Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT5G40490.1
CDS Infomation	\| RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein \| Chr5:16225483-16227423 FORWARD LENGTH=1272 \| 201606
Sequence	ATGGATCCTTATGGAACGGAAACAGTTATCGAAGACGAAATCCACGATCCTAAACCATCC GAAGATATTGAAGACGATGACGACAAATCTCAGCCTCACTCTGGTGGCGGCGTCGATAGT GCTGGAAAGATATTTGTTGGAGGTTTAGCCAGGGAGACAACTTCAGCTGAATTCCTCAAG CATTTTGGGAAATATGGAGAGATCACTGATTCTGTGATTATGAAGGATAGGAAAACTGGA CAGCCTCGGGGATTTGGGTTTGTCACATATGCTGATTCCTCTGTGGTCGACAAAGTTATC CAAGACAATCACATTATAATTGGCAAGCAGGTTGAAATTAAGCGGACGATACCAAGAGGA TCCATGAGCTCTAACGATTTCAAAACCAAGAAGATATTTGTTGGTGGAATTCCTTCATCT GTGGATGATGATGAATTCAAGGAGTTCTTTATGCAATTTGGAGAGCTGAAGGAACATCAG ATTATGCGTGATCACTCAACTGGAAGATCACGTGGCTTTGGGTTTGTTACATATGAAAGT GAAGATATGGTTGATCATCTCTTGGCGAAAGGGAACAGAATTGAGCTTTCAGGGACTCAG GTAGAGATAAAGAAGGCAGAGCCTAAAAAACCAAACTCGGTTACAACCCCATCGAAGCGG TTCGGTGACTCTCGCTCTAACTTTGGTGGAGGTTATGGAGATGGTTATGGTGGCGGACAC GGTGGAGGATATGGTGGTCCAGGTGGTCCTTACAAGTCAGGTGGCGGTTATGGAGGTGGC CGGTCTGGTGGTTATGGAGGGTACGGAGGAGAATTCGGTGGGTATGGCGGTGGTGGATAT GGTGGTGGTGTGGGACCTTATAGAGGAGAACCAGCTCTTGGATATTCTGGTCGTTATGGA GGAGGAGGCGGTGGTTACAATAGAGGTGGATACAGTATGGGAGGGGGCGGTGGGTACGGT GGTGGACCAGGTGATATGTATGGTGGGTCATACGGTGAACCAGGAGGTGGTTATGGTGGA CCTAGTGGCAGTTATGGAGGCGGGTATGGTAGTAGCGGAATAGGTGGGTATGGTGGTGGA ATGGGTGGTGCTGGTGGCGGAGGCTATAGAGGAGGTGGTGGCTATGATATGGGTGGAGTT GGAGGGGGAGGCGCAGGAGGATATGGTGCTGGTGGTGGCGGAAACGGTGGAGGATCATTT TATGGAGGAGGAGGAGGTAGAGGTGGATATGGAGGCGGGGGCAGCGGACGGTACCATCCT TATGGAAGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	AT5G40490.1
PEP Infomation	\| RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein \| Chr5:16225483-16227423 FORWARD LENGTH=423 \| 201606
Sequence	MDPYGTETVIEDEIHDPKPSEDIEDDDDKSQPHSGGGVDSAGKIFVGGLARETTSAEFLK HFGKYGEITDSVIMKDRKTGQPRGFGFVTYADSSVVDKVIQDNHIIIGKQVEIKRTIPRG SMSSNDFKTKKIFVGGIPSSVDDDEFKEFFMQFGELKEHQIMRDHSTGRSRGFGFVTYES EDMVDHLLAKGNRIELSGTQVEIKKAEPKKPNSVTTPSKRFGDSRSNFGGGYGDGYGGGH GGGYGGPGGPYKSGGGYGGGRSGGYGGYGGEFGGYGGGGYGGGVGPYRGEPALGYSGRYG GGGGGYNRGGYSMGGGGGYGGGPGDMYGGSYGEPGGGYGGPSGSYGGGYGSSGIGGYGGG MGGAGGGGYRGGGGYDMGGVGGGGAGGYGAGGGGNGGGSFYGGGGGRGGYGGGGSGRYHP YGR

Transcript Sequence

Transcript ID	AT5G40490.1
Transcript Infomation	\| RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein \| Chr5:16225326-16227757 FORWARD LENGTH=1763 \| 201606
Sequence	TGTTTCTAAATCAAAGACACAACACAAGTGCTACGCGAAGTACAATAAGTGTCGCTCCTT TCTCTTCTCCAAGGGTTTTAGGGCTTTTAGGCGGCTGCCGCTTCTTTTTCATCTTCTTCT TCGTTCTCCGAAGGTTTAGGGTTTCGATTTTCCCATCATGGATCCTTATGGAACGGAAAC AGTTATCGAAGACGAAATCCACGATCCTAAACCATCCGAAGATATTGAAGACGATGACGA CAAATCTCAGCCTCACTCTGGTGGCGGCGTCGATAGTGCTGGAAAGATATTTGTTGGAGG TTTAGCCAGGGAGACAACTTCAGCTGAATTCCTCAAGCATTTTGGGAAATATGGAGAGAT CACTGATTCTGTGATTATGAAGGATAGGAAAACTGGACAGCCTCGGGGATTTGGGTTTGT CACATATGCTGATTCCTCTGTGGTCGACAAAGTTATCCAAGACAATCACATTATAATTGG CAAGCAGGTTGAAATTAAGCGGACGATACCAAGAGGATCCATGAGCTCTAACGATTTCAA AACCAAGAAGATATTTGTTGGTGGAATTCCTTCATCTGTGGATGATGATGAATTCAAGGA GTTCTTTATGCAATTTGGAGAGCTGAAGGAACATCAGATTATGCGTGATCACTCAACTGG AAGATCACGTGGCTTTGGGTTTGTTACATATGAAAGTGAAGATATGGTTGATCATCTCTT GGCGAAAGGGAACAGAATTGAGCTTTCAGGGACTCAGGTAGAGATAAAGAAGGCAGAGCC TAAAAAACCAAACTCGGTTACAACCCCATCGAAGCGGTTCGGTGACTCTCGCTCTAACTT TGGTGGAGGTTATGGAGATGGTTATGGTGGCGGACACGGTGGAGGATATGGTGGTCCAGG TGGTCCTTACAAGTCAGGTGGCGGTTATGGAGGTGGCCGGTCTGGTGGTTATGGAGGGTA CGGAGGAGAATTCGGTGGGTATGGCGGTGGTGGATATGGTGGTGGTGTGGGACCTTATAG AGGAGAACCAGCTCTTGGATATTCTGGTCGTTATGGAGGAGGAGGCGGTGGTTACAATAG AGGTGGATACAGTATGGGAGGGGGCGGTGGGTACGGTGGTGGACCAGGTGATATGTATGG TGGGTCATACGGTGAACCAGGAGGTGGTTATGGTGGACCTAGTGGCAGTTATGGAGGCGG GTATGGTAGTAGCGGAATAGGTGGGTATGGTGGTGGAATGGGTGGTGCTGGTGGCGGAGG CTATAGAGGAGGTGGTGGCTATGATATGGGTGGAGTTGGAGGGGGAGGCGCAGGAGGATA TGGTGCTGGTGGTGGCGGAAACGGTGGAGGATCATTTTATGGAGGAGGAGGAGGTAGAGG TGGATATGGAGGCGGGGGCAGCGGACGGTACCATCCTTATGGAAGGTAGAGAGTTCGATG AAAGCTTGAATCTTCTTCTTACTTGTTGTGTCATGCTTAGCATCATGTATGGTTATCAAG ATTGATAGCTAGTCATTGTATTTTGAGAGATGAGGCTTTTAGGGCTTTGATTCCCCTGAG TAGTTTAAATCAATACATTTTTTAGATTATAATTATCTCGGCGTAACAATGCCAGATTAT TTTTTACTCTCATGTGACATCTTTAGAGTTAGCTTGTAGCAACGCTTTTGAGGTTTTGGC TCAAATCTTATTAGAAGAAGACTCTTGTTTGTACCATTGCATATTTTTCATCATAAGCCT CTGTATGTGTCCGAAGGTTTGAT