Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT5G44980.1
CDS Infomation	\| F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein \| Chr5:18160600-18162058 FORWARD LENGTH=1308 \| 201606
Sequence	ATGGATCGCGATTATATCAGCGAATTGCCGGATTCTTTACTAACTCAGATACTCTTAGAG CTTCGAACCAAAGATTCTGTTAAGACAAGCGTGTTATCGAAGAGATGGAGAAATCTTTGG TTAAACGTTCCTGGACTCGAATTATTCACCCTTCAATTCACATATCCTGATCGCGAAGAA ATCTTTGTAAGGTTTATGGACAGATTTATGGAGTTTAAGTGCAGGTCACGCCTGAAAAAG TTCATGATAACGTATGTCGATTGTAAAGGTTATCGAGATCGATTAATGGAGTTGATCGGT ACACTGGTTGATCATGGACTTCAGCATTTGTATGTTTTTATGCATACTTTTGACAGAGTT GATTTCAAACGTCAAAACATTTACAAGAGCAAGACATTGGTCTCTTTGAAGCTTCATAAC GTAGAGTTAAAGAATTCAGACTTTGTTGTTTCTCTACCTTGTCTCAAGATCTTGAAACTG GAGAATATTTGTCACGGTGAGGATGGTCCTTTGGTTGTGGAGAAGCTCATCTCAGGATGT TCTGTTCTTGAAGATCTTGAGCTGATTAGGCCTTTTGATATTAGGACACATAAAGTTCTT CTGCTTCTGCGTGTGAGCTCTCAGACTCTGAAAAGCTTTACCTTACATTTTGCGATCTAT AAGGATCGTACAGATTTTTCAGTTGAGATTGATGCTCCAAGACTCAAGTATATGACTGTT GAACAGAGTCAATCTGATAGCATTGTGGTAAAGAACCTGAGTTCCTTGTTCAGCATCGAC ATTGGTACTAAATTTAATCCTTTGAGACATGAGGATCTAAGGATGCGTAATGTTTTCTAC GATTTTTTAACCGGGATATCTAGTGTAAAACATATGATCATCTGTTTGTGGAGTCTCCAG AGGTTTTCTCCTTATTCAAAACCCGGACTGATTCCCAAATTCCAGAACTTGTATCATTTA AAAGCACAGATGTGGAGCTCATCAACACACTTATTGGAAGCGTTTCTTGAGAGCTGCCCA AATCTGAAAAACCTCATCTTGGAATATAATGTTGAATTGGATCGAGAGCAAGTGGACTTT ACCAACGTGCCTCAATGTTTAATATCGACGCTGGAGTATGTTGAGATTAAAGAACCGAAT GAGAAAAGTACGATTAAACTAGTGAACTACTTTCTTGAGAATTCAGCAGTCCTCAAGAAA CTTACTCTACGTTTCTCATATTCATCTTCTATCTACCTAAAGAGCTACAAGAAGCTTCTT ACATCAACAAAGCTTTCTCCCACATGTCAAGTTATCTTTGGTTGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT5G44980.1
PEP Infomation	\| F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein \| Chr5:18160600-18162058 FORWARD LENGTH=435 \| 201606
Sequence	MDRDYISELPDSLLTQILLELRTKDSVKTSVLSKRWRNLWLNVPGLELFTLQFTYPDREE IFVRFMDRFMEFKCRSRLKKFMITYVDCKGYRDRLMELIGTLVDHGLQHLYVFMHTFDRV DFKRQNIYKSKTLVSLKLHNVELKNSDFVVSLPCLKILKLENICHGEDGPLVVEKLISGC SVLEDLELIRPFDIRTHKVLLLLRVSSQTLKSFTLHFAIYKDRTDFSVEIDAPRLKYMTV EQSQSDSIVVKNLSSLFSIDIGTKFNPLRHEDLRMRNVFYDFLTGISSVKHMIICLWSLQ RFSPYSKPGLIPKFQNLYHLKAQMWSSSTHLLEAFLESCPNLKNLILEYNVELDREQVDF TNVPQCLISTLEYVEIKEPNEKSTIKLVNYFLENSAVLKKLTLRFSYSSSIYLKSYKKLL TSTKLSPTCQVIFGC

Transcript Sequence

Transcript ID	AT5G44980.1
Transcript Infomation	\| F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein \| Chr5:18160204-18162264 FORWARD LENGTH=1678 \| 201606
Sequence	GCCCAACTAAATGAAAAAAAACCTAATCCATCAATTGTCACTTGGCTATATATCTCCGGC GATAATCTGTCGACTGTGGACAAATCAAACCTACGAAATTACGTAAGAAATTTTAATCGA ATTTGGGATAAAAATTGAGAAGCTAATAGAGCGGATTATGTGGGATGGATCGCGATTATA TCAGCGAATTGCCGGATTCTTTACTAACTCAGATACTCTTAGAGCTTCGAACCAAAGATT CTGTTAAGACAAGCGTGTTATCGAAGAGATGGAGAAATCTTTGGTTAAACGTTCCTGGAC TCGAATTATTCACCCTTCAATTCACATATCCTGATCGCGAAGAAATCTTTGTAAGGTTTA TGGACAGATTTATGGAGTTTAAGTGCAGGTCACGCCTGAAAAAGTTCATGATAACGTATG TCGATTGTAAAGGTTATCGAGATCGATTAATGGAGTTGATCGGTACACTGGTTGATCATG GACTTCAGCATTTGTATGTTTTTATGCATACTTTTGACAGAGTTGATTTCAAACGTCAAA ACATTTACAAGAGCAAGACATTGGTCTCTTTGAAGCTTCATAACGTAGAGTTAAAGAATT CAGACTTTGTTGTTTCTCTACCTTGTCTCAAGATCTTGAAACTGGAGAATATTTGTCACG GTGAGGATGGTCCTTTGGTTGTGGAGAAGCTCATCTCAGGATGTTCTGTTCTTGAAGATC TTGAGCTGATTAGGCCTTTTGATATTAGGACACATAAAGTTCTTCTGCTTCTGCGTGTGA GCTCTCAGACTCTGAAAAGCTTTACCTTACATTTTGCGATCTATAAGGATCGTACAGATT TTTCAGTTGAGATTGATGCTCCAAGACTCAAGTATATGACTGTTGAACAGAGTCAATCTG ATAGCATTGTGGTAAAGAACCTGAGTTCCTTGTTCAGCATCGACATTGGTACTAAATTTA ATCCTTTGAGACATGAGGATCTAAGGATGCGTAATGTTTTCTACGATTTTTTAACCGGGA TATCTAGTGTAAAACATATGATCATCTGTTTGTGGAGTCTCCAGAGGTTTTCTCCTTATT CAAAACCCGGACTGATTCCCAAATTCCAGAACTTGTATCATTTAAAAGCACAGATGTGGA GCTCATCAACACACTTATTGGAAGCGTTTCTTGAGAGCTGCCCAAATCTGAAAAACCTCA TCTTGGAATATAATGTTGAATTGGATCGAGAGCAAGTGGACTTTACCAACGTGCCTCAAT GTTTAATATCGACGCTGGAGTATGTTGAGATTAAAGAACCGAATGAGAAAAGTACGATTA AACTAGTGAACTACTTTCTTGAGAATTCAGCAGTCCTCAAGAAACTTACTCTACGTTTCT CATATTCATCTTCTATCTACCTAAAGAGCTACAAGAAGCTTCTTACATCAACAAAGCTTT CTCCCACATGTCAAGTTATCTTTGGTTGTTGAACATTGTTTCAGTGACGTTATTCCTGTA GTTTGGCTTTTTGTTGCTTTGATTTCAATTTCAGGACAGAGTTTCAGTTTAATTATAGTT TTCTCTTTTTTTTTTAATAAAAATTTTTATTTTCAACATAATAATTGTAGTTTATATACA TTTTAATTAATAATTGCATTTCTCTGGTTGTATAAAATTCTAATTGGGTTTTGGATTC