Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT5G52180.1
CDS Infomation	\| transmembrane protein 161AB protein \| Chr5:21200165-21201541 REVERSE LENGTH=1377 \| 201606
Sequence	ATGCTTGAGCTTTTAGGAAGTTACAGGAATCTAACACTTCAAATCCTACTATCTCTCTTC TTAACGTTAGTCCTTTCATTCGTCAAAATCTCAATCATCTTCCTCCACGGTCTCTGTACC TATATCCAACCTGAAAATCTCAACCAAAACAACACCGGAAATGGACTCCGACCTGCGATT AGACGACCATCTAGTACCGACGATCCAAAATCTAATGTTGAAGTCAGAAGAAGAAACAGA TCCAAAGATAAATCCGAATTCGACGAAAGCAATGCTCAGATCTTTCGAATTAAGCTCGAT GAAGATCATCTCAGATCTCGAATGTATTTCACTGAGTACAATTCGCTATTCGTGATATCG TTCTTAGCTGTTTCTTGCTTTCTTCTAGATAAGTACTTCGGTATTATTGAGGATAATAGT CATGGAGTTTTAAGTAATGGATTGATGTTTCCGATTGTTCTAGGGTTTATAGCTTTGTGT AAGGTGTTTGTAGCTTTGGGGAAGATTTCTATTGAGAGATCTGCTTCTAAGGAATCTGAG AAGAGATTGAGTTTGATTTTTGGTGTTTTAGGGTTTGTGTTTGGGATTATAATCAGTGCT GGTGTTTTTCCTAAAGGATTTGATTTTCAATTAGGTTCTGTTGATGCGTTTTGTTGCATT GTGATATCGTTTTCGATGGCTTGTATTGGTGGTTTCCTTTATATGCCTGCTGGAAGAAGT GCAAGGTCGTTTTGGGTTGGGACTGATCAGATTAGGAGTAATTTGTCGATCATTTCTTGT GGATGGTTTGGTAGGATGATTCTATATGCGAATTATATCGTATCGGTTTTCACTTCGTTG CTTTGGATTCATCCGTTGGCAGAGGTTTTAGTGAAGAGAAGTGGTGATCCTGGGACTAGT GGTAGTAGTCAGAGTCAGAGTGGGTTGGTTGGTAATGTAGGCATGTTGAGTGATGATTTT GCGAAGTTTCGGGTTTTGTGTTTGTTACTTTCGGGTTTACTACAAGCGATGGCGGTTCGT CCTAACCTTCAGATGTTCTTGAACGAAGCAGTCCTTTCGTGGTATCAGAGATTACATGGA AGTAAAACTCCTGATTTGGATTTTAGTCGTGCAAAGATGTTTCTTCACAACCATTACCTA TGCCTTGTTGCTCTGCAGTTTTTGGCGCCTTCGGTGCTAGTGATTCTTTTCCTCGGCTTG TCTCAGATTGACTTGAGCTCTTTTGCTGTATCTCAACTGGTATGTGGTTCTTTGCCTTGT AGCGATTTCATTAAACAAGTTGGTTTGTTGATGTCTTGGTGGGTTCTTTTTGTTTGGTCG GGTTTTACTTCAGCGAGTCTTGTTTTCTATCGTCGAGGTGTCTTGTATGTTTCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT5G52180.1
PEP Infomation	\| transmembrane protein 161AB protein \| Chr5:21200165-21201541 REVERSE LENGTH=458 \| 201606
Sequence	MLELLGSYRNLTLQILLSLFLTLVLSFVKISIIFLHGLCTYIQPENLNQNNTGNGLRPAI RRPSSTDDPKSNVEVRRRNRSKDKSEFDESNAQIFRIKLDEDHLRSRMYFTEYNSLFVIS FLAVSCFLLDKYFGIIEDNSHGVLSNGLMFPIVLGFIALCKVFVALGKISIERSASKESE KRLSLIFGVLGFVFGIIISAGVFPKGFDFQLGSVDAFCCIVISFSMACIGGFLYMPAGRS ARSFWVGTDQIRSNLSIISCGWFGRMILYANYIVSVFTSLLWIHPLAEVLVKRSGDPGTS GSSQSQSGLVGNVGMLSDDFAKFRVLCLLLSGLLQAMAVRPNLQMFLNEAVLSWYQRLHG SKTPDLDFSRAKMFLHNHYLCLVALQFLAPSVLVILFLGLSQIDLSSFAVSQLVCGSLPC SDFIKQVGLLMSWWVLFVWSGFTSASLVFYRRGVLYVS

Transcript Sequence

Transcript ID	AT5G52180.1
Transcript Infomation	\| transmembrane protein 161AB protein \| Chr5:21200040-21201610 REVERSE LENGTH=1571 \| 201606
Sequence	AACAAATTCAGACTCTCTTCATACATCTTCTTCTACCCAGAGAGAGTCGAACAACAGAGT GAAGAAACAATGCTTGAGCTTTTAGGAAGTTACAGGAATCTAACACTTCAAATCCTACTA TCTCTCTTCTTAACGTTAGTCCTTTCATTCGTCAAAATCTCAATCATCTTCCTCCACGGT CTCTGTACCTATATCCAACCTGAAAATCTCAACCAAAACAACACCGGAAATGGACTCCGA CCTGCGATTAGACGACCATCTAGTACCGACGATCCAAAATCTAATGTTGAAGTCAGAAGA AGAAACAGATCCAAAGATAAATCCGAATTCGACGAAAGCAATGCTCAGATCTTTCGAATT AAGCTCGATGAAGATCATCTCAGATCTCGAATGTATTTCACTGAGTACAATTCGCTATTC GTGATATCGTTCTTAGCTGTTTCTTGCTTTCTTCTAGATAAGTACTTCGGTATTATTGAG GATAATAGTCATGGAGTTTTAAGTAATGGATTGATGTTTCCGATTGTTCTAGGGTTTATA GCTTTGTGTAAGGTGTTTGTAGCTTTGGGGAAGATTTCTATTGAGAGATCTGCTTCTAAG GAATCTGAGAAGAGATTGAGTTTGATTTTTGGTGTTTTAGGGTTTGTGTTTGGGATTATA ATCAGTGCTGGTGTTTTTCCTAAAGGATTTGATTTTCAATTAGGTTCTGTTGATGCGTTT TGTTGCATTGTGATATCGTTTTCGATGGCTTGTATTGGTGGTTTCCTTTATATGCCTGCT GGAAGAAGTGCAAGGTCGTTTTGGGTTGGGACTGATCAGATTAGGAGTAATTTGTCGATC ATTTCTTGTGGATGGTTTGGTAGGATGATTCTATATGCGAATTATATCGTATCGGTTTTC ACTTCGTTGCTTTGGATTCATCCGTTGGCAGAGGTTTTAGTGAAGAGAAGTGGTGATCCT GGGACTAGTGGTAGTAGTCAGAGTCAGAGTGGGTTGGTTGGTAATGTAGGCATGTTGAGT GATGATTTTGCGAAGTTTCGGGTTTTGTGTTTGTTACTTTCGGGTTTACTACAAGCGATG GCGGTTCGTCCTAACCTTCAGATGTTCTTGAACGAAGCAGTCCTTTCGTGGTATCAGAGA TTACATGGAAGTAAAACTCCTGATTTGGATTTTAGTCGTGCAAAGATGTTTCTTCACAAC CATTACCTATGCCTTGTTGCTCTGCAGTTTTTGGCGCCTTCGGTGCTAGTGATTCTTTTC CTCGGCTTGTCTCAGATTGACTTGAGCTCTTTTGCTGTATCTCAACTGGTATGTGGTTCT TTGCCTTGTAGCGATTTCATTAAACAAGTTGGTTTGTTGATGTCTTGGTGGGTTCTTTTT GTTTGGTCGGGTTTTACTTCAGCGAGTCTTGTTTTCTATCGTCGAGGTGTCTTGTATGTT TCTTGAGAAGTCTGTAGCTTTTTCCCAACGTTTTTTATGTATCAGTGGAAAATGGCATAA ACACAAAAAAACAAATCAGTTTTGCAAATTGTAAACTTTGGTCCATTTGTTTGTTTATTT GTTTGTTCTAC