Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g006290.3.1
CDS Infomation	Peroxidase (AHRD V3.3 *** K4ASJ5_SOLLC)
Sequence	ATGTCTTTTTTAAGATTTATTTTAGCAATTTTCTTCTTGGTTTCAATTAATTTTGGAGTA TCAAATGCTCATTATAAATTAACTCCTACATTTTATGATTGCACTTGCCCAAATGTCATA CACATTGTACGTGATGTTATGGAGCAAATTCAACGTAGAGATGTTCGAGCTGGGGCCAAA ATTATTCGTCTTCATTTTCATGATTGCTTCGTTAACGGTTGTGATGGATCAATTTTACTT AATAATGCAACTGGAATTATAAGTGAAAAAGATGCAAATCCAAATGTTGGTGCTGGAGGA TTTGATATTGTTGATGAAATTAAAACCGCATTGGAAAATGAGTGCCCTGGCGTTGTTTCT TGTGCTGATATTTTAGCTCTTGCATCTGAAATCGGAGTTGTTTTGGCTGGAGGTCCATCA TGGCAAGTTCCTTTAGGGAGAAGAGACAGCTTAACAGCAAACAGAAGTGGAGCTAATAGT GATATCCCAAGCCCTACTGAAACCCTTGCTGTTATGATACCACAATTCACTAGAAAGGGA ATGGATTTAACTGATCTTGTTGCTCTATCAGGGGCACATACATTTGGAAGAGCAAGATGT AGAACATTCAATCAAAGACTTTTCAACTTTAGTGGAAGTGGTAGACCTGATCCAACCATA GACTCTAATTATTTAAAAACATTACAAAGACTTTGTCCACAAGGTGGAAATGGTGGTACT TTTGCTAATCTTGATAAATCAACTCCAGATGAATTTGATAATTATTATTTTACAAATCTT AAAAATCATCAAGGGTTACTTCAAACTGATCAAGAATTGTTTTCTACATCTGGATCTAGT ACAATTTCAATTGTGACTAATTATGCAAATAATCAACACAAGTTCTTTGATGATTTTGTT TGTTCAATGATTAAATTGGGAAATATTAGTCCATTAACAGGTACTAATGGAGAGATTAGG AAAGATTGCAAGAGGATT

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g006290.3.1
PEP Infomation	Peroxidase (AHRD V3.3 *** K4ASJ5_SOLLC)
Sequence	MSFLRFILAIFFLVSINFGVSNAHYKLTPTFYDCTCPNVIHIVRDVMEQIQRRDVRAGAK IIRLHFHDCFVNGCDGSILLNNATGIISEKDANPNVGAGGFDIVDEIKTALENECPGVVS CADILALASEIGVVLAGGPSWQVPLGRRDSLTANRSGANSDIPSPTETLAVMIPQFTRKG MDLTDLVALSGAHTFGRARCRTFNQRLFNFSGSGRPDPTIDSNYLKTLQRLCPQGGNGGT FANLDKSTPDEFDNYYFTNLKNHQGLLQTDQELFSTSGSSTISIVTNYANNQHKFFDDFV CSMIKLGNISPLTGTNGEIRKDCKRI

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g006290.3.1
Transcript Infomation	Peroxidase (AHRD V3.3 *** K4ASJ5_SOLLC)
Sequence	AAAACATGAAAAACAAGATTTAATTAAAAAAACAAACAAAATTGTTTCAATTATTAATTA TGTCTTTTTTAAGATTTATTTTAGCAATTTTCTTCTTGGTTTCAATTAATTTTGGAGTAT CAAATGCTCATTATAAATTAACTCCTACATTTTATGATTGCACTTGCCCAAATGTCATAC ACATTGTACGTGATGTTATGGAGCAAATTCAACGTAGAGATGTTCGAGCTGGGGCCAAAA TTATTCGTCTTCATTTTCATGATTGCTTCGTTAACGGTTGTGATGGATCAATTTTACTTA ATAATGCAACTGGAATTATAAGTGAAAAAGATGCAAATCCAAATGTTGGTGCTGGAGGAT TTGATATTGTTGATGAAATTAAAACCGCATTGGAAAATGAGTGCCCTGGCGTTGTTTCTT GTGCTGATATTTTAGCTCTTGCATCTGAAATCGGAGTTGTTTTGGCTGGAGGTCCATCAT GGCAAGTTCCTTTAGGGAGAAGAGACAGCTTAACAGCAAACAGAAGTGGAGCTAATAGTG ATATCCCAAGCCCTACTGAAACCCTTGCTGTTATGATACCACAATTCACTAGAAAGGGAA TGGATTTAACTGATCTTGTTGCTCTATCAGGGGCACATACATTTGGAAGAGCAAGATGTA GAACATTCAATCAAAGACTTTTCAACTTTAGTGGAAGTGGTAGACCTGATCCAACCATAG ACTCTAATTATTTAAAAACATTACAAAGACTTTGTCCACAAGGTGGAAATGGTGGTACTT TTGCTAATCTTGATAAATCAACTCCAGATGAATTTGATAATTATTATTTTACAAATCTTA AAAATCATCAAGGGTTACTTCAAACTGATCAAGAATTGTTTTCTACATCTGGATCTAGTA CAATTTCAATTGTGACTAATTATGCAAATAATCAACACAAGTTCTTTGATGATTTTGTTT GTTCAATGATTAAATTGGGAAATATTAGTCCATTAACAGGTACTAATGGAGAGATTAGGA AAGATTGCAAGAGGATT