Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT5G63120.2
CDS Infomation	\| P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein \| Chr5:25318967-25322071 REVERSE LENGTH=1776 \| 201606
Sequence	ATGAGCTCGTATGATCGTAGATTTGCTGATCCAAATTCGTATCGCCAACGCTCTGGCGCC CCAGTTGGTTCGTCTCAGCCGATGGATCCTTCCGCCGCACCATACAACCCACGGTACACT GGTGGTGGTGGAGGATATGGACCATCTCCGGTAATGGCCGGTGATAATTCCGGCTATAAT CGGTACCCATCTTTCCAGCCACCTAGTGGCGGTTTCTCTGTTGGCCGCGGTGGTGGAAGA GGTGGATATGGTCAATACGGCGATAGAAACGGCGGAGGGAATTGGGGAGGAGGAGGAGGA CGTGGCGGATCGAGTAAAAGAGAGCTAGATAGTGTTTCTCTTCCGAAGCAGAATTTTGGG AATCTTGTACATTTTGAGAAGAATTTCTATGTGGAGAGTCCCACTGTGCAAGCTATGACA GAGCAGGATGTTGCAATGTACAGAACCGAGAGGGATATATCCGTTGAAGGTCGTGATGTT CCTAAGCCGATGAAGATGTTCCAAGATGCTAACTTTCCAGATAACATTCTTGAAGCAATT GCTAAATTGGGATTTACTGAGCCAACACCTATACAAGCTCAGGGATGGCCGATGGCGTTG AAGGGTAGGGATTTGATTGGTATTGCTGAGACTGGCTCTGGTAAGACATTGGCTTACTTG TTACCAGCATTGGTTCACGTTAGTGCACAACCTCGATTAGGTCAGGATGATGGCCCCATT GTGTTAATATTAGCTCCCACAAGAGAACTAGCTGTTCAGATTCAAGAGGAATCAAGGAAA TTCGGGTTGAGGTCTGGTGTTAGAAGTACTTGTATCTATGGTGGTGCTCCTAAAGGACCT CAGATTCGTGATCTTAGAAGAGGTGTTGAGATTGTAATTGCTACACCTGGTCGTTTGATT GATATGTTGGAATGTCAACACACTAATTTGAAGAGAGTGACTTACCTTGTACTGGATGAG GCTGACAGAATGTTAGACATGGGATTTGAACCCCAAATTAGAAAGATTGTATCTCAGATC CGACCTGATAGACAAACACTTCTTTGGAGTGCAACATGGCCACGAGAGGTTGAAACTCTT GCCAGGCAGTTTCTACGAGATCCATATAAGGCCATTATTGGATCAACAGATCTAAAAGCT AACCAGTCTATTAACCAAGTAATCGAGATTGTACCGACGCCAGAGAAATACAACAGGCTC CTTACACTACTTAAACAGTTAATGGATGGGAGTAAAATCCTAATTTTTGTGGAGACAAAG AGAGGGTGTGATCAAGTGACTAGACAATTGAGAATGGACGGATGGCCAGCTCTTGCCATA CATGGTGACAAGACCCAATCGGAAAGAGACCGAGTCTTGGCAGAATTTAAGAGTGGACGA AGCCCGATAATGACTGCCACTGATGTAGCAGCAAGGGGACTTGATGTGAAGGACATTAAA TGTGTGGTTAATTATGATTTCCCAAATACATTGGAGGATTACATCCATAGGATTGGTCGA ACCGGGCGTGCAGGAGCTAAAGGAATGGCCTTTACATTCTTCACACATGACAATGCTAAG TTTGCGAGAGAGCTTGTCAAGATCCTTCAAGAAGCTGGTCAAGTTGTACCTCCTACTCTC TCCGCACTAGTCCGATCATCTGGTTCTGGTTATGGAGGTTCAGGTGGTGGAAGAAACTTC AGGCCAAGAGGAGGAGGACGTGGTGGTGGGTTTGGAGATAAACGGTCAAGATCGACTTCA AACTTTGTACCTCACGGTGGAAAGAGGACTTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	AT5G63120.2
PEP Infomation	\| P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein \| Chr5:25318967-25322071 REVERSE LENGTH=591 \| 201606
Sequence	MSSYDRRFADPNSYRQRSGAPVGSSQPMDPSAAPYNPRYTGGGGGYGPSPVMAGDNSGYN RYPSFQPPSGGFSVGRGGGRGGYGQYGDRNGGGNWGGGGGRGGSSKRELDSVSLPKQNFG NLVHFEKNFYVESPTVQAMTEQDVAMYRTERDISVEGRDVPKPMKMFQDANFPDNILEAI AKLGFTEPTPIQAQGWPMALKGRDLIGIAETGSGKTLAYLLPALVHVSAQPRLGQDDGPI VLILAPTRELAVQIQEESRKFGLRSGVRSTCIYGGAPKGPQIRDLRRGVEIVIATPGRLI DMLECQHTNLKRVTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVSQIRPDRQTLLWSATWPREVETL ARQFLRDPYKAIIGSTDLKANQSINQVIEIVPTPEKYNRLLTLLKQLMDGSKILIFVETK RGCDQVTRQLRMDGWPALAIHGDKTQSERDRVLAEFKSGRSPIMTATDVAARGLDVKDIK CVVNYDFPNTLEDYIHRIGRTGRAGAKGMAFTFFTHDNAKFARELVKILQEAGQVVPPTL SALVRSSGSGYGGSGGGRNFRPRGGGRGGGFGDKRSRSTSNFVPHGGKRTW

Transcript Sequence

Transcript ID	AT5G63120.2
Transcript Infomation	\| P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein \| Chr5:25318642-25322284 REVERSE LENGTH=2314 \| 201606
Sequence	AAAAATGGTGGGACAAATTAGGGTTACTAATTTGGGAATTTTACTGTCCAAAACGAATCA AAAAAAAAATCTAAGCTTTTTGTTCCTTTTGCGGCTTTTCGTCGTCTTCCTTGCACTATC TTCCTTCTGTAGCATCAATTCGTTTCCAAGGTTACGTAGTAGAATTTACGCGAGAGAGCG AGAGATCAAAAACCATAACCATCTTAAGTTACAATGAGCTCGTATGATCGTAGATTTGCT GATCCAAATTCGTATCGCCAACGCTCTGGCGCCCCAGTTGGTTCGTCTCAGCCGATGGAT CCTTCCGCCGCACCATACAACCCACGGTACACTGGTGGTGGTGGAGGATATGGACCATCT CCGGTAATGGCCGGTGATAATTCCGGCTATAATCGGTACCCATCTTTCCAGCCACCTAGT GGCGGTTTCTCTGTTGGCCGCGGTGGTGGAAGAGGTGGATATGGTCAATACGGCGATAGA AACGGCGGAGGGAATTGGGGAGGAGGAGGAGGACGTGGCGGATCGAGTAAAAGAGAGCTA GATAGTGTTTCTCTTCCGAAGCAGAATTTTGGGAATCTTGTACATTTTGAGAAGAATTTC TATGTGGAGAGTCCCACTGTGCAAGCTATGACAGAGCAGGATGTTGCAATGTACAGAACC GAGAGGGATATATCCGTTGAAGGTCGTGATGTTCCTAAGCCGATGAAGATGTTCCAAGAT GCTAACTTTCCAGATAACATTCTTGAAGCAATTGCTAAATTGGGATTTACTGAGCCAACA CCTATACAAGCTCAGGGATGGCCGATGGCGTTGAAGGGTAGGGATTTGATTGGTATTGCT GAGACTGGCTCTGGTAAGACATTGGCTTACTTGTTACCAGCATTGGTTCACGTTAGTGCA CAACCTCGATTAGGTCAGGATGATGGCCCCATTGTGTTAATATTAGCTCCCACAAGAGAA CTAGCTGTTCAGATTCAAGAGGAATCAAGGAAATTCGGGTTGAGGTCTGGTGTTAGAAGT ACTTGTATCTATGGTGGTGCTCCTAAAGGACCTCAGATTCGTGATCTTAGAAGAGGTGTT GAGATTGTAATTGCTACACCTGGTCGTTTGATTGATATGTTGGAATGTCAACACACTAAT TTGAAGAGAGTGACTTACCTTGTACTGGATGAGGCTGACAGAATGTTAGACATGGGATTT GAACCCCAAATTAGAAAGATTGTATCTCAGATCCGACCTGATAGACAAACACTTCTTTGG AGTGCAACATGGCCACGAGAGGTTGAAACTCTTGCCAGGCAGTTTCTACGAGATCCATAT AAGGCCATTATTGGATCAACAGATCTAAAAGCTAACCAGTCTATTAACCAAGTAATCGAG ATTGTACCGACGCCAGAGAAATACAACAGGCTCCTTACACTACTTAAACAGTTAATGGAT GGGAGTAAAATCCTAATTTTTGTGGAGACAAAGAGAGGGTGTGATCAAGTGACTAGACAA TTGAGAATGGACGGATGGCCAGCTCTTGCCATACATGGTGACAAGACCCAATCGGAAAGA GACCGAGTCTTGGCAGAATTTAAGAGTGGACGAAGCCCGATAATGACTGCCACTGATGTA GCAGCAAGGGGACTTGATGTGAAGGACATTAAATGTGTGGTTAATTATGATTTCCCAAAT ACATTGGAGGATTACATCCATAGGATTGGTCGAACCGGGCGTGCAGGAGCTAAAGGAATG GCCTTTACATTCTTCACACATGACAATGCTAAGTTTGCGAGAGAGCTTGTCAAGATCCTT CAAGAAGCTGGTCAAGTTGTACCTCCTACTCTCTCCGCACTAGTCCGATCATCTGGTTCT GGTTATGGAGGTTCAGGTGGTGGAAGAAACTTCAGGCCAAGAGGAGGAGGACGTGGTGGT GGGTTTGGAGATAAACGGTCAAGATCGACTTCAAACTTTGTACCTCACGGTGGAAAGAGG ACTTGGTAAAGAGAATCCCATCATTTTGATTCTATGAGAAAACCTTTAATTATGATGATG ATGATCAGCGTTTGGTTTCGACTAGAAGTTCTTTGTCGTAGAGAACAAACATTTACTATA TAACTATTTAGCTGATTTCGCTGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATGATATTTCTAAACATT TTGCCTTTTTCTTAATTCTATCAACTAAATACACTTTACTACTTTACTCTCAAGTCAACC GTAACACTGTAATGAAACTTGTTTTTAAAAATCGGATGTGGATTATTAGGTTGGGAGATT CAAGTATTGCGAATAGAATTTAGACAAATGTAAG