Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Arabidopsis thaliana ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Arabidopsis thaliana

CDS Sequence

CDS ID	AT5G39350.1
CDS Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr5:15750929-15752962 FORWARD LENGTH=2034 \| 201606
Sequence	ATGAGTGAAGTTTTGCGCAGAGCCAACAACGCACTTAGTAGCGTCAAGCAATACCAATCT CTCTTGAATCACTTTGCAGCTACTCAATCAATTTCAAAAACCAAAGCTTTACACTGCCAC GTCATCACCGGCGGTCGAGTTTCCGGCCACATTCTCTCGACTCTCTCCGTAACTTATGCG TTATGTGGTCACATCACTTATGCACGGAAGCTGTTCGAGGAAATGCCTCAAAGCTCTTTG CTTTCTTATAACATTGTTATTAGAATGTACGTGCGTGAAGGATTGTATCACGATGCGATT AGCGTGTTTATTAGGATGGTTAGTGAGGGGGTTAAGTGTGTTCCGGATGGTTATACATAC CCTTTTGTTGCTAAAGCTGCTGGAGAATTGAAATCGATGAAATTGGGGTTGGTTGTTCAT GGGAGGATCTTGAGGAGTTGGTTTGGTAGGGATAAGTATGTGCAGAACGCGTTGTTAGCG ATGTATATGAACTTTGGGAAGGTTGAAATGGCGAGGGATGTGTTTGATGTGATGAAGAAC CGTGATGTGATTTCGTGGAACACGATGATTAGTGGGTATTATAGGAATGGTTATATGAAT GATGCGTTAATGATGTTTGATTGGATGGTTAATGAAAGTGTTGATCTTGACCATGCTACG ATTGTTTCTATGTTGCCTGTTTGTGGTCACTTGAAGGATTTGGAGATGGGGAGGAATGTT CATAAGTTGGTGGAAGAGAAGCGGTTAGGGGATAAAATTGAGGTGAAGAATGCGTTGGTG AATATGTACTTGAAATGTGGTCGTATGGATGAAGCGAGATTTGTTTTTGACAGGATGGAA CGAAGGGATGTGATCACGTGGACTTGTATGATTAACGGATATACTGAAGATGGAGATGTG GAAAACGCTTTAGAGTTGTGTAGATTGATGCAGTTTGAAGGCGTAAGACCTAATGCTGTG ACTATAGCTTCTCTTGTTTCGGTGTGTGGTGATGCTTTGAAGGTGAATGATGGTAAATGT TTACACGGTTGGGCGGTGAGGCAACAGGTTTATTCCGATATCATTATAGAAACATCTTTG ATCAGCATGTATGCTAAATGCAAACGTGTAGACCTCTGCTTTAGAGTATTTTCGGGGGCT TCGAAATACCATACCGGTCCTTGGAGTGCAATTATCGCTGGTTGTGTACAGAATGAACTT GTGAGTGATGCGTTAGGTCTATTCAAACGGATGCGACGGGAAGATGTGGAGCCCAATATT GCTACATTAAACAGTCTCCTTCCAGCATATGCAGCTTTGGCAGATTTGCGTCAAGCAATG AATATCCATTGCTACCTAACCAAAACCGGGTTTATGTCAAGCCTTGATGCTGCTACAGGG TTGGTTCATGTTTACTCAAAGTGTGGAACATTAGAATCTGCTCACAAGATATTCAATGGA ATCCAGGAAAAACACAAGAGCAAAGATGTAGTTCTATGGGGTGCGTTAATATCCGGCTAC GGGATGCACGGAGATGGTCATAATGCGTTGCAAGTTTTCATGGAAATGGTTCGATCTGGT GTAACGCCAAACGAAATCACATTTACATCTGCCTTGAATGCTTGCAGTCATTCGGGTTTG GTTGAAGAAGGCTTGACATTATTCAGGTTCATGCTTGAACATTACAAAACGTTAGCCAGA TCAAACCATTACACTTGCATTGTTGATCTCCTTGGTCGAGCAGGTCGGTTAGACGAAGCT TACAATCTCATCACAACAATTCCATTTGAACCAACGTCAACCGTTTGGGGTGCGTTGCTT GCTGCTTGTGTCACACATGAGAATGTCCAGCTTGGAGAAATGGCAGCAAACAAGTTGTTC GAGCTGGAACCAGAGAACACGGGCAACTATGTGTTGTTGGCAAACATCTATGCGGCTTTA GGACGATGGAAAGATATGGAGAAGGTGAGAAGCATGATGGAGAATGTTGGATTGAGAAAG AAACCAGGTCATAGCACAATCGAGATCAGAAGTAATTCAGTTGATACAAGATGA

Peptide Sequence

PEP ID	AT5G39350.1
PEP Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr5:15750929-15752962 FORWARD LENGTH=677 \| 201606
Sequence	MSEVLRRANNALSSVKQYQSLLNHFAATQSISKTKALHCHVITGGRVSGHILSTLSVTYA LCGHITYARKLFEEMPQSSLLSYNIVIRMYVREGLYHDAISVFIRMVSEGVKCVPDGYTY PFVAKAAGELKSMKLGLVVHGRILRSWFGRDKYVQNALLAMYMNFGKVEMARDVFDVMKN RDVISWNTMISGYYRNGYMNDALMMFDWMVNESVDLDHATIVSMLPVCGHLKDLEMGRNV HKLVEEKRLGDKIEVKNALVNMYLKCGRMDEARFVFDRMERRDVITWTCMINGYTEDGDV ENALELCRLMQFEGVRPNAVTIASLVSVCGDALKVNDGKCLHGWAVRQQVYSDIIIETSL ISMYAKCKRVDLCFRVFSGASKYHTGPWSAIIAGCVQNELVSDALGLFKRMRREDVEPNI ATLNSLLPAYAALADLRQAMNIHCYLTKTGFMSSLDAATGLVHVYSKCGTLESAHKIFNG IQEKHKSKDVVLWGALISGYGMHGDGHNALQVFMEMVRSGVTPNEITFTSALNACSHSGL VEEGLTLFRFMLEHYKTLARSNHYTCIVDLLGRAGRLDEAYNLITTIPFEPTSTVWGALL AACVTHENVQLGEMAANKLFELEPENTGNYVLLANIYAALGRWKDMEKVRSMMENVGLRK KPGHSTIEIRSNSVDTR

Transcript Sequence

Transcript ID	AT5G39350.1
Transcript Infomation	\| Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein \| Chr5:15750875-15752962 FORWARD LENGTH=2088 \| 201606
Sequence	GCTTTTAAAAAATTGCGACCCAATAGATTTTTCAACAGTCGTTTTTTTCTTTAAATGAGT GAAGTTTTGCGCAGAGCCAACAACGCACTTAGTAGCGTCAAGCAATACCAATCTCTCTTG AATCACTTTGCAGCTACTCAATCAATTTCAAAAACCAAAGCTTTACACTGCCACGTCATC ACCGGCGGTCGAGTTTCCGGCCACATTCTCTCGACTCTCTCCGTAACTTATGCGTTATGT GGTCACATCACTTATGCACGGAAGCTGTTCGAGGAAATGCCTCAAAGCTCTTTGCTTTCT TATAACATTGTTATTAGAATGTACGTGCGTGAAGGATTGTATCACGATGCGATTAGCGTG TTTATTAGGATGGTTAGTGAGGGGGTTAAGTGTGTTCCGGATGGTTATACATACCCTTTT GTTGCTAAAGCTGCTGGAGAATTGAAATCGATGAAATTGGGGTTGGTTGTTCATGGGAGG ATCTTGAGGAGTTGGTTTGGTAGGGATAAGTATGTGCAGAACGCGTTGTTAGCGATGTAT ATGAACTTTGGGAAGGTTGAAATGGCGAGGGATGTGTTTGATGTGATGAAGAACCGTGAT GTGATTTCGTGGAACACGATGATTAGTGGGTATTATAGGAATGGTTATATGAATGATGCG TTAATGATGTTTGATTGGATGGTTAATGAAAGTGTTGATCTTGACCATGCTACGATTGTT TCTATGTTGCCTGTTTGTGGTCACTTGAAGGATTTGGAGATGGGGAGGAATGTTCATAAG TTGGTGGAAGAGAAGCGGTTAGGGGATAAAATTGAGGTGAAGAATGCGTTGGTGAATATG TACTTGAAATGTGGTCGTATGGATGAAGCGAGATTTGTTTTTGACAGGATGGAACGAAGG GATGTGATCACGTGGACTTGTATGATTAACGGATATACTGAAGATGGAGATGTGGAAAAC GCTTTAGAGTTGTGTAGATTGATGCAGTTTGAAGGCGTAAGACCTAATGCTGTGACTATA GCTTCTCTTGTTTCGGTGTGTGGTGATGCTTTGAAGGTGAATGATGGTAAATGTTTACAC GGTTGGGCGGTGAGGCAACAGGTTTATTCCGATATCATTATAGAAACATCTTTGATCAGC ATGTATGCTAAATGCAAACGTGTAGACCTCTGCTTTAGAGTATTTTCGGGGGCTTCGAAA TACCATACCGGTCCTTGGAGTGCAATTATCGCTGGTTGTGTACAGAATGAACTTGTGAGT GATGCGTTAGGTCTATTCAAACGGATGCGACGGGAAGATGTGGAGCCCAATATTGCTACA TTAAACAGTCTCCTTCCAGCATATGCAGCTTTGGCAGATTTGCGTCAAGCAATGAATATC CATTGCTACCTAACCAAAACCGGGTTTATGTCAAGCCTTGATGCTGCTACAGGGTTGGTT CATGTTTACTCAAAGTGTGGAACATTAGAATCTGCTCACAAGATATTCAATGGAATCCAG GAAAAACACAAGAGCAAAGATGTAGTTCTATGGGGTGCGTTAATATCCGGCTACGGGATG CACGGAGATGGTCATAATGCGTTGCAAGTTTTCATGGAAATGGTTCGATCTGGTGTAACG CCAAACGAAATCACATTTACATCTGCCTTGAATGCTTGCAGTCATTCGGGTTTGGTTGAA GAAGGCTTGACATTATTCAGGTTCATGCTTGAACATTACAAAACGTTAGCCAGATCAAAC CATTACACTTGCATTGTTGATCTCCTTGGTCGAGCAGGTCGGTTAGACGAAGCTTACAAT CTCATCACAACAATTCCATTTGAACCAACGTCAACCGTTTGGGGTGCGTTGCTTGCTGCT TGTGTCACACATGAGAATGTCCAGCTTGGAGAAATGGCAGCAAACAAGTTGTTCGAGCTG GAACCAGAGAACACGGGCAACTATGTGTTGTTGGCAAACATCTATGCGGCTTTAGGACGA TGGAAAGATATGGAGAAGGTGAGAAGCATGATGGAGAATGTTGGATTGAGAAAGAAACCA GGTCATAGCACAATCGAGATCAGAAGTAATTCAGTTGATACAAGATGA