Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	ATCG01010.1
CDS Infomation	\| NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I)%2C chain 5 protein \| ChrC:110398-112638 REVERSE LENGTH=2241 \| 201606
Sequence	ATGGAACATACATATCAATATTCATGGATCATCCCTTTCATTCCACTTCCAGTACCTATT TTACTAGGAGTTGGACTTCTCCTTTTTCCGACAGCAACAAAAAACCTTCGCCGCATGTGG ACTTTTCTTAGTATTTTTTTGTTAAGTATAGTTATGATCTTTTCAATCTATCTATCTATT CAACAAATTTTTCTAAGTTGCATTCATCAAAATGTATGGTCTTGGACCATAAATAATGAA TTTTCTTTTGAGTTCGGTTACTTTATCGATCCACTTACTTCTATTATGTCAATATTAATT ACAACTGTTGGGATTTTGGTTCTGATTTATAGTGACAATTATATGTCGCATGATCAAGGA TACCTGAGATTTTTTGCTTATATGGGTTTTTTTAATACTTCAATGTTAGGATTAGTTACT AGTTCTAATTTGATCCAAGTTTATTTTTTTTGGGAATTAGTTGGAATGTGTTCGTATTTA TTAATAGGTTTTTGGTTCACACGACCTATTGCAGCGAATGCTTGTCAAAAAGCTTTTGTA ACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTTTATTATTAGGAATTTTAGGTCTTTATTGGATAACT GGCAGTTTTGAATTTCAGGATTTGTTCGAAATATTCAATAATTTAATTTTAAATAATAGA GTAAATCTCTTATTCCTTACTTTGTGTGCATTTCTATTATTTGTAGGTCCTATTGCTAAA TCCGCACAATTTCCTCTTCATGTATGGTTACCTGATGCCATGGAGGGCCCTACTCCCATT TCGGCTCTTATACATGCTGCTACTATGGTAGCGGCGGGTATTTTTCTTGTAGCTCGTCTT CTTCCTCTTTTTATCGTTATCCCTTCTATAATGTATATAATATCTTTGATAGGTATAATA ACAGTACTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCAAAAAGACATTAAGCGGGGTTTAGCC TATTCTACAATGTCTCAACTCGGTTATATGATGTTAGCTCTAGGTATGGGGTCTTATCGA TCTGCTTTATTTCATTTGATTACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTGTTGTTTTTAGGATCT GGATCCATTATTCATTCAATGGAAGCTATAGTTGGATATTCTCCCGATAAAAGTCAGAAT ATGATTCTTATGGGTGGTTTGACAAAACATGTCCCGATTACAAAAACGGCCTTTTTAATA GGAACACTCTCTCTTTGTGGTATCCCCCCCCTTGCTTGTTTTTGGTCGAAAGATGAAATT CTTAATGATAGTTTGTTATTTTCGCCAATTTTTGCAATAATAGCTTGTTCAACAGCGGGA TTAACCGCATTTTATATGTTTCGGATTTATTTACTTACTTTTGAAGGACATTTAAACACT TATTTTCTAAATTACAGTGGAAAAAAAAGTGGCTCCTTCTATTCACTCTCTTTATGGGGT AAAGAAGAAGAAAAAAAACTTAATAAAAATTTTGGGTTAGTACCATTATTAACAATGAAT AATACAAAAAGAGCTTCTTTTTTTTGCAATAAAACATATAAAATAAGTAATAATGTAAGA AATCAAATTTTTATTACTGTTGAAAATTTTGGACTTAATACAAGAACTTTCTATTATCCG CATGAATCAGACAATACTATTCTATTTCCTATGCTTATTTTGGTTTTATTTACTTTGTTT ATTGGAGCCATAGGAATTCCTTTCAATCAAGAAGGAATAGACTTTGATATATTATCAAAA TTTTTCACGCCGTCAATAAACCTTTTGCATAAAAATTCACAAAATTTTGTAGATTGGTAT GAATTTTTGAGAAATGCAACTTTTTCGGTCAGTATAGCCTTTTTTGGAATATTTATAGCA TACTGTTTATATAAGCCTTTTTATTCATCTTTATTAAATTTAACCTTACTTAATTCATTT CAAAAATGGAATTCTAAACGAATTCATTGGGAAAAACTAATAAATTTTGTATATAATTGG TCATATAATCGTGGTTACATAGATTCTTTTTTTAAAACATCTTTAATTGAAAGTATAAGA AGATTAGCAAAACAAACGACTTTTTTTGATAAACGAATCATTGATGGAATTACAAATGGA GTAGGTATTACAAGTTTCTTTGTAGGAGAAGTAACAAAATATATAGGTGGAAGTCGCATC TCTTCTTATCTGTTCTTATATTTGTCCTATGTATTGATTTTTTTAATGATCCTCTTTTTT TTTTATTTTGAAAAATTCTAA

Peptide Sequence

PEP ID	ATCG01010.1
PEP Infomation	\| NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I)%2C chain 5 protein \| ChrC:110398-112638 REVERSE LENGTH=746 \| 201606
Sequence	MEHTYQYSWIIPFIPLPVPILLGVGLLLFPTATKNLRRMWTFLSIFLLSIVMIFSIYLSI QQIFLSCIHQNVWSWTINNEFSFEFGYFIDPLTSIMSILITTVGILVLIYSDNYMSHDQG YLRFFAYMGFFNTSMLGLVTSSNLIQVYFFWELVGMCSYLLIGFWFTRPIAANACQKAFV TNRVGDFGLLLGILGLYWITGSFEFQDLFEIFNNLILNNRVNLLFLTLCAFLLFVGPIAK SAQFPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPSIMYIISLIGII TVLLGATLALAQKDIKRGLAYSTMSQLGYMMLALGMGSYRSALFHLITHAYSKALLFLGS GSIIHSMEAIVGYSPDKSQNMILMGGLTKHVPITKTAFLIGTLSLCGIPPLACFWSKDEI LNDSLLFSPIFAIIACSTAGLTAFYMFRIYLLTFEGHLNTYFLNYSGKKSGSFYSLSLWG KEEEKKLNKNFGLVPLLTMNNTKRASFFCNKTYKISNNVRNQIFITVENFGLNTRTFYYP HESDNTILFPMLILVLFTLFIGAIGIPFNQEGIDFDILSKFFTPSINLLHKNSQNFVDWY EFLRNATFSVSIAFFGIFIAYCLYKPFYSSLLNLTLLNSFQKWNSKRIHWEKLINFVYNW SYNRGYIDSFFKTSLIESIRRLAKQTTFFDKRIIDGITNGVGITSFFVGEVTKYIGGSRI SSYLFLYLSYVLIFLMILFFFYFEKF

Transcript Sequence

Transcript ID	ATCG01010.1
Transcript Infomation	\| NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I)%2C chain 5 protein \| ChrC:110398-112638 REVERSE LENGTH=2241 \| 201606
Sequence	ATGGAACATACATATCAATATTCATGGATCATCCCTTTCATTCCACTTCCAGTACCTATT TTACTAGGAGTTGGACTTCTCCTTTTTCCGACAGCAACAAAAAACCTTCGCCGCATGTGG ACTTTTCTTAGTATTTTTTTGTTAAGTATAGTTATGATCTTTTCAATCTATCTATCTATT CAACAAATTTTTCTAAGTTGCATTCATCAAAATGTATGGTCTTGGACCATAAATAATGAA TTTTCTTTTGAGTTCGGTTACTTTATCGATCCACTTACTTCTATTATGTCAATATTAATT ACAACTGTTGGGATTTTGGTTCTGATTTATAGTGACAATTATATGTCGCATGATCAAGGA TACCTGAGATTTTTTGCTTATATGGGTTTTTTTAATACTTCAATGTTAGGATTAGTTACT AGTTCTAATTTGATCCAAGTTTATTTTTTTTGGGAATTAGTTGGAATGTGTTCGTATTTA TTAATAGGTTTTTGGTTCACACGACCTATTGCAGCGAATGCTTGTCAAAAAGCTTTTGTA ACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTTTATTATTAGGAATTTTAGGTCTTTATTGGATAACT GGCAGTTTTGAATTTCAGGATTTGTTCGAAATATTCAATAATTTAATTTTAAATAATAGA GTAAATCTCTTATTCCTTACTTTGTGTGCATTTCTATTATTTGTAGGTCCTATTGCTAAA TCCGCACAATTTCCTCTTCATGTATGGTTACCTGATGCCATGGAGGGCCCTACTCCCATT TCGGCTCTTATACATGCTGCTACTATGGTAGCGGCGGGTATTTTTCTTGTAGCTCGTCTT CTTCCTCTTTTTATCGTTATCCCTTCTATAATGTATATAATATCTTTGATAGGTATAATA ACAGTACTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCAAAAAGACATTAAGCGGGGTTTAGCC TATTCTACAATGTCTCAACTCGGTTATATGATGTTAGCTCTAGGTATGGGGTCTTATCGA TCTGCTTTATTTCATTTGATTACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTGTTGTTTTTAGGATCT GGATCCATTATTCATTCAATGGAAGCTATAGTTGGATATTCTCCCGATAAAAGTCAGAAT ATGATTCTTATGGGTGGTTTGACAAAACATGTCCCGATTACAAAAACGGCCTTTTTAATA GGAACACTCTCTCTTTGTGGTATCCCCCCCCTTGCTTGTTTTTGGTCGAAAGATGAAATT CTTAATGATAGTTTGTTATTTTCGCCAATTTTTGCAATAATAGCTTGTTCAACAGCGGGA TTAACCGCATTTTATATGTTTCGGATTTATTTACTTACTTTTGAAGGACATTTAAACACT TATTTTCTAAATTACAGTGGAAAAAAAAGTGGCTCCTTCTATTCACTCTCTTTATGGGGT AAAGAAGAAGAAAAAAAACTTAATAAAAATTTTGGGTTAGTACCATTATTAACAATGAAT AATACAAAAAGAGCTTCTTTTTTTTGCAATAAAACATATAAAATAAGTAATAATGTAAGA AATCAAATTTTTATTACTGTTGAAAATTTTGGACTTAATACAAGAACTTTCTATTATCCG CATGAATCAGACAATACTATTCTATTTCCTATGCTTATTTTGGTTTTATTTACTTTGTTT ATTGGAGCCATAGGAATTCCTTTCAATCAAGAAGGAATAGACTTTGATATATTATCAAAA TTTTTCACGCCGTCAATAAACCTTTTGCATAAAAATTCACAAAATTTTGTAGATTGGTAT GAATTTTTGAGAAATGCAACTTTTTCGGTCAGTATAGCCTTTTTTGGAATATTTATAGCA TACTGTTTATATAAGCCTTTTTATTCATCTTTATTAAATTTAACCTTACTTAATTCATTT CAAAAATGGAATTCTAAACGAATTCATTGGGAAAAACTAATAAATTTTGTATATAATTGG TCATATAATCGTGGTTACATAGATTCTTTTTTTAAAACATCTTTAATTGAAAGTATAAGA AGATTAGCAAAACAAACGACTTTTTTTGATAAACGAATCATTGATGGAATTACAAATGGA GTAGGTATTACAAGTTTCTTTGTAGGAGAAGTAACAAAATATATAGGTGGAAGTCGCATC TCTTCTTATCTGTTCTTATATTTGTCCTATGTATTGATTTTTTTAATGATCCTCTTTTTT TTTTATTTTGAAAAATTCTAA