Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT5G47850.1
CDS Infomation	\| CRINKLY4 related 4 \| Chr5:19378803-19381058 REVERSE LENGTH=2256 \| 201606
Sequence	ATGGCACTTACCATCTCAATCTCTTGTTTCTCCTCTTACTTTGTGTCTCTCCTTCTTCTT GTTCTATCTTCCTTCTCCTTTGTTTGCTTCTCCCTCTCCACCGTCTCCATCTCCCACATC TCTAATCAGACTCTTGTATGTGCTCTCAACAACCACTCTTATCTTCAATGTTCCAGTTTC CCTTTAAATTCGATTCCATTTTCTTTAACCGGTAACCTTCGAAATCGAAGGTTTTCGGGG GTTGTTTCAGGGAATGGGTTTGTGTGCGGATTGATATCGCGGCTGGATTCCAACACTTCC ACACTTCTTTGTTGGAGATTCTCTGTTGATGGAACTAATATGTTGCACAAAAGAATCTAC CACGGTCCTGAGCTCGAAGAGCTAGAAGCCGGGAATTTCCGCATTTGTGGAGTTGAAAGA GTCTCAAGGCGCCTCCGTTGCTGGCAACCGTACTATCTGCCACGGCCGGATAATTACCGT TCCATTGCCTTGGGAGATAATTTTTTCTGTGGGCTATCTCAGCCACCTGGTATGATCAGT TGTGAAGGTATAGCCAAAGTGCCGAGTGGAGACCACTACATCGCGATAGCGGCTGGATCA CGACAAGCGTGTGCGATCACTGTTGACAATGATGTCGAGTGTTGGGGACAAACACAGTCG CTGCCACGTGAAAAGTTCTTAGCACTAGCGGTTGGGGAAGACCGTGGTTGCGGTGTTAGA TGGTCTAATGGAACTGTGGTGTGTTGGGGCAACAACAACAACTTTAGTTTGCCTCAAACG CTTAAGGACATTCATTTTACATCAATATATGCTAAAGGGCCAATGTTTTGCGGTGTTGCC ACAAGAAATTACACTCTAATTTGTTGGGGGAATGAGAATTTTAAATCCGGTGTTTTCACT CCATTCCAAGGCCTAATTTCTCAAGTGGTAATGCCAGGACCGTGTAGAAGAGAATGCCCT TACCGTCCATTGTCAGGATCACAGTCCTTATGCGGCAATGAGTTGATGATTTGCGATTTG AAAAGAAATGATGGAGAGTTTCCTGATACTAGGGCTCAAAACTCTAAGAACAAAACTTGG AGCAGAAGAAACATTGCGTTTCTAGTGGTCGGATGCGTTGGAACGTTTTCCTTGCTCCTT GTCATCAGTTTCTTGATCTTTAAAAGCCACTGTCGATGCCGTGTCCATGACTCTGGACGT CTTGATGATACTAGGACAATAGACATACCCAAGCTCGAGAAGAGGCTGTGCACTCTAGCA AGTTTAGGTAATCCTGGGCAGCTAATGGAGTTCTCAATTGACGAGCTAGCTCTAGCCACG GATGGTTTCTCTGTCCGGTTTCATCTTGGTATAGGCAGCTTCGGCTCTGTTTATCAAGGT GTTTTGTCGGATGGACGTCATGTCGCAATCAAACGAGCTGAGCTAACAAATCCTACATTG TCTGGGACAACGATGAGACACCGACGAGCAGATAAGGATTCAGCGTTCGTGAACGAGCTA GAGTCTATGTCGCGGCTTAACCACAAAAATCTTGTTCGACTTCTGGGTTTCTATGAGGAC ACAGAAGAGAGGATTTTGGTGTACGAGTACATGAAAAATGGATCTCTAGCCGATCACCTT CACAATCCTCAATTTGACCCTCTTTCGTGGCAAACACGCTTGATGATCGCGCTTGACGCT GCTCGTGGGATCCAATACCTTCATGAGTTTATCGTGCCTCCGGTGATCCACCGTGACATA AAGTCATCAAACATACTTTTGGACGCCACATGGACAGCCAAAGTTTCAGATTTCGGCCTA TCTCAAATGGGTCCAACGGAAGAAGATGACGTCTCACATCTCTCTTTACACGCTGCCGGT ACATTGGGATATATCGACCCGGAGTACTACAAGTTTCAACAGCTCACAACCAAGAGCGAT GTTTACAGCTTTGGCGTGGTGTTGCTGGAGTTGCTGTCTGGTCACAAAGCGATACACAAT AACGAAGACGAAAACCCTAGAAACTTAGTGGAATATGTTGTACCATACATTTTGCTGGAT GAGGCTCATAGAATACTTGACCAGAGGATTCCACCGCCGACCCCTTACGAAATCGAGGCG GTGGCTCATGTCGGATACTTGGCAGCGGAGTGTTTGATGCCGTGTAGTCGGAAAAGGCCG TCAATGGTGGAGGTAGTCAGTAAACTAGAGAGTGCTTTGGCCGCTTGTTTGACGGCTCCA AAGACGGAGACCGTATCTCGATCAAACACTTATTAG

Peptide Sequence

PEP ID	AT5G47850.1
PEP Infomation	\| CRINKLY4 related 4 \| Chr5:19378803-19381058 REVERSE LENGTH=751 \| 201606
Sequence	MALTISISCFSSYFVSLLLLVLSSFSFVCFSLSTVSISHISNQTLVCALNNHSYLQCSSF PLNSIPFSLTGNLRNRRFSGVVSGNGFVCGLISRLDSNTSTLLCWRFSVDGTNMLHKRIY HGPELEELEAGNFRICGVERVSRRLRCWQPYYLPRPDNYRSIALGDNFFCGLSQPPGMIS CEGIAKVPSGDHYIAIAAGSRQACAITVDNDVECWGQTQSLPREKFLALAVGEDRGCGVR WSNGTVVCWGNNNNFSLPQTLKDIHFTSIYAKGPMFCGVATRNYTLICWGNENFKSGVFT PFQGLISQVVMPGPCRRECPYRPLSGSQSLCGNELMICDLKRNDGEFPDTRAQNSKNKTW SRRNIAFLVVGCVGTFSLLLVISFLIFKSHCRCRVHDSGRLDDTRTIDIPKLEKRLCTLA SLGNPGQLMEFSIDELALATDGFSVRFHLGIGSFGSVYQGVLSDGRHVAIKRAELTNPTL SGTTMRHRRADKDSAFVNELESMSRLNHKNLVRLLGFYEDTEERILVYEYMKNGSLADHL HNPQFDPLSWQTRLMIALDAARGIQYLHEFIVPPVIHRDIKSSNILLDATWTAKVSDFGL SQMGPTEEDDVSHLSLHAAGTLGYIDPEYYKFQQLTTKSDVYSFGVVLLELLSGHKAIHN NEDENPRNLVEYVVPYILLDEAHRILDQRIPPPTPYEIEAVAHVGYLAAECLMPCSRKRP SMVEVVSKLESALAACLTAPKTETVSRSNTY

Transcript Sequence

Transcript ID	AT5G47850.1
Transcript Infomation	\| CRINKLY4 related 4 \| Chr5:19378669-19381190 REVERSE LENGTH=2522 \| 201606
Sequence	CTTAGTTTTGGTCTCTTGGTAAGGAGGTGTCTCTGTCTCTGTCTCATGTCTCTCTAACCG CGTTGATTTGCCGTCTTAAAAACACAACTCCTCAAACATAAAACATTCACACGCCATGAG AACTCTTCTTCAATGGCACTTACCATCTCAATCTCTTGTTTCTCCTCTTACTTTGTGTCT CTCCTTCTTCTTGTTCTATCTTCCTTCTCCTTTGTTTGCTTCTCCCTCTCCACCGTCTCC ATCTCCCACATCTCTAATCAGACTCTTGTATGTGCTCTCAACAACCACTCTTATCTTCAA TGTTCCAGTTTCCCTTTAAATTCGATTCCATTTTCTTTAACCGGTAACCTTCGAAATCGA AGGTTTTCGGGGGTTGTTTCAGGGAATGGGTTTGTGTGCGGATTGATATCGCGGCTGGAT TCCAACACTTCCACACTTCTTTGTTGGAGATTCTCTGTTGATGGAACTAATATGTTGCAC AAAAGAATCTACCACGGTCCTGAGCTCGAAGAGCTAGAAGCCGGGAATTTCCGCATTTGT GGAGTTGAAAGAGTCTCAAGGCGCCTCCGTTGCTGGCAACCGTACTATCTGCCACGGCCG GATAATTACCGTTCCATTGCCTTGGGAGATAATTTTTTCTGTGGGCTATCTCAGCCACCT GGTATGATCAGTTGTGAAGGTATAGCCAAAGTGCCGAGTGGAGACCACTACATCGCGATA GCGGCTGGATCACGACAAGCGTGTGCGATCACTGTTGACAATGATGTCGAGTGTTGGGGA CAAACACAGTCGCTGCCACGTGAAAAGTTCTTAGCACTAGCGGTTGGGGAAGACCGTGGT TGCGGTGTTAGATGGTCTAATGGAACTGTGGTGTGTTGGGGCAACAACAACAACTTTAGT TTGCCTCAAACGCTTAAGGACATTCATTTTACATCAATATATGCTAAAGGGCCAATGTTT TGCGGTGTTGCCACAAGAAATTACACTCTAATTTGTTGGGGGAATGAGAATTTTAAATCC GGTGTTTTCACTCCATTCCAAGGCCTAATTTCTCAAGTGGTAATGCCAGGACCGTGTAGA AGAGAATGCCCTTACCGTCCATTGTCAGGATCACAGTCCTTATGCGGCAATGAGTTGATG ATTTGCGATTTGAAAAGAAATGATGGAGAGTTTCCTGATACTAGGGCTCAAAACTCTAAG AACAAAACTTGGAGCAGAAGAAACATTGCGTTTCTAGTGGTCGGATGCGTTGGAACGTTT TCCTTGCTCCTTGTCATCAGTTTCTTGATCTTTAAAAGCCACTGTCGATGCCGTGTCCAT GACTCTGGACGTCTTGATGATACTAGGACAATAGACATACCCAAGCTCGAGAAGAGGCTG TGCACTCTAGCAAGTTTAGGTAATCCTGGGCAGCTAATGGAGTTCTCAATTGACGAGCTA GCTCTAGCCACGGATGGTTTCTCTGTCCGGTTTCATCTTGGTATAGGCAGCTTCGGCTCT GTTTATCAAGGTGTTTTGTCGGATGGACGTCATGTCGCAATCAAACGAGCTGAGCTAACA AATCCTACATTGTCTGGGACAACGATGAGACACCGACGAGCAGATAAGGATTCAGCGTTC GTGAACGAGCTAGAGTCTATGTCGCGGCTTAACCACAAAAATCTTGTTCGACTTCTGGGT TTCTATGAGGACACAGAAGAGAGGATTTTGGTGTACGAGTACATGAAAAATGGATCTCTA GCCGATCACCTTCACAATCCTCAATTTGACCCTCTTTCGTGGCAAACACGCTTGATGATC GCGCTTGACGCTGCTCGTGGGATCCAATACCTTCATGAGTTTATCGTGCCTCCGGTGATC CACCGTGACATAAAGTCATCAAACATACTTTTGGACGCCACATGGACAGCCAAAGTTTCA GATTTCGGCCTATCTCAAATGGGTCCAACGGAAGAAGATGACGTCTCACATCTCTCTTTA CACGCTGCCGGTACATTGGGATATATCGACCCGGAGTACTACAAGTTTCAACAGCTCACA ACCAAGAGCGATGTTTACAGCTTTGGCGTGGTGTTGCTGGAGTTGCTGTCTGGTCACAAA GCGATACACAATAACGAAGACGAAAACCCTAGAAACTTAGTGGAATATGTTGTACCATAC ATTTTGCTGGATGAGGCTCATAGAATACTTGACCAGAGGATTCCACCGCCGACCCCTTAC GAAATCGAGGCGGTGGCTCATGTCGGATACTTGGCAGCGGAGTGTTTGATGCCGTGTAGT CGGAAAAGGCCGTCAATGGTGGAGGTAGTCAGTAAACTAGAGAGTGCTTTGGCCGCTTGT TTGACGGCTCCAAAGACGGAGACCGTATCTCGATCAAACACTTATTAGCCACGTTTAGCT TAATTAAATCTTGTGGTCAACTGTAATTGTATTTATTTTTCTAGGGATTAGGAATTTAAT TAATTGGTACAGAATTTTAATATTTTCTTCGACGAAAACCCTTGCACAATTCAATTTCTT TT