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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc01g007850.2.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat superfamily protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A061F6E7_THECC)

Sequence

ATGGAACTCGATTTTCTCTCAGTACATATGCGTAATCCACCGTTTATTAGAGGTATTTTT
TCAAGTTTTTATCATATGCCTAGAACTCGTTTGATAATATGTCCCAATGAACCTCAACTA
GGTAAAGTTCCATTCTTTACATCTATTCGTAGCTGTTTCTCATTTACTGCTGTAGTACAA
GTAGTAGAAACCCCAACAGTTGAAAAAGAAACAATCTTTCAAGATTCTGATGGGGGTAGG
AGGTTGAGTACTAAACAGTTGAAATATGGTGCTAAGAAGAGGTTAGTTGAAAAAAAAACA
ATCTTTCAAGATTCTGATGGGGGTAGGAGGTTGAGTGCTAAAGAGTTGAAATATGGTGTT
GAGAAGGGGTTAGTTGAAAAGGGCGATGGTGGGTTTTTGATTAAGGAGAAGAAAAGGGGG
ATTAAATGGTATTCTGAAATGTTTAAAGATTATGCTGGTAAGTTATGTTTGAAGGAAGGT
AAAGCTTTACATGGTGAAATGATAAGGAGTGGGGTTGAACCAGATTCATATTTATGGGTT
TCTTTGATTAATTTCTATTCGAAATGTGGGGATTTAGTTTTCGCGGAGAATGTGTTTGAT
TTAATTCCAAGCAGAGATGTTGTGTCGTGGACAGCGTTGATAGCAGGGTTTATAGCTCAA
GGTTATGGAAGTAAAGGGATTTGTTTATTCTGTGATATGAAGGGAGAAGATATTAGGCCT
AATGAGTTCACTTTGGCAACAGTTTTAAAGGGTTGTTCAATGTGTTTAGATTTGGAGTTT
GGGAAACAACTACATGCTGTAGTTGTTAAAGGTGCAGCCTTTTCAGATGTTTATGTTGGT
TCTGCTCTTGTTGATTTGTATGCTAAATGTTGTGAATTAGAATCGGCTGTTAAAGTTTTC
TTTTCCATGCCGGAGCAGAATTCAGTATCGTGGAATGTTTTACTTAATGGGTATGTGCAG
GCTGGTCAAGGAGAGGAGGCTCTAAAATTGTTTTTGAAGATGTCGGATTCAGAGATGAGG
TTTAGTAATTATACCCTATCTACCATTTTAAAGGGTTGTGCGAATTCAGTTAATCTGAAA
GCTGGTCAAGTTATCCACTCAATGTTGGTCAAAATTGGGTCTGAAATCGATGATTTTACA
AGCTGTAGTCTTCTAGATATGTATAACAAATGTGGTCTTCAAGATGATGCCCTGAAAGTG
TTTTTAAGGACCAAAAATCATGACATTGTGGCATGGACTGCAATGATCAGCGGACTCGAT
CAGCAAGGACAGAAGAGAGAAGCTATTCATCTTTTTTGCTTGATGATGCATTCAGGTTTG
AGGCCTAATCAATTTACGCTGGCTAGTGTTGTTAGTGCAGCGGCTGATTCGGTGGATATA
AGGTGTTGCAAAAGTATTCATGCTTGTGTTTACAAATTTGGTTTTGACTCAGAAGAGTGT
GTCTGTAATGCATTGATTGCAATGTACATGAAATTTGGTTCAGTTTTGGATGGGTATCGT
ATATTTTCTTCTTTGAGTAATAGGGATATAATTTCGTGGAACTCACTTTTGTCTGGATTC
CACGATAATGAAACTTCTTATGAAGGGCCTAAAATCTTCAGGCAGTTGCTTGTTGAAGGT
TTGAAGCCAAATATTTACACGCTCATCAGCAATTTGAGATCTTGTGCAAGCCTCTTAGAT
GCCAGTCTAGGGAAACAAGTGCATGCCCATGTAGTTAAAGCTGACCTTGGTGGCAATATA
TATGTAGGAACTGCTCTGGTTGATATGTATGCCAAGTGTGGGCAGTTGGATGATGCAGAA
TTGATCTTTTATAGATTGAGTGAAAAAGACGTCTTCACTTGGACAGTGGTCATTTCAGGT
TATGCGCAGTCTGATCAAGGAGAAAAGGCTTTCCGATGCTTCAATCAGATGCAAAGGGAA
GCTATTAAACCCAATGAGTTCACTCTTGCTAGCTGTCTAAAAGGTTGTTCACGTATAGCC
AGCCTAGACAATGGGCGGCAGTTGCATTCCGTGGTAATGAAGTCTGGGCAGTTCAGTGAT
ATGTATGTAGCTAGTGCGTTGATTGACATGTATGCAAAATCTGGGTGTATCAAAGATGCC
GAGTCTCTATTTCAGAGCATGGAATCTAGTGATACAGTGTTGTGGAACACAATTATATAT
GCCTACTCCCAACATGGACTAGATGAAGAAGCATTGAAAACATTTAGAACCATGTTAAGT
GAAGGTATTCCGCCTGATGGGATTACGTTTATTGCTGTCCTCTCTGCATGCAGCCATCTG
GGCCTGGTCAAAGAAGGAAGAAGGCATTTTGACTCAATAAAAAATGGTTTTGGTATCACT
CCTTCAATAGAACATTATGCTTGTATGGTTGATATCCTTGGCCGTGCAGGCAAATTTACT
GAAATGGAACACTTCATTGAGGGTATGGCGCTTGCTCCTGATGCCTTGATATGGGAGACT
GTTCTTGGAGTCTGCAAGGCTCATGGGAATGTGGAATTGGCTGAGAAAGCTGCAAACACA
CTTTTCGAAATTGATCCAAAAGCAGAGTCAAGTTATATATTGTTGTCCAATATATATGCA
TCAAAGGGTAGATGGGCTGATGTTTCGACGGTTAGAGCACTAATGTCCAGGCAGGGTGTC
AAAAAGGAACCTGGTTGTAGCTGGATTGAGATTGATAATCAAGTTCATGTCTTCTTATCT
CAGGATGCTTCACATCCTAGGTTAAAGGATATCCATAAAAAGTTGGAGGAGCTGACTTCG
AGAATTACTGCCGCAGGATATATTCCAAACACAAACTATGTGCTTCATAATGTCTCTGAC
AAAGAAAAGATAGACAACCTTTCACATCATAGTGAAAGGCTAGCTCTTGCATTTGCTCTC
ATGAGCAGCAGTAGGAACAGCACTATCAGGATCTTTAAAAATCTTTGCATCTGTGGAGAT
TGCCATGAATTTATGAAGCTGGCGTCAATTGTTACAAACCGAGAAATAGTTATTCGTGAT
ATTAACCGCTTCCACCATTTCTCTCACGGAACATGCTCATGTAAGGACTATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc01g007850.2.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat superfamily protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A061F6E7_THECC)

Sequence

MELDFLSVHMRNPPFIRGIFSSFYHMPRTRLIICPNEPQLGKVPFFTSIRSCFSFTAVVQ
VVETPTVEKETIFQDSDGGRRLSTKQLKYGAKKRLVEKKTIFQDSDGGRRLSAKELKYGV
EKGLVEKGDGGFLIKEKKRGIKWYSEMFKDYAGKLCLKEGKALHGEMIRSGVEPDSYLWV
SLINFYSKCGDLVFAENVFDLIPSRDVVSWTALIAGFIAQGYGSKGICLFCDMKGEDIRP
NEFTLATVLKGCSMCLDLEFGKQLHAVVVKGAAFSDVYVGSALVDLYAKCCELESAVKVF
FSMPEQNSVSWNVLLNGYVQAGQGEEALKLFLKMSDSEMRFSNYTLSTILKGCANSVNLK
AGQVIHSMLVKIGSEIDDFTSCSLLDMYNKCGLQDDALKVFLRTKNHDIVAWTAMISGLD
QQGQKREAIHLFCLMMHSGLRPNQFTLASVVSAAADSVDIRCCKSIHACVYKFGFDSEEC
VCNALIAMYMKFGSVLDGYRIFSSLSNRDIISWNSLLSGFHDNETSYEGPKIFRQLLVEG
LKPNIYTLISNLRSCASLLDASLGKQVHAHVVKADLGGNIYVGTALVDMYAKCGQLDDAE
LIFYRLSEKDVFTWTVVISGYAQSDQGEKAFRCFNQMQREAIKPNEFTLASCLKGCSRIA
SLDNGRQLHSVVMKSGQFSDMYVASALIDMYAKSGCIKDAESLFQSMESSDTVLWNTIIY
AYSQHGLDEEALKTFRTMLSEGIPPDGITFIAVLSACSHLGLVKEGRRHFDSIKNGFGIT
PSIEHYACMVDILGRAGKFTEMEHFIEGMALAPDALIWETVLGVCKAHGNVELAEKAANT
LFEIDPKAESSYILLSNIYASKGRWADVSTVRALMSRQGVKKEPGCSWIEIDNQVHVFLS
QDASHPRLKDIHKKLEELTSRITAAGYIPNTNYVLHNVSDKEKIDNLSHHSERLALAFAL
MSSSRNSTIRIFKNLCICGDCHEFMKLASIVTNREIVIRDINRFHHFSHGTCSCKDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc01g007850.2.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat superfamily protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A061F6E7_THECC)

Sequence

ATGGAACTCGATTTTCTCTCAGTACATATGCGTAATCCACCGTTTATTAGAGGTATTTTT
TCAAGTTTTTATCATATGCCTAGAACTCGTTTGATAATATGTCCCAATGAACCTCAACTA
GGTAAAGTTCCATTCTTTACATCTATTCGTAGCTGTTTCTCATTTACTGCTGTAGTACAA
GTAGTAGAAACCCCAACAGTTGAAAAAGAAACAATCTTTCAAGATTCTGATGGGGGTAGG
AGGTTGAGTACTAAACAGTTGAAATATGGTGCTAAGAAGAGGTTAGTTGAAAAAAAAACA
ATCTTTCAAGATTCTGATGGGGGTAGGAGGTTGAGTGCTAAAGAGTTGAAATATGGTGTT
GAGAAGGGGTTAGTTGAAAAGGGCGATGGTGGGTTTTTGATTAAGGAGAAGAAAAGGGGG
ATTAAATGGTATTCTGAAATGTTTAAAGATTATGCTGGTAAGTTATGTTTGAAGGAAGGT
AAAGCTTTACATGGTGAAATGATAAGGAGTGGGGTTGAACCAGATTCATATTTATGGGTT
TCTTTGATTAATTTCTATTCGAAATGTGGGGATTTAGTTTTCGCGGAGAATGTGTTTGAT
TTAATTCCAAGCAGAGATGTTGTGTCGTGGACAGCGTTGATAGCAGGGTTTATAGCTCAA
GGTTATGGAAGTAAAGGGATTTGTTTATTCTGTGATATGAAGGGAGAAGATATTAGGCCT
AATGAGTTCACTTTGGCAACAGTTTTAAAGGGTTGTTCAATGTGTTTAGATTTGGAGTTT
GGGAAACAACTACATGCTGTAGTTGTTAAAGGTGCAGCCTTTTCAGATGTTTATGTTGGT
TCTGCTCTTGTTGATTTGTATGCTAAATGTTGTGAATTAGAATCGGCTGTTAAAGTTTTC
TTTTCCATGCCGGAGCAGAATTCAGTATCGTGGAATGTTTTACTTAATGGGTATGTGCAG
GCTGGTCAAGGAGAGGAGGCTCTAAAATTGTTTTTGAAGATGTCGGATTCAGAGATGAGG
TTTAGTAATTATACCCTATCTACCATTTTAAAGGGTTGTGCGAATTCAGTTAATCTGAAA
GCTGGTCAAGTTATCCACTCAATGTTGGTCAAAATTGGGTCTGAAATCGATGATTTTACA
AGCTGTAGTCTTCTAGATATGTATAACAAATGTGGTCTTCAAGATGATGCCCTGAAAGTG
TTTTTAAGGACCAAAAATCATGACATTGTGGCATGGACTGCAATGATCAGCGGACTCGAT
CAGCAAGGACAGAAGAGAGAAGCTATTCATCTTTTTTGCTTGATGATGCATTCAGGTTTG
AGGCCTAATCAATTTACGCTGGCTAGTGTTGTTAGTGCAGCGGCTGATTCGGTGGATATA
AGGTGTTGCAAAAGTATTCATGCTTGTGTTTACAAATTTGGTTTTGACTCAGAAGAGTGT
GTCTGTAATGCATTGATTGCAATGTACATGAAATTTGGTTCAGTTTTGGATGGGTATCGT
ATATTTTCTTCTTTGAGTAATAGGGATATAATTTCGTGGAACTCACTTTTGTCTGGATTC
CACGATAATGAAACTTCTTATGAAGGGCCTAAAATCTTCAGGCAGTTGCTTGTTGAAGGT
TTGAAGCCAAATATTTACACGCTCATCAGCAATTTGAGATCTTGTGCAAGCCTCTTAGAT
GCCAGTCTAGGGAAACAAGTGCATGCCCATGTAGTTAAAGCTGACCTTGGTGGCAATATA
TATGTAGGAACTGCTCTGGTTGATATGTATGCCAAGTGTGGGCAGTTGGATGATGCAGAA
TTGATCTTTTATAGATTGAGTGAAAAAGACGTCTTCACTTGGACAGTGGTCATTTCAGGT
TATGCGCAGTCTGATCAAGGAGAAAAGGCTTTCCGATGCTTCAATCAGATGCAAAGGGAA
GCTATTAAACCCAATGAGTTCACTCTTGCTAGCTGTCTAAAAGGTTGTTCACGTATAGCC
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ATGTATGTAGCTAGTGCGTTGATTGACATGTATGCAAAATCTGGGTGTATCAAAGATGCC
GAGTCTCTATTTCAGAGCATGGAATCTAGTGATACAGTGTTGTGGAACACAATTATATAT
GCCTACTCCCAACATGGACTAGATGAAGAAGCATTGAAAACATTTAGAACCATGTTAAGT
GAAGGTATTCCGCCTGATGGGATTACGTTTATTGCTGTCCTCTCTGCATGCAGCCATCTG
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CCTTCAATAGAACATTATGCTTGTATGGTTGATATCCTTGGCCGTGCAGGCAAATTTACT
GAAATGGAACACTTCATTGAGGGTATGGCGCTTGCTCCTGATGCCTTGATATGGGAGACT
GTTCTTGGAGTCTGCAAGGCTCATGGGAATGTGGAATTGGCTGAGAAAGCTGCAAACACA
CTTTTCGAAATTGATCCAAAAGCAGAGTCAAGTTATATATTGTTGTCCAATATATATGCA
TCAAAGGGTAGATGGGCTGATGTTTCGACGGTTAGAGCACTAATGTCCAGGCAGGGTGTC
AAAAAGGAACCTGGTTGTAGCTGGATTGAGATTGATAATCAAGTTCATGTCTTCTTATCT
CAGGATGCTTCACATCCTAGGTTAAAGGATATCCATAAAAAGTTGGAGGAGCTGACTTCG
AGAATTACTGCCGCAGGATATATTCCAAACACAAACTATGTGCTTCATAATGTCTCTGAC
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ATGAGCAGCAGTAGGAACAGCACTATCAGGATCTTTAAAAATCTTTGCATCTGTGGAGAT
TGCCATGAATTTATGAAGCTGGCGTCAATTGTTACAAACCGAGAAATAGTTATTCGTGAT
ATTAACCGCTTCCACCATTTCTCTCACGGAACATGCTCATGTAAGGACTATTGGTGATTA
TTGACTGGCTGACCTAGTCAGGCAAGACTATTCATGTTCCGCAGCTGCTACAAGTCAATA
GTGCTCAACTGAAGTTCT