Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID

AT5G49890.1

CDS Infomation

| chloride channel C | Chr5:20288489-20292143 REVERSE LENGTH=2340 | 201606

Sequence

ATGGATGATCGGCACGAAGGAGACCATCATGATATAGAGGTTGAAGGAGGAGCTTTACAT
GGTTTCGAGAGGAAGATATCTGGGATTCTAGACGATGGATCTGTCGGATTTCGACAGCCT
CTTCTCGCTAGGAATCGAAAGAACACAACTTCTCAGATCGCTATTGTCGGAGCTAATACT
TGTCCCATCGAAAGCCTTGATTACGAGATCTTCGAAAATGATTTTTTCAAGCAAGACTGG
AGGTCTAGGAAGAAGATTGAGATACTTCAGTATACGTTTCTCAAATGGGCGCTTGCTTTT
CTTATTGGTTTAGCTACTGGACTTGTTGGCTTTTTGAATAACCTTGGTGTTGAGAATATA
GCTGGATTTAAACTCTTGCTCATCGGTAATCTCATGCTCAAGGAAAAATATTTCCAGGCA
TTTTTTGCATTTGCTGGTTGTAACTTAATTTTGGCAACTGCTGCTGCTTCACTCTGTGCT
TTTATTGCTCCTGCGGCGGCAGGATCTGGCATACCTGAGGTTAAAGCATATCTCAATGGT
ATAGATGCTTATTCAATATTAGCTCCAAGCACCCTCTTTGTTAAGATCTTTGGCTCTATA
TTTGGAGTTGCTGCCGGATTTGTAGTTGGAAAAGAAGGGCCTATGGTTCATACTGGTGCT
TGCATTGCTAATTTACTTGGACAAGGTGGTTCCAAAAAGTACCGGTTGACTTGGAAGTGG
CTCAGATTCTTCAAAAACGATAGAGACAGAAGAGACCTGATCACTTGCGGGGCTGCTGCT
GGTGTAGCAGCTGCCTTCCGTGCTCCAGTTGGAGGAGTGCTTTTCGCCCTTGAAGAAGCT
GCTTCATGGTGGAGGAATGCCCTTCTCTGGAGGACATTCTTCACTACCGCAGTTGTAGCA
GTGGTCTTACGAAGTTTGATTGAGTTCTGTCGCTCTGGGAGATGTGGACTGTTTGGGAAA
GGAGGTCTCATCATGTTTGATGTAAACTCGGGACCAGTGCTATATAGCACTCCAGATTTG
CTAGCAATAGTATTCCTTGGAGTTATTGGTGGTGTGCTTGGAAGCCTTTACAACTACCTT
GTGGACAAAGTCCTCCGCACATATAGCATTATAAACGAGAAAGGTCCGAGATTTAAAATT
ATGCTTGTAATGGCAGTTTCCATTTTGAGCTCGTGTTGCGCATTTGGTCTCCCATGGCTT
TCACAGTGTACTCCATGTCCTATTGGCATAGAGGAGGGAAAGTGCCCTAGTGTAGGTCGA
TCCAGCATCTATAAGAGTTTCCAGTGTCCTCCAAACCATTACAATGACCTTTCCTCCCTA
CTTCTCAACACCAATGATGATGCAATCCGTAATCTTTTCACATCCAGATCTGAAAATGAA
TTCCATATCTCTACCCTTGCCATCTTCTTTGTCGCAGTGTACTGCCTTGGCATCATAACA
TACGGCATAGCCATACCCTCTGGGCTTTTCATTCCTGTCATTCTTGCTGGAGCCTCTTAT
GGACGACTAGTGGGTAGACTGCTGGGTCCAGTATCTCAGCTTGATGTAGGTCTGTTTTCT
CTGCTCGGAGCTGCTTCCTTCCTTGGAGGCACAATGAGAATGACGGTCTCTCTATGTGTT
ATACTGCTCGAACTTACAAATAATCTCCTAATGCTGCCACTGGTGATGCTTGTACTCCTT
ATATCAAAAACGGTTGCAGATTGTTTCAACAGGGGGGTCTATGACCAGATTGTAACAATG
AAAGGACTGCCTTACATGGAAGACCATGCAGAGCCGTACATGCGCAATTTGGTTGCAAAG
GACGTAGTTTCTGGAGCTTTGATATCCTTTTCGAGAGTTGAAAAGGTTGGGGTAATATGG
CAGGCTTTAAAAATGACAAGACATAATGGTTTCCCTGTAATTGATGAGCCACCTTTCACA
GAAGCTTCTGAGCTATGTGGGATTGCCTTGAGATCTCATCTCCTTGTGCTTCTCCAAGGG
AAGAAATTCTCGAAGCAGAGAACAACTTTTGGTTCACAAATTCTGAGAAGTTGCAAAGCC
CGTGACTTTGGTAAAGCAGGGTTAGGTAAGGGGCTCAAGATTGAAGATTTGGATCTAAGT
GAGGAGGAGATGGAGATGTATGTTGATCTCCATCCCATCACTAACACATCTCCTTACACT
GTGCTTGAGACTCTGTCTCTAGCTAAGGCGGCTATTCTTTTCCGGCAACTTGGTCTTCGC
CACTTGTGTGTGGTGCCTAAAACACCAGGGAGACCGCCTATTGTTGGAATACTGACAAGG
CATGATTTCATGCCGGAACATGTCCTGGGACTCTACCCTCACATTGATCCCCTCAAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

AT5G49890.1

PEP Infomation

| chloride channel C | Chr5:20288489-20292143 REVERSE LENGTH=779 | 201606

Sequence

MDDRHEGDHHDIEVEGGALHGFERKISGILDDGSVGFRQPLLARNRKNTTSQIAIVGANT
CPIESLDYEIFENDFFKQDWRSRKKIEILQYTFLKWALAFLIGLATGLVGFLNNLGVENI
AGFKLLLIGNLMLKEKYFQAFFAFAGCNLILATAAASLCAFIAPAAAGSGIPEVKAYLNG
IDAYSILAPSTLFVKIFGSIFGVAAGFVVGKEGPMVHTGACIANLLGQGGSKKYRLTWKW
LRFFKNDRDRRDLITCGAAAGVAAAFRAPVGGVLFALEEAASWWRNALLWRTFFTTAVVA
VVLRSLIEFCRSGRCGLFGKGGLIMFDVNSGPVLYSTPDLLAIVFLGVIGGVLGSLYNYL
VDKVLRTYSIINEKGPRFKIMLVMAVSILSSCCAFGLPWLSQCTPCPIGIEEGKCPSVGR
SSIYKSFQCPPNHYNDLSSLLLNTNDDAIRNLFTSRSENEFHISTLAIFFVAVYCLGIIT
YGIAIPSGLFIPVILAGASYGRLVGRLLGPVSQLDVGLFSLLGAASFLGGTMRMTVSLCV
ILLELTNNLLMLPLVMLVLLISKTVADCFNRGVYDQIVTMKGLPYMEDHAEPYMRNLVAK
DVVSGALISFSRVEKVGVIWQALKMTRHNGFPVIDEPPFTEASELCGIALRSHLLVLLQG
KKFSKQRTTFGSQILRSCKARDFGKAGLGKGLKIEDLDLSEEEMEMYVDLHPITNTSPYT
VLETLSLAKAAILFRQLGLRHLCVVPKTPGRPPIVGILTRHDFMPEHVLGLYPHIDPLK

Transcript Sequence

Transcript ID

AT5G49890.1

Transcript Infomation

| chloride channel C | Chr5:20288055-20292432 REVERSE LENGTH=2982 | 201606

Sequence

GAAAATCATAACAAAGAAAGAGAGTTTAGTTTTGCCTAAATTAGGATCAAATAAAAAAAC
AAAATTCCTGACCCATACCACTCTACGACCTCCCTCAAAAAAAAACAAAAAAGAAAAAAA
AACAATAAAAAAATCGACTTTTTAGCATCTGCTTGAGCGCGAGAGGTTCATGATTCCAGG
AATCTCGTGCCCAATTATATAGCTTTCCATTTCTGTGGCTTTGTAATCTGATCGGAAATC
GAAAACAAACAATTTTATTTTCTTAAAAAAACAAGATCGTGGAGGAGAGATGGATGATCG
GCACGAAGGAGACCATCATGATATAGAGGTTGAAGGAGGAGCTTTACATGGTTTCGAGAG
GAAGATATCTGGGATTCTAGACGATGGATCTGTCGGATTTCGACAGCCTCTTCTCGCTAG
GAATCGAAAGAACACAACTTCTCAGATCGCTATTGTCGGAGCTAATACTTGTCCCATCGA
AAGCCTTGATTACGAGATCTTCGAAAATGATTTTTTCAAGCAAGACTGGAGGTCTAGGAA
GAAGATTGAGATACTTCAGTATACGTTTCTCAAATGGGCGCTTGCTTTTCTTATTGGTTT
AGCTACTGGACTTGTTGGCTTTTTGAATAACCTTGGTGTTGAGAATATAGCTGGATTTAA
ACTCTTGCTCATCGGTAATCTCATGCTCAAGGAAAAATATTTCCAGGCATTTTTTGCATT
TGCTGGTTGTAACTTAATTTTGGCAACTGCTGCTGCTTCACTCTGTGCTTTTATTGCTCC
TGCGGCGGCAGGATCTGGCATACCTGAGGTTAAAGCATATCTCAATGGTATAGATGCTTA
TTCAATATTAGCTCCAAGCACCCTCTTTGTTAAGATCTTTGGCTCTATATTTGGAGTTGC
TGCCGGATTTGTAGTTGGAAAAGAAGGGCCTATGGTTCATACTGGTGCTTGCATTGCTAA
TTTACTTGGACAAGGTGGTTCCAAAAAGTACCGGTTGACTTGGAAGTGGCTCAGATTCTT
CAAAAACGATAGAGACAGAAGAGACCTGATCACTTGCGGGGCTGCTGCTGGTGTAGCAGC
TGCCTTCCGTGCTCCAGTTGGAGGAGTGCTTTTCGCCCTTGAAGAAGCTGCTTCATGGTG
GAGGAATGCCCTTCTCTGGAGGACATTCTTCACTACCGCAGTTGTAGCAGTGGTCTTACG
AAGTTTGATTGAGTTCTGTCGCTCTGGGAGATGTGGACTGTTTGGGAAAGGAGGTCTCAT
CATGTTTGATGTAAACTCGGGACCAGTGCTATATAGCACTCCAGATTTGCTAGCAATAGT
ATTCCTTGGAGTTATTGGTGGTGTGCTTGGAAGCCTTTACAACTACCTTGTGGACAAAGT
CCTCCGCACATATAGCATTATAAACGAGAAAGGTCCGAGATTTAAAATTATGCTTGTAAT
GGCAGTTTCCATTTTGAGCTCGTGTTGCGCATTTGGTCTCCCATGGCTTTCACAGTGTAC
TCCATGTCCTATTGGCATAGAGGAGGGAAAGTGCCCTAGTGTAGGTCGATCCAGCATCTA
TAAGAGTTTCCAGTGTCCTCCAAACCATTACAATGACCTTTCCTCCCTACTTCTCAACAC
CAATGATGATGCAATCCGTAATCTTTTCACATCCAGATCTGAAAATGAATTCCATATCTC
TACCCTTGCCATCTTCTTTGTCGCAGTGTACTGCCTTGGCATCATAACATACGGCATAGC
CATACCCTCTGGGCTTTTCATTCCTGTCATTCTTGCTGGAGCCTCTTATGGACGACTAGT
GGGTAGACTGCTGGGTCCAGTATCTCAGCTTGATGTAGGTCTGTTTTCTCTGCTCGGAGC
TGCTTCCTTCCTTGGAGGCACAATGAGAATGACGGTCTCTCTATGTGTTATACTGCTCGA
ACTTACAAATAATCTCCTAATGCTGCCACTGGTGATGCTTGTACTCCTTATATCAAAAAC
GGTTGCAGATTGTTTCAACAGGGGGGTCTATGACCAGATTGTAACAATGAAAGGACTGCC
TTACATGGAAGACCATGCAGAGCCGTACATGCGCAATTTGGTTGCAAAGGACGTAGTTTC
TGGAGCTTTGATATCCTTTTCGAGAGTTGAAAAGGTTGGGGTAATATGGCAGGCTTTAAA
AATGACAAGACATAATGGTTTCCCTGTAATTGATGAGCCACCTTTCACAGAAGCTTCTGA
GCTATGTGGGATTGCCTTGAGATCTCATCTCCTTGTGCTTCTCCAAGGGAAGAAATTCTC
GAAGCAGAGAACAACTTTTGGTTCACAAATTCTGAGAAGTTGCAAAGCCCGTGACTTTGG
TAAAGCAGGGTTAGGTAAGGGGCTCAAGATTGAAGATTTGGATCTAAGTGAGGAGGAGAT
GGAGATGTATGTTGATCTCCATCCCATCACTAACACATCTCCTTACACTGTGCTTGAGAC
TCTGTCTCTAGCTAAGGCGGCTATTCTTTTCCGGCAACTTGGTCTTCGCCACTTGTGTGT
GGTGCCTAAAACACCAGGGAGACCGCCTATTGTTGGAATACTGACAAGGCATGATTTCAT
GCCGGAACATGTCCTGGGACTCTACCCTCACATTGATCCCCTCAAGTGAATAAGGTAATA
AAGAATGGAGAAACAAGTACGTGAGAGTTCTCTAAAGATCTACAATGTAATAATATGTGA
ATATCAAAAAATTAAAAGCCCAGATGACCAATGTCACTTAGGCATTTATTTCAATTATTC
GTTGAGATTGATTATGGAAAAGCAGGGGAAGGATGATTGTGTAATGAGGTGATACAAGTT
TTTTTTTTTTGGGTTTTGGTTTTCACAACATTTATTCAAAACAATAAATAAAAACTAAAC
ATGTAATTATATTATAAGTCGATATCAATTTTGCTCTAATCTTCTTTACATGTAGGTAGT
CTGTGTATTATTTGTGTTTTAAATTCATGGTTATATAAAAAT