CGGGGAGCTGAGGCAACACCTAGTGGTGAAGAGGAACCTGCCTTGATCAAACCTGATTCA AATAATTCTACCCCAACTGGAGTTAGGCTGCATCACCGTGCTGTGGTTGTAGCTGCAGAG ACTGGGGGTGCCCTAGGTGGCATGGTGCGACAACTTTCAATTGATCAATTTGAAAATGAA GGCAGGCGAGTAAGTTATGGAACCCCAGAAAATGCAACAGCAGCGAGAAAACTTTTGGAT AGGCAAATGTCCGTTAACAGTGTTCCCAAAAAGGTGATTGCCCATCTTCTGAAACCTCGA GGTTGGAAGCCGCCTGTCAGACGGCAATTTTTCTTGGATTGCAATGAAATAGCTGATCTT TGTGATAGTGCAGAGAGAATATTTTCCAGTGAACCTAGTGTTTTACAGCTAAGAGCTCCT ATTAAGATATTTGGTGACTTGCATGGGCAATTTGGGGATCTGATGCGTCTTTTTGATGAG TATGGTTCCCCATCAACTGCTGGAGACATAGCGTATATCGATTATCTCTTCTTAGGAGAT TATGTTGATAGGGGCCAGCACAGCTTGGAGACCATGACTCTTCTCCTTGCTTTAAAGGTT GAGCATCCCCACAACGTTCATTTAATTCGAGGGAATCATGAAGCGGCAGATATAAATGCA CTTTTCGGCTTTCGAATTGAGTGCATTGAACGCATGGGTGAGAGAGATGGAATCTGGGCT TGGCATCGGATTAACAGGTTGTTCAATTGGCTTCCTCTCGCAGCATTAATTGAGAAAAAA ATAATCTGTATGCACGGTGGCATTGGAAGGTCGATCAATCATGTAGAACAGATAGAGAAT ATCCAGCGTCCTATCACCATGGAAGCAGGGTCGATTATTCTGATGGATTTGTTGTGGTCT GATCCAACGGAAAATGATAGCGTTGAAGGGTTAAGACCAAATGCAAGAGGTCCAGGGCTG GTTACTTTTGGGCCTGATCGTGTGATGGAATTTTGCAACAACAATGATCTTCAACTGATA GTGCGAGCGCACGAATGTGTGATGGATGGCTTTGAACGATTTGCTCAGGGACATTTAATT ACACTATTTTCAGCCACCAATTATTGTGGTACTGCTAATAATGCTGGCGCAATCTTGGTA TTGGGTAGAGATCTTGTAGTTGTTCCAAAACTTATTCACCCATTGCCACCAGCACTTTCA TCACCCGAAAATTCACCTGAGCGTATGGAAGACACTTGGATGCAGGAGCTAAATGCTAAC AGACCACCTACGCCAACTAGAGGTCGTCCTCAAACTGCCAATGATCGAGGTTCTCTTGCT TGGATTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g009280.3.1
PEP Infomation	Serine/threonine-protein phosphatase (AHRD V3.3 *** G8Z292_SOLLC)
Sequence	MDLDSSMASEADQDPVQNNGPTLVNKSSNAGESAPVETPNATPVAGPRCAPTYTVVQSVI EKKEDGPGPRCGHTLTAVPAVGEEGSPNYIGPRLILFGGATALEGNSAAAAAPSSPGGAG IRLAGATADVHSYDVLTNKWSRITPIGEPPTPRAAHVATAVGTMVVIQGGIGPAGLSAED LHVLDLTQQHRPRWHRVVVQGPGPGPRYGHVMALVGQRYLMAIGGNDGKRPLADVWALDT AAKPYEWRKLEPEGEGPPPCMYATASARSDGLLLLCGGRDANSVPLASAYGLAKHRDGRW EWAIAPGVSPSPRYQHAAVFVNARLHVSGGALGGGRMVEDSSSIAVLDTAAGVWCDIKSV VTSPRTGRYSADAAGGDAAVELTRRCRHAAAAVGDLVYMYGGLRGGVLLDDLLVAEDLAA AETTSAASHAAAAAAASNVQDGRITGRYGFGDERTRQTIPEEVNDGSVILGSPVAPPVNG DMFTDISTENAMLQGCRKLGKGVEYLVEASAAEAEAITAALAAAKARQQGNGEVELPDRD RGAEATPSGEEEPALIKPDSNNSTPTGVRLHHRAVVVAAETGGALGGMVRQLSIDQFENE GRRVSYGTPENATAARKLLDRQMSVNSVPKKVIAHLLKPRGWKPPVRRQFFLDCNEIADL CDSAERIFSSEPSVLQLRAPIKIFGDLHGQFGDLMRLFDEYGSPSTAGDIAYIDYLFLGD YVDRGQHSLETMTLLLALKVEHPHNVHLIRGNHEAADINALFGFRIECIERMGERDGIWA WHRINRLFNWLPLAALIEKKIICMHGGIGRSINHVEQIENIQRPITMEAGSIILMDLLWS DPTENDSVEGLRPNARGPGLVTFGPDRVMEFCNNNDLQLIVRAHECVMDGFERFAQGHLI TLFSATNYCGTANNAGAILVLGRDLVVVPKLIHPLPPALSSPENSPERMEDTWMQELNAN RPPTPTRGRPQTANDRGSLAWI*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g009280.3.1
Transcript Infomation	Serine/threonine-protein phosphatase (AHRD V3.3 *** G8Z292_SOLLC)
Sequence	GTATCGAATTGAATTTTCAGATATGGACTTAGATTCTTCAATGGCGTCAGAAGCCGATCA GGATCCAGTTCAGAATAACGGGCCAACATTGGTGAACAAGTCATCAAACGCCGGAGAATC GGCTCCGGTTGAGACTCCTAATGCTACTCCGGTGGCTGGGCCGAGGTGTGCTCCGACTTA TACGGTGGTGCAGTCTGTTATAGAGAAGAAGGAAGATGGTCCCGGCCCTAGGTGTGGACA TACACTAACAGCGGTTCCAGCTGTTGGAGAGGAGGGAAGTCCGAATTATATTGGTCCTAG GTTGATTCTCTTTGGTGGTGCTACTGCGCTTGAGGGGAATTCTGCTGCTGCAGCAGCTCC TTCTTCTCCTGGAGGTGCTGGAATTCGCTTAGCAGGAGCTACTGCAGATGTGCACTCTTA TGATGTTCTGACAAATAAATGGTCTAGGATCACACCAATTGGAGAGCCACCGACGCCGAG GGCTGCTCATGTTGCTACAGCTGTTGGAACTATGGTTGTCATTCAGGGTGGAATTGGTCC AGCTGGTTTGTCAGCTGAGGATCTTCACGTTCTGGACCTTACACAACAACATCGACCAAG ATGGCACAGGGTTGTGGTCCAAGGACCTGGTCCAGGGCCTCGTTATGGACATGTCATGGC TTTGGTAGGGCAAAGATATCTTATGGCAATTGGTGGAAATGATGGAAAACGACCTCTAGC AGATGTTTGGGCTTTGGACACTGCTGCAAAACCATATGAATGGCGAAAATTGGAACCAGA GGGTGAAGGCCCTCCTCCTTGCATGTACGCAACTGCAAGTGCACGCTCTGATGGTCTTCT TCTGCTTTGTGGAGGGCGGGATGCCAATAGTGTGCCACTTGCAAGTGCATATGGACTGGC CAAACATAGAGATGGGCGGTGGGAATGGGCCATTGCTCCTGGTGTGTCACCATCTCCTAG ATATCAGCATGCCGCAGTATTTGTAAATGCTCGGCTCCATGTTTCTGGAGGGGCTCTTGG TGGTGGACGCATGGTAGAAGACTCTTCCAGTATAGCCGTTCTTGATACTGCTGCAGGAGT GTGGTGTGACATAAAATCTGTTGTCACCAGTCCTAGGACAGGTAGATACAGTGCAGATGC GGCTGGGGGAGATGCCGCAGTTGAATTGACCAGGCGTTGTCGGCATGCGGCTGCTGCTGT TGGTGACTTGGTATATATGTATGGTGGTTTACGTGGAGGGGTACTGCTAGATGACTTGCT TGTCGCGGAAGACTTGGCTGCTGCTGAAACAACTAGTGCAGCTTCACATGCAGCCGCTGC AGCTGCAGCATCTAATGTTCAAGATGGAAGGATTACCGGAAGGTATGGATTTGGTGATGA AAGAACAAGGCAAACCATTCCAGAGGAAGTTAATGATGGTTCTGTTATATTGGGAAGTCC TGTTGCCCCTCCTGTAAATGGTGATATGTTTACTGATATAAGCACTGAAAATGCCATGCT ACAAGGATGTCGGAAACTTGGCAAAGGTGTTGAATACCTTGTGGAGGCCTCTGCAGCAGA AGCAGAGGCCATTACTGCTGCACTAGCAGCTGCCAAAGCTCGACAACAAGGTAATGGTGA AGTTGAACTTCCAGATAGGGATCGGGGAGCTGAGGCAACACCTAGTGGTGAAGAGGAACC TGCCTTGATCAAACCTGATTCAAATAATTCTACCCCAACTGGAGTTAGGCTGCATCACCG TGCTGTGGTTGTAGCTGCAGAGACTGGGGGTGCCCTAGGTGGCATGGTGCGACAACTTTC AATTGATCAATTTGAAAATGAAGGCAGGCGAGTAAGTTATGGAACCCCAGAAAATGCAAC AGCAGCGAGAAAACTTTTGGATAGGCAAATGTCCGTTAACAGTGTTCCCAAAAAGGTGAT TGCCCATCTTCTGAAACCTCGAGGTTGGAAGCCGCCTGTCAGACGGCAATTTTTCTTGGA TTGCAATGAAATAGCTGATCTTTGTGATAGTGCAGAGAGAATATTTTCCAGTGAACCTAG TGTTTTACAGCTAAGAGCTCCTATTAAGATATTTGGTGACTTGCATGGGCAATTTGGGGA TCTGATGCGTCTTTTTGATGAGTATGGTTCCCCATCAACTGCTGGAGACATAGCGTATAT CGATTATCTCTTCTTAGGAGATTATGTTGATAGGGGCCAGCACAGCTTGGAGACCATGAC TCTTCTCCTTGCTTTAAAGGTTGAGCATCCCCACAACGTTCATTTAATTCGAGGGAATCA TGAAGCGGCAGATATAAATGCACTTTTCGGCTTTCGAATTGAGTGCATTGAACGCATGGG TGAGAGAGATGGAATCTGGGCTTGGCATCGGATTAACAGGTTGTTCAATTGGCTTCCTCT CGCAGCATTAATTGAGAAAAAAATAATCTGTATGCACGGTGGCATTGGAAGGTCGATCAA TCATGTAGAACAGATAGAGAATATCCAGCGTCCTATCACCATGGAAGCAGGGTCGATTAT TCTGATGGATTTGTTGTGGTCTGATCCAACGGAAAATGATAGCGTTGAAGGGTTAAGACC AAATGCAAGAGGTCCAGGGCTGGTTACTTTTGGGCCTGATCGTGTGATGGAATTTTGCAA CAACAATGATCTTCAACTGATAGTGCGAGCGCACGAATGTGTGATGGATGGCTTTGAACG ATTTGCTCAGGGACATTTAATTACACTATTTTCAGCCACCAATTATTGTGGTACTGCTAA TAATGCTGGCGCAATCTTGGTATTGGGTAGAGATCTTGTAGTTGTTCCAAAACTTATTCA CCCATTGCCACCAGCACTTTCATCACCCGAAAATTCACCTGAGCGTATGGAAGACACTTG GATGCAGGAGCTAAATGCTAACAGACCACCTACGCCAACTAGAGGTCGTCCTCAAACTGC CAATGATCGAGGTTCTCTTGCTTGGATTTAGATAGTAGTGAAGATTGTTCCCTGCACTTC AGGCTCCTGCTAACATCGAGGAATTCCAGTTGTATGTACAGCATGATGCCATTTCGAAAA ATGGCGGAGTTATAGATATCTTGTAGAGATATGAGGCTTCGAGACCCTAGGGATCTTCAA CAGAAAGGACAGGCTTCAGACAGAGCAAGATTGAAACTTTCCCAGGTTGCAGATGCACCT GTTCAACTTGATTGAAGCAGTTGAGGGTTTCGAGTTGGGGCCTTTGTAAATTAAGCCACA GGCAAGTAGAAGGAATTAGAGTCTTCTTCGTTATCAAGGGCTTGTAGTGCTGGATTTTTG TTTTGTTTATTGTACTTTCTCAGCGTTGTTGATATATATATTTTTCTTCTTTTTAGGTGT ATTATTTTTGTCTATGGTAAAAGAGGACTTGAGGTCCCATATATATATATATTATTGATG AAATATATATAGTCCTGAAATCTCTGTTGGGAGTTCTTGTATCATAGATAGGGGGTGTTA AATTTGTGTAATTTGTGATGATACCTTGTACAATGTAACAATTTGAAGAAGAAAAGAAGC TTTCTCTGACAAGAAAATGAGCAATGGCTGATTATTT