Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT5G61990.1
CDS Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr5:24900186-24903110 REVERSE LENGTH=2925 \| 201606
Sequence	ATGATGGGATCGATGTTGTTCAGGAAGAGAACTTTGGTCACGAGAGCGAATTTTTTACTT TTCCGGTCGTTTTCCGTTAACGTTGAGAAACTTTCCGACGCATCAGCTGAAATAGCGGGA ATTCTCAAGCAAGAGAACTGGCGTGACACTCTGGTATCTTCGAATCTTTCAATCGAGATA AATCCAGAAGTAGTTCTCTCCGTTTTACGATCCAAACGCGTCGATGATCCCTCTAAGCTT TTGAGTTTCTTCAACTGGGTCGATTCTCAAAAAGTCACAGAGCAGAAATTGGATTCGTTT TCGTTTCTCGCTTTGGATTTGTGTAATTTCGGTAGTTTTGAGAAAGCTCTTAGTGTTGTA GAACGGATGATTGAGAGAAATTGGCCTGTAGCTGAGGTTTGGAGTTCGATTGTGAGATGT TCACAAGAGTTTGTGGGAAAGAGTGATGATGGAGTTCTATTTGGGATATTGTTTGATGGA TACATTGCAAAAGGGTATATAGAAGAAGCTGTGTTTGTGTTTTCTAGCTCTATGGGTTTG GAATTGGTTCCTCGTTTGTCACGATGTAAAGTTTTGTTGGATGCGTTGTTGAGGTGGAAC CGGCTGGATTTGTTTTGGGATGTGTATAAGGGGATGGTTGAGAGAAATGTAGTATTTGAT GTTAAGACCTATCATATGTTGATTATTGCTCATTGTAGGGCTGGGAATGTTCAGTTGGGG AAAGATGTTCTTTTTAAAACGGAAAAAGAATTCAGGACGGCTACTTTGAATGTGGATGGA GCACTTAAGCTTAAGGAGTCGATGATTTGCAAAGGATTGGTGCCATTGAAGTATACATAC GATGTACTTATAGATGGGTTGTGTAAGATAAAGAGACTAGAAGATGCTAAATCGTTGCTG GTAGAGATGGATAGTTTAGGTGTGTCTCTTGATAATCATACTTATAGTTTACTGATTGAT GGCTTACTGAAGGGTAGAAATGCAGATGCTGCGAAAGGACTAGTCCATGAGATGGTTTCA CATGGTATTAACATCAAACCTTATATGTATGATTGTTGTATTTGTGTGATGTCAAAGGAA GGGGTGATGGAGAAGGCAAAGGCTCTCTTTGATGGAATGATCGCATCCGGACTGATACCA CAGGCTCAGGCTTATGCTAGTCTGATCGAAGGATACTGTCGAGAAAAGAATGTACGTCAG GGTTATGAGTTACTTGTTGAAATGAAAAAGAGGAACATTGTCATATCTCCATATACTTAT GGTACAGTGGTGAAAGGCATGTGCTCTTCTGGGGATCTCGATGGAGCTTATAACATTGTG AAGGAAATGATTGCAAGTGGTTGCAGACCCAATGTGGTTATATATACCACATTGATCAAA ACCTTTCTCCAGAATAGTAGGTTTGGAGATGCAATGAGGGTGTTAAAAGAAATGAAAGAA CAAGGAATCGCACCAGACATATTTTGCTACAATTCCCTTATAATTGGCCTTTCAAAAGCT AAAAGAATGGACGAAGCAAGGTCTTTTCTGGTTGAAATGGTCGAGAACGGATTAAAGCCT AATGCTTTCACCTATGGGGCTTTTATCAGTGGATATATAGAGGCAAGTGAATTTGCATCT GCAGATAAGTATGTGAAAGAGATGCGGGAATGTGGCGTACTTCCAAATAAGGTTCTTTGC ACGGGTTTGATCAATGAGTATTGCAAAAAGGGGAAAGTAATAGAGGCGTGTTCAGCATAT AGATCCATGGTTGACCAAGGGATCCTGGGGGATGCTAAAACATACACTGTTCTTATGAAT GGTCTTTTTAAAAATGATAAAGTAGATGATGCCGAGGAGATTTTCCGCGAAATGCGTGGG AAGGGTATTGCACCTGATGTATTCTCTTATGGTGTTCTCATTAATGGATTTTCTAAGTTG GGAAATATGCAGAAGGCTTCTAGTATTTTTGATGAGATGGTTGAAGAAGGTTTGACTCCT AATGTTATCATATACAACATGTTACTTGGTGGCTTTTGCAGATCTGGTGAAATTGAAAAA GCTAAGGAACTGCTTGATGAAATGTCAGTTAAAGGTCTTCACCCGAATGCAGTGACCTAC TGTACAATTATAGATGGATATTGCAAATCTGGGGATCTAGCTGAGGCTTTTCGGTTATTT GATGAGATGAAACTAAAGGGATTAGTTCCTGATAGTTTTGTGTACACAACACTCGTGGAT GGGTGTTGCAGATTGAACGATGTGGAAAGAGCTATAACCATCTTTGGGACAAACAAGAAG GGCTGTGCTTCTAGTACCGCCCCTTTCAATGCTTTGATCAATTGGGTTTTTAAGTTTGGA AAAACAGAATTAAAAACAGAAGTGTTAAATCGGCTAATGGATGGGTCGTTTGATAGGTTT GGCAAGCCCAATGACGTAACATACAACATTATGATTGATTATCTATGCAAGGAAGGAAAC TTGGAAGCTGCAAAGGAGCTCTTTCACCAGATGCAGAACGCTAATCTGATGCCTACTGTT ATAACTTACACATCTCTTCTAAACGGGTATGATAAAATGGGTAGAAGAGCTGAAATGTTT CCTGTATTTGATGAGGCGATTGCTGCAGGAATTGAACCAGACCACATAATGTATAGTGTT ATCATCAATGCTTTCCTGAAAGAAGGGATGACGACAAAAGCACTTGTGCTTGTGGATCAA ATGTTTGCTAAGAACGCTGTTGATGATGGGTGTAAGCTAAGTATTTCAACATGCCGGGCT CTACTCTCTGGTTTTGCTAAAGTGGGAGAAATGGAGGTAGCTGAGAAGGTTATGGAGAAC ATGGTTCGACTCCAATATATTCCTGATTCTGCGACTGTTATTGAGTTAATCAATGAAAGT TGCATTTCCTCAAACCAAAGAGTGGAAGCTGATGCAGTTCCATAG

Peptide Sequence

PEP ID	AT5G61990.1
PEP Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr5:24900186-24903110 REVERSE LENGTH=974 \| 201606
Sequence	MMGSMLFRKRTLVTRANFLLFRSFSVNVEKLSDASAEIAGILKQENWRDTLVSSNLSIEI NPEVVLSVLRSKRVDDPSKLLSFFNWVDSQKVTEQKLDSFSFLALDLCNFGSFEKALSVV ERMIERNWPVAEVWSSIVRCSQEFVGKSDDGVLFGILFDGYIAKGYIEEAVFVFSSSMGL ELVPRLSRCKVLLDALLRWNRLDLFWDVYKGMVERNVVFDVKTYHMLIIAHCRAGNVQLG KDVLFKTEKEFRTATLNVDGALKLKESMICKGLVPLKYTYDVLIDGLCKIKRLEDAKSLL VEMDSLGVSLDNHTYSLLIDGLLKGRNADAAKGLVHEMVSHGINIKPYMYDCCICVMSKE GVMEKAKALFDGMIASGLIPQAQAYASLIEGYCREKNVRQGYELLVEMKKRNIVISPYTY GTVVKGMCSSGDLDGAYNIVKEMIASGCRPNVVIYTTLIKTFLQNSRFGDAMRVLKEMKE QGIAPDIFCYNSLIIGLSKAKRMDEARSFLVEMVENGLKPNAFTYGAFISGYIEASEFAS ADKYVKEMRECGVLPNKVLCTGLINEYCKKGKVIEACSAYRSMVDQGILGDAKTYTVLMN GLFKNDKVDDAEEIFREMRGKGIAPDVFSYGVLINGFSKLGNMQKASSIFDEMVEEGLTP NVIIYNMLLGGFCRSGEIEKAKELLDEMSVKGLHPNAVTYCTIIDGYCKSGDLAEAFRLF DEMKLKGLVPDSFVYTTLVDGCCRLNDVERAITIFGTNKKGCASSTAPFNALINWVFKFG KTELKTEVLNRLMDGSFDRFGKPNDVTYNIMIDYLCKEGNLEAAKELFHQMQNANLMPTV ITYTSLLNGYDKMGRRAEMFPVFDEAIAAGIEPDHIMYSVIINAFLKEGMTTKALVLVDQ MFAKNAVDDGCKLSISTCRALLSGFAKVGEMEVAEKVMENMVRLQYIPDSATVIELINES CISSNQRVEADAVP

Transcript Sequence

Transcript ID	AT5G61990.1
Transcript Infomation	\| Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein \| Chr5:24899606-24903131 REVERSE LENGTH=3512 \| 201606
Sequence	ATCGGTGATGATGGGATCGATGTTGTTCAGGAAGAGAACTTTGGTCACGAGAGCGAATTT TTTACTTTTCCGGTCGTTTTCCGTTAACGTTGAGAAACTTTCCGACGCATCAGCTGAAAT AGCGGGAATTCTCAAGCAAGAGAACTGGCGTGACACTCTGGTATCTTCGAATCTTTCAAT CGAGATAAATCCAGAAGTAGTTCTCTCCGTTTTACGATCCAAACGCGTCGATGATCCCTC TAAGCTTTTGAGTTTCTTCAACTGGGTCGATTCTCAAAAAGTCACAGAGCAGAAATTGGA TTCGTTTTCGTTTCTCGCTTTGGATTTGTGTAATTTCGGTAGTTTTGAGAAAGCTCTTAG TGTTGTAGAACGGATGATTGAGAGAAATTGGCCTGTAGCTGAGGTTTGGAGTTCGATTGT GAGATGTTCACAAGAGTTTGTGGGAAAGAGTGATGATGGAGTTCTATTTGGGATATTGTT TGATGGATACATTGCAAAAGGGTATATAGAAGAAGCTGTGTTTGTGTTTTCTAGCTCTAT GGGTTTGGAATTGGTTCCTCGTTTGTCACGATGTAAAGTTTTGTTGGATGCGTTGTTGAG GTGGAACCGGCTGGATTTGTTTTGGGATGTGTATAAGGGGATGGTTGAGAGAAATGTAGT ATTTGATGTTAAGACCTATCATATGTTGATTATTGCTCATTGTAGGGCTGGGAATGTTCA GTTGGGGAAAGATGTTCTTTTTAAAACGGAAAAAGAATTCAGGACGGCTACTTTGAATGT GGATGGAGCACTTAAGCTTAAGGAGTCGATGATTTGCAAAGGATTGGTGCCATTGAAGTA TACATACGATGTACTTATAGATGGGTTGTGTAAGATAAAGAGACTAGAAGATGCTAAATC GTTGCTGGTAGAGATGGATAGTTTAGGTGTGTCTCTTGATAATCATACTTATAGTTTACT GATTGATGGCTTACTGAAGGGTAGAAATGCAGATGCTGCGAAAGGACTAGTCCATGAGAT GGTTTCACATGGTATTAACATCAAACCTTATATGTATGATTGTTGTATTTGTGTGATGTC AAAGGAAGGGGTGATGGAGAAGGCAAAGGCTCTCTTTGATGGAATGATCGCATCCGGACT GATACCACAGGCTCAGGCTTATGCTAGTCTGATCGAAGGATACTGTCGAGAAAAGAATGT ACGTCAGGGTTATGAGTTACTTGTTGAAATGAAAAAGAGGAACATTGTCATATCTCCATA TACTTATGGTACAGTGGTGAAAGGCATGTGCTCTTCTGGGGATCTCGATGGAGCTTATAA CATTGTGAAGGAAATGATTGCAAGTGGTTGCAGACCCAATGTGGTTATATATACCACATT GATCAAAACCTTTCTCCAGAATAGTAGGTTTGGAGATGCAATGAGGGTGTTAAAAGAAAT GAAAGAACAAGGAATCGCACCAGACATATTTTGCTACAATTCCCTTATAATTGGCCTTTC AAAAGCTAAAAGAATGGACGAAGCAAGGTCTTTTCTGGTTGAAATGGTCGAGAACGGATT AAAGCCTAATGCTTTCACCTATGGGGCTTTTATCAGTGGATATATAGAGGCAAGTGAATT TGCATCTGCAGATAAGTATGTGAAAGAGATGCGGGAATGTGGCGTACTTCCAAATAAGGT TCTTTGCACGGGTTTGATCAATGAGTATTGCAAAAAGGGGAAAGTAATAGAGGCGTGTTC AGCATATAGATCCATGGTTGACCAAGGGATCCTGGGGGATGCTAAAACATACACTGTTCT TATGAATGGTCTTTTTAAAAATGATAAAGTAGATGATGCCGAGGAGATTTTCCGCGAAAT GCGTGGGAAGGGTATTGCACCTGATGTATTCTCTTATGGTGTTCTCATTAATGGATTTTC TAAGTTGGGAAATATGCAGAAGGCTTCTAGTATTTTTGATGAGATGGTTGAAGAAGGTTT GACTCCTAATGTTATCATATACAACATGTTACTTGGTGGCTTTTGCAGATCTGGTGAAAT TGAAAAAGCTAAGGAACTGCTTGATGAAATGTCAGTTAAAGGTCTTCACCCGAATGCAGT GACCTACTGTACAATTATAGATGGATATTGCAAATCTGGGGATCTAGCTGAGGCTTTTCG GTTATTTGATGAGATGAAACTAAAGGGATTAGTTCCTGATAGTTTTGTGTACACAACACT CGTGGATGGGTGTTGCAGATTGAACGATGTGGAAAGAGCTATAACCATCTTTGGGACAAA CAAGAAGGGCTGTGCTTCTAGTACCGCCCCTTTCAATGCTTTGATCAATTGGGTTTTTAA GTTTGGAAAAACAGAATTAAAAACAGAAGTGTTAAATCGGCTAATGGATGGGTCGTTTGA TAGGTTTGGCAAGCCCAATGACGTAACATACAACATTATGATTGATTATCTATGCAAGGA AGGAAACTTGGAAGCTGCAAAGGAGCTCTTTCACCAGATGCAGAACGCTAATCTGATGCC TACTGTTATAACTTACACATCTCTTCTAAACGGGTATGATAAAATGGGTAGAAGAGCTGA AATGTTTCCTGTATTTGATGAGGCGATTGCTGCAGGAATTGAACCAGACCACATAATGTA TAGTGTTATCATCAATGCTTTCCTGAAAGAAGGGATGACGACAAAAGCACTTGTGCTTGT GGATCAAATGTTTGCTAAGAACGCTGTTGATGATGGGTGTAAGCTAAGTATTTCAACATG CCGGGCTCTACTCTCTGGTTTTGCTAAAGTGGGAGAAATGGAGGTAGCTGAGAAGGTTAT GGAGAACATGGTTCGACTCCAATATATTCCTGATTCTGCGACTGTTATTGAGTTAATCAA TGAAAGTTGCATTTCCTCAAACCAAAGAGTGGAAGCTGATGCAGTTCCATAGTTTTCTAG ACGGAAAGCTAGAGCAGATAAACTTCCTTCTTTTTCTTTGTGGCTAAAAACGGAGTCTGC TGCTTTTAGTTTGGTTTACGGCAAATTTCTGATGGGCTGCAATTGTGGCAAAATTTACAA GCTTTATCATCTCACTTTTGATGATCTCTACTCAGTCTCAATCTTCTGATATGTCATTGT ATATTTTTTCAGTTACCATTAAGAATCTGGAGGTGCTGTTCCTGAAACAATTTGTGTCTG CTCATAAACTCTTCTGGACCAATTCATTTACTTCAGAACGGTTTGCCTTCAGCTAGACAT GTTGGATCCCATTGATTTACATGGGAGCAGTTTCCATTACGATGACGACAATCAGAAGTT GACGATGAAAAGGAGACGCATGGGAGCAATTTATTCTGCAACTTCCTCTGTTTTCTTAGT CTCGGAAAAATCCTGTTGAAGAACAGAGATGACAGTTTTATACTGATTTTTTTATCTATA AAAAGATTTTGGTGTGCGAATGTTACTATGATGATCAACTTATATTAAGTTATTTATTCA TCAATATCAAAATCTGGCTGGTGATTTAAAGC