Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc01g005220.3.1

CDS Infomation

MACPF domain-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A0B2Q4M6_GLYSO)

Sequence

ATGAGTAATAATAATATTGTGGAGAAGGCAATCAAGAGTTTAGGAAAAGGATTTGATTTA
ACATGTGATTTTAGACTAAAGTATTGTAAAGGAAATGAAAGGCTTGTGTTACTAAATGAA
AAATTGAAGAAAGAGTTGATGGTGCCTGGTTTTGGAGCTTATGAAAATGTACCAATTGAT
ATTAAGTGTGATAAAGGTGATAGAGTTAGATTTCAATCTGATATTCTTGATTTTAATCAG
ATGTCTGAATATATAAATAGGAGAAGTTCAGTGCCTGGAAAAATACCATCTGGACTGTTT
AATTCAATGTTTGGATTTGAGAGTGGTTCATGGGCTAATGATGCAGCAAATACAAAGTAT
TTGGGGCTTGATGGTTATTTCATCATATTATTTGATGTTCATATTGATAGATATTCACTT
GTTTTGGATAATCAAGTTGTTAATGATGTTCCTTCCACTTGGGATCCTGCAGCACTTGCA
AGGTTTATTGAAAAATATGGTACACACATAATAGTGGGGTTAAGTATTGGAGGACAAGAT
GTGGTCCTAGTGAGGCAAGACAAATTATCAAACATGGAACCATCACAACTCAAGAACCAC
TTGGATGAACTTGGTGATCAATTATTCACTGGCATTTGCAACTATTGTCCACAACAATTC
AAATCAAGAGAACAAAAACATAAGGCATTCAATATTTTTGATCCACAACCCAACATCTTT
AGCAGCTTTCCATCAGCAACAACCAAAAATGGTGTAACTGTGATATGTTCAAAAAGAGGT
GGAGATTTAACAGCAAATACACATAGTGAATGGCTTCTAACAGTGCCTTCAATGCCAGAT
GCTATTGCCTTTAACTTCATTCCTATTACTTCACTTCTCAAAGGTGTTCCTGGCAAGGGC
TTTTTATCACATGCTATCAACCTTTATCTTAGATATAAGCCACCCATAGCAGATTTGCAA
TATTTTCTGGATTTTCAAGCCCACAAAATTTGGGCTCCTATTCACAATGATCTTCCTTTA
GGCCCAACTACAAATAGGTCCATTAGACCTCCAGCCATTCATTTCAATTTGATGGGCCCA
AAGCTATATGTAAACCCAACTCAGGTAATAGTTGGGAAGACACCTGTAACTGGAATACGA
CTTTATCTTGAAGGAGTAAAGTGTGATAGGCTGGCCATACATTTACAACACTTGATAAAC
ACTCCAGTACTCCTACAAGACAAAATAGACGATCCGCTGACGTGGCGCGGGTCCGAAGAC
ACACCCGACCATCGATATTTCGAACCCATCCAGTGGAAAAAATTCTCACACGTATGCACG
GCTCCTGTAAAGTACGATCCGAATTGGGCACCATACGAAAATGGCTTTAGTTTCATCGTT
ACGGGTGCTCAACTCCACGTTAAAAAACACGATACAAAGAGTGTCTTACATCTCAGATTG
TTATATTCTAAAGTTTCTAACTCATGTATCGTGCAGTCTCAGTGGATGCAATGTGCCTTT
GAGAGTTGCACGAAATCATCATCGGGTTTTTTATCAGCTATTAGTGGTGCATCCTCGATT
CCCGGGTTTTTATCCGAAAAACCGGTGGTGGTGGACTCGGGTGTGTACCCGACGGGCCCA
CCGGTGCCGGTGCATACCCAAAAGCTACTTAAATTTGTGGATACAACACAATTGTGTAGA
GGCCCATTGGATAGTCCAGGTCATTGGTTGGTTACCGGGGCAAAATTGGACTTGGAAAGA
GGGAAAATTTGCTTGCGTGTTAAATTTTCCTTGCTAAATATCTCTTCTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc01g005220.3.1

PEP Infomation

MACPF domain-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A0B2Q4M6_GLYSO)

Sequence

MSNNNIVEKAIKSLGKGFDLTCDFRLKYCKGNERLVLLNEKLKKELMVPGFGAYENVPID
IKCDKGDRVRFQSDILDFNQMSEYINRRSSVPGKIPSGLFNSMFGFESGSWANDAANTKY
LGLDGYFIILFDVHIDRYSLVLDNQVVNDVPSTWDPAALARFIEKYGTHIIVGLSIGGQD
VVLVRQDKLSNMEPSQLKNHLDELGDQLFTGICNYCPQQFKSREQKHKAFNIFDPQPNIF
SSFPSATTKNGVTVICSKRGGDLTANTHSEWLLTVPSMPDAIAFNFIPITSLLKGVPGKG
FLSHAINLYLRYKPPIADLQYFLDFQAHKIWAPIHNDLPLGPTTNRSIRPPAIHFNLMGP
KLYVNPTQVIVGKTPVTGIRLYLEGVKCDRLAIHLQHLINTPVLLQDKIDDPLTWRGSED
TPDHRYFEPIQWKKFSHVCTAPVKYDPNWAPYENGFSFIVTGAQLHVKKHDTKSVLHLRL
LYSKVSNSCIVQSQWMQCAFESCTKSSSGFLSAISGASSIPGFLSEKPVVVDSGVYPTGP
PVPVHTQKLLKFVDTTQLCRGPLDSPGHWLVTGAKLDLERGKICLRVKFSLLNISS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc01g005220.3.1

Transcript Infomation

MACPF domain-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A0B2Q4M6_GLYSO)

Sequence

ACATTATTGATAAAATAAAACTATAGTCTCAACTAAAATTCACACATTCTTCTTCTCTCT
ATTTTCCCTCTTTATAACCCCTTCATATCCTTCCAACACAAGTGTCCATCATTAGAAGTT
GCATCTCTATTCTGGGCACGCATCGAAAAAAGTGCTCTGCTAATGAAATTGATCCACTAA
TAATTATTTCAATCAAGATCGAGCACGCTTATCTCGAAAAAAAAGAGACATGAGTAATAA
TAATATTGTGGAGAAGGCAATCAAGAGTTTAGGAAAAGGATTTGATTTAACATGTGATTT
TAGACTAAAGTATTGTAAAGGAAATGAAAGGCTTGTGTTACTAAATGAAAAATTGAAGAA
AGAGTTGATGGTGCCTGGTTTTGGAGCTTATGAAAATGTACCAATTGATATTAAGTGTGA
TAAAGGTGATAGAGTTAGATTTCAATCTGATATTCTTGATTTTAATCAGATGTCTGAATA
TATAAATAGGAGAAGTTCAGTGCCTGGAAAAATACCATCTGGACTGTTTAATTCAATGTT
TGGATTTGAGAGTGGTTCATGGGCTAATGATGCAGCAAATACAAAGTATTTGGGGCTTGA
TGGTTATTTCATCATATTATTTGATGTTCATATTGATAGATATTCACTTGTTTTGGATAA
TCAAGTTGTTAATGATGTTCCTTCCACTTGGGATCCTGCAGCACTTGCAAGGTTTATTGA
AAAATATGGTACACACATAATAGTGGGGTTAAGTATTGGAGGACAAGATGTGGTCCTAGT
GAGGCAAGACAAATTATCAAACATGGAACCATCACAACTCAAGAACCACTTGGATGAACT
TGGTGATCAATTATTCACTGGCATTTGCAACTATTGTCCACAACAATTCAAATCAAGAGA
ACAAAAACATAAGGCATTCAATATTTTTGATCCACAACCCAACATCTTTAGCAGCTTTCC
ATCAGCAACAACCAAAAATGGTGTAACTGTGATATGTTCAAAAAGAGGTGGAGATTTAAC
AGCAAATACACATAGTGAATGGCTTCTAACAGTGCCTTCAATGCCAGATGCTATTGCCTT
TAACTTCATTCCTATTACTTCACTTCTCAAAGGTGTTCCTGGCAAGGGCTTTTTATCACA
TGCTATCAACCTTTATCTTAGATATAAGCCACCCATAGCAGATTTGCAATATTTTCTGGA
TTTTCAAGCCCACAAAATTTGGGCTCCTATTCACAATGATCTTCCTTTAGGCCCAACTAC
AAATAGGTCCATTAGACCTCCAGCCATTCATTTCAATTTGATGGGCCCAAAGCTATATGT
AAACCCAACTCAGGTAATAGTTGGGAAGACACCTGTAACTGGAATACGACTTTATCTTGA
AGGAGTAAAGTGTGATAGGCTGGCCATACATTTACAACACTTGATAAACACTCCAGTACT
CCTACAAGACAAAATAGACGATCCGCTGACGTGGCGCGGGTCCGAAGACACACCCGACCA
TCGATATTTCGAACCCATCCAGTGGAAAAAATTCTCACACGTATGCACGGCTCCTGTAAA
GTACGATCCGAATTGGGCACCATACGAAAATGGCTTTAGTTTCATCGTTACGGGTGCTCA
ACTCCACGTTAAAAAACACGATACAAAGAGTGTCTTACATCTCAGATTGTTATATTCTAA
AGTTTCTAACTCATGTATCGTGCAGTCTCAGTGGATGCAATGTGCCTTTGAGAGTTGCAC
GAAATCATCATCGGGTTTTTTATCAGCTATTAGTGGTGCATCCTCGATTCCCGGGTTTTT
ATCCGAAAAACCGGTGGTGGTGGACTCGGGTGTGTACCCGACGGGCCCACCGGTGCCGGT
GCATACCCAAAAGCTACTTAAATTTGTGGATACAACACAATTGTGTAGAGGCCCATTGGA
TAGTCCAGGTCATTGGTTGGTTACCGGGGCAAAATTGGACTTGGAAAGAGGGAAAATTTG
CTTGCGTGTTAAATTTTCCTTGCTAAATATCTCTTCTTAATCTTTTACGTCTAGTAATAC
TCGTTGTGGACTTCAGTTAATTCAGATTCATAAAGAAAAAGTATTTTAAAAGGTAATAGT
ATTTTTTATCAAAGACGACTTTATTTATAGAGTTTGAGAGTCGAAATCCCCAAACAAAGG
ATGGAGATATATATATTGTTTATTTCTTGAGAAGTCCCCAAAAATGTGGGTTGTAATTAG
TTATTTTGATTAATTGGCTTGTGCAATGTATATAAGTTATAATATGGGGTAAAATATAGA
ACTTGAGTTTAATTGGAGAGTTATTCATTTTATTTATTTGTTTATTATTGGCATATGTAC
TAAGAAGGGAAAAGGGGCAGAGTAAAGTGTTTTTTTAATTTTATTTTATATGTTGGTACA
AAAATTATACATTTCATTT