Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT5G49610.1
CDS Infomation	\| F-box family protein \| Chr5:20131448-20132527 REVERSE LENGTH=1080 \| 201606
Sequence	ATGGATAACCAAAAAGGTGCTCTCTTTCCCGATGAGGTTATTCTCCAGATTCTTGCTAGA TTACCTGTTAAATCTCTCTTCAGGTTCAAATCCGTTTGCAAATCATGGTACAGATTACCT TCTGACAAATATTTCACTTCCTTGTTCAATCAACTCTCTGTAAAAGAGCAATTGCTTGTG GCTGAAGTATCAGATTCTTCTAGTTTGATCTGTGTTGATAATCTGAGAGGTGTTTCTGAG TTATCATTGGATTTTGTTAGAGATAGGGTGAGGATTAGGGTTTCTTCTAATGGTTTGTTG TGTTGTTCAAGCATTCCTGAAAAGGGTGTTTACTATGTTTGTAATCCGTCGACTAGAGAG TATAGGAAATTGCCTAAGAGTCGAGAAAGACCTGTTACTCGGTTTTACCCTGATGGTGAG GCTACTCTTGTTGGTTTGGCTTGTGATTTGAGTAAGAACAAGTTTAATGTGGTGTTGGCT GGTTACCATAGGTCTTTTGGTCAGAGACCTGATGGGAGTTTCATTTGCTTGGTGTTTGAT TCTGAGAGTAACAAATGGAGGAAGTTTGTTTCGGTGTTAGAAGAATGTAGTTTCACACAC ATGAGTAAGAACCAAGTGGTGTTTGTTAATGGGATGCTTCATTGGTTGATGAGTGGTTTG TGTTATATACTTGCGCTTGATGTTGAACATGATGTGTGGAGAAAGATTTCTTTGCCCGAT GAGATTAGAATTGGGAATGGTGGTGGTAATCGGGTTTATCTCTTGGAATCCGATGGGTTT TTGTCGGTGATTCAGTTATCAGATGTATGGATGAAGATTTGGAAGATGAGTGAGTATGAG ACTGAAACTTGGAGTGTTGTTGATAGCATAAGTTTAAGGTGTATTAAAGGCTTGGTACCT GGAATCTTCCCGATTTGTCAGACCGGTGAGTATGTTTTCTTGGCTACTCATAAACAGGTT TTGGTGTATCAAAGACGAAGTAAGTTATGGAAAGAGATGTTTTCTGTAAAAGGAAGCTCT TCTCTGCCTTTGTGGTTCTCTGCTCACGCCTTTCGCAGCACCATAGTACCCTGTAATTAA

Peptide Sequence

PEP ID	AT5G49610.1
PEP Infomation	\| F-box family protein \| Chr5:20131448-20132527 REVERSE LENGTH=359 \| 201606
Sequence	MDNQKGALFPDEVILQILARLPVKSLFRFKSVCKSWYRLPSDKYFTSLFNQLSVKEQLLV AEVSDSSSLICVDNLRGVSELSLDFVRDRVRIRVSSNGLLCCSSIPEKGVYYVCNPSTRE YRKLPKSRERPVTRFYPDGEATLVGLACDLSKNKFNVVLAGYHRSFGQRPDGSFICLVFD SESNKWRKFVSVLEECSFTHMSKNQVVFVNGMLHWLMSGLCYILALDVEHDVWRKISLPD EIRIGNGGGNRVYLLESDGFLSVIQLSDVWMKIWKMSEYETETWSVVDSISLRCIKGLVP GIFPICQTGEYVFLATHKQVLVYQRRSKLWKEMFSVKGSSSLPLWFSAHAFRSTIVPCN

Transcript Sequence

Transcript ID	AT5G49610.1
Transcript Infomation	\| F-box family protein \| Chr5:20131274-20132744 REVERSE LENGTH=1471 \| 201606
Sequence	AAGCGATTCTTCATCATCCGTTTCGCCATTTTTGTTTCTCAGTGATCTCTGAAATGGTCT CTTCTCTTTTTTTGGTCGAATCCAATCTCAATTATGTTGTTATCTTTCTTCCATCAATGG GTAATCAAAACATAGAATTGATGCGGTAAGACTATAAAGGTTTAGTCTTTAACCATTGTA GATTCCTCTGTCTCTTGTGTATTTGATTGATCTGTTAATGGATAACCAAAAAGGTGCTCT CTTTCCCGATGAGGTTATTCTCCAGATTCTTGCTAGATTACCTGTTAAATCTCTCTTCAG GTTCAAATCCGTTTGCAAATCATGGTACAGATTACCTTCTGACAAATATTTCACTTCCTT GTTCAATCAACTCTCTGTAAAAGAGCAATTGCTTGTGGCTGAAGTATCAGATTCTTCTAG TTTGATCTGTGTTGATAATCTGAGAGGTGTTTCTGAGTTATCATTGGATTTTGTTAGAGA TAGGGTGAGGATTAGGGTTTCTTCTAATGGTTTGTTGTGTTGTTCAAGCATTCCTGAAAA GGGTGTTTACTATGTTTGTAATCCGTCGACTAGAGAGTATAGGAAATTGCCTAAGAGTCG AGAAAGACCTGTTACTCGGTTTTACCCTGATGGTGAGGCTACTCTTGTTGGTTTGGCTTG TGATTTGAGTAAGAACAAGTTTAATGTGGTGTTGGCTGGTTACCATAGGTCTTTTGGTCA GAGACCTGATGGGAGTTTCATTTGCTTGGTGTTTGATTCTGAGAGTAACAAATGGAGGAA GTTTGTTTCGGTGTTAGAAGAATGTAGTTTCACACACATGAGTAAGAACCAAGTGGTGTT TGTTAATGGGATGCTTCATTGGTTGATGAGTGGTTTGTGTTATATACTTGCGCTTGATGT TGAACATGATGTGTGGAGAAAGATTTCTTTGCCCGATGAGATTAGAATTGGGAATGGTGG TGGTAATCGGGTTTATCTCTTGGAATCCGATGGGTTTTTGTCGGTGATTCAGTTATCAGA TGTATGGATGAAGATTTGGAAGATGAGTGAGTATGAGACTGAAACTTGGAGTGTTGTTGA TAGCATAAGTTTAAGGTGTATTAAAGGCTTGGTACCTGGAATCTTCCCGATTTGTCAGAC CGGTGAGTATGTTTTCTTGGCTACTCATAAACAGGTTTTGGTGTATCAAAGACGAAGTAA GTTATGGAAAGAGATGTTTTCTGTAAAAGGAAGCTCTTCTCTGCCTTTGTGGTTCTCTGC TCACGCCTTTCGCAGCACCATAGTACCCTGTAATTAACATGTTAATGTTGCCTTCTCTAC TCTTTTATTTTTTTTGGTTTATTTTCAGCTCTCGGATCCTTTAGGGCTTATGAAATTTGT TCAAGGTTTTATAATCTTTCTAGGATAACATCATATAAAGTAGTATAGAGTTGATTTCTT CTGTTGCTTTTAGTACAAATAGATTTTGGTT